Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S8MVT6

Protein Details
Accession A0A4S8MVT6    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MASNNRQSKQPRKGAQDNSRRTPAWHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.333, mito 6.5, cyto_mito 6.332
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MASNNRQSKQPRKGAQDNSRRTPAWSSGARSSPTFSPTSSSPRPSNSGPTHSSSPLSNGTRSDASNTLGALNGLIGVTVTISTKTSQRFEGVVASTNAEGDTTGVTLRDVKDISNPGAPLKDQYFIAATNIENWQSGPADAKLTNGDTFHTDTEISQKKLGGQVRELQAWQAPSDAPLPAMSPFAKGDEVTFGSSSGNIPWDQFDANEKMFGIEATFDEDLYTTKLDRNAPDYKEKERKAQKMANEILNSSSNNPHIAEERNQAIDDSGINEEDKYGAVVRGANAYVPPGARKAATAATGTSAGTSSKTDVPKVSVNGPDGTSVPQSQSPASSSKAPSPAPAANKPPADPVPAFRDFVTNEKQRLTQKRQALVKSDMDKRMAELVKFSQSFKLNKPIPDDLVSILAKDEEKQKLIREKSTKDATSTNARSIGQVVSPGGIPPRAPQITQAKVVEAARKPSVPSSSSSGNKTTTAAAATPSAAGVTAKASAATSATKAEGAKKPAMFIQAIPPFKGGKSKVGAASSTVASAGLPNGSVSSAAVSPAVKSASPSGAANANANINNRLNVNASSFRPNPRASAFTPGATSPNPSTSGQSIASASASPKPKDPVSASPNAFFGTRLIKKVPPVNIKDDFSPLKTNKVSDPTGVSHMWPYSGKRYMMMFPLPQHPPTQPSSHMVPPVPPPMPPPSYDEDAAAQAAARGYMYYPPYGYPGQPMMPGMPPPGPPGAFIPSPYMQPMPYPPGMPPNAMYAPPNMGQMPPQSYMPPPPPPGSYPPPPNGAGPRPSMPPTPIPAPAHPYYHQSPQLQHAVPYPMMMPPPPNAVPHPNPYEGGPAPVQMGGHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.87
3 0.87
4 0.86
5 0.84
6 0.82
7 0.73
8 0.66
9 0.61
10 0.56
11 0.53
12 0.5
13 0.47
14 0.48
15 0.52
16 0.52
17 0.47
18 0.46
19 0.41
20 0.39
21 0.35
22 0.28
23 0.27
24 0.29
25 0.36
26 0.39
27 0.42
28 0.43
29 0.46
30 0.51
31 0.5
32 0.56
33 0.53
34 0.54
35 0.52
36 0.53
37 0.53
38 0.5
39 0.48
40 0.39
41 0.37
42 0.38
43 0.37
44 0.33
45 0.3
46 0.33
47 0.34
48 0.34
49 0.34
50 0.27
51 0.26
52 0.25
53 0.24
54 0.2
55 0.17
56 0.16
57 0.12
58 0.09
59 0.08
60 0.06
61 0.05
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.05
67 0.06
68 0.07
69 0.09
70 0.14
71 0.19
72 0.21
73 0.23
74 0.25
75 0.25
76 0.26
77 0.3
78 0.27
79 0.26
80 0.25
81 0.24
82 0.21
83 0.2
84 0.19
85 0.13
86 0.11
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.11
94 0.12
95 0.15
96 0.15
97 0.15
98 0.21
99 0.25
100 0.27
101 0.28
102 0.27
103 0.25
104 0.27
105 0.27
106 0.25
107 0.23
108 0.22
109 0.18
110 0.19
111 0.19
112 0.17
113 0.18
114 0.15
115 0.14
116 0.14
117 0.16
118 0.15
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.14
124 0.14
125 0.13
126 0.16
127 0.15
128 0.17
129 0.17
130 0.18
131 0.19
132 0.17
133 0.17
134 0.16
135 0.19
136 0.18
137 0.17
138 0.15
139 0.14
140 0.23
141 0.28
142 0.27
143 0.26
144 0.27
145 0.28
146 0.34
147 0.38
148 0.33
149 0.3
150 0.35
151 0.37
152 0.39
153 0.37
154 0.31
155 0.29
156 0.27
157 0.23
158 0.17
159 0.14
160 0.13
161 0.14
162 0.13
163 0.11
164 0.1
165 0.11
166 0.1
167 0.12
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.14
176 0.15
177 0.15
178 0.15
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.1
184 0.11
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.12
189 0.11
190 0.12
191 0.15
192 0.17
193 0.18
194 0.18
195 0.17
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.1
200 0.07
201 0.07
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.11
210 0.08
211 0.11
212 0.15
213 0.18
214 0.19
215 0.25
216 0.3
217 0.33
218 0.41
219 0.42
220 0.48
221 0.54
222 0.55
223 0.59
224 0.61
225 0.65
226 0.65
227 0.66
228 0.62
229 0.62
230 0.64
231 0.61
232 0.52
233 0.46
234 0.39
235 0.36
236 0.32
237 0.24
238 0.22
239 0.17
240 0.17
241 0.17
242 0.16
243 0.17
244 0.2
245 0.21
246 0.23
247 0.24
248 0.24
249 0.23
250 0.22
251 0.19
252 0.16
253 0.12
254 0.11
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.09
279 0.1
280 0.11
281 0.12
282 0.13
283 0.13
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.1
289 0.09
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.09
294 0.13
295 0.15
296 0.16
297 0.17
298 0.19
299 0.22
300 0.23
301 0.25
302 0.23
303 0.23
304 0.23
305 0.23
306 0.21
307 0.18
308 0.18
309 0.15
310 0.13
311 0.12
312 0.12
313 0.13
314 0.12
315 0.12
316 0.13
317 0.14
318 0.15
319 0.18
320 0.18
321 0.21
322 0.25
323 0.24
324 0.23
325 0.26
326 0.28
327 0.28
328 0.31
329 0.32
330 0.32
331 0.33
332 0.32
333 0.32
334 0.29
335 0.28
336 0.24
337 0.22
338 0.24
339 0.25
340 0.25
341 0.21
342 0.23
343 0.2
344 0.24
345 0.28
346 0.25
347 0.25
348 0.26
349 0.29
350 0.34
351 0.42
352 0.47
353 0.46
354 0.49
355 0.54
356 0.58
357 0.57
358 0.55
359 0.5
360 0.48
361 0.46
362 0.46
363 0.42
364 0.38
365 0.35
366 0.31
367 0.33
368 0.29
369 0.23
370 0.19
371 0.18
372 0.22
373 0.22
374 0.22
375 0.2
376 0.23
377 0.26
378 0.27
379 0.34
380 0.33
381 0.34
382 0.38
383 0.35
384 0.33
385 0.33
386 0.31
387 0.22
388 0.22
389 0.19
390 0.15
391 0.13
392 0.11
393 0.09
394 0.09
395 0.14
396 0.12
397 0.14
398 0.15
399 0.19
400 0.26
401 0.29
402 0.35
403 0.35
404 0.36
405 0.41
406 0.46
407 0.43
408 0.37
409 0.36
410 0.32
411 0.35
412 0.34
413 0.29
414 0.25
415 0.25
416 0.23
417 0.23
418 0.2
419 0.12
420 0.11
421 0.09
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.12
430 0.13
431 0.13
432 0.18
433 0.24
434 0.26
435 0.3
436 0.29
437 0.23
438 0.25
439 0.26
440 0.27
441 0.21
442 0.22
443 0.19
444 0.2
445 0.2
446 0.2
447 0.21
448 0.17
449 0.18
450 0.18
451 0.23
452 0.25
453 0.26
454 0.26
455 0.25
456 0.24
457 0.23
458 0.2
459 0.15
460 0.13
461 0.11
462 0.1
463 0.09
464 0.08
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.05
469 0.05
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.07
482 0.08
483 0.09
484 0.14
485 0.17
486 0.21
487 0.24
488 0.23
489 0.24
490 0.24
491 0.26
492 0.21
493 0.18
494 0.22
495 0.25
496 0.25
497 0.25
498 0.25
499 0.23
500 0.23
501 0.28
502 0.21
503 0.2
504 0.22
505 0.24
506 0.26
507 0.27
508 0.26
509 0.22
510 0.23
511 0.17
512 0.15
513 0.12
514 0.09
515 0.07
516 0.07
517 0.06
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.04
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.08
532 0.08
533 0.07
534 0.08
535 0.09
536 0.1
537 0.11
538 0.11
539 0.11
540 0.13
541 0.14
542 0.14
543 0.13
544 0.14
545 0.15
546 0.16
547 0.18
548 0.16
549 0.16
550 0.16
551 0.16
552 0.15
553 0.14
554 0.17
555 0.17
556 0.19
557 0.24
558 0.26
559 0.29
560 0.32
561 0.32
562 0.32
563 0.31
564 0.33
565 0.28
566 0.34
567 0.31
568 0.27
569 0.27
570 0.25
571 0.24
572 0.2
573 0.22
574 0.15
575 0.16
576 0.18
577 0.18
578 0.2
579 0.18
580 0.21
581 0.19
582 0.18
583 0.17
584 0.14
585 0.14
586 0.12
587 0.12
588 0.15
589 0.19
590 0.19
591 0.22
592 0.25
593 0.26
594 0.3
595 0.33
596 0.36
597 0.38
598 0.45
599 0.44
600 0.41
601 0.41
602 0.37
603 0.33
604 0.24
605 0.19
606 0.2
607 0.21
608 0.22
609 0.25
610 0.26
611 0.31
612 0.36
613 0.43
614 0.43
615 0.45
616 0.49
617 0.51
618 0.51
619 0.47
620 0.47
621 0.41
622 0.35
623 0.39
624 0.33
625 0.35
626 0.35
627 0.35
628 0.34
629 0.38
630 0.36
631 0.3
632 0.33
633 0.28
634 0.31
635 0.3
636 0.26
637 0.22
638 0.21
639 0.21
640 0.19
641 0.2
642 0.22
643 0.27
644 0.27
645 0.27
646 0.29
647 0.3
648 0.32
649 0.33
650 0.29
651 0.27
652 0.34
653 0.34
654 0.33
655 0.32
656 0.3
657 0.3
658 0.31
659 0.32
660 0.28
661 0.29
662 0.33
663 0.34
664 0.36
665 0.33
666 0.32
667 0.33
668 0.37
669 0.33
670 0.29
671 0.28
672 0.31
673 0.32
674 0.31
675 0.31
676 0.31
677 0.34
678 0.34
679 0.32
680 0.27
681 0.26
682 0.24
683 0.19
684 0.13
685 0.1
686 0.09
687 0.08
688 0.06
689 0.05
690 0.06
691 0.11
692 0.13
693 0.13
694 0.14
695 0.14
696 0.18
697 0.2
698 0.2
699 0.19
700 0.21
701 0.21
702 0.21
703 0.22
704 0.2
705 0.2
706 0.21
707 0.19
708 0.19
709 0.18
710 0.2
711 0.23
712 0.21
713 0.2
714 0.22
715 0.24
716 0.22
717 0.23
718 0.26
719 0.23
720 0.24
721 0.25
722 0.24
723 0.19
724 0.21
725 0.24
726 0.25
727 0.25
728 0.25
729 0.24
730 0.31
731 0.32
732 0.32
733 0.28
734 0.28
735 0.29
736 0.29
737 0.29
738 0.22
739 0.25
740 0.24
741 0.25
742 0.19
743 0.18
744 0.2
745 0.23
746 0.26
747 0.23
748 0.24
749 0.24
750 0.25
751 0.32
752 0.35
753 0.37
754 0.37
755 0.38
756 0.41
757 0.43
758 0.48
759 0.49
760 0.52
761 0.53
762 0.52
763 0.54
764 0.52
765 0.52
766 0.52
767 0.51
768 0.47
769 0.44
770 0.43
771 0.43
772 0.45
773 0.44
774 0.4
775 0.39
776 0.4
777 0.39
778 0.43
779 0.43
780 0.43
781 0.47
782 0.46
783 0.46
784 0.42
785 0.45
786 0.42
787 0.46
788 0.49
789 0.46
790 0.46
791 0.48
792 0.55
793 0.49
794 0.46
795 0.43
796 0.41
797 0.37
798 0.35
799 0.29
800 0.23
801 0.23
802 0.23
803 0.21
804 0.18
805 0.25
806 0.26
807 0.28
808 0.3
809 0.37
810 0.41
811 0.47
812 0.5
813 0.46
814 0.45
815 0.44
816 0.46
817 0.38
818 0.37
819 0.29
820 0.24
821 0.23
822 0.23