Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S8L9V0

Protein Details
Accession A0A4S8L9V0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-101RSYEDRTRKQPPKPNFDSRFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-243ARKKRKKEG
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 7.5, cyto_nucl 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MAAQSGVPPPTTAAAQPRTVTATTTATTSTTQASGAAGTGTAGGVDTSDLATLNDALGSAGVDLRAEEESLQRTSDHHLTYRSYEDRTRKQPPKPNFDSRFLGATMRTIGDSHKITRIPDDSVNYLALALRARLQELLTSMISAAKHRTDTQFDRPASMYDDGSPMWSILVQKDVAKQLAAIEKVEREEELRIRRERKERADMAAAHAAVLAAQAAGNNAVLSTGDGFDEDGGGARKKRKKEGPGVTARNMSEDVRKKMSNAVASQAAGLGGRYSWMTAANAASANTTPVKKDKPATTASTPAMTSTPIGSSTTMTTTAAATTSTPATTTTPATSGWARPYVATKKASPTAPEPVEDDTRLPITMRDAMFVIRNERGHGGGRGAARGWT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.29
3 0.3
4 0.3
5 0.33
6 0.31
7 0.3
8 0.25
9 0.24
10 0.21
11 0.21
12 0.2
13 0.17
14 0.18
15 0.18
16 0.17
17 0.14
18 0.13
19 0.12
20 0.12
21 0.11
22 0.1
23 0.09
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.05
28 0.05
29 0.04
30 0.04
31 0.04
32 0.04
33 0.04
34 0.04
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.06
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.1
56 0.13
57 0.14
58 0.15
59 0.14
60 0.14
61 0.2
62 0.25
63 0.24
64 0.24
65 0.26
66 0.28
67 0.31
68 0.37
69 0.34
70 0.32
71 0.37
72 0.43
73 0.49
74 0.54
75 0.62
76 0.63
77 0.7
78 0.76
79 0.78
80 0.8
81 0.79
82 0.82
83 0.78
84 0.75
85 0.7
86 0.63
87 0.56
88 0.46
89 0.39
90 0.28
91 0.24
92 0.19
93 0.15
94 0.13
95 0.11
96 0.11
97 0.15
98 0.17
99 0.18
100 0.21
101 0.22
102 0.22
103 0.26
104 0.28
105 0.26
106 0.27
107 0.28
108 0.25
109 0.24
110 0.24
111 0.19
112 0.17
113 0.14
114 0.12
115 0.09
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.1
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.11
124 0.13
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.11
133 0.13
134 0.15
135 0.18
136 0.22
137 0.27
138 0.34
139 0.41
140 0.39
141 0.4
142 0.38
143 0.36
144 0.34
145 0.3
146 0.22
147 0.14
148 0.15
149 0.13
150 0.13
151 0.12
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.12
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.15
167 0.15
168 0.12
169 0.11
170 0.12
171 0.13
172 0.13
173 0.11
174 0.08
175 0.1
176 0.14
177 0.19
178 0.24
179 0.28
180 0.32
181 0.38
182 0.44
183 0.49
184 0.52
185 0.55
186 0.51
187 0.5
188 0.51
189 0.45
190 0.41
191 0.37
192 0.3
193 0.21
194 0.18
195 0.15
196 0.1
197 0.09
198 0.05
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.06
220 0.07
221 0.1
222 0.18
223 0.23
224 0.27
225 0.36
226 0.43
227 0.51
228 0.6
229 0.67
230 0.69
231 0.74
232 0.75
233 0.7
234 0.66
235 0.57
236 0.48
237 0.4
238 0.31
239 0.29
240 0.3
241 0.31
242 0.32
243 0.32
244 0.31
245 0.35
246 0.38
247 0.35
248 0.3
249 0.29
250 0.26
251 0.25
252 0.25
253 0.19
254 0.15
255 0.1
256 0.09
257 0.06
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.09
272 0.1
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.18
277 0.22
278 0.25
279 0.32
280 0.35
281 0.37
282 0.42
283 0.46
284 0.45
285 0.47
286 0.44
287 0.4
288 0.35
289 0.3
290 0.25
291 0.2
292 0.17
293 0.12
294 0.11
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.12
299 0.12
300 0.13
301 0.13
302 0.12
303 0.12
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.09
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.12
315 0.14
316 0.16
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.18
321 0.2
322 0.21
323 0.23
324 0.24
325 0.24
326 0.24
327 0.31
328 0.34
329 0.38
330 0.39
331 0.38
332 0.42
333 0.47
334 0.49
335 0.45
336 0.44
337 0.47
338 0.45
339 0.43
340 0.38
341 0.37
342 0.38
343 0.35
344 0.31
345 0.25
346 0.24
347 0.23
348 0.21
349 0.18
350 0.18
351 0.24
352 0.23
353 0.21
354 0.2
355 0.22
356 0.26
357 0.27
358 0.28
359 0.26
360 0.27
361 0.28
362 0.29
363 0.3
364 0.29
365 0.29
366 0.27
367 0.26
368 0.27
369 0.26