Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S8LYL1

Protein Details
Accession A0A4S8LYL1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
182-202QSPHKKKGPKGPNPLSVKKKKBasic
249-277GQTQSERAGPKRKRRRRGKKLAEVAEESMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-219HKKKGPKGPNPLSVKKKKATQPDPPAKDKDKGSKK
255-268RAGPKRKRRRRGKK
Subcellular Location(s) mito 20.5, mito_nucl 13.5, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRQKRAKTYKKLMALYSMSFGFRQPYQVLVDSEICKEVTEHKLEFVKQLGSVLQGEVKPMITQCCIHELYLQQRSNEAAVELAKTFERRKCNHREAIPGDECLKHVVGDTNKHRYVIASQNQPLRTKFRAIPAVPLIHINRSVMVLEPPSDATIRAKNTAEEQSLHSSSLDKAVVSPLTTAQSPHKKKGPKGPNPLSVKKKKATQPDPPAKDKDKGSKKAEIQNSVPSADLKRRRTEDDDAISGDEGIGQTQSERAGPKRKRRRRGKKLAEVAEESM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.54
3 0.46
4 0.38
5 0.3
6 0.26
7 0.24
8 0.2
9 0.17
10 0.2
11 0.18
12 0.19
13 0.22
14 0.25
15 0.26
16 0.26
17 0.29
18 0.27
19 0.27
20 0.26
21 0.22
22 0.19
23 0.18
24 0.21
25 0.22
26 0.25
27 0.25
28 0.27
29 0.32
30 0.32
31 0.34
32 0.3
33 0.26
34 0.21
35 0.22
36 0.18
37 0.15
38 0.15
39 0.14
40 0.14
41 0.13
42 0.14
43 0.13
44 0.13
45 0.12
46 0.12
47 0.14
48 0.12
49 0.14
50 0.14
51 0.19
52 0.19
53 0.19
54 0.2
55 0.22
56 0.28
57 0.36
58 0.37
59 0.32
60 0.32
61 0.32
62 0.3
63 0.27
64 0.19
65 0.11
66 0.09
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.12
72 0.16
73 0.2
74 0.27
75 0.3
76 0.38
77 0.47
78 0.55
79 0.6
80 0.6
81 0.63
82 0.59
83 0.64
84 0.57
85 0.49
86 0.42
87 0.35
88 0.32
89 0.25
90 0.21
91 0.12
92 0.11
93 0.14
94 0.15
95 0.22
96 0.27
97 0.33
98 0.33
99 0.34
100 0.33
101 0.29
102 0.31
103 0.32
104 0.33
105 0.31
106 0.34
107 0.39
108 0.41
109 0.43
110 0.4
111 0.37
112 0.32
113 0.3
114 0.29
115 0.3
116 0.35
117 0.33
118 0.35
119 0.33
120 0.32
121 0.28
122 0.28
123 0.23
124 0.17
125 0.17
126 0.13
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.13
141 0.13
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.19
146 0.22
147 0.21
148 0.18
149 0.2
150 0.22
151 0.22
152 0.22
153 0.19
154 0.16
155 0.15
156 0.17
157 0.14
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.08
165 0.1
166 0.1
167 0.11
168 0.17
169 0.27
170 0.31
171 0.36
172 0.41
173 0.46
174 0.51
175 0.61
176 0.64
177 0.64
178 0.71
179 0.73
180 0.76
181 0.78
182 0.81
183 0.81
184 0.78
185 0.75
186 0.69
187 0.69
188 0.67
189 0.7
190 0.69
191 0.7
192 0.72
193 0.76
194 0.78
195 0.75
196 0.76
197 0.69
198 0.67
199 0.62
200 0.61
201 0.6
202 0.63
203 0.62
204 0.64
205 0.66
206 0.69
207 0.71
208 0.66
209 0.59
210 0.58
211 0.54
212 0.46
213 0.41
214 0.34
215 0.3
216 0.33
217 0.39
218 0.37
219 0.43
220 0.47
221 0.52
222 0.56
223 0.6
224 0.59
225 0.56
226 0.54
227 0.47
228 0.44
229 0.38
230 0.32
231 0.24
232 0.17
233 0.1
234 0.08
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.1
241 0.14
242 0.2
243 0.31
244 0.4
245 0.51
246 0.62
247 0.71
248 0.8
249 0.87
250 0.92
251 0.93
252 0.95
253 0.96
254 0.95
255 0.95
256 0.94
257 0.89