FuNGI

A0A4S8KR53

Protein Details

Accession

A0A4S8KR53

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
480-505	EERPEVEQHPRKRKRDKERAPQCLFD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
489-496	PRKRKRDK

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039659 SPT5 IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II

Amino Acid Sequences

MPSRNPFLDLEAYGSDEEDLREEMPSVHDHEATGAGGKDEEEEEDPREDEEEEAGTLQAKDGGVYEDEDFPEMFGPALFDSLEKRYNPEALAKLKMVSPVLLRSDDDLVDKPTLHLDLMAKALLLSERKPIFWRVRCITGKETELVYDIMAHLHPSAHTLASRCLEAFTRYQAGAKEDLEEALKEVLELDTLPREVQNQIDEAVAQRAQNQEVVPKHNPPNLELAGPESDHRPECAFEFSFPNILEVDPIPPLWSTAIGKATLEPDADVNEALQALHAMKNDLVPSLVRNVPVPLPLPSTSNDLRSAKDTLLSVALSDNENSYHVFSAFSVPGVTGSVYLEAYLGKDPQNARIVHFLRQQAAVMKVGNVRLDRQSDKYQQRVWLQPVSPQDIADLLTMSHPSIKPLEWVRVTHGLYKDDVGLVVRRETSTGLRRLAMLLVPRLHRNVNPPPPRPPHPNHPLARAENSASNPTSSQQQLQEERPEVEQHPRKRKRDKERAPQCLFDHSLWPEGDGTFAWKQLGHKCYEMAGDRFEHGLLLTFFTYTSVTDIDVQMDMSTRRLFQGSTHPLIQRVNMPLSENWVFLVDENVEVIHGAPLTDQEKVERLHTQKTYRKTGRIDQVERDRCLIHFDDYNDDPYEETISKMDVEETDVWISKTNLRKKINIGDHVEVIAGDLQGRHGFVVGNWGLEVDMVDMGSENKEPFNVAINSCRITQAQNDVTIPWLNRRVTVTRGQYFNHTGIVCDVIPPRLNGPTMLDVMLVNLSHTVRIRHDDVLDTCANEPLCKAIPLLLHQQAFQQASWTLDYAPTVSRPAIDPQGRPLLPQQYFIHQHRPPVPWIDKPVMVVKGLIKNRGIVKDVELYHRFKSGMRVMVEFDFISAELGANPRQWICYGWIRDPTTGLPLHARYPLGQRDARYWRPLKPIRAVSVPAPKSAIQTQQPQARTPPHRTQDFVDPFHWLLDSRLDGKSFLACWEPLDHSEAAIKDVIVTPDGEINWIWVEKSGRHGPQRWKALPQEVSLPADPQRPIKPPSNTRPLLVVRGDHTGKHIRQIYFKSQKGTKERLITASVFEPWGMPEEARVEEHIVVRGEDCAFVPSDPNKSRFEGLMMSLKQIARQKRQR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.17
3	0.13
4	0.13
5	0.11
6	0.12
7	0.11
8	0.11
9	0.12
10	0.12
11	0.14
12	0.16
13	0.19
14	0.2
15	0.2
16	0.2
17	0.2
18	0.2
19	0.18
20	0.18
21	0.14
22	0.12
23	0.12
24	0.12
25	0.12
26	0.11
27	0.13
28	0.14
29	0.15
30	0.18
31	0.2
32	0.2
33	0.19
34	0.2
35	0.18
36	0.16
37	0.15
38	0.13
39	0.11
40	0.12
41	0.11
42	0.12
43	0.11
44	0.11
45	0.12
46	0.1
47	0.1
48	0.11
49	0.12
50	0.12
51	0.14
52	0.15
53	0.16
54	0.16
55	0.17
56	0.16
57	0.14
58	0.14
59	0.12
60	0.1
61	0.08
62	0.09
63	0.08
64	0.09
65	0.08
66	0.08
67	0.11
68	0.15
69	0.21
70	0.2
71	0.24
72	0.26
73	0.29
74	0.31
75	0.34
76	0.37
77	0.36
78	0.4
79	0.36
80	0.34
81	0.33
82	0.35
83	0.29
84	0.24
85	0.22
86	0.23
87	0.25
88	0.25
89	0.24
90	0.24
91	0.25
92	0.24
93	0.24
94	0.21
95	0.21
96	0.21
97	0.2
98	0.18
99	0.18
100	0.18
101	0.16
102	0.16
103	0.15
104	0.15
105	0.17
106	0.16
107	0.13
108	0.12
109	0.13
110	0.13
111	0.14
112	0.13
113	0.2
114	0.21
115	0.22
116	0.26
117	0.33
118	0.4
119	0.45
120	0.53
121	0.5
122	0.59
123	0.61
124	0.64
125	0.61
126	0.57
127	0.52
128	0.45
129	0.41
130	0.32
131	0.29
132	0.24
133	0.19
134	0.14
135	0.11
136	0.1
137	0.1
138	0.1
139	0.08
140	0.09
141	0.09
142	0.1
143	0.12
144	0.12
145	0.14
146	0.15
147	0.19
148	0.2
149	0.21
150	0.19
151	0.19
152	0.19
153	0.2
154	0.21
155	0.21
156	0.22
157	0.22
158	0.24
159	0.25
160	0.26
161	0.26
162	0.24
163	0.22
164	0.19
165	0.19
166	0.18
167	0.16
168	0.14
169	0.12
170	0.11
171	0.09
172	0.09
173	0.08
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.09
178	0.1
179	0.1
180	0.1
181	0.12
182	0.13
183	0.15
184	0.15
185	0.14
186	0.14
187	0.14
188	0.14
189	0.13
190	0.16
191	0.14
192	0.13
193	0.15
194	0.16
195	0.17
196	0.19
197	0.18
198	0.22
199	0.24
200	0.31
201	0.32
202	0.37
203	0.42
204	0.42
205	0.43
206	0.38
207	0.41
208	0.36
209	0.33
210	0.26
211	0.23
212	0.22
213	0.21
214	0.2
215	0.15
216	0.17
217	0.17
218	0.18
219	0.17
220	0.16
221	0.17
222	0.22
223	0.2
224	0.19
225	0.22
226	0.22
227	0.24
228	0.23
229	0.22
230	0.17
231	0.16
232	0.16
233	0.12
234	0.12
235	0.1
236	0.1
237	0.1
238	0.09
239	0.1
240	0.09
241	0.11
242	0.11
243	0.13
244	0.15
245	0.15
246	0.15
247	0.15
248	0.16
249	0.15
250	0.14
251	0.11
252	0.1
253	0.11
254	0.11
255	0.1
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.06
261	0.05
262	0.06
263	0.08
264	0.09
265	0.09
266	0.1
267	0.12
268	0.12
269	0.11
270	0.11
271	0.09
272	0.1
273	0.14
274	0.15
275	0.14
276	0.14
277	0.16
278	0.16
279	0.18
280	0.18
281	0.15
282	0.17
283	0.17
284	0.18
285	0.18
286	0.23
287	0.23
288	0.24
289	0.28
290	0.25
291	0.26
292	0.27
293	0.28
294	0.22
295	0.23
296	0.21
297	0.16
298	0.16
299	0.14
300	0.12
301	0.1
302	0.11
303	0.09
304	0.09
305	0.09
306	0.08
307	0.09
308	0.09
309	0.1
310	0.09
311	0.09
312	0.09
313	0.09
314	0.12
315	0.12
316	0.11
317	0.1
318	0.09
319	0.09
320	0.09
321	0.09
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.07
330	0.07
331	0.08
332	0.08
333	0.13
334	0.13
335	0.18
336	0.25
337	0.24
338	0.25
339	0.33
340	0.34
341	0.35
342	0.4
343	0.37
344	0.32
345	0.32
346	0.31
347	0.25
348	0.25
349	0.21
350	0.16
351	0.16
352	0.16
353	0.17
354	0.19
355	0.16
356	0.17
357	0.18
358	0.22
359	0.23
360	0.26
361	0.32
362	0.39
363	0.44
364	0.47
365	0.48
366	0.5
367	0.52
368	0.53
369	0.5
370	0.47
371	0.42
372	0.41
373	0.41
374	0.4
375	0.35
376	0.29
377	0.25
378	0.19
379	0.2
380	0.15
381	0.12
382	0.06
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.1
387	0.09
388	0.1
389	0.12
390	0.12
391	0.16
392	0.18
393	0.24
394	0.22
395	0.23
396	0.26
397	0.31
398	0.32
399	0.32
400	0.32
401	0.28
402	0.26
403	0.26
404	0.22
405	0.15
406	0.15
407	0.1
408	0.1
409	0.1
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.1
414	0.12
415	0.16
416	0.2
417	0.24
418	0.24
419	0.23
420	0.24
421	0.24
422	0.23
423	0.2
424	0.15
425	0.14
426	0.16
427	0.17
428	0.18
429	0.2
430	0.2
431	0.2
432	0.25
433	0.31
434	0.38
435	0.45
436	0.47
437	0.54
438	0.58
439	0.62
440	0.63
441	0.59
442	0.59
443	0.59
444	0.65
445	0.58
446	0.59
447	0.59
448	0.53
449	0.51
450	0.43
451	0.36
452	0.3
453	0.29
454	0.26
455	0.2
456	0.18
457	0.16
458	0.15
459	0.17
460	0.15
461	0.16
462	0.16
463	0.21
464	0.24
465	0.26
466	0.3
467	0.28
468	0.28
469	0.26
470	0.26
471	0.22
472	0.28
473	0.33
474	0.38
475	0.47
476	0.55
477	0.62
478	0.7
479	0.79
480	0.81
481	0.85
482	0.86
483	0.86
484	0.88
485	0.9
486	0.83
487	0.78
488	0.68
489	0.62
490	0.53
491	0.43
492	0.36
493	0.26
494	0.26
495	0.21
496	0.21
497	0.16
498	0.13
499	0.13
500	0.09
501	0.12
502	0.09
503	0.1
504	0.09
505	0.1
506	0.12
507	0.18
508	0.21
509	0.19
510	0.19
511	0.19
512	0.2
513	0.21
514	0.22
515	0.16
516	0.15
517	0.14
518	0.14
519	0.14
520	0.13
521	0.1
522	0.08
523	0.08
524	0.07
525	0.07
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.07
530	0.07
531	0.05
532	0.06
533	0.05
534	0.06
535	0.07
536	0.07
537	0.07
538	0.07
539	0.07
540	0.06
541	0.06
542	0.06
543	0.07
544	0.07
545	0.07
546	0.07
547	0.08
548	0.08
549	0.09
550	0.18
551	0.22
552	0.24
553	0.26
554	0.26
555	0.27
556	0.28
557	0.27
558	0.2
559	0.18
560	0.16
561	0.14
562	0.15
563	0.14
564	0.18
565	0.18
566	0.15
567	0.13
568	0.13
569	0.12
570	0.1
571	0.11
572	0.07
573	0.06
574	0.06
575	0.05
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.03
581	0.03
582	0.03
583	0.05
584	0.06
585	0.07
586	0.07
587	0.07
588	0.11
589	0.11
590	0.13
591	0.17
592	0.18
593	0.23
594	0.27
595	0.35
596	0.38
597	0.43
598	0.51
599	0.5
600	0.54
601	0.52
602	0.55
603	0.56
604	0.58
605	0.56
606	0.52
607	0.59
608	0.58
609	0.55
610	0.49
611	0.41
612	0.32
613	0.33
614	0.28
615	0.19
616	0.16
617	0.16
618	0.19
619	0.19
620	0.22
621	0.18
622	0.17
623	0.15
624	0.13
625	0.15
626	0.11
627	0.1
628	0.08
629	0.08
630	0.08
631	0.08
632	0.08
633	0.06
634	0.09
635	0.09
636	0.1
637	0.1
638	0.11
639	0.11
640	0.12
641	0.13
642	0.14
643	0.22
644	0.28
645	0.36
646	0.38
647	0.41
648	0.44
649	0.53
650	0.54
651	0.53
652	0.5
653	0.43
654	0.41
655	0.38
656	0.34
657	0.24
658	0.18
659	0.12
660	0.07
661	0.05
662	0.05
663	0.05
664	0.05
665	0.06
666	0.05
667	0.05
668	0.05
669	0.05
670	0.12
671	0.11
672	0.11
673	0.1
674	0.11
675	0.1
676	0.1
677	0.1
678	0.04
679	0.04
680	0.03
681	0.03
682	0.04
683	0.04
684	0.05
685	0.06
686	0.06
687	0.06
688	0.06
689	0.06
690	0.07
691	0.12
692	0.13
693	0.13
694	0.16
695	0.18
696	0.2
697	0.2
698	0.21
699	0.16
700	0.16
701	0.17
702	0.2
703	0.2
704	0.2
705	0.2
706	0.19
707	0.2
708	0.21
709	0.2
710	0.17
711	0.21
712	0.19
713	0.21
714	0.24
715	0.25
716	0.26
717	0.33
718	0.37
719	0.35
720	0.37
721	0.36
722	0.38
723	0.38
724	0.35
725	0.32
726	0.24
727	0.2
728	0.18
729	0.2
730	0.15
731	0.14
732	0.14
733	0.12
734	0.13
735	0.13
736	0.14
737	0.14
738	0.15
739	0.13
740	0.15
741	0.15
742	0.15
743	0.15
744	0.14
745	0.11
746	0.11
747	0.11
748	0.08
749	0.06
750	0.06
751	0.06
752	0.08
753	0.09
754	0.1
755	0.11
756	0.16
757	0.19
758	0.19
759	0.2
760	0.23
761	0.23
762	0.26
763	0.25
764	0.21
765	0.19
766	0.2
767	0.19
768	0.15
769	0.14
770	0.12
771	0.12
772	0.12
773	0.11
774	0.11
775	0.13
776	0.16
777	0.22
778	0.24
779	0.24
780	0.23
781	0.25
782	0.26
783	0.26
784	0.23
785	0.19
786	0.15
787	0.16
788	0.16
789	0.15
790	0.11
791	0.1
792	0.11
793	0.1
794	0.1
795	0.1
796	0.11
797	0.1
798	0.11
799	0.12
800	0.15
801	0.22
802	0.25
803	0.24
804	0.27
805	0.36
806	0.35
807	0.34
808	0.36
809	0.36
810	0.34
811	0.38
812	0.35
813	0.34
814	0.41
815	0.43
816	0.48
817	0.4
818	0.46
819	0.47
820	0.48
821	0.44
822	0.46
823	0.47
824	0.42
825	0.46
826	0.43
827	0.37
828	0.37
829	0.39
830	0.31
831	0.28
832	0.25
833	0.23
834	0.28
835	0.29
836	0.31
837	0.26
838	0.29
839	0.33
840	0.34
841	0.32
842	0.25
843	0.26
844	0.29
845	0.3
846	0.34
847	0.33
848	0.34
849	0.33
850	0.34
851	0.32
852	0.26
853	0.32
854	0.3
855	0.33
856	0.31
857	0.31
858	0.31
859	0.32
860	0.32
861	0.25
862	0.19
863	0.12
864	0.11
865	0.1
866	0.07
867	0.07
868	0.06
869	0.08
870	0.09
871	0.1
872	0.11
873	0.11
874	0.12
875	0.12
876	0.13
877	0.16
878	0.24
879	0.27
880	0.29
881	0.37
882	0.38
883	0.38
884	0.38
885	0.35
886	0.31
887	0.28
888	0.25
889	0.22
890	0.21
891	0.23
892	0.24
893	0.23
894	0.21
895	0.27
896	0.31
897	0.33
898	0.34
899	0.33
900	0.39
901	0.47
902	0.5
903	0.52
904	0.5
905	0.5
906	0.58
907	0.64
908	0.62
909	0.63
910	0.64
911	0.6
912	0.61
913	0.57
914	0.52
915	0.55
916	0.5
917	0.42
918	0.38
919	0.34
920	0.34
921	0.35
922	0.36
923	0.31
924	0.37
925	0.43
926	0.47
927	0.49
928	0.47
929	0.49
930	0.52
931	0.54
932	0.54
933	0.57
934	0.59
935	0.6
936	0.61
937	0.59
938	0.6
939	0.6
940	0.55
941	0.46
942	0.41
943	0.38
944	0.36
945	0.32
946	0.22
947	0.16
948	0.17
949	0.19
950	0.18
951	0.19
952	0.19
953	0.19
954	0.2
955	0.21
956	0.17
957	0.16
958	0.16
959	0.15
960	0.16
961	0.19
962	0.2
963	0.19
964	0.23
965	0.21
966	0.19
967	0.22
968	0.21
969	0.19
970	0.17
971	0.16
972	0.13
973	0.15
974	0.16
975	0.13
976	0.13
977	0.12
978	0.14
979	0.14
980	0.14
981	0.11
982	0.12
983	0.13
984	0.13
985	0.12
986	0.13
987	0.15
988	0.15
989	0.23
990	0.3
991	0.35
992	0.42
993	0.5
994	0.57
995	0.64
996	0.73
997	0.69
998	0.68
999	0.67
1000	0.69
1001	0.65
1002	0.57
1003	0.54
1004	0.47
1005	0.48
1006	0.42
1007	0.38
1008	0.32
1009	0.34
1010	0.33
1011	0.32
1012	0.34
1013	0.35
1014	0.4
1015	0.46
1016	0.53
1017	0.58
1018	0.66
1019	0.71
1020	0.67
1021	0.62
1022	0.65
1023	0.59
1024	0.56
1025	0.49
1026	0.42
1027	0.34
1028	0.4
1029	0.39
1030	0.32
1031	0.35
1032	0.38
1033	0.36
1034	0.42
1035	0.47
1036	0.42
1037	0.48
1038	0.55
1039	0.6
1040	0.61
1041	0.64
1042	0.63
1043	0.6
1044	0.67
1045	0.68
1046	0.69
1047	0.65
1048	0.64
1049	0.64
1050	0.6
1051	0.59
1052	0.51
1053	0.46
1054	0.4
1055	0.34
1056	0.26
1057	0.23
1058	0.19
1059	0.15
1060	0.18
1061	0.16
1062	0.13
1063	0.14
1064	0.17
1065	0.18
1066	0.19
1067	0.2
1068	0.19
1069	0.21
1070	0.23
1071	0.25
1072	0.23
1073	0.21
1074	0.21
1075	0.21
1076	0.19
1077	0.17
1078	0.16
1079	0.14
1080	0.14
1081	0.13
1082	0.18
1083	0.19
1084	0.29
1085	0.33
1086	0.37
1087	0.39
1088	0.41
1089	0.44
1090	0.39
1091	0.39
1092	0.32
1093	0.31
1094	0.37
1095	0.34
1096	0.32
1097	0.34
1098	0.33
1099	0.36
1100	0.4
1101	0.45

A0A4S8KR53

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer