Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V4HHD7

Protein Details
Accession A0A4V4HHD7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-34EKARQDKRFALKKLNFTPRHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MDGVNGVSSTRIDDEKARQDKRFALKKLNFTPRHPESSKLDSSLKRHTALIKRMRQSMANDNREQILKDIDTLSLEKYVDEIVSSTLDGISRCKTEKDVWSAVEIISALHRRFPATFTPSLVSLMSQALSVPSRSSLSGLTQEQREKEDSSRVTRQRPVLRVCSELALVGVIRDDVGRSGGEWIMKAVKDMLSNDPTLSSLPLLTTFLKSYSLPYLGLVPPSTNKQVSANADGDSLSSSVQESANSADAFPPLISEEDQLVEKDIRDRFKRMCEGYFDNVCKKLVIEHTRLQEQDRRNHEAYIRSGEIFEDRQQAYEKMTKGYEKLLASCQQLSELLYLSLPSLPNNARKTDSIQIGVSSSTGSGDLDEIYTPGGKWEDEEERKFYEEVQDLKDFVPKSVLGIEEGPKEEMRKLEEELEKLSVQEPGSSNKEINGSAEEEEDVPTPTPGTPKASTPPMSPQLALQGPSQLLSALLTRLPDATNRALVDQAAIDFAFLNSKAARKRLVKFLGQVPKNRTDLLPHYSRLVATLSKYMPDIGTELVAILEEEFRYLQRKKNVVKELAEVRLKNITYLSNLTKFRVVPTHLILHMFKVCLDDFSGTNVENLALLLEGCGRFLLRSDDTRERFGTMLELMRRKQSMQHFDQRQLLLLENAYYQCNPPERSPRQEKQRPPMELFIRHLIYDVLAKKTIDKVFKLIRKLDWDDASVRKILFKLFIKPWKLKFANISLMAMLTYDLQRYQPAFSVSVVDQVLEDVRRGLEQNVYSTNQRRIATIKYLGELYIYRLLSSGIIFDTLWSLVTFGHPDGRPLPNQVCPLDMPDDFFRLRLVCALLDTCGMCFDRGNQKKKLDNFLVFFQYYIHCKDDLPMDVEFMVSDSLEAVRPKLIYQQAESSVVVEEDDSGEESEDEDSRREDEERDEDDEDEPVDAEENEGERPSSPDEAVVLSASNSMQEYLGPSEEAEAEFDKELAKLVTDTSTESRKVDKKTAMALWDSSVLPPGMRRKRGEDGEDEENGGVIDPNVMNFNFLTKRGNKHQTRQLAIPSESALAVHTRSAQLQDKVEQQQLKRLVLDYEQREEAEELKALEARNRAGAIKIRYVAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.38
3 0.48
4 0.51
5 0.52
6 0.56
7 0.63
8 0.67
9 0.69
10 0.64
11 0.66
12 0.67
13 0.74
14 0.79
15 0.81
16 0.76
17 0.72
18 0.76
19 0.72
20 0.74
21 0.66
22 0.62
23 0.58
24 0.6
25 0.6
26 0.54
27 0.55
28 0.52
29 0.55
30 0.59
31 0.57
32 0.51
33 0.5
34 0.54
35 0.55
36 0.6
37 0.65
38 0.64
39 0.65
40 0.69
41 0.69
42 0.65
43 0.61
44 0.62
45 0.63
46 0.61
47 0.58
48 0.54
49 0.54
50 0.51
51 0.46
52 0.37
53 0.32
54 0.25
55 0.25
56 0.23
57 0.21
58 0.21
59 0.21
60 0.2
61 0.18
62 0.17
63 0.15
64 0.14
65 0.15
66 0.12
67 0.11
68 0.11
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.13
77 0.15
78 0.18
79 0.19
80 0.21
81 0.25
82 0.3
83 0.38
84 0.43
85 0.45
86 0.42
87 0.43
88 0.42
89 0.38
90 0.32
91 0.24
92 0.16
93 0.17
94 0.21
95 0.18
96 0.21
97 0.22
98 0.23
99 0.24
100 0.26
101 0.29
102 0.3
103 0.32
104 0.31
105 0.33
106 0.31
107 0.32
108 0.29
109 0.21
110 0.16
111 0.15
112 0.12
113 0.1
114 0.09
115 0.1
116 0.11
117 0.12
118 0.11
119 0.12
120 0.13
121 0.13
122 0.15
123 0.14
124 0.16
125 0.21
126 0.24
127 0.27
128 0.31
129 0.35
130 0.35
131 0.38
132 0.38
133 0.35
134 0.34
135 0.38
136 0.38
137 0.41
138 0.49
139 0.52
140 0.55
141 0.59
142 0.65
143 0.65
144 0.68
145 0.67
146 0.66
147 0.62
148 0.59
149 0.54
150 0.47
151 0.38
152 0.3
153 0.23
154 0.15
155 0.12
156 0.09
157 0.08
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.05
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.09
167 0.11
168 0.12
169 0.11
170 0.13
171 0.16
172 0.15
173 0.16
174 0.15
175 0.16
176 0.17
177 0.2
178 0.24
179 0.23
180 0.24
181 0.23
182 0.22
183 0.2
184 0.19
185 0.17
186 0.11
187 0.09
188 0.08
189 0.09
190 0.11
191 0.12
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.15
196 0.15
197 0.16
198 0.18
199 0.18
200 0.16
201 0.16
202 0.2
203 0.19
204 0.21
205 0.18
206 0.16
207 0.17
208 0.21
209 0.25
210 0.21
211 0.21
212 0.22
213 0.27
214 0.3
215 0.33
216 0.3
217 0.26
218 0.26
219 0.25
220 0.22
221 0.17
222 0.13
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.1
231 0.13
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.07
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.17
251 0.2
252 0.26
253 0.29
254 0.34
255 0.35
256 0.42
257 0.49
258 0.47
259 0.46
260 0.45
261 0.47
262 0.49
263 0.52
264 0.47
265 0.43
266 0.42
267 0.39
268 0.33
269 0.27
270 0.26
271 0.28
272 0.31
273 0.33
274 0.37
275 0.41
276 0.45
277 0.46
278 0.44
279 0.42
280 0.42
281 0.45
282 0.46
283 0.49
284 0.46
285 0.48
286 0.48
287 0.47
288 0.44
289 0.41
290 0.36
291 0.29
292 0.28
293 0.26
294 0.25
295 0.21
296 0.2
297 0.2
298 0.19
299 0.2
300 0.22
301 0.22
302 0.24
303 0.27
304 0.26
305 0.22
306 0.24
307 0.24
308 0.23
309 0.25
310 0.26
311 0.22
312 0.23
313 0.25
314 0.27
315 0.27
316 0.27
317 0.24
318 0.2
319 0.19
320 0.18
321 0.14
322 0.11
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.11
331 0.14
332 0.21
333 0.24
334 0.26
335 0.26
336 0.27
337 0.32
338 0.34
339 0.33
340 0.29
341 0.26
342 0.25
343 0.23
344 0.21
345 0.17
346 0.11
347 0.08
348 0.06
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.05
360 0.06
361 0.07
362 0.06
363 0.07
364 0.11
365 0.18
366 0.23
367 0.26
368 0.28
369 0.29
370 0.3
371 0.3
372 0.26
373 0.24
374 0.23
375 0.23
376 0.25
377 0.24
378 0.23
379 0.24
380 0.27
381 0.22
382 0.18
383 0.18
384 0.13
385 0.13
386 0.14
387 0.14
388 0.11
389 0.12
390 0.14
391 0.14
392 0.15
393 0.15
394 0.14
395 0.15
396 0.15
397 0.15
398 0.15
399 0.15
400 0.16
401 0.22
402 0.24
403 0.24
404 0.24
405 0.25
406 0.22
407 0.2
408 0.2
409 0.15
410 0.13
411 0.15
412 0.14
413 0.16
414 0.2
415 0.2
416 0.2
417 0.19
418 0.2
419 0.17
420 0.17
421 0.15
422 0.12
423 0.12
424 0.12
425 0.11
426 0.1
427 0.11
428 0.1
429 0.09
430 0.08
431 0.07
432 0.08
433 0.08
434 0.09
435 0.09
436 0.14
437 0.14
438 0.16
439 0.19
440 0.24
441 0.25
442 0.25
443 0.3
444 0.29
445 0.29
446 0.27
447 0.24
448 0.24
449 0.24
450 0.24
451 0.18
452 0.15
453 0.14
454 0.14
455 0.14
456 0.09
457 0.08
458 0.06
459 0.07
460 0.05
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.1
468 0.11
469 0.13
470 0.13
471 0.13
472 0.13
473 0.12
474 0.12
475 0.08
476 0.07
477 0.05
478 0.05
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.05
483 0.05
484 0.06
485 0.06
486 0.09
487 0.11
488 0.13
489 0.2
490 0.24
491 0.27
492 0.35
493 0.39
494 0.38
495 0.39
496 0.46
497 0.48
498 0.46
499 0.49
500 0.44
501 0.45
502 0.44
503 0.42
504 0.34
505 0.29
506 0.29
507 0.29
508 0.28
509 0.23
510 0.23
511 0.23
512 0.22
513 0.19
514 0.17
515 0.12
516 0.1
517 0.13
518 0.12
519 0.12
520 0.12
521 0.12
522 0.1
523 0.1
524 0.09
525 0.06
526 0.06
527 0.05
528 0.05
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.03
533 0.03
534 0.03
535 0.03
536 0.04
537 0.04
538 0.09
539 0.11
540 0.16
541 0.22
542 0.29
543 0.33
544 0.42
545 0.48
546 0.48
547 0.47
548 0.47
549 0.44
550 0.43
551 0.42
552 0.33
553 0.27
554 0.27
555 0.25
556 0.21
557 0.18
558 0.13
559 0.12
560 0.15
561 0.17
562 0.19
563 0.2
564 0.2
565 0.21
566 0.21
567 0.2
568 0.21
569 0.21
570 0.17
571 0.19
572 0.21
573 0.19
574 0.21
575 0.2
576 0.18
577 0.17
578 0.14
579 0.12
580 0.11
581 0.1
582 0.09
583 0.1
584 0.09
585 0.08
586 0.1
587 0.11
588 0.09
589 0.09
590 0.09
591 0.08
592 0.07
593 0.07
594 0.04
595 0.03
596 0.03
597 0.03
598 0.04
599 0.04
600 0.04
601 0.04
602 0.04
603 0.04
604 0.05
605 0.09
606 0.1
607 0.12
608 0.18
609 0.26
610 0.28
611 0.31
612 0.31
613 0.29
614 0.27
615 0.24
616 0.2
617 0.13
618 0.15
619 0.16
620 0.19
621 0.18
622 0.21
623 0.21
624 0.2
625 0.25
626 0.29
627 0.33
628 0.37
629 0.46
630 0.46
631 0.49
632 0.54
633 0.48
634 0.42
635 0.34
636 0.29
637 0.2
638 0.16
639 0.13
640 0.09
641 0.1
642 0.09
643 0.09
644 0.09
645 0.11
646 0.15
647 0.16
648 0.19
649 0.29
650 0.33
651 0.41
652 0.5
653 0.54
654 0.61
655 0.68
656 0.71
657 0.7
658 0.75
659 0.7
660 0.64
661 0.65
662 0.58
663 0.54
664 0.49
665 0.45
666 0.36
667 0.32
668 0.29
669 0.21
670 0.17
671 0.18
672 0.17
673 0.14
674 0.15
675 0.15
676 0.16
677 0.22
678 0.26
679 0.24
680 0.23
681 0.26
682 0.33
683 0.38
684 0.41
685 0.38
686 0.37
687 0.4
688 0.43
689 0.42
690 0.36
691 0.33
692 0.32
693 0.31
694 0.3
695 0.25
696 0.21
697 0.18
698 0.17
699 0.16
700 0.18
701 0.18
702 0.23
703 0.28
704 0.36
705 0.4
706 0.45
707 0.47
708 0.52
709 0.51
710 0.47
711 0.45
712 0.42
713 0.44
714 0.39
715 0.36
716 0.26
717 0.25
718 0.22
719 0.17
720 0.12
721 0.07
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.07
726 0.09
727 0.1
728 0.11
729 0.12
730 0.13
731 0.14
732 0.14
733 0.17
734 0.15
735 0.18
736 0.16
737 0.14
738 0.12
739 0.11
740 0.12
741 0.1
742 0.1
743 0.06
744 0.07
745 0.07
746 0.09
747 0.09
748 0.12
749 0.13
750 0.15
751 0.18
752 0.2
753 0.23
754 0.27
755 0.31
756 0.32
757 0.32
758 0.31
759 0.3
760 0.32
761 0.34
762 0.35
763 0.31
764 0.26
765 0.26
766 0.24
767 0.23
768 0.19
769 0.17
770 0.17
771 0.16
772 0.15
773 0.15
774 0.15
775 0.14
776 0.14
777 0.11
778 0.06
779 0.07
780 0.06
781 0.06
782 0.07
783 0.07
784 0.07
785 0.06
786 0.06
787 0.06
788 0.07
789 0.08
790 0.08
791 0.14
792 0.13
793 0.15
794 0.19
795 0.22
796 0.23
797 0.26
798 0.29
799 0.27
800 0.31
801 0.3
802 0.27
803 0.25
804 0.26
805 0.25
806 0.22
807 0.21
808 0.19
809 0.22
810 0.2
811 0.2
812 0.18
813 0.15
814 0.15
815 0.14
816 0.13
817 0.1
818 0.11
819 0.11
820 0.11
821 0.11
822 0.11
823 0.09
824 0.1
825 0.1
826 0.09
827 0.09
828 0.14
829 0.24
830 0.32
831 0.39
832 0.44
833 0.49
834 0.56
835 0.62
836 0.66
837 0.62
838 0.59
839 0.55
840 0.53
841 0.51
842 0.44
843 0.39
844 0.31
845 0.26
846 0.24
847 0.24
848 0.21
849 0.17
850 0.17
851 0.19
852 0.22
853 0.22
854 0.22
855 0.19
856 0.18
857 0.17
858 0.17
859 0.15
860 0.11
861 0.08
862 0.05
863 0.05
864 0.05
865 0.05
866 0.08
867 0.09
868 0.09
869 0.11
870 0.11
871 0.12
872 0.18
873 0.23
874 0.23
875 0.25
876 0.3
877 0.3
878 0.33
879 0.32
880 0.26
881 0.21
882 0.19
883 0.16
884 0.11
885 0.08
886 0.07
887 0.07
888 0.07
889 0.07
890 0.07
891 0.07
892 0.08
893 0.09
894 0.1
895 0.1
896 0.11
897 0.11
898 0.12
899 0.14
900 0.15
901 0.16
902 0.19
903 0.24
904 0.27
905 0.3
906 0.3
907 0.29
908 0.28
909 0.27
910 0.23
911 0.17
912 0.13
913 0.09
914 0.09
915 0.07
916 0.07
917 0.08
918 0.08
919 0.09
920 0.09
921 0.1
922 0.09
923 0.12
924 0.14
925 0.15
926 0.15
927 0.14
928 0.15
929 0.15
930 0.15
931 0.13
932 0.1
933 0.08
934 0.09
935 0.08
936 0.08
937 0.08
938 0.08
939 0.07
940 0.08
941 0.1
942 0.11
943 0.12
944 0.12
945 0.11
946 0.12
947 0.13
948 0.13
949 0.12
950 0.11
951 0.12
952 0.12
953 0.12
954 0.12
955 0.11
956 0.12
957 0.1
958 0.09
959 0.08
960 0.09
961 0.11
962 0.11
963 0.15
964 0.17
965 0.22
966 0.23
967 0.24
968 0.31
969 0.35
970 0.4
971 0.44
972 0.46
973 0.46
974 0.51
975 0.54
976 0.49
977 0.46
978 0.41
979 0.35
980 0.32
981 0.28
982 0.22
983 0.2
984 0.16
985 0.14
986 0.18
987 0.27
988 0.34
989 0.4
990 0.44
991 0.48
992 0.57
993 0.64
994 0.64
995 0.6
996 0.57
997 0.56
998 0.53
999 0.47
1000 0.38
1001 0.31
1002 0.25
1003 0.19
1004 0.13
1005 0.07
1006 0.09
1007 0.08
1008 0.09
1009 0.11
1010 0.11
1011 0.12
1012 0.12
1013 0.17
1014 0.17
1015 0.18
1016 0.25
1017 0.27
1018 0.35
1019 0.44
1020 0.55
1021 0.58
1022 0.65
1023 0.73
1024 0.75
1025 0.76
1026 0.73
1027 0.71
1028 0.68
1029 0.61
1030 0.53
1031 0.45
1032 0.37
1033 0.31
1034 0.26
1035 0.19
1036 0.14
1037 0.13
1038 0.13
1039 0.14
1040 0.14
1041 0.16
1042 0.21
1043 0.27
1044 0.3
1045 0.33
1046 0.36
1047 0.41
1048 0.45
1049 0.5
1050 0.51
1051 0.45
1052 0.5
1053 0.52
1054 0.5
1055 0.44
1056 0.4
1057 0.36
1058 0.36
1059 0.43
1060 0.4
1061 0.39
1062 0.38
1063 0.37
1064 0.38
1065 0.36
1066 0.32
1067 0.26
1068 0.22
1069 0.18
1070 0.18
1071 0.21
1072 0.19
1073 0.22
1074 0.24
1075 0.24
1076 0.25
1077 0.26
1078 0.25
1079 0.28
1080 0.34
1081 0.35
1082 0.38