FuNGI

A0A4V4HCY2

Protein Details

Accession

A0A4V4HCY2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
369-393	KVLLVPRLRSNRKRKSRSPQGLFNP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
374-385	PRLRSNRKRKSR
991-1005	ARDAAAKPKPPRKKR

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II

Amino Acid Sequences

MPRKKTKFILEEAEVDDEEDGETDSNDELDHPAEWNEPEYWQDEDSHIVPFADSKSDTDEDPCASAAYRNSHLREFFALVDIIEEQYVRNPTCPTQVPLDADNQVSNKDLRLILLGLSPRNVYRLKCKRGQETMLVMDIYRYFLQRPQSERLSLPVSSSKSSRDTRGWDVVQRFALGAFSTLPETETELQNIYGDQYEPTQWQDILHSINDQEDGGDASTILAEIEKHLSKGDPSSPDVLESTHPSLPRNQLLCGQVDYSAAAHLLQPLPKAPVYSAFTAPSVLGWIYLEATIDSDFQGWLCKRLDVVHTSTGNVVLEVVEQVEVAQLLSSSCPSIEPFTWIRVTKGLYRHDIGLVLARESSLGGRRLKVLLVPRLRSNRKRKSRSPQGLFNPINFYRSDYTVLGHCRYQYQGDVFDHGLIELIVDYASVTYTDVEPDQATRLYFAQSGHSIYRKYPMPAPRSWVFFYGDRVKVRCSEPLIGTDWKDKPTHGGKTYEKMGQVICVEVHRCRVEFDDEADVWVDIRDLRKVIRTGDFLEVVGGAHIGRSASVLDVVGDVADAVLADRVDRNQTTILSLHVNMCRVTQKHLNAAVPWIDEHVAIVKGMYGSYTGTVVDVHIPKPFTVVDVYIPQLRQTVKIRHDYLIHTLSNRPLNHVHPLSVSQQAFRQSDWDLQPAPNIPNEPRASDAVGYNPVDQQFRASTPPSPWWGVEVFIIKGEWKGQGFVKNVERRTPDKSRSGVMVLVELQRWSASSGANPCVQVDYDFLRDPRSGLGLNEAYPLRGQQRYYEPRFRASPVDPIKLKLPVPPPPPSSPLLRPSTPPISPEETMTDVGAWNPSAPLPPVWPLLPELAGKEFLATYRSREGAGTYALQKGVEIKPHLLLQKVQVWTGREYVFVQPEDILPCQDKIDPTRTRKAMLAISGEHIGKYIRPITNKYTLEGKAVFTAKTFSNWGRADETLLDEWIEIAPEHLARISDDPNEKRWSPMMRIARDAAAKPKPPRKKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.35
3	0.28
4	0.19
5	0.16
6	0.11
7	0.09
8	0.07
9	0.07
10	0.07
11	0.08
12	0.07
13	0.07
14	0.08
15	0.09
16	0.1
17	0.1
18	0.1
19	0.12
20	0.14
21	0.15
22	0.17
23	0.17
24	0.16
25	0.18
26	0.19
27	0.2
28	0.18
29	0.19
30	0.17
31	0.2
32	0.2
33	0.2
34	0.18
35	0.16
36	0.15
37	0.16
38	0.16
39	0.16
40	0.16
41	0.16
42	0.21
43	0.22
44	0.23
45	0.24
46	0.25
47	0.22
48	0.23
49	0.22
50	0.16
51	0.16
52	0.18
53	0.2
54	0.23
55	0.28
56	0.33
57	0.36
58	0.41
59	0.41
60	0.41
61	0.4
62	0.36
63	0.31
64	0.26
65	0.23
66	0.18
67	0.18
68	0.16
69	0.13
70	0.11
71	0.1
72	0.08
73	0.12
74	0.17
75	0.17
76	0.19
77	0.21
78	0.23
79	0.3
80	0.33
81	0.32
82	0.33
83	0.37
84	0.38
85	0.37
86	0.39
87	0.35
88	0.32
89	0.32
90	0.27
91	0.23
92	0.22
93	0.21
94	0.17
95	0.18
96	0.17
97	0.15
98	0.16
99	0.16
100	0.15
101	0.18
102	0.2
103	0.17
104	0.19
105	0.19
106	0.17
107	0.21
108	0.24
109	0.23
110	0.31
111	0.4
112	0.47
113	0.53
114	0.6
115	0.65
116	0.7
117	0.72
118	0.68
119	0.64
120	0.59
121	0.53
122	0.46
123	0.37
124	0.3
125	0.25
126	0.22
127	0.16
128	0.14
129	0.13
130	0.17
131	0.25
132	0.3
133	0.35
134	0.39
135	0.43
136	0.45
137	0.44
138	0.45
139	0.41
140	0.35
141	0.33
142	0.32
143	0.3
144	0.29
145	0.3
146	0.29
147	0.32
148	0.35
149	0.38
150	0.37
151	0.4
152	0.44
153	0.51
154	0.5
155	0.5
156	0.49
157	0.48
158	0.44
159	0.38
160	0.31
161	0.23
162	0.21
163	0.14
164	0.12
165	0.09
166	0.08
167	0.09
168	0.09
169	0.09
170	0.09
171	0.13
172	0.15
173	0.15
174	0.16
175	0.16
176	0.16
177	0.16
178	0.15
179	0.12
180	0.11
181	0.1
182	0.09
183	0.1
184	0.11
185	0.12
186	0.15
187	0.16
188	0.15
189	0.15
190	0.16
191	0.17
192	0.17
193	0.17
194	0.16
195	0.14
196	0.15
197	0.15
198	0.13
199	0.1
200	0.08
201	0.09
202	0.08
203	0.07
204	0.06
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.04
210	0.04
211	0.05
212	0.1
213	0.1
214	0.11
215	0.12
216	0.13
217	0.14
218	0.17
219	0.21
220	0.21
221	0.23
222	0.26
223	0.25
224	0.26
225	0.25
226	0.22
227	0.19
228	0.2
229	0.21
230	0.2
231	0.21
232	0.21
233	0.26
234	0.3
235	0.35
236	0.32
237	0.3
238	0.32
239	0.34
240	0.34
241	0.3
242	0.25
243	0.19
244	0.18
245	0.17
246	0.12
247	0.1
248	0.08
249	0.07
250	0.07
251	0.08
252	0.1
253	0.11
254	0.11
255	0.12
256	0.15
257	0.15
258	0.15
259	0.13
260	0.18
261	0.2
262	0.23
263	0.23
264	0.22
265	0.21
266	0.21
267	0.21
268	0.14
269	0.12
270	0.09
271	0.07
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.05
278	0.06
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.12
286	0.12
287	0.15
288	0.16
289	0.16
290	0.16
291	0.19
292	0.23
293	0.21
294	0.24
295	0.27
296	0.26
297	0.27
298	0.26
299	0.25
300	0.21
301	0.17
302	0.13
303	0.06
304	0.06
305	0.05
306	0.05
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.03
314	0.03
315	0.04
316	0.04
317	0.05
318	0.04
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.09
323	0.09
324	0.13
325	0.14
326	0.17
327	0.21
328	0.21
329	0.21
330	0.21
331	0.23
332	0.23
333	0.29
334	0.3
335	0.3
336	0.31
337	0.31
338	0.29
339	0.27
340	0.22
341	0.21
342	0.17
343	0.13
344	0.12
345	0.1
346	0.1
347	0.09
348	0.11
349	0.1
350	0.14
351	0.15
352	0.16
353	0.18
354	0.18
355	0.19
356	0.2
357	0.22
358	0.26
359	0.3
360	0.32
361	0.36
362	0.45
363	0.53
364	0.59
365	0.64
366	0.67
367	0.72
368	0.79
369	0.82
370	0.84
371	0.87
372	0.88
373	0.84
374	0.82
375	0.77
376	0.79
377	0.7
378	0.61
379	0.56
380	0.45
381	0.41
382	0.32
383	0.28
384	0.2
385	0.2
386	0.22
387	0.16
388	0.16
389	0.18
390	0.21
391	0.2
392	0.19
393	0.18
394	0.16
395	0.17
396	0.17
397	0.16
398	0.14
399	0.17
400	0.17
401	0.19
402	0.18
403	0.17
404	0.16
405	0.13
406	0.12
407	0.07
408	0.06
409	0.04
410	0.03
411	0.03
412	0.03
413	0.03
414	0.03
415	0.03
416	0.03
417	0.03
418	0.04
419	0.04
420	0.05
421	0.05
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.07
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.09
430	0.09
431	0.1
432	0.1
433	0.11
434	0.12
435	0.14
436	0.14
437	0.16
438	0.16
439	0.15
440	0.19
441	0.19
442	0.2
443	0.23
444	0.29
445	0.32
446	0.32
447	0.38
448	0.36
449	0.38
450	0.37
451	0.33
452	0.29
453	0.24
454	0.28
455	0.29
456	0.3
457	0.28
458	0.28
459	0.27
460	0.28
461	0.28
462	0.27
463	0.23
464	0.22
465	0.21
466	0.22
467	0.24
468	0.22
469	0.22
470	0.24
471	0.23
472	0.22
473	0.22
474	0.2
475	0.22
476	0.26
477	0.31
478	0.28
479	0.33
480	0.33
481	0.36
482	0.39
483	0.36
484	0.3
485	0.25
486	0.22
487	0.18
488	0.16
489	0.13
490	0.1
491	0.09
492	0.1
493	0.09
494	0.13
495	0.12
496	0.12
497	0.12
498	0.14
499	0.16
500	0.15
501	0.16
502	0.16
503	0.15
504	0.16
505	0.15
506	0.13
507	0.1
508	0.09
509	0.07
510	0.05
511	0.06
512	0.06
513	0.07
514	0.07
515	0.11
516	0.12
517	0.15
518	0.17
519	0.18
520	0.2
521	0.21
522	0.21
523	0.17
524	0.16
525	0.13
526	0.1
527	0.08
528	0.06
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.03
535	0.04
536	0.03
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.03
543	0.03
544	0.03
545	0.02
546	0.02
547	0.02
548	0.02
549	0.03
550	0.03
551	0.03
552	0.04
553	0.04
554	0.07
555	0.07
556	0.09
557	0.09
558	0.1
559	0.11
560	0.11
561	0.12
562	0.11
563	0.12
564	0.14
565	0.14
566	0.15
567	0.13
568	0.14
569	0.17
570	0.16
571	0.2
572	0.23
573	0.24
574	0.28
575	0.31
576	0.31
577	0.27
578	0.28
579	0.25
580	0.19
581	0.17
582	0.13
583	0.1
584	0.08
585	0.08
586	0.08
587	0.07
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.04
595	0.04
596	0.05
597	0.05
598	0.05
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.09
603	0.1
604	0.11
605	0.12
606	0.13
607	0.13
608	0.14
609	0.14
610	0.11
611	0.1
612	0.1
613	0.1
614	0.11
615	0.13
616	0.14
617	0.14
618	0.13
619	0.15
620	0.15
621	0.18
622	0.23
623	0.29
624	0.31
625	0.39
626	0.41
627	0.4
628	0.42
629	0.39
630	0.39
631	0.35
632	0.31
633	0.25
634	0.25
635	0.27
636	0.31
637	0.29
638	0.26
639	0.25
640	0.27
641	0.33
642	0.32
643	0.28
644	0.23
645	0.26
646	0.24
647	0.28
648	0.26
649	0.2
650	0.21
651	0.26
652	0.26
653	0.23
654	0.23
655	0.18
656	0.24
657	0.25
658	0.25
659	0.21
660	0.21
661	0.23
662	0.23
663	0.23
664	0.18
665	0.19
666	0.17
667	0.23
668	0.24
669	0.23
670	0.23
671	0.23
672	0.22
673	0.21
674	0.21
675	0.15
676	0.18
677	0.18
678	0.16
679	0.17
680	0.17
681	0.17
682	0.16
683	0.17
684	0.14
685	0.15
686	0.17
687	0.17
688	0.18
689	0.2
690	0.24
691	0.26
692	0.26
693	0.24
694	0.23
695	0.22
696	0.2
697	0.19
698	0.17
699	0.14
700	0.12
701	0.13
702	0.11
703	0.11
704	0.11
705	0.12
706	0.1
707	0.12
708	0.14
709	0.21
710	0.23
711	0.28
712	0.35
713	0.39
714	0.41
715	0.44
716	0.46
717	0.43
718	0.49
719	0.52
720	0.49
721	0.5
722	0.5
723	0.47
724	0.45
725	0.43
726	0.37
727	0.29
728	0.24
729	0.19
730	0.19
731	0.17
732	0.14
733	0.12
734	0.1
735	0.11
736	0.1
737	0.09
738	0.08
739	0.11
740	0.15
741	0.18
742	0.2
743	0.2
744	0.19
745	0.19
746	0.19
747	0.16
748	0.14
749	0.14
750	0.16
751	0.18
752	0.18
753	0.2
754	0.19
755	0.19
756	0.18
757	0.18
758	0.15
759	0.14
760	0.19
761	0.18
762	0.18
763	0.21
764	0.2
765	0.17
766	0.17
767	0.19
768	0.17
769	0.19
770	0.19
771	0.2
772	0.31
773	0.4
774	0.48
775	0.55
776	0.53
777	0.55
778	0.57
779	0.54
780	0.5
781	0.43
782	0.45
783	0.42
784	0.48
785	0.43
786	0.43
787	0.43
788	0.41
789	0.4
790	0.36
791	0.36
792	0.37
793	0.41
794	0.46
795	0.48
796	0.48
797	0.51
798	0.47
799	0.47
800	0.45
801	0.47
802	0.46
803	0.42
804	0.41
805	0.44
806	0.48
807	0.43
808	0.38
809	0.36
810	0.36
811	0.35
812	0.34
813	0.31
814	0.27
815	0.27
816	0.26
817	0.21
818	0.15
819	0.15
820	0.14
821	0.11
822	0.08
823	0.08
824	0.08
825	0.1
826	0.11
827	0.11
828	0.12
829	0.15
830	0.17
831	0.17
832	0.18
833	0.18
834	0.18
835	0.19
836	0.17
837	0.16
838	0.16
839	0.17
840	0.15
841	0.15
842	0.13
843	0.12
844	0.14
845	0.13
846	0.15
847	0.19
848	0.2
849	0.19
850	0.2
851	0.2
852	0.2
853	0.22
854	0.21
855	0.19
856	0.2
857	0.2
858	0.2
859	0.18
860	0.21
861	0.21
862	0.24
863	0.25
864	0.24
865	0.26
866	0.3
867	0.33
868	0.3
869	0.29
870	0.28
871	0.32
872	0.32
873	0.32
874	0.31
875	0.32
876	0.32
877	0.34
878	0.3
879	0.24
880	0.26
881	0.29
882	0.3
883	0.27
884	0.26
885	0.22
886	0.24
887	0.25
888	0.24
889	0.21
890	0.18
891	0.19
892	0.19
893	0.21
894	0.23
895	0.25
896	0.33
897	0.4
898	0.45
899	0.54
900	0.54
901	0.54
902	0.53
903	0.53
904	0.49
905	0.44
906	0.41
907	0.33
908	0.33
909	0.34
910	0.32
911	0.26
912	0.22
913	0.19
914	0.15
915	0.18
916	0.23
917	0.24
918	0.28
919	0.34
920	0.4
921	0.49
922	0.49
923	0.47
924	0.47
925	0.44
926	0.45
927	0.41
928	0.36
929	0.32
930	0.33
931	0.31
932	0.24
933	0.26
934	0.21
935	0.23
936	0.26
937	0.22
938	0.29
939	0.3
940	0.32
941	0.33
942	0.33
943	0.33
944	0.3
945	0.32
946	0.24
947	0.23
948	0.2
949	0.16
950	0.16
951	0.14
952	0.13
953	0.08
954	0.07
955	0.09
956	0.09
957	0.1
958	0.1
959	0.11
960	0.12
961	0.15
962	0.18
963	0.23
964	0.31
965	0.34
966	0.39
967	0.45
968	0.44
969	0.44
970	0.47
971	0.47
972	0.44
973	0.51
974	0.54
975	0.52
976	0.56
977	0.55
978	0.54
979	0.52
980	0.49
981	0.49
982	0.47
983	0.51
984	0.56
985	0.64

A0A4V4HCY2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer