Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S8KVR6

Protein Details
Accession A0A4S8KVR6    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-57RTESNPAKPPPSKKRKKSRAQNGFHTKTSHydrophilic
254-280AKGRCEARKGLSKKKKRNPLETWMKIWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-47AKPPPSKKRKKSR
261-270RKGLSKKKKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MRTVVSYDDITLPYEATTNINEEVAKLNRTESNPAKPPPSKKRKKSRAQNGFHTKTSSSAATPDEDSEEYLQVEESRELTHEEVWDDSALIEAWNAATEEYEAYNGPDKGWKDEPIHKSPLWYNFPATKKQKTSHDTSSTMKAPTSSAFNEDAYAHDVQDDENSQPVDFNTFVPSHNPGLDLPVLEEPPAIPGPDFSAFYSRSLAESGGPMVSQDEAFSRALGAMYWGGYWTAVYHVSINFVICSHHSYLSISAKGRCEARKGLSKKKKRNPLETWMKIWMRVMRTMRHTLTKLHPLETLCPLNGESETRMCASRTLHEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.12
4 0.13
5 0.14
6 0.14
7 0.15
8 0.14
9 0.14
10 0.2
11 0.21
12 0.21
13 0.19
14 0.21
15 0.25
16 0.28
17 0.36
18 0.36
19 0.42
20 0.48
21 0.51
22 0.57
23 0.58
24 0.66
25 0.69
26 0.74
27 0.76
28 0.79
29 0.87
30 0.89
31 0.93
32 0.94
33 0.94
34 0.94
35 0.91
36 0.92
37 0.91
38 0.86
39 0.77
40 0.69
41 0.58
42 0.5
43 0.44
44 0.35
45 0.24
46 0.22
47 0.21
48 0.19
49 0.2
50 0.18
51 0.18
52 0.17
53 0.18
54 0.17
55 0.16
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.1
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.1
65 0.12
66 0.12
67 0.13
68 0.12
69 0.13
70 0.12
71 0.13
72 0.12
73 0.1
74 0.09
75 0.08
76 0.07
77 0.06
78 0.05
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.15
95 0.16
96 0.2
97 0.23
98 0.26
99 0.27
100 0.35
101 0.41
102 0.43
103 0.47
104 0.42
105 0.42
106 0.42
107 0.45
108 0.41
109 0.36
110 0.34
111 0.35
112 0.38
113 0.44
114 0.46
115 0.45
116 0.45
117 0.48
118 0.54
119 0.52
120 0.56
121 0.55
122 0.55
123 0.52
124 0.49
125 0.49
126 0.42
127 0.38
128 0.32
129 0.24
130 0.19
131 0.16
132 0.17
133 0.13
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.13
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.06
149 0.07
150 0.08
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.12
161 0.15
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.11
166 0.13
167 0.13
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.06
175 0.08
176 0.09
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.09
181 0.1
182 0.11
183 0.1
184 0.13
185 0.14
186 0.15
187 0.16
188 0.14
189 0.13
190 0.13
191 0.13
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.09
229 0.1
230 0.09
231 0.13
232 0.13
233 0.14
234 0.14
235 0.16
236 0.2
237 0.24
238 0.27
239 0.26
240 0.27
241 0.28
242 0.3
243 0.35
244 0.32
245 0.33
246 0.34
247 0.39
248 0.45
249 0.5
250 0.59
251 0.64
252 0.72
253 0.78
254 0.83
255 0.87
256 0.86
257 0.9
258 0.86
259 0.86
260 0.87
261 0.81
262 0.76
263 0.74
264 0.66
265 0.56
266 0.53
267 0.48
268 0.4
269 0.42
270 0.42
271 0.4
272 0.45
273 0.52
274 0.51
275 0.53
276 0.51
277 0.5
278 0.53
279 0.56
280 0.52
281 0.47
282 0.46
283 0.41
284 0.44
285 0.44
286 0.4
287 0.31
288 0.3
289 0.28
290 0.26
291 0.25
292 0.24
293 0.2
294 0.18
295 0.2
296 0.21
297 0.22
298 0.21
299 0.23
300 0.23