Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7QCL6

Protein Details
Accession A0A4Y7QCL6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
374-393PSRSRTASPRQPKPPNHPPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
368-386SPPRSPPSRSRTASPRQPK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.333, cyto 12, nucl 9.5, cyto_mito 9.499, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00780  CNH  
PF10366  Vps39_1  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MSSVNPAEVPPFQLQQLISTVIQQNVSSGRRDSRVPAEVTCAQALGSEIYIGCSDGSLMRFALQADDPNSPESYKILSQQTLPTNKPIDEIVLTPSISRALILSAHQIHIYSIPSLDPVQINPIRNVIHFAVDDRQLHRVQPSVADQLAMASVEPVEFAVIKRSSIALFSLTDRLIFHQDIPIPQPGRLARRTGNFLCMAGRDTYDLIDLHHSSSLSVLPISQASFDGPPPPPIKPSITVVGENEFLLLTSLGESTIGVFVTGEGDPTRSPLEWPAHPDAVCVDYPYVAALLPNHSIEIHNLEASTLVQVITPPPTSPGPSPTAPEPRSLLAACMGFLVPSTQRTEKLRLVRMPLITLPPRARSPPVSPPRSPPSRSRTASPRQPKPPNHPPSPVVRPPVFPRATVLVLCANGVQCLLPSTLISQAEALLSAHRIEDALELAEQNARKMLGSSQGDEDQAEELRYVHQRAGMQLLSETRFEDAGRALLAGDADPRILIRLFPDLRGSLFNPEDTLDVFAGVAEHLPPQTSIDEIVVDNLVRNYSPHLKPDTRSAPPTAELRRILTSAARDMLKAYLRKCRTRRLLERANGNKEMNAVVDTVLVKILAESEETAELYTLLDGAHDVVLQEVEQPLVKNGQYNALCKLYVARGDEGKLLEAWQQLADGVWTDEDISNPLERMVELLQKTSNWSLAQQWGIWLVGKDADLGLKLLIARDSRRSSKADDVSMLERIRAADESAGTRFLEYLVLQKRSNDPDLHEQLATSCINQLTQALSDDTIAKLWRAKASSYASSPTDTPFLSYFASTTPESPSKLIRLKTALFLQGSSHYSFSAILDRIQPHATILRLERAILFGQLGRHADALGALVNDVKDAASAEAYCTLGGVVVPAKVALAIGERHGLQRWATLVAGTKGINASASMERQKSADGGTQRELLRVLLGVYMSGGKATADRTARLLNSQAINLDVADVLALVPPDWPLNALSSFLARSFRRTLHTEHEGALVKAICEGQNLEISDRTYEILRSEGAVIEEPASDEEDDGDGGDVNEKEKADEGDSVHDSDEVPVVHEKDARLSEKVAGIVLADGGDGGEETSLPPPPPRKESLAHRNTSFLGRDGLRTPGRDVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.24
4 0.23
5 0.2
6 0.23
7 0.26
8 0.25
9 0.26
10 0.23
11 0.23
12 0.26
13 0.28
14 0.26
15 0.26
16 0.29
17 0.31
18 0.34
19 0.37
20 0.38
21 0.43
22 0.43
23 0.4
24 0.42
25 0.43
26 0.44
27 0.38
28 0.3
29 0.23
30 0.21
31 0.21
32 0.15
33 0.11
34 0.09
35 0.09
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.09
40 0.07
41 0.08
42 0.1
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.12
47 0.13
48 0.13
49 0.16
50 0.14
51 0.18
52 0.2
53 0.23
54 0.24
55 0.25
56 0.26
57 0.23
58 0.22
59 0.19
60 0.2
61 0.19
62 0.24
63 0.27
64 0.28
65 0.3
66 0.37
67 0.44
68 0.46
69 0.46
70 0.46
71 0.45
72 0.43
73 0.42
74 0.35
75 0.3
76 0.25
77 0.24
78 0.21
79 0.2
80 0.2
81 0.18
82 0.18
83 0.16
84 0.14
85 0.13
86 0.1
87 0.08
88 0.1
89 0.11
90 0.17
91 0.18
92 0.19
93 0.2
94 0.19
95 0.19
96 0.19
97 0.2
98 0.14
99 0.12
100 0.11
101 0.13
102 0.13
103 0.15
104 0.14
105 0.13
106 0.21
107 0.25
108 0.27
109 0.27
110 0.3
111 0.29
112 0.28
113 0.33
114 0.25
115 0.24
116 0.22
117 0.23
118 0.23
119 0.27
120 0.29
121 0.26
122 0.3
123 0.28
124 0.29
125 0.29
126 0.28
127 0.24
128 0.26
129 0.28
130 0.28
131 0.27
132 0.26
133 0.23
134 0.2
135 0.19
136 0.15
137 0.1
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.13
