Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V4HDG2

Protein Details
Accession A0A4V4HDG2    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
439-461GKETCDRGRLRPCRMCRCHCLDRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
204-209KRLKRR
Subcellular Location(s) extr 13, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040182  ATG13  
IPR018731  Atg13_N  
IPR036570  HORMA_dom_sf  
Gene Ontology GO:1990316  C:Atg1/ULK1 kinase complex  
GO:0000045  P:autophagosome assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF10033  ATG13  
Amino Acid Sequences MSNDTQKADQIAFHFYTKLFYVLNHARATAEPGTNAKVDKWFNLETPDSDLFPRESRDRYKSISTSLSASASNSSSSLSSPSSSFSSSTGVPPLEIQVLLTIPDLNTNQVLVYLPDSSSSTSTRNRVQPTPKHVLLEKWVLEFTPRNATHRTRDRDRDGREGAEEASGPAGSSVALSTIYKHGIPLFRSLFSLLRILPAWKVAKRLKRRGLGGGAANGMSVVLRVVDPTSAGGAGDILGFGPSSSQSDAPHYQTQVSQTLTLPTSTHAFPPVPHPLGTLTLTSTYLSNPNFRIDELESLLSSRFLYLEQEVGRGVGIGGAGVYQYDQEQERDRERERQLREREVADDDNFVPTLVKNQQRESLISSGGTGLGGGGLLAQGPLPVPTSNFPARSPPRDIPRLQQRGNISGLGVGGKEDAESWRIGLCCSVLLLLPPMIGGKETCDRGRLRPCRMCRCHCLDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.23
3 0.25
4 0.23
5 0.23
6 0.17
7 0.15
8 0.23
9 0.28
10 0.34
11 0.32
12 0.31
13 0.3
14 0.3
15 0.36
16 0.32
17 0.26
18 0.22
19 0.24
20 0.26
21 0.27
22 0.28
23 0.24
24 0.26
25 0.26
26 0.27
27 0.3
28 0.3
29 0.3
30 0.34
31 0.35
32 0.29
33 0.34
34 0.33
35 0.28
36 0.27
37 0.27
38 0.25
39 0.25
40 0.28
41 0.26
42 0.31
43 0.37
44 0.43
45 0.45
46 0.48
47 0.53
48 0.51
49 0.51
50 0.49
51 0.43
52 0.39
53 0.37
54 0.33
55 0.26
56 0.24
57 0.21
58 0.17
59 0.16
60 0.13
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.13
65 0.12
66 0.13
67 0.12
68 0.15
69 0.16
70 0.17
71 0.17
72 0.15
73 0.17
74 0.17
75 0.18
76 0.19
77 0.17
78 0.16
79 0.16
80 0.16
81 0.15
82 0.13
83 0.12
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.07
90 0.1
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.08
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.13
107 0.16
108 0.2
109 0.24
110 0.3
111 0.36
112 0.4
113 0.45
114 0.53
115 0.56
116 0.6
117 0.65
118 0.6
119 0.56
120 0.53
121 0.48
122 0.43
123 0.42
124 0.34
125 0.27
126 0.25
127 0.22
128 0.24
129 0.23
130 0.2
131 0.24
132 0.23
133 0.25
134 0.3
135 0.34
136 0.41
137 0.49
138 0.54
139 0.52
140 0.6
141 0.65
142 0.68
143 0.69
144 0.68
145 0.61
146 0.54
147 0.47
148 0.41
149 0.33
150 0.25
151 0.2
152 0.12
153 0.1
154 0.08
155 0.07
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.03
161 0.03
162 0.04
163 0.04
164 0.06
165 0.07
166 0.09
167 0.08
168 0.09
169 0.11
170 0.14
171 0.15
172 0.2
173 0.2
174 0.2
175 0.2
176 0.21
177 0.2
178 0.17
179 0.18
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.14
186 0.16
187 0.16
188 0.23
189 0.27
190 0.35
191 0.44
192 0.54
193 0.57
194 0.6
195 0.61
196 0.59
197 0.56
198 0.51
199 0.43
200 0.35
201 0.27
202 0.21
203 0.18
204 0.13
205 0.1
206 0.06
207 0.04
208 0.03
209 0.02
210 0.02
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.02
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.05
232 0.06
233 0.07
234 0.12
235 0.14
236 0.18
237 0.2
238 0.2
239 0.2
240 0.2
241 0.22
242 0.2
243 0.19
244 0.16
245 0.14
246 0.16
247 0.15
248 0.15
249 0.12
250 0.1
251 0.12
252 0.11
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.16
258 0.22
259 0.21
260 0.21
261 0.21
262 0.2
263 0.22
264 0.22
265 0.17
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.09
272 0.12
273 0.13
274 0.15
275 0.16
276 0.18
277 0.18
278 0.18
279 0.2
280 0.17
281 0.18
282 0.17
283 0.17
284 0.14
285 0.14
286 0.14
287 0.11
288 0.1
289 0.08
290 0.06
291 0.06
292 0.08
293 0.07
294 0.11
295 0.11
296 0.12
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.09
301 0.08
302 0.05
303 0.04
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.05
313 0.07
314 0.09
315 0.14
316 0.19
317 0.24
318 0.29
319 0.32
320 0.39
321 0.45
322 0.51
323 0.53
324 0.59
325 0.61
326 0.63
327 0.64
328 0.57
329 0.53
330 0.49
331 0.45
332 0.36
333 0.32
334 0.25
335 0.23
336 0.21
337 0.18
338 0.14
339 0.11
340 0.15
341 0.2
342 0.26
343 0.27
344 0.3
345 0.36
346 0.37
347 0.39
348 0.38
349 0.34
350 0.28
351 0.25
352 0.23
353 0.17
354 0.15
355 0.13
356 0.08
357 0.05
358 0.04
359 0.04
360 0.03
361 0.03
362 0.02
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.04
368 0.04
369 0.06
370 0.07
371 0.09
372 0.11
373 0.17
374 0.22
375 0.24
376 0.24
377 0.33
378 0.39
379 0.44
380 0.49
381 0.5
382 0.55
383 0.6
384 0.62
385 0.61
386 0.65
387 0.69
388 0.64
389 0.63
390 0.58
391 0.55
392 0.55
393 0.46
394 0.35
395 0.26
396 0.24
397 0.19
398 0.14
399 0.1
400 0.08
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.13
409 0.14
410 0.14
411 0.14
412 0.13
413 0.11
414 0.11
415 0.11
416 0.08
417 0.09
418 0.11
419 0.11
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.09
424 0.1
425 0.09
426 0.12
427 0.18
428 0.23
429 0.24
430 0.29
431 0.32
432 0.39
433 0.5
434 0.54
435 0.59
436 0.64
437 0.73
438 0.78
439 0.85
440 0.85
441 0.83