Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7PTJ1

Protein Details
Accession A0A4Y7PTJ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-29EIVAAKRTTRRGKPRGVRRGGARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-29KRTTRRGKPRGVRRGGAR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MDKSLDEIVAAKRTTRRGKPRGVRRGGARQQILGNTPKSADPAQRTRRAAPAAAPAVATTPFSEKIIVSNLPADVNEAQVRELFKTTVGPLKDVTMHYDAHGASKGIATVVFHKKGDGAQAYNQYNNRLIDGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.5
3 0.57
4 0.6
5 0.71
6 0.78
7 0.84
8 0.86
9 0.84
10 0.8
11 0.77
12 0.8
13 0.77
14 0.75
15 0.66
16 0.57
17 0.52
18 0.48
19 0.44
20 0.38
21 0.31
22 0.23
23 0.23
24 0.21
25 0.21
26 0.21
27 0.23
28 0.24
29 0.33
30 0.4
31 0.47
32 0.5
33 0.49
34 0.52
35 0.49
36 0.44
37 0.36
38 0.34
39 0.28
40 0.25
41 0.23
42 0.17
43 0.16
44 0.15
45 0.13
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.08
52 0.09
53 0.11
54 0.11
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.07
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.11
68 0.1
69 0.11
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.15
75 0.15
76 0.15
77 0.14
78 0.16
79 0.18
80 0.17
81 0.2
82 0.17
83 0.17
84 0.16
85 0.18
86 0.17
87 0.16
88 0.17
89 0.13
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.14
97 0.21
98 0.24
99 0.24
100 0.24
101 0.25
102 0.25
103 0.31
104 0.28
105 0.24
106 0.27
107 0.36
108 0.38
109 0.43
110 0.44
111 0.41
112 0.41
113 0.39