FuNGI

A0A4S8LD53

Protein Details

Accession

A0A4S8LD53

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
408-429	AQSGTLRKRKREKERASQRLFV	Hydrophilic
1003-1031	IDTLRKAARKSDKGKTPKRPYKPRPRSNR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
414-421	RKRKREKE
1007-1031	RKAARKSDKGKTPKRPYKPRPRSNR

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II

Amino Acid Sequences

MSNPFVDLEAYEDREEDEYGPDVEDGDHGDEEDIYDDQGQWDVEDHPVHEEETAMDTNAEPAPGFLDTLTEHLANRYVKQPISLDSTSCEQSEDEFMQKLIAKADLLAEEKQLFWRVKCKPGREFNLVLDIMHHELRQNSALVSTTHDIVHPVPTGQTTTAQQESSSPAAISPSARALRMIRQYALTQVGEPKELSDSLQSLLGCDFTVEWSHLIDRAGLEPGEEDVLGALAAVNTLAAQSLPAAVVLEADHTQDLSPVVRVGSQSKQSHNFGVEVAQRVVPPARTLLSAFCIPTVNGSVYLEGSYDDALVRFLWHHSGVIKHKTSSAHLTPWIEPVPSADVSILLEMPLPSIQPLSWVRITRGQYRDVVGLVQHREMCGSQRRLIVLLVPRLTPAADTLQNSLPPSAQSGTLRKRKREKERASQRLFVQQSYSGPSTRIGPSKFRAGQTEYHYGLVVKCYDYSSVTQNEVVMDEATRKLFRVSGHPLLERVHLPLPDDWVFYVEDQVEIVVPAPLSEAQRMNPDLPRTTYRKDGTVIAVAEKDCSVRLAEHDAYAVDNSDMFVTVPKINIRKKIRTGHSVVVEAGQLKGRDGLVLTNFGDMLEVHEMRRTQLQAFHVHANSCRVTTLRSAADVPWLDRHITVVDGPYRGYTGLITDTHPPSSHPPHAHFTTLDVRIPRSQLYLREAAPLTAAQQRFKQSTWDVYSAPNFSPSPTDPFTGRQLLADDLVKREPKEPWINVPVRVVAGPVKNTGIVRRIERNYKNESGLRLLVEFDYVSADHGASPQFWLDYAAVRDPRTGLPLHIVHTLKGSQRFWEPLIPIKAVSVPCLVRSGLESNQALQLPSTPTWNRDDCYDVFTIDSDSPRASSAAEHPPSHWTLDSRLDGKEFCARWEPKQESIYINDGGSLWWVPANEIFDLALPIRPTTNKLPLLVVRGPHTGKYLRQIFCKFIENEDEPVITGAVYDRWGTSAEQQVEPYLEVKAEDCAFAASDPNKTRFKEEIDTLRKAARKSDKGKTPKRPYKPRPRSNR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.21
3	0.17
4	0.16
5	0.15
6	0.15
7	0.16
8	0.14
9	0.13
10	0.13
11	0.12
12	0.12
13	0.13
14	0.12
15	0.12
16	0.12
17	0.11
18	0.12
19	0.13
20	0.11
21	0.09
22	0.09
23	0.09
24	0.1
25	0.12
26	0.11
27	0.09
28	0.11
29	0.12
30	0.15
31	0.16
32	0.16
33	0.18
34	0.18
35	0.19
36	0.17
37	0.16
38	0.13
39	0.17
40	0.17
41	0.14
42	0.13
43	0.13
44	0.15
45	0.15
46	0.14
47	0.1
48	0.09
49	0.1
50	0.1
51	0.11
52	0.08
53	0.09
54	0.09
55	0.11
56	0.14
57	0.13
58	0.13
59	0.14
60	0.2
61	0.2
62	0.22
63	0.26
64	0.28
65	0.28
66	0.31
67	0.32
68	0.3
69	0.36
70	0.35
71	0.3
72	0.28
73	0.32
74	0.3
75	0.28
76	0.25
77	0.17
78	0.18
79	0.22
80	0.21
81	0.2
82	0.19
83	0.19
84	0.21
85	0.23
86	0.22
87	0.18
88	0.17
89	0.14
90	0.14
91	0.16
92	0.16
93	0.17
94	0.17
95	0.18
96	0.17
97	0.18
98	0.2
99	0.24
100	0.24
101	0.23
102	0.31
103	0.34
104	0.44
105	0.51
106	0.56
107	0.59
108	0.67
109	0.73
110	0.71
111	0.69
112	0.62
113	0.62
114	0.54
115	0.44
116	0.36
117	0.3
118	0.26
119	0.23
120	0.21
121	0.15
122	0.16
123	0.18
124	0.19
125	0.17
126	0.15
127	0.14
128	0.16
129	0.14
130	0.18
131	0.17
132	0.17
133	0.16
134	0.16
135	0.17
136	0.16
137	0.19
138	0.15
139	0.14
140	0.13
141	0.14
142	0.16
143	0.15
144	0.17
145	0.16
146	0.2
147	0.22
148	0.21
149	0.2
150	0.2
151	0.23
152	0.22
153	0.21
154	0.16
155	0.14
156	0.15
157	0.16
158	0.15
159	0.12
160	0.17
161	0.18
162	0.18
163	0.2
164	0.21
165	0.28
166	0.34
167	0.36
168	0.3
169	0.31
170	0.32
171	0.33
172	0.35
173	0.28
174	0.22
175	0.24
176	0.24
177	0.23
178	0.23
179	0.2
180	0.17
181	0.17
182	0.17
183	0.14
184	0.14
185	0.13
186	0.16
187	0.15
188	0.13
189	0.13
190	0.13
191	0.1
192	0.09
193	0.08
194	0.07
195	0.09
196	0.09
197	0.09
198	0.1
199	0.1
200	0.12
201	0.12
202	0.12
203	0.11
204	0.11
205	0.13
206	0.11
207	0.11
208	0.1
209	0.1
210	0.1
211	0.09
212	0.07
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.04
217	0.04
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.02
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.05
234	0.05
235	0.07
236	0.06
237	0.07
238	0.07
239	0.07
240	0.07
241	0.08
242	0.08
243	0.07
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.09
248	0.1
249	0.13
250	0.17
251	0.25
252	0.28
253	0.33
254	0.38
255	0.4
256	0.41
257	0.39
258	0.35
259	0.27
260	0.28
261	0.25
262	0.23
263	0.22
264	0.2
265	0.18
266	0.19
267	0.21
268	0.17
269	0.14
270	0.13
271	0.13
272	0.13
273	0.14
274	0.13
275	0.15
276	0.16
277	0.15
278	0.14
279	0.14
280	0.13
281	0.13
282	0.14
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.11
287	0.1
288	0.1
289	0.09
290	0.07
291	0.07
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.05
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.07
301	0.09
302	0.09
303	0.1
304	0.11
305	0.17
306	0.22
307	0.29
308	0.3
309	0.29
310	0.32
311	0.32
312	0.34
313	0.35
314	0.32
315	0.28
316	0.3
317	0.32
318	0.29
319	0.31
320	0.29
321	0.22
322	0.19
323	0.17
324	0.17
325	0.14
326	0.14
327	0.1
328	0.1
329	0.1
330	0.1
331	0.09
332	0.05
333	0.06
334	0.05
335	0.06
336	0.06
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.05
341	0.1
342	0.11
343	0.15
344	0.19
345	0.2
346	0.22
347	0.28
348	0.32
349	0.35
350	0.36
351	0.35
352	0.33
353	0.33
354	0.32
355	0.26
356	0.23
357	0.16
358	0.18
359	0.17
360	0.17
361	0.15
362	0.14
363	0.15
364	0.15
365	0.18
366	0.22
367	0.25
368	0.26
369	0.28
370	0.29
371	0.29
372	0.28
373	0.27
374	0.23
375	0.24
376	0.21
377	0.19
378	0.19
379	0.18
380	0.18
381	0.14
382	0.11
383	0.1
384	0.11
385	0.12
386	0.15
387	0.16
388	0.18
389	0.18
390	0.17
391	0.14
392	0.12
393	0.13
394	0.11
395	0.12
396	0.13
397	0.2
398	0.28
399	0.36
400	0.41
401	0.47
402	0.56
403	0.63
404	0.72
405	0.76
406	0.77
407	0.79
408	0.86
409	0.89
410	0.84
411	0.79
412	0.7
413	0.68
414	0.6
415	0.49
416	0.39
417	0.3
418	0.26
419	0.25
420	0.25
421	0.16
422	0.16
423	0.16
424	0.17
425	0.18
426	0.22
427	0.2
428	0.23
429	0.24
430	0.32
431	0.35
432	0.33
433	0.33
434	0.31
435	0.34
436	0.36
437	0.4
438	0.32
439	0.29
440	0.28
441	0.25
442	0.23
443	0.19
444	0.14
445	0.09
446	0.08
447	0.08
448	0.09
449	0.1
450	0.11
451	0.13
452	0.14
453	0.15
454	0.14
455	0.14
456	0.14
457	0.13
458	0.11
459	0.08
460	0.06
461	0.06
462	0.07
463	0.08
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.1
468	0.11
469	0.15
470	0.21
471	0.26
472	0.28
473	0.28
474	0.29
475	0.28
476	0.29
477	0.23
478	0.19
479	0.15
480	0.13
481	0.14
482	0.14
483	0.17
484	0.16
485	0.16
486	0.13
487	0.12
488	0.12
489	0.11
490	0.11
491	0.07
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.03
500	0.03
501	0.04
502	0.06
503	0.06
504	0.08
505	0.08
506	0.09
507	0.12
508	0.13
509	0.14
510	0.15
511	0.16
512	0.16
513	0.18
514	0.22
515	0.24
516	0.25
517	0.3
518	0.29
519	0.29
520	0.29
521	0.28
522	0.25
523	0.24
524	0.22
525	0.16
526	0.16
527	0.14
528	0.13
529	0.11
530	0.1
531	0.07
532	0.07
533	0.07
534	0.05
535	0.07
536	0.11
537	0.12
538	0.12
539	0.12
540	0.11
541	0.11
542	0.11
543	0.1
544	0.05
545	0.04
546	0.04
547	0.04
548	0.04
549	0.04
550	0.05
551	0.06
552	0.07
553	0.08
554	0.11
555	0.17
556	0.2
557	0.29
558	0.35
559	0.39
560	0.46
561	0.53
562	0.56
563	0.56
564	0.58
565	0.54
566	0.5
567	0.45
568	0.38
569	0.29
570	0.25
571	0.19
572	0.14
573	0.11
574	0.09
575	0.08
576	0.09
577	0.08
578	0.08
579	0.08
580	0.09
581	0.08
582	0.1
583	0.1
584	0.09
585	0.09
586	0.08
587	0.08
588	0.07
589	0.08
590	0.09
591	0.09
592	0.09
593	0.11
594	0.11
595	0.12
596	0.15
597	0.14
598	0.13
599	0.16
600	0.19
601	0.21
602	0.24
603	0.27
604	0.25
605	0.25
606	0.25
607	0.25
608	0.22
609	0.18
610	0.16
611	0.13
612	0.13
613	0.14
614	0.17
615	0.13
616	0.14
617	0.15
618	0.15
619	0.19
620	0.18
621	0.17
622	0.16
623	0.17
624	0.16
625	0.15
626	0.15
627	0.11
628	0.11
629	0.11
630	0.11
631	0.12
632	0.11
633	0.12
634	0.11
635	0.11
636	0.1
637	0.1
638	0.07
639	0.06
640	0.08
641	0.09
642	0.1
643	0.14
644	0.15
645	0.16
646	0.16
647	0.17
648	0.2
649	0.26
650	0.31
651	0.3
652	0.32
653	0.37
654	0.39
655	0.39
656	0.33
657	0.31
658	0.31
659	0.3
660	0.28
661	0.23
662	0.24
663	0.24
664	0.25
665	0.22
666	0.19
667	0.2
668	0.21
669	0.25
670	0.26
671	0.24
672	0.28
673	0.27
674	0.24
675	0.22
676	0.18
677	0.16
678	0.18
679	0.19
680	0.16
681	0.2
682	0.24
683	0.25
684	0.25
685	0.28
686	0.25
687	0.31
688	0.34
689	0.33
690	0.3
691	0.31
692	0.33
693	0.3
694	0.28
695	0.24
696	0.19
697	0.17
698	0.2
699	0.19
700	0.22
701	0.22
702	0.23
703	0.21
704	0.24
705	0.28
706	0.28
707	0.26
708	0.21
709	0.2
710	0.2
711	0.2
712	0.2
713	0.17
714	0.15
715	0.19
716	0.21
717	0.2
718	0.22
719	0.23
720	0.28
721	0.35
722	0.35
723	0.38
724	0.45
725	0.46
726	0.45
727	0.45
728	0.38
729	0.3
730	0.28
731	0.22
732	0.17
733	0.17
734	0.17
735	0.16
736	0.16
737	0.17
738	0.18
739	0.19
740	0.2
741	0.21
742	0.24
743	0.3
744	0.35
745	0.43
746	0.48
747	0.52
748	0.54
749	0.55
750	0.56
751	0.5
752	0.48
753	0.42
754	0.38
755	0.33
756	0.25
757	0.23
758	0.18
759	0.15
760	0.13
761	0.09
762	0.08
763	0.07
764	0.08
765	0.08
766	0.08
767	0.07
768	0.08
769	0.09
770	0.08
771	0.09
772	0.08
773	0.08
774	0.08
775	0.09
776	0.09
777	0.11
778	0.13
779	0.18
780	0.2
781	0.21
782	0.21
783	0.21
784	0.22
785	0.21
786	0.2
787	0.16
788	0.19
789	0.2
790	0.22
791	0.26
792	0.26
793	0.24
794	0.26
795	0.28
796	0.27
797	0.31
798	0.3
799	0.26
800	0.29
801	0.32
802	0.31
803	0.33
804	0.3
805	0.32
806	0.35
807	0.33
808	0.29
809	0.27
810	0.29
811	0.24
812	0.25
813	0.21
814	0.18
815	0.18
816	0.2
817	0.19
818	0.15
819	0.18
820	0.19
821	0.17
822	0.23
823	0.22
824	0.22
825	0.25
826	0.26
827	0.23
828	0.19
829	0.2
830	0.18
831	0.18
832	0.23
833	0.21
834	0.23
835	0.29
836	0.32
837	0.29
838	0.28
839	0.32
840	0.26
841	0.29
842	0.28
843	0.22
844	0.2
845	0.19
846	0.2
847	0.17
848	0.17
849	0.14
850	0.14
851	0.14
852	0.14
853	0.14
854	0.12
855	0.12
856	0.17
857	0.26
858	0.29
859	0.3
860	0.3
861	0.35
862	0.36
863	0.36
864	0.31
865	0.23
866	0.23
867	0.29
868	0.32
869	0.29
870	0.29
871	0.29
872	0.28
873	0.29
874	0.33
875	0.27
876	0.25
877	0.33
878	0.34
879	0.38
880	0.48
881	0.49
882	0.48
883	0.5
884	0.5
885	0.43
886	0.45
887	0.44
888	0.35
889	0.3
890	0.24
891	0.22
892	0.19
893	0.17
894	0.13
895	0.09
896	0.09
897	0.09
898	0.09
899	0.12
900	0.14
901	0.12
902	0.13
903	0.12
904	0.11
905	0.13
906	0.13
907	0.13
908	0.12
909	0.12
910	0.14
911	0.16
912	0.2
913	0.25
914	0.33
915	0.34
916	0.34
917	0.38
918	0.39
919	0.44
920	0.43
921	0.39
922	0.33
923	0.37
924	0.37
925	0.33
926	0.36
927	0.32
928	0.32
929	0.39
930	0.44
931	0.42
932	0.49
933	0.51
934	0.5
935	0.5
936	0.55
937	0.47
938	0.42
939	0.46
940	0.4
941	0.4
942	0.38
943	0.34
944	0.27
945	0.26
946	0.22
947	0.14
948	0.11
949	0.09
950	0.08
951	0.09
952	0.09
953	0.09
954	0.1
955	0.12
956	0.13
957	0.17
958	0.25
959	0.28
960	0.29
961	0.29
962	0.3
963	0.3
964	0.29
965	0.25
966	0.17
967	0.13
968	0.12
969	0.12
970	0.15
971	0.14
972	0.13
973	0.13
974	0.13
975	0.13
976	0.13
977	0.18
978	0.15
979	0.23
980	0.28
981	0.34
982	0.39
983	0.4
984	0.46
985	0.45
986	0.49
987	0.48
988	0.51
989	0.56
990	0.57
991	0.6
992	0.57
993	0.59
994	0.56
995	0.5
996	0.52
997	0.52
998	0.55
999	0.58
1000	0.66
1001	0.69
1002	0.76
1003	0.85
1004	0.87
1005	0.88
1006	0.88
1007	0.92
1008	0.93
1009	0.94
1010	0.95
1011	0.95

A0A4S8LD53

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer