Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V4HDW8

Protein Details
Accession A0A4V4HDW8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
853-876LKSYVKPTGRYPPPKKKPTGTSGDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
482-489PKGEWGRR
553-571KKKDREKAQKQASRRRVRG
Subcellular Location(s) cysk 10, cyto_nucl 9, nucl 8.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MSTLLPFHTVILNEIHDPATSDLIVLARGLGLRRILCTLLKIYDSPQNLILLVNATQEEETEIGEELGIMGCRKPGLRVVGYETGSRDRQDLYKKGGLISVTSRILVVDMLQNDIPVDLITGMLVLHAEKISPLHLVSFITRLYREKNKTSFLKAFTDQPEHITSGLQPLKNVMKELQLRRVHIYPRFHQDIKDTLERRRADVVELSQDMTQAMDDIHGAIVQCMNSTLAELRRSKDLDLEGISLPAAYFSSFDHTVRKQLDPIWHKVGGTTKALVRDLGVLRRLVGYLLTYDPLQFHSYCQSLIAASNESSSSKNSSDSSVGKSQWMFTDAANIIFERAKYRCFLMNSASKGKTPASVKPPEVIDLVDDEEGWNALYELEGRVPPPAQNTSSKPDKLPSWLPANMQPVLEELPKWSLLAEILEEIEGEILRMENDALTSKGKGVSGDGAEFGTNTTLVMCSSDATCTLLTEYLAKMDNKRPKGEWGRRMMLRKLKSWLWWEQKKKQLMEKGGAAGAAAVVGYNEMLLRGAGGLDDGGLGDDGIDDGISEALKKKDREKAQKQASRRRVRGAAPVNAVGGRGTTVPPQSATSENVDMEVLAMDDNEIQLNFGVEAADVTTLNFATEFDTHYGLLQPAQTVLVRAYSDDSDDMVLDELKPRFIVMYEPCMEFVRRVEVYKCSNPGLAVRVYHMVYSNSCEEHKYLAGIRREKDSFERLIKERGSMLLPIYEDRQRSESDAIIKTISSRIAGGRRELSTVPSQVIVDMREFRSTLPSLLHAANLLVIPATLTVGDYILTPDICVERKSLADLVSSFNSGRLYTQCELMSVHYKTPVLLIEFEEDKAFSLEVVSDLKSYVKPTGRYPPPKKKPTGTSGDPSSSSYENPSKSPSIQSKIVLLTLSFPRLKIIWSSSPYFTAEIFNDLKKDRPEPDPVKAISVGTEEEDPSTTGMGVNAAAEELVRSFPGVNEKNVRYVMGKVGNVRRLCEMELVEVQGILGAEPGKACYEFLHRGEEGWRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.16
4 0.18
5 0.17
6 0.16
7 0.14
8 0.13
9 0.13
10 0.12
11 0.13
12 0.1
13 0.09
14 0.07
15 0.09
16 0.1
17 0.11
18 0.15
19 0.15
20 0.17
21 0.19
22 0.21
23 0.2
24 0.23
25 0.24
26 0.23
27 0.25
28 0.24
29 0.25
30 0.3
31 0.32
32 0.3
33 0.29
34 0.26
35 0.24
36 0.24
37 0.21
38 0.16
39 0.14
40 0.14
41 0.12
42 0.12
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.06
54 0.07
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.11
60 0.12
61 0.13
62 0.18
63 0.24
64 0.26
65 0.29
66 0.35
67 0.4
68 0.41
69 0.41
70 0.38
71 0.37
72 0.36
73 0.34
74 0.29
75 0.25
76 0.3
77 0.36
78 0.39
79 0.42
80 0.44
81 0.45
82 0.44
83 0.44
84 0.38
85 0.32
86 0.3
87 0.28
88 0.24
89 0.22
90 0.21
91 0.19
92 0.18
93 0.15
94 0.13
95 0.12
96 0.12
97 0.15
98 0.15
99 0.15
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.08
104 0.08
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.04
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.12
124 0.12
125 0.14
126 0.14
127 0.15
128 0.17
129 0.19
130 0.25
131 0.33
132 0.39
133 0.45
134 0.5
135 0.56
136 0.59
137 0.64
138 0.64
139 0.59
140 0.58
141 0.52
142 0.53
143 0.5
144 0.51
145 0.43
146 0.4
147 0.39
148 0.34
149 0.32
150 0.25
151 0.2
152 0.24
153 0.28
154 0.25
155 0.22
156 0.26
157 0.31
158 0.31
159 0.33
160 0.25
161 0.28
162 0.36
163 0.41
164 0.46
165 0.45
166 0.47
167 0.49
168 0.53
169 0.52
170 0.5
171 0.53
172 0.49
173 0.53
174 0.57
175 0.54
176 0.5
177 0.48
178 0.48
179 0.47
180 0.5
181 0.44
182 0.42
183 0.5
184 0.49
185 0.48
186 0.47
187 0.41
188 0.35
189 0.37
190 0.34
191 0.31
192 0.31
193 0.29
194 0.24
195 0.23
196 0.2
197 0.15
198 0.12
199 0.07
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.07
214 0.08
215 0.11
216 0.13
217 0.19
218 0.21
219 0.22
220 0.27
221 0.29
222 0.28
223 0.29
224 0.27
225 0.25
226 0.24
227 0.25
228 0.2
229 0.19
230 0.18
231 0.14
232 0.12
233 0.09
234 0.07
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.18
242 0.19
243 0.26
244 0.28
245 0.29
246 0.26
247 0.29
248 0.38
249 0.38
250 0.43
251 0.42
252 0.4
253 0.38
254 0.38
255 0.4
256 0.34
257 0.31
258 0.27
259 0.23
260 0.25
261 0.26
262 0.24
263 0.18
264 0.2
265 0.21
266 0.22
267 0.22
268 0.19
269 0.19
270 0.2
271 0.19
272 0.14
273 0.12
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.11
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.15
286 0.16
287 0.15
288 0.15
289 0.14
290 0.12
291 0.13
292 0.13
293 0.11
294 0.1
295 0.11
296 0.11
297 0.12
298 0.12
299 0.12
300 0.14
301 0.13
302 0.15
303 0.15
304 0.17
305 0.2
306 0.21
307 0.25
308 0.26
309 0.26
310 0.26
311 0.26
312 0.25
313 0.22
314 0.22
315 0.18
316 0.13
317 0.19
318 0.17
319 0.18
320 0.17
321 0.16
322 0.14
323 0.14
324 0.15
325 0.12
326 0.12
327 0.13
328 0.13
329 0.16
330 0.19
331 0.2
332 0.22
333 0.24
334 0.3
335 0.33
336 0.39
337 0.38
338 0.33
339 0.33
340 0.32
341 0.31
342 0.28
343 0.3
344 0.31
345 0.35
346 0.36
347 0.37
348 0.37
349 0.33
350 0.31
351 0.24
352 0.17
353 0.13
354 0.13
355 0.1
356 0.09
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.05
362 0.04
363 0.03
364 0.04
365 0.04
366 0.05
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.08
372 0.09
373 0.12
374 0.14
375 0.15
376 0.2
377 0.23
378 0.28
379 0.34
380 0.35
381 0.32
382 0.32
383 0.31
384 0.32
385 0.32
386 0.3
387 0.3
388 0.3
389 0.31
390 0.32
391 0.34
392 0.31
393 0.27
394 0.23
395 0.18
396 0.18
397 0.17
398 0.12
399 0.09
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.09
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.06
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.04
423 0.05
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.1
433 0.1
434 0.1
435 0.1
436 0.09
437 0.08
438 0.08
439 0.07
440 0.05
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.07
453 0.07
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.09
462 0.1
463 0.13
464 0.2
465 0.27
466 0.28
467 0.31
468 0.3
469 0.37
470 0.47
471 0.53
472 0.53
473 0.53
474 0.56
475 0.58
476 0.61
477 0.58
478 0.55
479 0.49
480 0.44
481 0.41
482 0.37
483 0.37
484 0.37
485 0.4
486 0.42
487 0.47
488 0.52
489 0.55
490 0.61
491 0.62
492 0.61
493 0.58
494 0.54
495 0.5
496 0.45
497 0.39
498 0.33
499 0.28
500 0.25
501 0.19
502 0.12
503 0.09
504 0.05
505 0.03
506 0.02
507 0.02
508 0.02
509 0.02
510 0.02
511 0.02
512 0.02
513 0.02
514 0.02
515 0.02
516 0.02
517 0.02
518 0.02
519 0.02
520 0.02
521 0.02
522 0.02
523 0.02
524 0.02
525 0.02
526 0.02
527 0.02
528 0.02
529 0.02
530 0.02
531 0.02
532 0.02
533 0.02
534 0.03
535 0.03
536 0.03
537 0.05
538 0.08
539 0.13
540 0.15
541 0.2
542 0.28
543 0.37
544 0.47
545 0.54
546 0.61
547 0.67
548 0.71
549 0.75
550 0.78
551 0.8
552 0.78
553 0.72
554 0.67
555 0.62
556 0.59
557 0.59
558 0.55
559 0.49
560 0.42
561 0.39
562 0.34
563 0.3
564 0.27
565 0.18
566 0.12
567 0.07
568 0.06
569 0.06
570 0.07
571 0.08
572 0.09
573 0.09
574 0.11
575 0.12
576 0.13
577 0.14
578 0.15
579 0.16
580 0.15
581 0.15
582 0.13
583 0.11
584 0.1
585 0.08
586 0.05
587 0.03
588 0.03
589 0.03
590 0.03
591 0.04
592 0.04
593 0.03
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.04
598 0.04
599 0.04
600 0.03
601 0.03
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.04
609 0.04
610 0.04
611 0.05
612 0.06
613 0.08
614 0.09
615 0.1
616 0.1
617 0.1
618 0.11
619 0.09
620 0.1
621 0.09
622 0.07
623 0.07
624 0.08
625 0.07
626 0.07
627 0.07
628 0.08
629 0.07
630 0.08
631 0.09
632 0.09
633 0.09
634 0.09
635 0.09
636 0.08
637 0.08
638 0.08
639 0.06
640 0.06
641 0.06
642 0.1
643 0.1
644 0.1
645 0.1
646 0.09
647 0.09
648 0.09
649 0.14
650 0.11
651 0.18
652 0.19
653 0.2
654 0.21
655 0.22
656 0.22
657 0.18
658 0.17
659 0.17
660 0.16
661 0.17
662 0.18
663 0.22
664 0.28
665 0.31
666 0.33
667 0.28
668 0.28
669 0.26
670 0.26
671 0.24
672 0.2
673 0.16
674 0.15
675 0.17
676 0.16
677 0.16
678 0.16
679 0.14
680 0.13
681 0.16
682 0.16
683 0.15
684 0.15
685 0.16
686 0.15
687 0.16
688 0.16
689 0.14
690 0.17
691 0.22
692 0.29
693 0.33
694 0.33
695 0.37
696 0.38
697 0.38
698 0.39
699 0.37
700 0.35
701 0.35
702 0.39
703 0.36
704 0.41
705 0.4
706 0.36
707 0.32
708 0.28
709 0.25
710 0.2
711 0.18
712 0.14
713 0.14
714 0.14
715 0.16
716 0.18
717 0.17
718 0.18
719 0.2
720 0.18
721 0.21
722 0.22
723 0.22
724 0.24
725 0.25
726 0.24
727 0.22
728 0.21
729 0.19
730 0.19
731 0.17
732 0.11
733 0.11
734 0.13
735 0.19
736 0.21
737 0.23
738 0.25
739 0.25
740 0.28
741 0.27
742 0.27
743 0.25
744 0.25
745 0.22
746 0.19
747 0.18
748 0.17
749 0.18
750 0.15
751 0.13
752 0.16
753 0.16
754 0.17
755 0.17
756 0.17
757 0.21
758 0.21
759 0.19
760 0.16
761 0.17
762 0.18
763 0.19
764 0.18
765 0.13
766 0.12
767 0.12
768 0.1
769 0.09
770 0.05
771 0.05
772 0.05
773 0.04
774 0.05
775 0.03
776 0.04
777 0.04
778 0.04
779 0.05
780 0.05
781 0.06
782 0.07
783 0.07
784 0.06
785 0.07
786 0.1
787 0.11
788 0.11
789 0.12
790 0.12
791 0.13
792 0.16
793 0.17
794 0.15
795 0.16
796 0.17
797 0.19
798 0.19
799 0.2
800 0.17
801 0.16
802 0.17
803 0.15
804 0.16
805 0.14
806 0.19
807 0.18
808 0.22
809 0.2
810 0.2
811 0.21
812 0.23
813 0.28
814 0.23
815 0.24
816 0.23
817 0.23
818 0.22
819 0.23
820 0.22
821 0.17
822 0.16
823 0.16
824 0.17
825 0.18
826 0.19
827 0.17
828 0.15
829 0.14
830 0.13
831 0.12
832 0.08
833 0.07
834 0.07
835 0.08
836 0.1
837 0.09
838 0.09
839 0.09
840 0.11
841 0.12
842 0.14
843 0.2
844 0.24
845 0.25
846 0.3
847 0.4
848 0.49
849 0.59
850 0.67
851 0.72
852 0.77
853 0.84
854 0.86
855 0.84
856 0.83
857 0.8
858 0.79
859 0.74
860 0.71
861 0.67
862 0.63
863 0.56
864 0.49
865 0.44
866 0.36
867 0.31
868 0.29
869 0.3
870 0.28
871 0.29
872 0.32
873 0.32
874 0.33
875 0.4
876 0.42
877 0.41
878 0.44
879 0.43
880 0.43
881 0.41
882 0.4
883 0.32
884 0.24
885 0.23
886 0.22
887 0.26
888 0.23
889 0.21
890 0.22
891 0.22
892 0.23
893 0.23
894 0.26
895 0.28
896 0.32
897 0.36
898 0.35
899 0.37
900 0.37
901 0.34
902 0.29
903 0.25
904 0.21
905 0.22
906 0.23
907 0.23
908 0.25
909 0.25
910 0.3
911 0.3
912 0.34
913 0.34
914 0.36
915 0.45
916 0.47
917 0.53
918 0.55
919 0.52
920 0.51
921 0.47
922 0.42
923 0.33
924 0.29
925 0.23
926 0.17
927 0.18
928 0.15
929 0.15
930 0.15
931 0.14
932 0.13
933 0.12
934 0.1
935 0.09
936 0.09
937 0.08
938 0.08
939 0.07
940 0.07
941 0.06
942 0.06
943 0.05
944 0.05
945 0.06
946 0.06
947 0.06
948 0.07
949 0.07
950 0.1
951 0.2
952 0.23
953 0.28
954 0.36
955 0.38
956 0.43
957 0.43
958 0.43
959 0.35
960 0.34
961 0.36
962 0.34
963 0.35
964 0.38
965 0.45
966 0.5
967 0.5
968 0.49
969 0.46
970 0.42
971 0.41
972 0.38
973 0.31
974 0.28
975 0.29
976 0.29
977 0.24
978 0.21
979 0.19
980 0.16
981 0.15
982 0.1
983 0.09
984 0.07
985 0.08
986 0.08
987 0.1
988 0.11
989 0.11
990 0.12
991 0.13
992 0.2
993 0.26
994 0.28
995 0.33
996 0.31
997 0.32
998 0.4