FuNGI

A0A4S8LHF2

Protein Details

Accession

A0A4S8LHF2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
254-279	KYDPNRKEKGKGKKRKGKEKAHATSD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
257-274	PNRKEKGKGKKRKGKEKA

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 2

Family & Domain DBs

Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2

Amino Acid Sequences

MSETAAASVPPTPRTPPSWSAPHQPLSYFPNGDSDCLVDDSNWVAWEAQIINGATVCKVSGHLDGTSVRPESPGAAQDEWDLKDALLRSWLMKCLKPSLIPQISKLSSCRDIYAHLQATYSTTGSGTLMYWARALLKPMKADNDVHKHCEDFLNALQFIEGTSWVIPQNVASILLLITLYADPADNKSWYTFVEKQNIKTETKVANVVNAIKEALLAHRNSDSSSGSGQGKYFCTICHSYGHDRNYCRQPGGGKYDPNRKEKGKGKKRKGKEKAHATSDGNEESTHVVLEKMLSVSETSSLAYSHFSSSSTDSSEVPDEAFRTTTSSSRLPPVYIDSGATSHIHSIRSDFTSCSSTTGSVSGFGTGTTRIQGRGEWVSHAQHPKGGVSKLKLQDTCFIPDSSPSLISVPRLDDAKCYTIFGNGWCICFEKDDHGQLLKSILSDEKVIFTGSRHGSRQYSLDTPDTDSTYYTHSPPVNKLEALHRRFGHIG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.39
3	0.4
4	0.45
5	0.51
6	0.53
7	0.58
8	0.61
9	0.62
10	0.57
11	0.52
12	0.49
13	0.47
14	0.48
15	0.41
16	0.34
17	0.36
18	0.35
19	0.35
20	0.31
21	0.26
22	0.22
23	0.22
24	0.22
25	0.13
26	0.13
27	0.14
28	0.14
29	0.13
30	0.12
31	0.11
32	0.1
33	0.13
34	0.13
35	0.11
36	0.14
37	0.14
38	0.13
39	0.14
40	0.15
41	0.12
42	0.11
43	0.11
44	0.07
45	0.09
46	0.11
47	0.13
48	0.15
49	0.15
50	0.17
51	0.19
52	0.2
53	0.23
54	0.22
55	0.19
56	0.17
57	0.17
58	0.17
59	0.18
60	0.19
61	0.2
62	0.19
63	0.2
64	0.22
65	0.26
66	0.25
67	0.24
68	0.2
69	0.15
70	0.18
71	0.18
72	0.16
73	0.15
74	0.15
75	0.16
76	0.17
77	0.24
78	0.24
79	0.26
80	0.28
81	0.31
82	0.33
83	0.34
84	0.36
85	0.4
86	0.45
87	0.43
88	0.43
89	0.46
90	0.44
91	0.43
92	0.41
93	0.36
94	0.33
95	0.33
96	0.32
97	0.24
98	0.26
99	0.29
100	0.35
101	0.32
102	0.27
103	0.27
104	0.25
105	0.26
106	0.24
107	0.2
108	0.12
109	0.09
110	0.09
111	0.09
112	0.1
113	0.07
114	0.09
115	0.1
116	0.1
117	0.1
118	0.1
119	0.13
120	0.13
121	0.17
122	0.19
123	0.21
124	0.24
125	0.26
126	0.29
127	0.29
128	0.32
129	0.37
130	0.41
131	0.41
132	0.42
133	0.4
134	0.37
135	0.36
136	0.35
137	0.27
138	0.2
139	0.2
140	0.21
141	0.2
142	0.19
143	0.18
144	0.15
145	0.14
146	0.11
147	0.09
148	0.05
149	0.05
150	0.06
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.07
155	0.08
156	0.07
157	0.08
158	0.06
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.04
164	0.04
165	0.04
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.06
171	0.08
172	0.08
173	0.09
174	0.1
175	0.1
176	0.11
177	0.18
178	0.23
179	0.25
180	0.34
181	0.36
182	0.39
183	0.46
184	0.48
185	0.42
186	0.36
187	0.38
188	0.31
189	0.3
190	0.31
191	0.24
192	0.22
193	0.22
194	0.23
195	0.18
196	0.16
197	0.14
198	0.09
199	0.1
200	0.08
201	0.09
202	0.1
203	0.1
204	0.1
205	0.11
206	0.12
207	0.12
208	0.14
209	0.12
210	0.1
211	0.1
212	0.12
213	0.12
214	0.13
215	0.13
216	0.13
217	0.14
218	0.13
219	0.13
220	0.1
221	0.14
222	0.15
223	0.16
224	0.17
225	0.19
226	0.24
227	0.29
228	0.34
229	0.34
230	0.34
231	0.39
232	0.43
233	0.41
234	0.35
235	0.31
236	0.29
237	0.29
238	0.36
239	0.34
240	0.32
241	0.35
242	0.45
243	0.5
244	0.52
245	0.52
246	0.45
247	0.5
248	0.53
249	0.6
250	0.61
251	0.65
252	0.72
253	0.77
254	0.84
255	0.87
256	0.89
257	0.89
258	0.88
259	0.88
260	0.84
261	0.79
262	0.75
263	0.65
264	0.58
265	0.5
266	0.4
267	0.3
268	0.23
269	0.18
270	0.14
271	0.13
272	0.09
273	0.07
274	0.06
275	0.05
276	0.06
277	0.06
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.08
290	0.08
291	0.09
292	0.09
293	0.09
294	0.1
295	0.12
296	0.13
297	0.14
298	0.14
299	0.13
300	0.15
301	0.15
302	0.14
303	0.12
304	0.12
305	0.11
306	0.1
307	0.11
308	0.09
309	0.1
310	0.11
311	0.13
312	0.16
313	0.18
314	0.18
315	0.23
316	0.23
317	0.21
318	0.21
319	0.23
320	0.22
321	0.2
322	0.19
323	0.15
324	0.15
325	0.16
326	0.15
327	0.11
328	0.12
329	0.13
330	0.14
331	0.13
332	0.14
333	0.16
334	0.19
335	0.19
336	0.17
337	0.17
338	0.19
339	0.19
340	0.2
341	0.18
342	0.16
343	0.15
344	0.16
345	0.14
346	0.12
347	0.12
348	0.11
349	0.1
350	0.09
351	0.09
352	0.09
353	0.09
354	0.1
355	0.1
356	0.11
357	0.11
358	0.12
359	0.15
360	0.19
361	0.19
362	0.2
363	0.22
364	0.24
365	0.3
366	0.35
367	0.31
368	0.28
369	0.28
370	0.28
371	0.3
372	0.31
373	0.3
374	0.28
375	0.36
376	0.4
377	0.46
378	0.45
379	0.42
380	0.46
381	0.44
382	0.45
383	0.39
384	0.35
385	0.28
386	0.27
387	0.28
388	0.23
389	0.21
390	0.16
391	0.15
392	0.15
393	0.17
394	0.17
395	0.17
396	0.17
397	0.18
398	0.18
399	0.19
400	0.23
401	0.26
402	0.24
403	0.24
404	0.22
405	0.23
406	0.24
407	0.21
408	0.27
409	0.24
410	0.24
411	0.23
412	0.25
413	0.23
414	0.24
415	0.24
416	0.21
417	0.24
418	0.28
419	0.3
420	0.31
421	0.3
422	0.29
423	0.29
424	0.24
425	0.19
426	0.16
427	0.15
428	0.14
429	0.16
430	0.16
431	0.15
432	0.15
433	0.16
434	0.15
435	0.14
436	0.21
437	0.25
438	0.29
439	0.3
440	0.34
441	0.36
442	0.38
443	0.41
444	0.37
445	0.36
446	0.35
447	0.37
448	0.34
449	0.36
450	0.37
451	0.35
452	0.3
453	0.27
454	0.24
455	0.25
456	0.26
457	0.23
458	0.26
459	0.28
460	0.32
461	0.37
462	0.43
463	0.42
464	0.4
465	0.41
466	0.45
467	0.52
468	0.52
469	0.54
470	0.48

A0A4S8LHF2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer