FuNGI

A0A4S8L1J0

Protein Details

Accession

A0A4S8L1J0

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
352-379	SSDPERKEVKDSKKRKREREKYPQALFD	Basic
949-969	LMKTMRDQARKTRPHKPKAKD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
357-371	RKEVKDSKKRKRERE
957-969	ARKTRPHKPKAKD

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II

Amino Acid Sequences

MPNPFIDVEAQVDNEEDIIEPLFLPGSDDEDDFWARSDDGETGNQSVKDENAPSPLIGDETLSNNSLRAALLSTDVATEIFWRVKCKPGHESDLVSDIMRRELGCASVDTPEMPATYNFESVPPAEVRAFEVLCKACVDPSASIPETEAELKKILASAYNALWEQAPNVSSPQDPDEDHSVALERLSAMQGQLVTTLLSPATNPPSCPSQAPAAPAPPPSLLRSAFFVPTVLGFIYLEADLGLRPQDTDIINYLRGHKAVYKRPQRTGETSFAQKPWLTKSLVWLERVPCGEIATVLETSTSTIRKYSWVRVTRGEYAGDVGLVWARQTSAAQRRLVILLVPRLPPRPSCASSDPERKEVKDSKKRKREREKYPQALFDPKAYSVSVSDEAHAYFIYNGKEYLHGLHCKSLDYHSVTQVDVDMDATTRRLFRASTLPTRFNHLPIPTNWTFFYQDKVEVICSAPLNESQKQNLDLPRQAMTKYAVVTAVDGDYCKVQFADYEGIDENDTADWISKLNLQKRIFKGDSVEDSRDVHDFFWVEANECRTTRIRESDAVPWLGHLVTVIKGPYRRYQGIVVDVHPPRPSFTSLDIRIPELVLTVPVNHDDVYDSCSYQYLRTVAPLTPQQKHFQQAMWEMEFAPNLKVAVYDKHERRYLTTNDMVIPQPPQPWIGNEVRVVTSIWKCLGIVKQVERSARSVSGLRLQVELQFISAVHSIPVQWFDYGEVYDPRTGDSLTIAYPLAGHQKRYWRPLIPPRHIRPDKQPMPIPEWSRPPRPLTPPWNSGPFFDPFASAEPSAGPGTSSLAQTHWTLNPRLVGRKFYARWGPTHDLPMEKVLVEPVEDKLIKVYSGAEVLIGRSHEIYDCAVRISPTTNKRPLLGVHREHTGKYMHQIYYKYDCEGKPVIIAAVFRNWGSSNEEYVETIEVQPEDLAETSNDWRHDPNEKRFASLMKTMRDQARKTRPHKPKAKD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.11
3	0.08
4	0.08
5	0.08
6	0.08
7	0.07
8	0.07
9	0.08
10	0.07
11	0.09
12	0.09
13	0.12
14	0.13
15	0.14
16	0.15
17	0.18
18	0.19
19	0.17
20	0.18
21	0.15
22	0.14
23	0.14
24	0.15
25	0.13
26	0.15
27	0.18
28	0.19
29	0.2
30	0.24
31	0.24
32	0.23
33	0.22
34	0.22
35	0.23
36	0.24
37	0.23
38	0.23
39	0.24
40	0.23
41	0.23
42	0.21
43	0.18
44	0.15
45	0.14
46	0.12
47	0.14
48	0.17
49	0.17
50	0.16
51	0.15
52	0.16
53	0.15
54	0.13
55	0.1
56	0.1
57	0.09
58	0.11
59	0.12
60	0.11
61	0.11
62	0.11
63	0.1
64	0.08
65	0.09
66	0.11
67	0.14
68	0.16
69	0.2
70	0.22
71	0.3
72	0.34
73	0.39
74	0.45
75	0.48
76	0.55
77	0.54
78	0.55
79	0.5
80	0.49
81	0.43
82	0.35
83	0.29
84	0.23
85	0.2
86	0.18
87	0.15
88	0.14
89	0.14
90	0.15
91	0.15
92	0.15
93	0.15
94	0.15
95	0.16
96	0.14
97	0.15
98	0.14
99	0.13
100	0.13
101	0.12
102	0.15
103	0.17
104	0.18
105	0.17
106	0.16
107	0.18
108	0.17
109	0.21
110	0.16
111	0.17
112	0.16
113	0.16
114	0.18
115	0.2
116	0.19
117	0.16
118	0.21
119	0.19
120	0.2
121	0.21
122	0.18
123	0.15
124	0.17
125	0.2
126	0.15
127	0.17
128	0.23
129	0.23
130	0.22
131	0.22
132	0.21
133	0.2
134	0.23
135	0.22
136	0.16
137	0.17
138	0.17
139	0.16
140	0.17
141	0.15
142	0.13
143	0.14
144	0.15
145	0.15
146	0.18
147	0.17
148	0.16
149	0.17
150	0.14
151	0.13
152	0.13
153	0.12
154	0.1
155	0.12
156	0.13
157	0.13
158	0.15
159	0.17
160	0.17
161	0.17
162	0.2
163	0.24
164	0.24
165	0.23
166	0.21
167	0.2
168	0.17
169	0.17
170	0.13
171	0.08
172	0.08
173	0.09
174	0.09
175	0.07
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.09
180	0.08
181	0.07
182	0.07
183	0.08
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.1
188	0.16
189	0.17
190	0.18
191	0.2
192	0.24
193	0.26
194	0.27
195	0.26
196	0.25
197	0.26
198	0.29
199	0.29
200	0.28
201	0.28
202	0.28
203	0.27
204	0.23
205	0.23
206	0.21
207	0.23
208	0.21
209	0.2
210	0.22
211	0.23
212	0.22
213	0.2
214	0.18
215	0.14
216	0.13
217	0.13
218	0.1
219	0.08
220	0.07
221	0.07
222	0.08
223	0.07
224	0.07
225	0.05
226	0.06
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.05
232	0.06
233	0.09
234	0.1
235	0.11
236	0.14
237	0.16
238	0.18
239	0.19
240	0.22
241	0.21
242	0.21
243	0.2
244	0.22
245	0.28
246	0.35
247	0.44
248	0.51
249	0.55
250	0.63
251	0.69
252	0.69
253	0.68
254	0.65
255	0.61
256	0.55
257	0.54
258	0.5
259	0.43
260	0.4
261	0.35
262	0.31
263	0.3
264	0.29
265	0.26
266	0.23
267	0.29
268	0.36
269	0.38
270	0.38
271	0.37
272	0.34
273	0.36
274	0.36
275	0.3
276	0.21
277	0.19
278	0.16
279	0.13
280	0.12
281	0.1
282	0.09
283	0.08
284	0.08
285	0.07
286	0.08
287	0.1
288	0.1
289	0.09
290	0.1
291	0.1
292	0.16
293	0.2
294	0.27
295	0.35
296	0.4
297	0.43
298	0.48
299	0.52
300	0.51
301	0.49
302	0.41
303	0.32
304	0.27
305	0.23
306	0.17
307	0.12
308	0.07
309	0.06
310	0.06
311	0.05
312	0.04
313	0.04
314	0.05
315	0.05
316	0.13
317	0.21
318	0.26
319	0.27
320	0.28
321	0.29
322	0.3
323	0.29
324	0.23
325	0.18
326	0.17
327	0.19
328	0.2
329	0.2
330	0.22
331	0.24
332	0.23
333	0.25
334	0.28
335	0.27
336	0.31
337	0.33
338	0.35
339	0.41
340	0.5
341	0.48
342	0.48
343	0.48
344	0.43
345	0.46
346	0.5
347	0.54
348	0.54
349	0.62
350	0.66
351	0.74
352	0.83
353	0.86
354	0.89
355	0.89
356	0.89
357	0.9
358	0.91
359	0.9
360	0.85
361	0.79
362	0.7
363	0.67
364	0.57
365	0.48
366	0.39
367	0.29
368	0.27
369	0.22
370	0.19
371	0.13
372	0.15
373	0.14
374	0.13
375	0.13
376	0.12
377	0.12
378	0.12
379	0.11
380	0.08
381	0.06
382	0.09
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.09
387	0.1
388	0.1
389	0.13
390	0.15
391	0.17
392	0.17
393	0.2
394	0.2
395	0.2
396	0.2
397	0.19
398	0.19
399	0.21
400	0.22
401	0.22
402	0.23
403	0.22
404	0.21
405	0.2
406	0.15
407	0.1
408	0.09
409	0.06
410	0.05
411	0.05
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.09
419	0.17
420	0.21
421	0.29
422	0.33
423	0.37
424	0.36
425	0.43
426	0.42
427	0.36
428	0.35
429	0.27
430	0.27
431	0.23
432	0.32
433	0.26
434	0.27
435	0.25
436	0.24
437	0.25
438	0.22
439	0.24
440	0.17
441	0.17
442	0.16
443	0.16
444	0.14
445	0.11
446	0.11
447	0.1
448	0.09
449	0.09
450	0.09
451	0.11
452	0.14
453	0.17
454	0.18
455	0.17
456	0.19
457	0.2
458	0.23
459	0.24
460	0.24
461	0.23
462	0.23
463	0.24
464	0.24
465	0.22
466	0.2
467	0.18
468	0.16
469	0.14
470	0.13
471	0.11
472	0.1
473	0.1
474	0.09
475	0.07
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.05
481	0.05
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.07
486	0.1
487	0.09
488	0.11
489	0.11
490	0.11
491	0.11
492	0.11
493	0.09
494	0.06
495	0.06
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.05
501	0.09
502	0.14
503	0.19
504	0.27
505	0.29
506	0.36
507	0.38
508	0.46
509	0.42
510	0.38
511	0.36
512	0.31
513	0.34
514	0.31
515	0.3
516	0.23
517	0.23
518	0.23
519	0.22
520	0.19
521	0.13
522	0.11
523	0.1
524	0.09
525	0.12
526	0.11
527	0.11
528	0.12
529	0.15
530	0.16
531	0.16
532	0.18
533	0.17
534	0.2
535	0.22
536	0.25
537	0.24
538	0.25
539	0.28
540	0.3
541	0.31
542	0.29
543	0.26
544	0.21
545	0.19
546	0.16
547	0.13
548	0.08
549	0.06
550	0.05
551	0.06
552	0.07
553	0.08
554	0.1
555	0.13
556	0.18
557	0.23
558	0.24
559	0.25
560	0.28
561	0.28
562	0.32
563	0.31
564	0.27
565	0.29
566	0.28
567	0.28
568	0.26
569	0.24
570	0.2
571	0.2
572	0.21
573	0.16
574	0.2
575	0.26
576	0.27
577	0.31
578	0.3
579	0.29
580	0.27
581	0.25
582	0.2
583	0.12
584	0.1
585	0.07
586	0.06
587	0.06
588	0.06
589	0.07
590	0.08
591	0.07
592	0.07
593	0.08
594	0.08
595	0.11
596	0.11
597	0.11
598	0.1
599	0.12
600	0.12
601	0.11
602	0.13
603	0.11
604	0.11
605	0.13
606	0.15
607	0.14
608	0.16
609	0.23
610	0.25
611	0.28
612	0.31
613	0.33
614	0.34
615	0.37
616	0.35
617	0.31
618	0.3
619	0.3
620	0.32
621	0.29
622	0.27
623	0.23
624	0.23
625	0.21
626	0.18
627	0.13
628	0.09
629	0.08
630	0.08
631	0.08
632	0.08
633	0.12
634	0.16
635	0.24
636	0.27
637	0.32
638	0.36
639	0.35
640	0.38
641	0.41
642	0.4
643	0.38
644	0.38
645	0.34
646	0.32
647	0.34
648	0.3
649	0.24
650	0.22
651	0.17
652	0.16
653	0.15
654	0.16
655	0.15
656	0.16
657	0.21
658	0.22
659	0.23
660	0.22
661	0.23
662	0.21
663	0.21
664	0.2
665	0.19
666	0.17
667	0.16
668	0.16
669	0.14
670	0.14
671	0.16
672	0.19
673	0.19
674	0.23
675	0.24
676	0.3
677	0.33
678	0.36
679	0.34
680	0.34
681	0.32
682	0.28
683	0.26
684	0.23
685	0.21
686	0.25
687	0.26
688	0.25
689	0.23
690	0.23
691	0.23
692	0.22
693	0.2
694	0.14
695	0.11
696	0.1
697	0.11
698	0.12
699	0.09
700	0.08
701	0.08
702	0.08
703	0.09
704	0.11
705	0.1
706	0.09
707	0.09
708	0.1
709	0.11
710	0.11
711	0.13
712	0.12
713	0.13
714	0.15
715	0.14
716	0.14
717	0.14
718	0.14
719	0.12
720	0.11
721	0.1
722	0.09
723	0.1
724	0.09
725	0.08
726	0.08
727	0.09
728	0.18
729	0.18
730	0.2
731	0.23
732	0.33
733	0.39
734	0.45
735	0.49
736	0.44
737	0.52
738	0.59
739	0.66
740	0.66
741	0.71
742	0.71
743	0.77
744	0.77
745	0.72
746	0.72
747	0.73
748	0.7
749	0.67
750	0.67
751	0.6
752	0.61
753	0.64
754	0.59
755	0.53
756	0.56
757	0.54
758	0.55
759	0.56
760	0.55
761	0.56
762	0.58
763	0.62
764	0.61
765	0.63
766	0.62
767	0.62
768	0.64
769	0.57
770	0.52
771	0.46
772	0.39
773	0.34
774	0.29
775	0.25
776	0.19
777	0.21
778	0.22
779	0.19
780	0.17
781	0.14
782	0.16
783	0.15
784	0.14
785	0.11
786	0.08
787	0.11
788	0.13
789	0.13
790	0.12
791	0.12
792	0.14
793	0.15
794	0.18
795	0.19
796	0.22
797	0.23
798	0.24
799	0.29
800	0.31
801	0.38
802	0.37
803	0.38
804	0.38
805	0.46
806	0.45
807	0.47
808	0.53
809	0.46
810	0.47
811	0.51
812	0.53
813	0.47
814	0.51
815	0.46
816	0.39
817	0.38
818	0.38
819	0.3
820	0.24
821	0.21
822	0.17
823	0.15
824	0.14
825	0.13
826	0.12
827	0.17
828	0.17
829	0.17
830	0.18
831	0.19
832	0.17
833	0.17
834	0.17
835	0.11
836	0.12
837	0.12
838	0.1
839	0.1
840	0.11
841	0.12
842	0.11
843	0.11
844	0.1
845	0.11
846	0.11
847	0.12
848	0.13
849	0.14
850	0.14
851	0.15
852	0.16
853	0.15
854	0.16
855	0.19
856	0.26
857	0.32
858	0.4
859	0.46
860	0.47
861	0.48
862	0.5
863	0.51
864	0.52
865	0.53
866	0.51
867	0.47
868	0.52
869	0.52
870	0.49
871	0.47
872	0.41
873	0.33
874	0.34
875	0.38
876	0.34
877	0.37
878	0.39
879	0.42
880	0.46
881	0.45
882	0.41
883	0.4
884	0.37
885	0.39
886	0.39
887	0.34
888	0.28
889	0.27
890	0.25
891	0.2
892	0.21
893	0.17
894	0.19
895	0.19
896	0.17
897	0.18
898	0.18
899	0.19
900	0.24
901	0.24
902	0.23
903	0.24
904	0.25
905	0.24
906	0.24
907	0.24
908	0.19
909	0.17
910	0.17
911	0.14
912	0.14
913	0.13
914	0.12
915	0.12
916	0.11
917	0.11
918	0.09
919	0.12
920	0.16
921	0.21
922	0.22
923	0.22
924	0.25
925	0.27
926	0.37
927	0.43
928	0.49
929	0.55
930	0.54
931	0.57
932	0.57
933	0.56
934	0.52
935	0.51
936	0.48
937	0.44
938	0.47
939	0.5
940	0.56
941	0.61
942	0.6
943	0.62
944	0.66
945	0.71
946	0.73
947	0.77
948	0.79
949	0.81

A0A4S8L1J0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer