Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S8MSH6

Protein Details
Accession A0A4S8MSH6    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
278-305VPTKGEEEERSRRRRRRNRKRDHSQEVRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
287-299RSRRRRRRNRKRD
Subcellular Location(s) plas 20, cyto 2, E.R. 2, nucl 1, mito 1, vacu 1, mito_nucl 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009617  Seipin  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0140042  P:lipid droplet formation  
GO:0006629  P:lipid metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF06775  Seipin  
Amino Acid Sequences MDPSNPPPEQKQNARFYDAPLNSLRDFVSRSFASLAPHLLPLVFFCLLIPVIINTSLFAGYIVWRNVAVGWEAPLYLQYGDSLTPYARTSLPPLVSRQPYDIILHLEIPTSESNLALGNFMNNVVLVTTSNKTVASVRRSAILLPAESSWFFGTPGVVTVDVPMLSAFVPGTTSLDAEIQIGRKDNWKGLGNGEQREVSIVYASLKGVVAHKGIRGLMTRFPLTLAVLSAATFFAILTLISGACLLPSIMSRSPTGNTSTTEVKATQSLPIEDSKEVVPTKGEEEERSRRRRRRNRKRDHSQEVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.66
3 0.61
4 0.62
5 0.53
6 0.47
7 0.41
8 0.41
9 0.34
10 0.35
11 0.3
12 0.22
13 0.24
14 0.21
15 0.25
16 0.2
17 0.22
18 0.24
19 0.24
20 0.24
21 0.24
22 0.25
23 0.2
24 0.2
25 0.18
26 0.15
27 0.14
28 0.12
29 0.14
30 0.12
31 0.1
32 0.09
33 0.11
34 0.11
35 0.11
36 0.1
37 0.06
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.07
42 0.08
43 0.08
44 0.07
45 0.07
46 0.06
47 0.07
48 0.12
49 0.13
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.13
55 0.12
56 0.08
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.08
70 0.07
71 0.08
72 0.09
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.15
77 0.19
78 0.22
79 0.22
80 0.26
81 0.31
82 0.33
83 0.33
84 0.31
85 0.28
86 0.27
87 0.26
88 0.24
89 0.19
90 0.17
91 0.17
92 0.15
93 0.13
94 0.11
95 0.12
96 0.11
97 0.09
98 0.09
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.12
121 0.16
122 0.18
123 0.2
124 0.2
125 0.21
126 0.22
127 0.21
128 0.21
129 0.18
130 0.14
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.09
169 0.1
170 0.14
171 0.15
172 0.17
173 0.21
174 0.22
175 0.22
176 0.24
177 0.32
178 0.32
179 0.32
180 0.32
181 0.27
182 0.24
183 0.24
184 0.22
185 0.13
186 0.09
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.14
202 0.15
203 0.16
204 0.18
205 0.21
206 0.21
207 0.19
208 0.19
209 0.18
210 0.16
211 0.15
212 0.11
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.1
236 0.12
237 0.14
238 0.15
239 0.17
240 0.19
241 0.21
242 0.23
243 0.21
244 0.21
245 0.23
246 0.26
247 0.25
248 0.26
249 0.25
250 0.23
251 0.23
252 0.22
253 0.22
254 0.22
255 0.22
256 0.21
257 0.24
258 0.25
259 0.22
260 0.23
261 0.2
262 0.22
263 0.21
264 0.2
265 0.18
266 0.17
267 0.2
268 0.24
269 0.26
270 0.26
271 0.33
272 0.43
273 0.51
274 0.6
275 0.67
276 0.7
277 0.79
278 0.86
279 0.9
280 0.91
281 0.92
282 0.94
283 0.95
284 0.97
285 0.97