FuNGI

A0A4S8LTP8

Protein Details

Accession

A0A4S8LTP8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
498-517	TTTTKKATKGTRKMRRMLKM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
713-716	KRKK

Subcellular Location(s)

nucl 11, mito 11, mito_nucl 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036735 NGN_dom_sf IPR039659 SPT5 IPR022581 Spt5_N
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF11942 Spt5_N

Amino Acid Sequences

MIPPSLQRHVLNMLIPPKKSNLSCLKLVSDIVDETQEHQHHQSYQYHHQQQQHQQQQLQLTPSKGVYIPGNHPHPNSHSHSNAEGSSCHLTRKRLSLQTLRIRTTWQLDLKIIISLITLRWRWPYQQGYITCQQQQPHHRYPQRSLDAAAVPLPPPPRPTSRWKEDWEELELCGATAGGGGTWRNRVQALPILKGASDGNSRHQPINPFLRSVDGINTHDSSYYLTPAGGMTTAQVLPGSTNNIGRQVVNLDAMIRLTNEFHFPIASFRHGDHPVLASRHLLYEAQQAFYYGLQPGLAIASVTSTPADTPGIFGTGIPSGDGLFFLGLSVAFHTGALNVFDVNGGDEGGEGEREGEGEGEGEKAVIKDEVGLHVAMGHDMNVGLSTQIGMLREMISGSKGSWEEVRNGELPLIIHVDNVDIMATLIKLKYDTEMDSHSNARIRMTFTGASEAHILADEIARAGIAVVLTPSRLFPRSWDARRTLCTPLCQTLKIMDMTTTTKKATKGTRKMRRMLKMMMQTTNRLAENCTRMMMMTSIEAEVSDEDEEEEDDEEYGVDGFFETGGAEDDDSSRRHHARLARRQMEEEEKSPKQIARDLNQRYGGRAAVRYTGDMNEIPQRLLMPSVHEASLWQVRVKPGREREIVFSLPGSQRSSWCLSHGINLVPIEEMASLLQIKKQDTTVVDIAENGEEVGLKFIPRIDLTPRDDGGDKKRKKTAGMRPPQQLFNFEESKSTVGIMSQREDLLSSSKINALILEDVNPTLDEITQFSRRQDGLEENMVDLSIIAEASRKAAISVLQPGEHVISG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.39
3	0.38
4	0.38
5	0.43
6	0.42
7	0.45
8	0.46
9	0.46
10	0.5
11	0.51
12	0.49
13	0.44
14	0.44
15	0.37
16	0.29
17	0.24
18	0.2
19	0.19
20	0.17
21	0.18
22	0.25
23	0.25
24	0.25
25	0.27
26	0.3
27	0.31
28	0.36
29	0.4
30	0.4
31	0.48
32	0.56
33	0.62
34	0.64
35	0.68
36	0.72
37	0.75
38	0.79
39	0.78
40	0.74
41	0.68
42	0.67
43	0.65
44	0.6
45	0.55
46	0.49
47	0.41
48	0.37
49	0.35
50	0.33
51	0.27
52	0.25
53	0.24
54	0.25
55	0.31
56	0.37
57	0.43
58	0.45
59	0.45
60	0.47
61	0.46
62	0.48
63	0.48
64	0.47
65	0.43
66	0.43
67	0.44
68	0.43
69	0.41
70	0.35
71	0.28
72	0.25
73	0.28
74	0.25
75	0.29
76	0.3
77	0.33
78	0.36
79	0.44
80	0.49
81	0.5
82	0.57
83	0.6
84	0.66
85	0.71
86	0.74
87	0.69
88	0.61
89	0.56
90	0.52
91	0.49
92	0.46
93	0.4
94	0.36
95	0.34
96	0.35
97	0.33
98	0.3
99	0.24
100	0.17
101	0.13
102	0.1
103	0.11
104	0.15
105	0.15
106	0.16
107	0.22
108	0.24
109	0.27
110	0.34
111	0.38
112	0.38
113	0.45
114	0.46
115	0.47
116	0.52
117	0.53
118	0.5
119	0.48
120	0.46
121	0.46
122	0.53
123	0.56
124	0.58
125	0.64
126	0.66
127	0.68
128	0.72
129	0.74
130	0.7
131	0.63
132	0.55
133	0.49
134	0.44
135	0.39
136	0.33
137	0.24
138	0.18
139	0.2
140	0.2
141	0.17
142	0.19
143	0.23
144	0.27
145	0.31
146	0.41
147	0.47
148	0.54
149	0.6
150	0.61
151	0.64
152	0.64
153	0.62
154	0.58
155	0.5
156	0.41
157	0.35
158	0.3
159	0.22
160	0.16
161	0.12
162	0.06
163	0.05
164	0.05
165	0.03
166	0.05
167	0.06
168	0.07
169	0.12
170	0.13
171	0.14
172	0.14
173	0.15
174	0.17
175	0.23
176	0.26
177	0.24
178	0.25
179	0.24
180	0.24
181	0.24
182	0.21
183	0.17
184	0.18
185	0.17
186	0.21
187	0.27
188	0.3
189	0.31
190	0.34
191	0.35
192	0.37
193	0.45
194	0.41
195	0.36
196	0.33
197	0.34
198	0.32
199	0.29
200	0.26
201	0.2
202	0.2
203	0.22
204	0.22
205	0.2
206	0.19
207	0.18
208	0.17
209	0.14
210	0.14
211	0.11
212	0.1
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.07
217	0.06
218	0.05
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.06
224	0.07
225	0.08
226	0.11
227	0.1
228	0.13
229	0.13
230	0.16
231	0.17
232	0.16
233	0.16
234	0.15
235	0.14
236	0.13
237	0.12
238	0.09
239	0.09
240	0.09
241	0.09
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.08
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.12
252	0.13
253	0.15
254	0.14
255	0.14
256	0.2
257	0.22
258	0.22
259	0.2
260	0.2
261	0.21
262	0.21
263	0.21
264	0.16
265	0.15
266	0.15
267	0.15
268	0.13
269	0.1
270	0.17
271	0.18
272	0.17
273	0.17
274	0.17
275	0.16
276	0.16
277	0.16
278	0.08
279	0.07
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.05
284	0.05
285	0.04
286	0.03
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.05
294	0.06
295	0.05
296	0.07
297	0.07
298	0.08
299	0.07
300	0.07
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.07
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.05
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.06
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.03
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.03
338	0.04
339	0.03
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.03
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.05
352	0.04
353	0.04
354	0.05
355	0.06
356	0.06
357	0.07
358	0.07
359	0.06
360	0.07
361	0.07
362	0.06
363	0.06
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.03
373	0.03
374	0.04
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.1
389	0.11
390	0.13
391	0.14
392	0.16
393	0.15
394	0.15
395	0.14
396	0.12
397	0.11
398	0.09
399	0.1
400	0.08
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.06
405	0.06
406	0.05
407	0.03
408	0.03
409	0.03
410	0.03
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.06
417	0.07
418	0.08
419	0.08
420	0.12
421	0.13
422	0.15
423	0.16
424	0.16
425	0.17
426	0.17
427	0.16
428	0.15
429	0.15
430	0.14
431	0.16
432	0.16
433	0.14
434	0.18
435	0.17
436	0.17
437	0.16
438	0.14
439	0.11
440	0.1
441	0.1
442	0.06
443	0.06
444	0.05
445	0.04
446	0.03
447	0.03
448	0.03
449	0.03
450	0.03
451	0.03
452	0.03
453	0.03
454	0.03
455	0.04
456	0.04
457	0.05
458	0.06
459	0.08
460	0.08
461	0.1
462	0.19
463	0.27
464	0.32
465	0.36
466	0.38
467	0.4
468	0.43
469	0.45
470	0.43
471	0.36
472	0.36
473	0.34
474	0.36
475	0.34
476	0.31
477	0.29
478	0.24
479	0.24
480	0.21
481	0.19
482	0.13
483	0.13
484	0.16
485	0.18
486	0.19
487	0.17
488	0.19
489	0.2
490	0.25
491	0.33
492	0.39
493	0.47
494	0.56
495	0.66
496	0.7
497	0.77
498	0.8
499	0.78
500	0.73
501	0.67
502	0.64
503	0.61
504	0.58
505	0.56
506	0.49
507	0.43
508	0.4
509	0.38
510	0.31
511	0.24
512	0.22
513	0.21
514	0.23
515	0.22
516	0.2
517	0.17
518	0.16
519	0.17
520	0.15
521	0.11
522	0.08
523	0.08
524	0.07
525	0.07
526	0.07
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.06
531	0.05
532	0.05
533	0.06
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.05
538	0.05
539	0.05
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.04
544	0.04
545	0.03
546	0.03
547	0.03
548	0.03
549	0.03
550	0.03
551	0.04
552	0.05
553	0.05
554	0.05
555	0.07
556	0.09
557	0.1
558	0.12
559	0.17
560	0.18
561	0.19
562	0.23
563	0.3
564	0.39
565	0.49
566	0.57
567	0.6
568	0.6
569	0.62
570	0.62
571	0.62
572	0.55
573	0.48
574	0.45
575	0.38
576	0.38
577	0.39
578	0.36
579	0.29
580	0.31
581	0.34
582	0.34
583	0.43
584	0.45
585	0.49
586	0.54
587	0.52
588	0.48
589	0.44
590	0.39
591	0.31
592	0.28
593	0.24
594	0.22
595	0.22
596	0.21
597	0.21
598	0.19
599	0.19
600	0.17
601	0.18
602	0.2
603	0.2
604	0.19
605	0.17
606	0.17
607	0.15
608	0.17
609	0.15
610	0.13
611	0.16
612	0.18
613	0.18
614	0.17
615	0.16
616	0.19
617	0.23
618	0.2
619	0.18
620	0.19
621	0.24
622	0.31
623	0.35
624	0.39
625	0.42
626	0.49
627	0.52
628	0.52
629	0.52
630	0.51
631	0.48
632	0.4
633	0.33
634	0.31
635	0.29
636	0.29
637	0.27
638	0.22
639	0.23
640	0.27
641	0.31
642	0.26
643	0.26
644	0.27
645	0.24
646	0.28
647	0.3
648	0.26
649	0.25
650	0.24
651	0.22
652	0.18
653	0.17
654	0.13
655	0.1
656	0.09
657	0.06
658	0.07
659	0.07
660	0.08
661	0.1
662	0.12
663	0.14
664	0.15
665	0.16
666	0.19
667	0.19
668	0.25
669	0.26
670	0.24
671	0.23
672	0.22
673	0.22
674	0.18
675	0.17
676	0.1
677	0.07
678	0.06
679	0.06
680	0.08
681	0.08
682	0.07
683	0.08
684	0.09
685	0.12
686	0.13
687	0.15
688	0.19
689	0.27
690	0.31
691	0.36
692	0.36
693	0.36
694	0.37
695	0.4
696	0.44
697	0.47
698	0.49
699	0.5
700	0.57
701	0.57
702	0.63
703	0.68
704	0.69
705	0.69
706	0.74
707	0.75
708	0.77
709	0.79
710	0.78
711	0.7
712	0.63
713	0.56
714	0.52
715	0.47
716	0.38
717	0.36
718	0.3
719	0.3
720	0.26
721	0.21
722	0.15
723	0.14
724	0.18
725	0.19
726	0.2
727	0.2
728	0.2
729	0.2
730	0.21
731	0.2
732	0.19
733	0.18
734	0.17
735	0.17
736	0.19
737	0.19
738	0.19
739	0.18
740	0.16
741	0.17
742	0.16
743	0.16
744	0.15
745	0.15
746	0.15
747	0.15
748	0.13
749	0.1
750	0.1
751	0.09
752	0.11
753	0.16
754	0.22
755	0.24
756	0.25
757	0.31
758	0.31
759	0.31
760	0.33
761	0.34
762	0.33
763	0.38
764	0.37
765	0.32
766	0.32
767	0.3
768	0.25
769	0.19
770	0.13
771	0.06
772	0.05
773	0.05
774	0.06
775	0.07
776	0.09
777	0.1
778	0.09
779	0.09
780	0.11
781	0.14
782	0.16
783	0.24
784	0.25
785	0.24
786	0.25
787	0.26

A0A4S8LTP8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer