FuNGI

A0A4S8MHN3

Protein Details

Accession

A0A4S8MHN3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
359-386	RILLVPRLRLNRKRKSRCPQGLFNPHNF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
370-372	RKR

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039659 SPT5 IPR022581 Spt5_N
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF11942 Spt5_N

Amino Acid Sequences

MSRKKSRFILEEAEVDDEEDEETDQEDSNDELDHPTEWNEPENWQDEDTHILPPVDSMPDADEDSRTLAAHQNSHLQELHTLADDLEQRYVRNPACLTPIPLDVNNQVSNKDLRLFLLGLPAPSNIYRLKCKRGQEMSLVMDIGRYLLQRPQSECQTHLAMLLPPVSSSEPSRDTRGWDVVQRFASGALSTLPEVEVALQNIYGERYDPSQWQDILRKINDREDNEDTPAILAEIDEHLKTASKHGSFSPETHPALEPLPESHVYSAFTVPSVLGWIYLEAGINPDFREWLRRRFDVVHTSTGDVTLEAVEQAEVAQLLSSSCPSIEPFTWIRVTKGLYKDDIGLVLAREISLGGRRLRILLVPRLRLNRKRKSRCPQGLFNPHNFSRSEYTVLGDCRYQYEEDVFDHGLIERIFDYASVTYTDIEPDQATRLYFAQSGHSFCLKYPLPNPEVGSFSMRTASRSTARNLW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.32
3	0.26
4	0.18
5	0.14
6	0.11
7	0.1
8	0.07
9	0.08
10	0.08
11	0.08
12	0.08
13	0.09
14	0.09
15	0.09
16	0.1
17	0.1
18	0.11
19	0.11
20	0.12
21	0.12
22	0.14
23	0.17
24	0.17
25	0.2
26	0.19
27	0.2
28	0.24
29	0.27
30	0.26
31	0.23
32	0.23
33	0.21
34	0.25
35	0.25
36	0.22
37	0.2
38	0.18
39	0.17
40	0.17
41	0.18
42	0.14
43	0.13
44	0.12
45	0.12
46	0.13
47	0.15
48	0.15
49	0.14
50	0.13
51	0.15
52	0.15
53	0.13
54	0.12
55	0.17
56	0.19
57	0.21
58	0.22
59	0.29
60	0.29
61	0.32
62	0.32
63	0.27
64	0.25
65	0.24
66	0.23
67	0.16
68	0.15
69	0.12
70	0.14
71	0.17
72	0.16
73	0.19
74	0.19
75	0.18
76	0.2
77	0.26
78	0.23
79	0.25
80	0.25
81	0.23
82	0.29
83	0.31
84	0.32
85	0.28
86	0.31
87	0.29
88	0.29
89	0.29
90	0.25
91	0.28
92	0.28
93	0.26
94	0.23
95	0.23
96	0.24
97	0.22
98	0.22
99	0.18
100	0.15
101	0.17
102	0.18
103	0.15
104	0.2
105	0.19
106	0.17
107	0.17
108	0.17
109	0.16
110	0.15
111	0.17
112	0.14
113	0.17
114	0.26
115	0.3
116	0.38
117	0.42
118	0.47
119	0.54
120	0.57
121	0.57
122	0.53
123	0.54
124	0.49
125	0.44
126	0.39
127	0.29
128	0.22
129	0.19
130	0.14
131	0.09
132	0.07
133	0.07
134	0.1
135	0.15
136	0.18
137	0.23
138	0.26
139	0.32
140	0.34
141	0.34
142	0.34
143	0.31
144	0.28
145	0.25
146	0.22
147	0.16
148	0.15
149	0.15
150	0.11
151	0.09
152	0.1
153	0.1
154	0.1
155	0.11
156	0.13
157	0.17
158	0.19
159	0.23
160	0.23
161	0.25
162	0.27
163	0.3
164	0.28
165	0.29
166	0.29
167	0.29
168	0.29
169	0.26
170	0.23
171	0.19
172	0.18
173	0.12
174	0.1
175	0.07
176	0.07
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.05
188	0.06
189	0.06
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.07
194	0.09
195	0.11
196	0.13
197	0.16
198	0.17
199	0.19
200	0.23
201	0.25
202	0.28
203	0.28
204	0.3
205	0.28
206	0.35
207	0.37
208	0.35
209	0.37
210	0.37
211	0.37
212	0.34
213	0.33
214	0.25
215	0.2
216	0.18
217	0.12
218	0.06
219	0.05
220	0.03
221	0.04
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.07
227	0.07
228	0.09
229	0.13
230	0.13
231	0.15
232	0.15
233	0.21
234	0.21
235	0.23
236	0.25
237	0.26
238	0.26
239	0.26
240	0.25
241	0.21
242	0.2
243	0.19
244	0.14
245	0.09
246	0.12
247	0.11
248	0.11
249	0.11
250	0.11
251	0.11
252	0.12
253	0.12
254	0.09
255	0.08
256	0.08
257	0.07
258	0.06
259	0.06
260	0.05
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.04
268	0.06
269	0.06
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.08
275	0.17
276	0.19
277	0.27
278	0.32
279	0.33
280	0.36
281	0.39
282	0.44
283	0.44
284	0.44
285	0.4
286	0.36
287	0.36
288	0.32
289	0.29
290	0.24
291	0.15
292	0.12
293	0.07
294	0.06
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.04
306	0.04
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.09
313	0.1
314	0.14
315	0.15
316	0.18
317	0.22
318	0.22
319	0.23
320	0.22
321	0.24
322	0.27
323	0.3
324	0.3
325	0.28
326	0.28
327	0.28
328	0.26
329	0.24
330	0.18
331	0.13
332	0.11
333	0.1
334	0.08
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.09
340	0.13
341	0.14
342	0.16
343	0.16
344	0.17
345	0.18
346	0.21
347	0.23
348	0.28
349	0.33
350	0.36
351	0.41
352	0.48
353	0.56
354	0.62
355	0.67
356	0.69
357	0.74
358	0.79
359	0.85
360	0.87
361	0.9
362	0.91
363	0.89
364	0.88
365	0.87
366	0.88
367	0.83
368	0.79
369	0.76
370	0.66
371	0.61
372	0.52
373	0.45
374	0.4
375	0.37
376	0.34
377	0.26
378	0.27
379	0.29
380	0.3
381	0.27
382	0.23
383	0.2
384	0.19
385	0.21
386	0.2
387	0.17
388	0.18
389	0.19
390	0.19
391	0.22
392	0.2
393	0.18
394	0.17
395	0.16
396	0.17
397	0.14
398	0.14
399	0.11
400	0.1
401	0.1
402	0.1
403	0.12
404	0.09
405	0.1
406	0.1
407	0.11
408	0.11
409	0.12
410	0.14
411	0.12
412	0.13
413	0.12
414	0.12
415	0.14
416	0.15
417	0.15
418	0.15
419	0.16
420	0.17
421	0.18
422	0.18
423	0.23
424	0.25
425	0.27
426	0.29
427	0.32
428	0.3
429	0.28
430	0.36
431	0.3
432	0.32
433	0.36
434	0.41
435	0.4
436	0.44
437	0.48
438	0.42
439	0.43
440	0.39
441	0.38
442	0.3
443	0.28
444	0.3
445	0.27
446	0.26
447	0.26
448	0.3
449	0.31
450	0.34

A0A4S8MHN3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer