FuNGI

A0A4S8MRJ2

Protein Details

Accession

A0A4S8MRJ2

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-48	AAPPATTGFKHKPKKEKEREKKEKKEKKEKQHQQQPHSERLKV	Basic
374-396	VGDQKSRRQKAREREERVKEEKE	Basic
419-447	NDIPAKHPPSSPKRDRNRRKPSVSGQGAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
15-36	KHKPKKEKEREKKEKKEKKEKQ
204-249	KAEKAAAKEKAALRHHHHIHPTEIIKKEDKDKKKGSAAPAASSKGT
254-268	ALAPGSKKAKKAAAA
378-400	KSRRQKAREREERVKEEKEKAKE
425-438	HPPSSPKRDRNRRK
496-515	SGRGRGRGRGRGGRGGTPRG

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, mito 10, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSTATAAPPATTGFKHKPKKEKEREKKEKKEKKEKQHQQQPHSERLKVIVRRLPPNLPEEIFWQSVQNWVTDETVTWKAFYQGKFRSRLNKENVSSRAYIAFKSEEPLSLFSREYDGHLFRDKAGNEAQAVVEFAPYQKVPSDKKKADARNGTIEKDEDYISFINSLNASSTSEPVSVEALIASTQPAPQPKTTPLLEALKAEKAEKAAAKEKAALRHHHHIHPTEIIKKEDKDKKKGSAAPAASSKGTEAVSALAPGSKKAKKAAAAAAKEAASTPVTIATRPGGPSKVSKAAARHQGGAQTKAVAAGLAATPAAPATSDASGSGSANNASVERSTSPVAAPAASGSTSRRGRPVLGLGSRQFEAALSGAGVVGDQKSRRQKAREREERVKEEKEKAKEEGGGGDKDSPAVASTSGSNDIPAKHPPSSPKRDRNRRKPSVSGQGASTVVPMILGRIDDPPPTPTILKRENVTGDSSLPSPQVGTPGVIPGPGIGSGRGRGRGRGRGGRGGTPRGV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.51
3	0.59
4	0.67
5	0.75
6	0.85
7	0.88
8	0.9
9	0.92
10	0.93
11	0.96
12	0.97
13	0.97
14	0.97
15	0.96
16	0.95
17	0.96
18	0.94
19	0.94
20	0.95
21	0.94
22	0.94
23	0.95
24	0.94
25	0.92
26	0.92
27	0.87
28	0.86
29	0.81
30	0.72
31	0.63
32	0.59
33	0.59
34	0.53
35	0.55
36	0.5
37	0.51
38	0.56
39	0.6
40	0.6
41	0.54
42	0.53
43	0.5
44	0.45
45	0.39
46	0.36
47	0.36
48	0.31
49	0.28
50	0.26
51	0.21
52	0.25
53	0.24
54	0.21
55	0.17
56	0.17
57	0.18
58	0.16
59	0.16
60	0.16
61	0.21
62	0.2
63	0.2
64	0.19
65	0.23
66	0.28
67	0.3
68	0.34
69	0.37
70	0.43
71	0.49
72	0.52
73	0.58
74	0.6
75	0.67
76	0.66
77	0.67
78	0.64
79	0.67
80	0.67
81	0.61
82	0.54
83	0.46
84	0.44
85	0.35
86	0.32
87	0.26
88	0.25
89	0.21
90	0.22
91	0.22
92	0.18
93	0.19
94	0.22
95	0.22
96	0.21
97	0.21
98	0.19
99	0.21
100	0.19
101	0.2
102	0.22
103	0.21
104	0.22
105	0.27
106	0.27
107	0.25
108	0.31
109	0.28
110	0.26
111	0.26
112	0.25
113	0.21
114	0.21
115	0.2
116	0.14
117	0.14
118	0.11
119	0.09
120	0.07
121	0.07
122	0.09
123	0.08
124	0.09
125	0.11
126	0.16
127	0.22
128	0.32
129	0.42
130	0.42
131	0.5
132	0.58
133	0.63
134	0.68
135	0.7
136	0.65
137	0.65
138	0.66
139	0.59
140	0.52
141	0.45
142	0.36
143	0.29
144	0.25
145	0.14
146	0.14
147	0.13
148	0.12
149	0.12
150	0.11
151	0.11
152	0.1
153	0.11
154	0.09
155	0.09
156	0.11
157	0.1
158	0.11
159	0.11
160	0.11
161	0.11
162	0.1
163	0.11
164	0.09
165	0.08
166	0.07
167	0.06
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.06
173	0.08
174	0.12
175	0.14
176	0.15
177	0.18
178	0.2
179	0.24
180	0.24
181	0.24
182	0.25
183	0.26
184	0.26
185	0.25
186	0.24
187	0.22
188	0.22
189	0.2
190	0.17
191	0.14
192	0.16
193	0.16
194	0.18
195	0.22
196	0.24
197	0.24
198	0.28
199	0.3
200	0.35
201	0.38
202	0.39
203	0.39
204	0.46
205	0.49
206	0.48
207	0.5
208	0.43
209	0.42
210	0.41
211	0.38
212	0.35
213	0.33
214	0.32
215	0.3
216	0.3
217	0.37
218	0.41
219	0.45
220	0.48
221	0.5
222	0.53
223	0.58
224	0.61
225	0.56
226	0.55
227	0.49
228	0.43
229	0.41
230	0.37
231	0.29
232	0.25
233	0.2
234	0.14
235	0.13
236	0.1
237	0.07
238	0.07
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.06
243	0.06
244	0.07
245	0.13
246	0.14
247	0.15
248	0.18
249	0.21
250	0.22
251	0.25
252	0.31
253	0.33
254	0.32
255	0.32
256	0.31
257	0.28
258	0.25
259	0.22
260	0.16
261	0.09
262	0.07
263	0.07
264	0.08
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.09
269	0.1
270	0.12
271	0.13
272	0.11
273	0.12
274	0.15
275	0.18
276	0.23
277	0.23
278	0.24
279	0.26
280	0.31
281	0.39
282	0.38
283	0.36
284	0.31
285	0.35
286	0.35
287	0.34
288	0.28
289	0.19
290	0.18
291	0.16
292	0.15
293	0.09
294	0.07
295	0.05
296	0.05
297	0.04
298	0.04
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.04
303	0.03
304	0.03
305	0.05
306	0.05
307	0.06
308	0.06
309	0.07
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.08
321	0.08
322	0.1
323	0.1
324	0.11
325	0.11
326	0.12
327	0.12
328	0.11
329	0.1
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.09
334	0.08
335	0.16
336	0.18
337	0.2
338	0.23
339	0.23
340	0.24
341	0.26
342	0.3
343	0.3
344	0.3
345	0.34
346	0.32
347	0.33
348	0.32
349	0.29
350	0.24
351	0.16
352	0.14
353	0.1
354	0.08
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.04
361	0.05
362	0.07
363	0.08
364	0.15
365	0.25
366	0.31
367	0.38
368	0.46
369	0.54
370	0.63
371	0.73
372	0.77
373	0.77
374	0.81
375	0.84
376	0.84
377	0.82
378	0.79
379	0.74
380	0.72
381	0.71
382	0.67
383	0.62
384	0.56
385	0.53
386	0.47
387	0.42
388	0.39
389	0.35
390	0.3
391	0.27
392	0.26
393	0.23
394	0.2
395	0.19
396	0.13
397	0.09
398	0.09
399	0.08
400	0.07
401	0.08
402	0.1
403	0.13
404	0.12
405	0.13
406	0.14
407	0.16
408	0.18
409	0.23
410	0.25
411	0.25
412	0.28
413	0.37
414	0.45
415	0.54
416	0.62
417	0.66
418	0.73
419	0.82
420	0.9
421	0.92
422	0.93
423	0.93
424	0.9
425	0.89
426	0.87
427	0.86
428	0.82
429	0.73
430	0.63
431	0.56
432	0.49
433	0.4
434	0.31
435	0.2
436	0.13
437	0.11
438	0.09
439	0.06
440	0.06
441	0.07
442	0.07
443	0.1
444	0.12
445	0.13
446	0.15
447	0.17
448	0.18
449	0.21
450	0.22
451	0.23
452	0.3
453	0.35
454	0.38
455	0.37
456	0.42
457	0.43
458	0.43
459	0.42
460	0.35
461	0.3
462	0.29
463	0.28
464	0.23
465	0.19
466	0.18
467	0.15
468	0.14
469	0.16
470	0.15
471	0.15
472	0.14
473	0.17
474	0.17
475	0.16
476	0.15
477	0.12
478	0.12
479	0.12
480	0.12
481	0.1
482	0.13
483	0.17
484	0.21
485	0.29
486	0.29
487	0.35
488	0.42
489	0.49
490	0.56
491	0.61
492	0.63
493	0.64
494	0.67
495	0.68
496	0.67

A0A4S8MRJ2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer