FuNGI

A0A4S8LFQ4

Protein Details

Accession

A0A4S8LFQ4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
94-117	SGSNERKTKKGWRNASRRMANPFI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 12, nucl 11, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II

Amino Acid Sequences

MSRRMMVGNKREGVRICRNTRDLPWRQAINLQWTFPYIESAGAEVWTTARAFRQLRTPSDLSILPPSSGSSTAQSLPSMEKKPTNALRCPQMLSGSNERKTKKGWRNASRRMANPFIDQEAYEDDDDQLELAEDDQWGRDGGSHDNEEDVEDLPSWADGSGVSWEDEDMLDTTRLDFEAFADHLAQRYTAPSVTDPKSRILIDDQLDEPALRAALMTEETVQSFWRIRCQPGTETNLVVDIMQHEIARRNIVSNPDRSDVSALPCSIPSSSLPTSPAAQAIELIRTFAQSPTSAVSEVSDSVARVLGVNSLPEMWRKAIDTTVLDPDEAQENPLLGLERFDNLVPALLASCAPEVAHSTCKSFDTSSATRSDEDQNFQPESAVQEVPRVLSAFLAPNVAGSVYLEANLGTSPQTTDIVHFLRQHDNVVVTSRLLRHEDVGKTQRLVWIEPVSKLEIAQLLRSVPHAIAPLSWVRVTRGMYSGDVALVLRRETSSSLRRIVLLLIPRLPPLPRSPTPPPRPAHPNHPLIMEGQPSTNRSSHQEIHSPVSLGRRKRTFEKHDQRLFTTREFPHYRQITHKCYEHRGTDVVMDQSTRRLFRASGHPVLDKVHLPVCDDWCFFVEERVEVIHALPLSIHQVLHPGLSEQSFLKSGTIVQVDTNTCLVQLTDYVDFREDDTSLEVKKVNIRKILRTGDAVIVEAGEMKGRYGFVLTSWGDEIEVGETGDRVGQYRGYTGFVIDVFPPRPSYTTLDIKIPNLLITVRIRHDDVHDTCANRPLQEALPLGPHQRHFVQSTWGLSLAPNIDVRPVDRHTGHEIGPQDLLLRQPEEPWIGVSVAIVKGPLKHEGIIKKVERNHHVSSGLKVMVELNFASAEHGVSPRFTYDYAWLRDPLTGLPLHIRYPLRGRQKYWEPLERVKAVSVPNPKLRSLQNTSVSHSQPTLPTPAWNGGEFLDPFQTSGEGPSTASSFSPPTHWAMDHRLDGKQFFARWQPKEGLGMPKVAAKPECKFGRVSLSDGGETWFVPPDEISDIELSIKPTTNKSPLLVVRGEHTGKHLRQIFCKYVDGEDEPVITAAVYGSWGTSAESQIEPYVEREVQRGNQCSTESS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.61
3	0.59
4	0.62
5	0.66
6	0.66
7	0.7
8	0.72
9	0.69
10	0.68
11	0.69
12	0.63
13	0.59
14	0.6
15	0.57
16	0.57
17	0.52
18	0.44
19	0.37
20	0.36
21	0.36
22	0.3
23	0.28
24	0.18
25	0.17
26	0.16
27	0.16
28	0.15
29	0.13
30	0.13
31	0.1
32	0.1
33	0.1
34	0.1
35	0.09
36	0.11
37	0.19
38	0.21
39	0.23
40	0.32
41	0.37
42	0.42
43	0.49
44	0.49
45	0.43
46	0.45
47	0.44
48	0.37
49	0.38
50	0.34
51	0.26
52	0.25
53	0.24
54	0.22
55	0.23
56	0.21
57	0.16
58	0.18
59	0.2
60	0.21
61	0.2
62	0.2
63	0.24
64	0.3
65	0.3
66	0.32
67	0.34
68	0.35
69	0.44
70	0.52
71	0.53
72	0.54
73	0.57
74	0.6
75	0.59
76	0.59
77	0.52
78	0.49
79	0.46
80	0.45
81	0.49
82	0.5
83	0.53
84	0.57
85	0.57
86	0.54
87	0.56
88	0.6
89	0.6
90	0.61
91	0.66
92	0.7
93	0.79
94	0.86
95	0.91
96	0.88
97	0.83
98	0.8
99	0.76
100	0.68
101	0.63
102	0.55
103	0.48
104	0.41
105	0.35
106	0.29
107	0.26
108	0.26
109	0.21
110	0.19
111	0.15
112	0.15
113	0.14
114	0.12
115	0.09
116	0.07
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.06
121	0.07
122	0.07
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.1
127	0.11
128	0.15
129	0.2
130	0.21
131	0.21
132	0.22
133	0.22
134	0.2
135	0.19
136	0.15
137	0.11
138	0.1
139	0.1
140	0.09
141	0.09
142	0.08
143	0.07
144	0.06
145	0.05
146	0.06
147	0.08
148	0.09
149	0.09
150	0.09
151	0.09
152	0.1
153	0.1
154	0.1
155	0.08
156	0.09
157	0.1
158	0.1
159	0.11
160	0.11
161	0.11
162	0.1
163	0.09
164	0.08
165	0.11
166	0.11
167	0.11
168	0.12
169	0.13
170	0.14
171	0.14
172	0.14
173	0.1
174	0.12
175	0.13
176	0.12
177	0.13
178	0.15
179	0.22
180	0.25
181	0.31
182	0.31
183	0.32
184	0.35
185	0.33
186	0.32
187	0.29
188	0.32
189	0.28
190	0.3
191	0.28
192	0.25
193	0.25
194	0.22
195	0.19
196	0.13
197	0.11
198	0.07
199	0.06
200	0.05
201	0.06
202	0.07
203	0.07
204	0.08
205	0.08
206	0.09
207	0.1
208	0.1
209	0.11
210	0.15
211	0.15
212	0.22
213	0.25
214	0.28
215	0.33
216	0.37
217	0.4
218	0.43
219	0.49
220	0.43
221	0.4
222	0.37
223	0.32
224	0.28
225	0.23
226	0.16
227	0.1
228	0.09
229	0.09
230	0.09
231	0.1
232	0.14
233	0.15
234	0.18
235	0.17
236	0.17
237	0.19
238	0.28
239	0.31
240	0.32
241	0.36
242	0.35
243	0.35
244	0.34
245	0.35
246	0.28
247	0.28
248	0.26
249	0.22
250	0.2
251	0.2
252	0.2
253	0.17
254	0.16
255	0.13
256	0.16
257	0.17
258	0.17
259	0.19
260	0.19
261	0.21
262	0.2
263	0.21
264	0.15
265	0.14
266	0.14
267	0.13
268	0.15
269	0.13
270	0.13
271	0.11
272	0.12
273	0.13
274	0.11
275	0.12
276	0.1
277	0.11
278	0.12
279	0.13
280	0.13
281	0.12
282	0.12
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.1
287	0.08
288	0.09
289	0.09
290	0.08
291	0.08
292	0.07
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.09
299	0.1
300	0.12
301	0.11
302	0.12
303	0.13
304	0.14
305	0.14
306	0.16
307	0.17
308	0.17
309	0.21
310	0.2
311	0.19
312	0.17
313	0.17
314	0.17
315	0.15
316	0.13
317	0.09
318	0.09
319	0.09
320	0.1
321	0.09
322	0.07
323	0.08
324	0.08
325	0.08
326	0.09
327	0.09
328	0.08
329	0.07
330	0.08
331	0.07
332	0.06
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.08
342	0.1
343	0.14
344	0.14
345	0.16
346	0.17
347	0.18
348	0.2
349	0.18
350	0.18
351	0.21
352	0.22
353	0.23
354	0.25
355	0.25
356	0.24
357	0.26
358	0.31
359	0.26
360	0.27
361	0.28
362	0.29
363	0.28
364	0.28
365	0.25
366	0.18
367	0.18
368	0.18
369	0.15
370	0.11
371	0.13
372	0.13
373	0.13
374	0.13
375	0.12
376	0.09
377	0.08
378	0.09
379	0.09
380	0.09
381	0.09
382	0.08
383	0.07
384	0.08
385	0.07
386	0.06
387	0.04
388	0.06
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.04
397	0.05
398	0.05
399	0.06
400	0.07
401	0.07
402	0.08
403	0.12
404	0.13
405	0.16
406	0.18
407	0.19
408	0.23
409	0.23
410	0.24
411	0.21
412	0.2
413	0.18
414	0.18
415	0.16
416	0.11
417	0.13
418	0.13
419	0.14
420	0.15
421	0.15
422	0.15
423	0.2
424	0.21
425	0.25
426	0.29
427	0.28
428	0.27
429	0.28
430	0.28
431	0.24
432	0.23
433	0.2
434	0.21
435	0.21
436	0.21
437	0.22
438	0.2
439	0.19
440	0.18
441	0.16
442	0.13
443	0.12
444	0.11
445	0.11
446	0.1
447	0.1
448	0.11
449	0.11
450	0.07
451	0.08
452	0.09
453	0.08
454	0.08
455	0.09
456	0.1
457	0.1
458	0.11
459	0.1
460	0.1
461	0.13
462	0.14
463	0.14
464	0.15
465	0.15
466	0.15
467	0.15
468	0.14
469	0.1
470	0.09
471	0.08
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.05
476	0.05
477	0.06
478	0.08
479	0.13
480	0.18
481	0.2
482	0.23
483	0.23
484	0.23
485	0.23
486	0.22
487	0.2
488	0.18
489	0.16
490	0.16
491	0.16
492	0.16
493	0.16
494	0.16
495	0.14
496	0.15
497	0.21
498	0.2
499	0.27
500	0.34
501	0.44
502	0.5
503	0.56
504	0.54
505	0.52
506	0.58
507	0.54
508	0.55
509	0.52
510	0.5
511	0.43
512	0.42
513	0.37
514	0.31
515	0.3
516	0.22
517	0.15
518	0.12
519	0.12
520	0.13
521	0.15
522	0.14
523	0.13
524	0.16
525	0.2
526	0.23
527	0.24
528	0.28
529	0.27
530	0.29
531	0.29
532	0.26
533	0.23
534	0.27
535	0.29
536	0.26
537	0.3
538	0.31
539	0.33
540	0.4
541	0.48
542	0.48
543	0.55
544	0.63
545	0.67
546	0.7
547	0.69
548	0.65
549	0.62
550	0.56
551	0.46
552	0.43
553	0.34
554	0.35
555	0.38
556	0.37
557	0.4
558	0.4
559	0.39
560	0.4
561	0.47
562	0.45
563	0.44
564	0.47
565	0.41
566	0.44
567	0.47
568	0.4
569	0.35
570	0.3
571	0.26
572	0.23
573	0.22
574	0.17
575	0.13
576	0.12
577	0.1
578	0.13
579	0.14
580	0.13
581	0.12
582	0.12
583	0.12
584	0.15
585	0.24
586	0.27
587	0.3
588	0.31
589	0.31
590	0.3
591	0.32
592	0.3
593	0.21
594	0.16
595	0.15
596	0.13
597	0.15
598	0.16
599	0.17
600	0.18
601	0.17
602	0.17
603	0.15
604	0.16
605	0.14
606	0.14
607	0.12
608	0.1
609	0.1
610	0.1
611	0.09
612	0.08
613	0.08
614	0.07
615	0.06
616	0.06
617	0.05
618	0.05
619	0.07
620	0.08
621	0.08
622	0.06
623	0.08
624	0.09
625	0.09
626	0.09
627	0.07
628	0.08
629	0.08
630	0.09
631	0.07
632	0.08
633	0.09
634	0.09
635	0.09
636	0.08
637	0.08
638	0.1
639	0.1
640	0.09
641	0.09
642	0.12
643	0.12
644	0.13
645	0.13
646	0.1
647	0.09
648	0.09
649	0.08
650	0.06
651	0.06
652	0.07
653	0.08
654	0.09
655	0.09
656	0.1
657	0.11
658	0.11
659	0.11
660	0.09
661	0.08
662	0.11
663	0.12
664	0.11
665	0.12
666	0.12
667	0.12
668	0.18
669	0.23
670	0.25
671	0.31
672	0.33
673	0.36
674	0.43
675	0.46
676	0.41
677	0.38
678	0.35
679	0.3
680	0.28
681	0.24
682	0.16
683	0.12
684	0.1
685	0.09
686	0.07
687	0.05
688	0.05
689	0.05
690	0.05
691	0.05
692	0.06
693	0.06
694	0.06
695	0.05
696	0.11
697	0.11
698	0.11
699	0.12
700	0.11
701	0.11
702	0.11
703	0.11
704	0.06
705	0.06
706	0.05
707	0.04
708	0.04
709	0.05
710	0.06
711	0.05
712	0.06
713	0.06
714	0.08
715	0.08
716	0.1
717	0.11
718	0.12
719	0.12
720	0.11
721	0.11
722	0.1
723	0.11
724	0.1
725	0.12
726	0.12
727	0.12
728	0.14
729	0.13
730	0.15
731	0.17
732	0.2
733	0.23
734	0.29
735	0.29
736	0.33
737	0.34
738	0.33
739	0.32
740	0.27
741	0.21
742	0.16
743	0.14
744	0.12
745	0.13
746	0.16
747	0.16
748	0.17
749	0.18
750	0.18
751	0.21
752	0.26
753	0.25
754	0.29
755	0.3
756	0.3
757	0.3
758	0.36
759	0.33
760	0.25
761	0.24
762	0.21
763	0.19
764	0.21
765	0.21
766	0.16
767	0.19
768	0.2
769	0.22
770	0.21
771	0.21
772	0.21
773	0.22
774	0.24
775	0.23
776	0.23
777	0.26
778	0.25
779	0.26
780	0.24
781	0.22
782	0.2
783	0.17
784	0.18
785	0.13
786	0.12
787	0.11
788	0.1
789	0.11
790	0.12
791	0.13
792	0.16
793	0.17
794	0.2
795	0.2
796	0.24
797	0.28
798	0.3
799	0.29
800	0.29
801	0.28
802	0.25
803	0.24
804	0.21
805	0.16
806	0.14
807	0.15
808	0.12
809	0.13
810	0.11
811	0.12
812	0.14
813	0.15
814	0.15
815	0.14
816	0.13
817	0.12
818	0.12
819	0.11
820	0.11
821	0.1
822	0.09
823	0.09
824	0.08
825	0.1
826	0.12
827	0.16
828	0.14
829	0.16
830	0.22
831	0.26
832	0.29
833	0.35
834	0.36
835	0.39
836	0.43
837	0.49
838	0.49
839	0.51
840	0.51
841	0.47
842	0.47
843	0.43
844	0.4
845	0.38
846	0.33
847	0.25
848	0.22
849	0.19
850	0.16
851	0.16
852	0.13
853	0.09
854	0.09
855	0.09
856	0.1
857	0.08
858	0.08
859	0.08
860	0.09
861	0.09
862	0.09
863	0.1
864	0.1
865	0.11
866	0.12
867	0.12
868	0.18
869	0.25
870	0.28
871	0.3
872	0.3
873	0.29
874	0.3
875	0.29
876	0.23
877	0.18
878	0.15
879	0.13
880	0.17
881	0.18
882	0.18
883	0.23
884	0.23
885	0.23
886	0.3
887	0.38
888	0.43
889	0.47
890	0.49
891	0.53
892	0.61
893	0.67
894	0.68
895	0.69
896	0.64
897	0.66
898	0.7
899	0.64
900	0.56
901	0.48
902	0.44
903	0.37
904	0.38
905	0.4
906	0.39
907	0.44
908	0.46
909	0.46
910	0.47
911	0.49
912	0.5
913	0.49
914	0.51
915	0.52
916	0.51
917	0.55
918	0.58
919	0.55
920	0.48
921	0.41
922	0.35
923	0.29
924	0.29
925	0.29
926	0.22
927	0.23
928	0.24
929	0.29
930	0.28
931	0.27
932	0.25
933	0.21
934	0.25
935	0.23
936	0.21
937	0.19
938	0.17
939	0.16
940	0.16
941	0.16
942	0.11
943	0.13
944	0.13
945	0.1
946	0.11
947	0.12
948	0.12
949	0.12
950	0.12
951	0.12
952	0.12
953	0.13
954	0.16
955	0.17
956	0.19
957	0.22
958	0.23
959	0.25
960	0.3
961	0.34
962	0.37
963	0.37
964	0.37
965	0.36
966	0.36
967	0.36
968	0.34
969	0.29
970	0.28
971	0.35
972	0.41
973	0.42
974	0.47
975	0.46
976	0.43
977	0.48
978	0.48
979	0.47
980	0.4
981	0.4
982	0.35
983	0.37
984	0.36
985	0.36
986	0.35
987	0.31
988	0.32
989	0.39
990	0.42
991	0.38
992	0.38
993	0.37
994	0.43
995	0.4
996	0.41
997	0.36
998	0.35
999	0.34
1000	0.33
1001	0.32
1002	0.22
1003	0.2
1004	0.17
1005	0.15
1006	0.13
1007	0.13
1008	0.12
1009	0.13
1010	0.15
1011	0.16
1012	0.17
1013	0.14
1014	0.14
1015	0.16
1016	0.18
1017	0.18
1018	0.17
1019	0.2
1020	0.2
1021	0.24
1022	0.3
1023	0.34
1024	0.35
1025	0.34
1026	0.41
1027	0.41
1028	0.44
1029	0.41
1030	0.36
1031	0.33
1032	0.37
1033	0.37
1034	0.29
1035	0.31
1036	0.35
1037	0.34
1038	0.43
1039	0.47
1040	0.44
1041	0.51
1042	0.58
1043	0.59
1044	0.53
1045	0.56
1046	0.49
1047	0.44
1048	0.45
1049	0.4
1050	0.35
1051	0.3
1052	0.27
1053	0.23
1054	0.22
1055	0.19
1056	0.13
1057	0.1
1058	0.07
1059	0.06
1060	0.06
1061	0.05
1062	0.05
1063	0.06
1064	0.06
1065	0.08
1066	0.1
1067	0.11
1068	0.13
1069	0.14
1070	0.15
1071	0.16
1072	0.17
1073	0.17
1074	0.16
1075	0.21
1076	0.2
1077	0.21
1078	0.23
1079	0.27
1080	0.33
1081	0.41
1082	0.45
1083	0.42
1084	0.43

A0A4S8LFQ4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer