Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S8LDI1

Protein Details
Accession A0A4S8LDI1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
268-296GKYDPNRKEKGKGKKRKGKEKAHATSDEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
272-289PNRKEKGKGKKRKGKEKA
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10.5, cyto 9.5, mito 3, extr 3
Family & Domain DBs
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences MSETAAASVPSTPRTPPSWSAPHQPLSYFPNGDSDHLVDDSNWVAWEAQIINGAKVCKVLGHLDGTSVRPESPGAAQDEWDLKDASLRSWLMKCLKPSLIPQISKLSSCREIYAHLQATYSTTGSGTLMYWARALLKPMKADDDVHKHCEDFLNALQFLEGTSWVIPQNVASILLLITLYADPADNKSWYTFVEKQNIKTETKVANVVNAIKEVLLAHRSSDSSSGSGQVDNALAVLEKDARSKGKYFCTICHSYGHDRNYCRQPGGGKYDPNRKEKGKGKKRKGKEKAHATSDEKMLSVSETSSLAYSHFSSSSTDSSEVPDEAFCTTTSSSRLPPVYIDSGATSHIHSIRSDFTSCSSTTGSVSGFGTGWSFEAEAAGYVFYT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.31
3 0.33
4 0.4
5 0.46
6 0.48
7 0.56
8 0.58
9 0.61
10 0.57
11 0.53
12 0.49
13 0.46
14 0.48
15 0.4
16 0.33
17 0.35
18 0.34
19 0.35
20 0.33
21 0.28
22 0.24
23 0.24
24 0.24
25 0.16
26 0.16
27 0.15
28 0.13
29 0.12
30 0.1
31 0.09
32 0.09
33 0.12
34 0.1
35 0.1
36 0.15
37 0.16
38 0.16
39 0.18
40 0.19
41 0.16
42 0.16
43 0.16
44 0.11
45 0.13
46 0.15
47 0.15
48 0.17
49 0.17
50 0.19
51 0.21
52 0.22
53 0.22
54 0.2
55 0.17
56 0.14
57 0.15
58 0.14
59 0.14
60 0.17
61 0.19
62 0.18
63 0.19
64 0.21
65 0.24
66 0.23
67 0.23
68 0.19
69 0.15
70 0.18
71 0.18
72 0.16
73 0.18
74 0.18
75 0.19
76 0.2
77 0.26
78 0.28
79 0.31
80 0.33
81 0.34
82 0.35
83 0.35
84 0.37
85 0.42
86 0.43
87 0.41
88 0.41
89 0.43
90 0.42
91 0.41
92 0.39
93 0.33
94 0.31
95 0.31
96 0.29
97 0.22
98 0.24
99 0.26
100 0.32
101 0.3
102 0.25
103 0.24
104 0.23
105 0.24
106 0.22
107 0.19
108 0.11
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.07
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.11
120 0.12
121 0.15
122 0.17
123 0.19
124 0.2
125 0.21
126 0.24
127 0.23
128 0.24
129 0.27
130 0.32
131 0.32
132 0.35
133 0.34
134 0.31
135 0.31
136 0.3
137 0.24
138 0.18
139 0.17
140 0.16
141 0.16
142 0.16
143 0.15
144 0.13
145 0.12
146 0.09
147 0.08
148 0.04
149 0.04
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.06
157 0.07
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.03
164 0.04
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.05
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.16
178 0.2
179 0.23
180 0.31
181 0.33
182 0.35
183 0.42
184 0.44
185 0.38
186 0.33
187 0.34
188 0.27
189 0.27
190 0.29
191 0.21
192 0.2
193 0.2
194 0.21
195 0.16
196 0.14
197 0.13
198 0.08
199 0.09
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.12
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.08
227 0.1
228 0.12
229 0.14
230 0.19
231 0.22
232 0.27
233 0.34
234 0.34
235 0.36
236 0.42
237 0.44
238 0.41
239 0.4
240 0.38
241 0.37
242 0.42
243 0.44
244 0.42
245 0.41
246 0.47
247 0.51
248 0.5
249 0.43
250 0.39
251 0.37
252 0.38
253 0.44
254 0.42
255 0.4
256 0.44
257 0.54
258 0.58
259 0.6
260 0.6
261 0.54
262 0.58
263 0.6
264 0.65
265 0.66
266 0.7
267 0.76
268 0.81
269 0.88
270 0.9
271 0.92
272 0.92
273 0.91
274 0.91
275 0.88
276 0.85
277 0.82
278 0.75
279 0.69
280 0.62
281 0.52
282 0.4
283 0.32
284 0.25
285 0.19
286 0.15
287 0.11
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.13
300 0.16
301 0.17
302 0.18
303 0.18
304 0.17
305 0.19
306 0.21
307 0.19
308 0.17
309 0.15
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.11
314 0.12
315 0.12
316 0.14
317 0.17
318 0.19
319 0.2
320 0.25
321 0.27
322 0.24
323 0.25
324 0.28
325 0.29
326 0.27
327 0.26
328 0.21
329 0.2
330 0.21
331 0.2
332 0.16
333 0.16
334 0.18
335 0.19
336 0.18
337 0.2
338 0.22
339 0.25
340 0.26
341 0.23
342 0.23
343 0.25
344 0.25
345 0.26
346 0.23
347 0.2
348 0.2
349 0.21
350 0.18
351 0.16
352 0.17
353 0.15
354 0.13
355 0.12
356 0.12
357 0.1
358 0.11
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.08