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.16
151 0.15
152 0.16
153 0.16
154 0.11
155 0.12
156 0.14
157 0.17
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.18
162 0.2
163 0.2
164 0.19
165 0.2
166 0.22
167 0.24
168 0.27
169 0.31
170 0.28
171 0.27
172 0.32
173 0.32
174 0.36
175 0.37
176 0.39
177 0.37
178 0.41
179 0.48
180 0.44
181 0.45
182 0.39
183 0.37
184 0.33
185 0.29
186 0.26
187 0.19
188 0.18
189 0.14
190 0.14
191 0.13
192 0.14
193 0.13
194 0.11
195 0.15
196 0.15
197 0.14
198 0.16
199 0.15
200 0.13
201 0.14
202 0.14
203 0.1
204 0.1
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.1
213 0.11
214 0.15
215 0.16
216 0.21
217 0.23
218 0.24
219 0.25
220 0.27
221 0.3
222 0.27
223 0.3
224 0.31
225 0.31
226 0.31
227 0.3
228 0.29
229 0.26
230 0.23
231 0.2
232 0.13
233 0.1
234 0.09
235 0.08
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.1
255 0.12
256 0.1
257 0.11
258 0.17
259 0.21
260 0.22
261 0.29
262 0.32
263 0.34
264 0.33
265 0.33
266 0.28
267 0.26
268 0.24
269 0.18
270 0.13
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.08
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.12
285 0.15
286 0.13
287 0.12
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.07
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.12
302 0.13
303 0.15
304 0.17
305 0.2
306 0.22
307 0.22
308 0.25
309 0.28
310 0.36
311 0.34
312 0.35
313 0.33
314 0.29
315 0.31
316 0.28
317 0.24
318 0.17
319 0.16
320 0.14
321 0.12
322 0.11
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.07
327 0.09
328 0.13
329 0.14
330 0.18
331 0.22
332 0.28
333 0.32
334 0.38
335 0.44
336 0.43
337 0.47
338 0.48
339 0.45
340 0.41
341 0.36
342 0.35
343 0.3
344 0.31
345 0.28
346 0.27
347 0.28
348 0.29
349 0.3
350 0.29
351 0.32
352 0.38
353 0.46
354 0.49
355 0.48
356 0.53
357 0.58
358 0.61
359 0.59
360 0.56
361 0.54
362 0.58
363 0.58
364 0.57
365 0.57
366 0.59
367 0.66
368 0.67
369 0.69
370 0.69
371 0.77
372 0.78
373 0.79
374 0.81
375 0.79
376 0.75
377 0.7
378 0.63
379 0.61
380 0.63
381 0.58
382 0.54
383 0.46
384 0.44
385 0.43
386 0.5
387 0.43
388 0.35
389 0.32
390 0.29
391 0.29
392 0.26
393 0.23
394 0.16
395 0.15
396 0.15
397 0.13
398 0.09
399 0.08
400 0.08
401 0.06
402 0.05
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.08
416 0.05
417 0.06
418 0.06
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.05
427 0.06
428 0.06
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.07
434 0.07
435 0.08
436 0.09
437 0.14
438 0.16
439 0.17
440 0.18
441 0.19
442 0.2
443 0.19
444 0.18
445 0.12
446 0.11
447 0.09
448 0.07
449 0.06
450 0.09
451 0.11
452 0.11
453 0.11
454 0.13
455 0.13
456 0.14
457 0.17
458 0.15
459 0.13
460 0.13
461 0.14
462 0.13
463 0.13
464 0.12
465 0.09
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.08
470 0.07
471 0.07
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.05
477 0.05
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.12
487 0.13
488 0.13
489 0.15
490 0.14
491 0.15
492 0.17
493 0.17
494 0.14
495 0.14
496 0.14
497 0.13
498 0.13
499 0.12
500 0.11
501 0.11
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.05
508 0.04
509 0.03
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.05
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.07
520 0.06
521 0.07
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.05
526 0.05
527 0.04
528 0.05
529 0.08
530 0.15
531 0.16
532 0.19
533 0.24
534 0.26
535 0.27
536 0.35
537 0.38
538 0.33
539 0.34
540 0.33
541 0.29
542 0.29
543 0.32
544 0.27
545 0.25
546 0.23
547 0.23
548 0.22
549 0.21
550 0.2
551 0.16
552 0.15
553 0.12
554 0.14
555 0.12
556 0.11
557 0.11
558 0.13
559 0.15
560 0.17
561 0.18
562 0.24
563 0.28
564 0.37
565 0.39
566 0.46
567 0.52
568 0.58
569 0.65
570 0.66
571 0.71
572 0.67
573 0.74
574 0.72
575 0.68
576 0.62
577 0.53
578 0.44
579 0.36
580 0.32
581 0.22
582 0.15
583 0.1
584 0.06
585 0.07
586 0.07
587 0.06
588 0.06
589 0.05
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.05
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.03
606 0.03
607 0.03
608 0.03
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.03
613 0.03
614 0.04
615 0.04
616 0.04
617 0.04
618 0.05
619 0.05
620 0.06
621 0.08
622 0.08
623 0.09
624 0.09
625 0.16
626 0.17
627 0.19
628 0.21
629 0.2
630 0.2
631 0.18
632 0.19
633 0.14
634 0.15
635 0.16
636 0.14
637 0.14
638 0.15
639 0.17
640 0.16
641 0.15
642 0.12
643 0.1
644 0.11
645 0.11
646 0.1
647 0.08
648 0.08
649 0.07
650 0.07
651 0.07
652 0.05
653 0.04
654 0.04
655 0.04
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.07
660 0.07
661 0.07
662 0.08
663 0.08
664 0.07
665 0.07
666 0.08
667 0.08
668 0.12
669 0.12
670 0.13
671 0.13
672 0.13
673 0.16
674 0.15
675 0.16
676 0.12
677 0.12
678 0.14
679 0.16
680 0.17
681 0.14
682 0.14
683 0.12
684 0.12
685 0.12
686 0.1
687 0.07
688 0.07
689 0.07
690 0.07
691 0.06
692 0.06
693 0.06
694 0.06
695 0.05
696 0.05
697 0.05
698 0.05
699 0.08
700 0.09
701 0.1
702 0.16
703 0.21
704 0.24
705 0.28
706 0.3
707 0.31
708 0.38
709 0.4
710 0.36
711 0.33
712 0.32
713 0.3
714 0.33
715 0.29
716 0.2
717 0.17
718 0.16
719 0.15
720 0.13
721 0.11
722 0.08
723 0.09
724 0.11
725 0.11
726 0.12
727 0.1
728 0.1
729 0.1
730 0.09
731 0.09
732 0.07
733 0.14
734 0.18
735 0.22
736 0.22
737 0.24
738 0.29
739 0.32
740 0.36
741 0.3
742 0.28
743 0.34
744 0.38
745 0.38
746 0.33
747 0.28
748 0.25
749 0.27
750 0.23
751 0.14
752 0.12
753 0.1
754 0.1
755 0.1
756 0.1
757 0.08
758 0.09
759 0.1
760 0.09
761 0.09
762 0.09
763 0.1
764 0.1
765 0.1
766 0.09
767 0.09
768 0.11
769 0.13
770 0.16
771 0.16
772 0.17
773 0.22
774 0.26
775 0.29
776 0.28
777 0.3
778 0.27
779 0.27
780 0.27
781 0.23
782 0.2
783 0.16
784 0.16
785 0.14
786 0.14
787 0.13
788 0.13
789 0.12
790 0.1
791 0.14
792 0.12
793 0.13
794 0.16
795 0.18
796 0.19
797 0.2
798 0.22
799 0.25
800 0.3
801 0.3
802 0.29
803 0.31
804 0.31
805 0.34
806 0.34
807 0.32
808 0.27
809 0.26
810 0.23
811 0.23
812 0.24
813 0.21
814 0.19
815 0.15
816 0.15
817 0.15
818 0.14
819 0.15
820 0.13
821 0.13
822 0.18
823 0.19
824 0.21
825 0.21
826 0.2
827 0.16
828 0.18
829 0.18
830 0.16
831 0.17
832 0.2
833 0.19
834 0.19
835 0.18
836 0.18
837 0.17
838 0.15
839 0.14
840 0.1
841 0.11
842 0.14
843 0.14
844 0.13
845 0.13
846 0.12
847 0.12
848 0.1
849 0.09
850 0.08
851 0.06
852 0.06
853 0.06
854 0.06
855 0.06
856 0.06
857 0.05
858 0.05
859 0.05
860 0.06
861 0.06
862 0.06
863 0.07
864 0.09
865 0.09
866 0.09
867 0.08
868 0.07
869 0.06
870 0.06
871 0.06
872 0.05
873 0.05
874 0.06
875 0.06
876 0.06
877 0.05
878 0.05
879 0.05
880 0.06
881 0.07
882 0.08
883 0.1
884 0.1
885 0.12
886 0.14
887 0.15
888 0.13
889 0.14
890 0.15
891 0.14
892 0.14
893 0.14
894 0.16
895 0.15
896 0.17
897 0.15
898 0.15
899 0.13
900 0.13
901 0.12
902 0.09
903 0.12
904 0.12
905 0.16
906 0.2
907 0.21
908 0.21
909 0.22
910 0.22
911 0.2
912 0.2
913 0.21
914 0.21
915 0.24
916 0.26
917 0.31
918 0.31
919 0.31
920 0.29
921 0.23
922 0.2
923 0.16
924 0.14
925 0.09
926 0.09
927 0.07
928 0.07
929 0.08
930 0.07
931 0.07
932 0.06
933 0.05
934 0.06
935 0.08
936 0.13
937 0.14
938 0.16
939 0.19
940 0.22
941 0.23
942 0.24
943 0.26
944 0.25
945 0.25
946 0.25
947 0.23
948 0.2
949 0.19
950 0.17
951 0.14
952 0.09
953 0.07
954 0.06
955 0.05
956 0.04
957 0.05
958 0.05
959 0.04
960 0.05
961 0.06
962 0.07
963 0.07
964 0.08
965 0.07
966 0.1
967 0.11
968 0.12
969 0.12
970 0.13
971 0.14
972 0.14
973 0.2
974 0.17
975 0.22
976 0.26
977 0.28
978 0.32
979 0.35
980 0.38
981 0.41
982 0.47
983 0.43
984 0.4
985 0.43
986 0.4
987 0.36
988 0.35
989 0.27
990 0.2
991 0.2
992 0.2
993 0.15
994 0.14
995 0.15
996 0.13
997 0.17
998 0.19
999 0.19
1000 0.2
1001 0.2
1002 0.2
1003 0.19
1004 0.19
1005 0.15
1006 0.15
1007 0.14
1008 0.14
1009 0.13
1010 0.13
1011 0.14
1012 0.14
1013 0.14
1014 0.14
1015 0.14
1016 0.13
1017 0.13
1018 0.12
1019 0.12
1020 0.12
1021 0.11
1022 0.1
1023 0.1
1024 0.1
1025 0.1
1026 0.09
1027 0.09
1028 0.07
1029 0.07
1030 0.11
1031 0.1
1032 0.11
1033 0.14
1034 0.14
1035 0.14
1036 0.16
1037 0.18
1038 0.16
1039 0.2
1040 0.2
1041 0.24
1042 0.26
1043 0.26
1044 0.24
1045 0.23
1046 0.21
1047 0.18
1048 0.19
1049 0.13
1050 0.14
1051 0.17
1052 0.18
1053 0.2
1054 0.22
1055 0.22
1056 0.25
1057 0.31
1058 0.32
1059 0.3
1060 0.3
1061 0.31
1062 0.31
1063 0.31
1064 0.25
1065 0.19
1066 0.16
1067 0.14
1068 0.13
1069 0.09
1070 0.06
1071 0.05
1072 0.04
1073 0.04
1074 0.04
1075 0.04
1076 0.04
1077 0.04
1078 0.05
1079 0.07
1080 0.11
1081 0.12
1082 0.18
1083 0.26
1084 0.33
1085 0.39
1086 0.43
1087 0.47
1088 0.52
1089 0.61
1090 0.66
1091 0.68
1092 0.68
1093 0.63
1094 0.61
1095 0.58
1096 0.56
1097 0.48
1098 0.38
1099 0.35
1100 0.3
1101 0.32
1102 0.3
1103 0.36
1104 0.35
1105 0.35