FuNGI

A0A4Y7QLB2

Protein Details

Accession

A0A4Y7QLB2

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-25	MAEQATKPKKSRSRKDPKVSQAAGQ	Hydrophilic
57-83	TVTWKVFRPGKMRKKFYKENIPSRAYI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-16	KPKKSRSRKD
218-244	SKKGAAAKAADDSHGKKGGRGKKDKAD
267-298	AKGGKVGGPQGKAIPKGPKAAREKKPEPEAKK
361-375	GGGERRARREKEKKP
406-427	GGRGGESSRRGRGGGRGGGRRR
490-534	RGRGGKHRGGGPDGPGHRAEGDGGGGGGGRGDGSRGRRRGRGRGM

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MAEQATKPKKSRSRKDPKVSQAAGQTERLKTVVRRLPPNLPEEIFWHSVQEWVTDETVTWKVFRPGKMRKKFYKENIPSRAYIAFKSEELLAAFGQAYDGHLFRDKAGNESYAIVEFAPCQKIPSEKKKVDPRNATIEQDEDYISFIQSLNAPPTKPAEADTLEALIAASRPPPQPESTPLLDALKAERSAAKDKEAILRNHAHYHQGSAPSTAKDHSKKGAAAKAADDSHGKKGGRGKKDKADTSKGASTSAPAAAAGSSSVPHDAKGGKVGGPQGKAIPKGPKAAREKKPEPEAKKVPTVTISTPTAHGESDQAGNAEGASPTTPRERRSRPVLGLASRQFEAALSGAGVPVGGGAGGGGGERRARREKEKKPAVDAAQGNEGGNGANGGAGQGAGSVRDNPGGGRGGESSRRGRGGGRGGGRRRDASDGESISSASHGAAPPILHRIDAPTQPPKILSRNSQAEGSQQQPTTPVTSDAQSQAQGVGRGRGGKHRGGGPDGPGHRAEGDGGGGGGGRGDGSRGRRRGRGRGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.93
3	0.93
4	0.93
5	0.93
6	0.84
7	0.78
8	0.75
9	0.71
10	0.63
11	0.59
12	0.54
13	0.45
14	0.44
15	0.4
16	0.36
17	0.32
18	0.38
19	0.39
20	0.42
21	0.48
22	0.52
23	0.6
24	0.61
25	0.62
26	0.58
27	0.52
28	0.45
29	0.41
30	0.41
31	0.35
32	0.3
33	0.29
34	0.23
35	0.25
36	0.24
37	0.22
38	0.18
39	0.17
40	0.18
41	0.15
42	0.15
43	0.16
44	0.19
45	0.18
46	0.17
47	0.18
48	0.25
49	0.3
50	0.36
51	0.42
52	0.5
53	0.6
54	0.69
55	0.76
56	0.79
57	0.83
58	0.87
59	0.87
60	0.88
61	0.87
62	0.87
63	0.86
64	0.8
65	0.72
66	0.64
67	0.59
68	0.5
69	0.4
70	0.34
71	0.27
72	0.23
73	0.24
74	0.21
75	0.18
76	0.16
77	0.16
78	0.12
79	0.11
80	0.1
81	0.09
82	0.08
83	0.07
84	0.08
85	0.08
86	0.09
87	0.1
88	0.13
89	0.14
90	0.15
91	0.21
92	0.2
93	0.22
94	0.24
95	0.24
96	0.21
97	0.22
98	0.22
99	0.16
100	0.15
101	0.12
102	0.1
103	0.1
104	0.13
105	0.14
106	0.13
107	0.14
108	0.15
109	0.24
110	0.33
111	0.42
112	0.49
113	0.5
114	0.59
115	0.69
116	0.77
117	0.79
118	0.79
119	0.73
120	0.72
121	0.71
122	0.65
123	0.55
124	0.47
125	0.38
126	0.3
127	0.25
128	0.15
129	0.14
130	0.12
131	0.1
132	0.09
133	0.08
134	0.08
135	0.1
136	0.11
137	0.14
138	0.16
139	0.16
140	0.17
141	0.2
142	0.2
143	0.19
144	0.19
145	0.19
146	0.18
147	0.19
148	0.19
149	0.16
150	0.14
151	0.14
152	0.11
153	0.07
154	0.06
155	0.05
156	0.06
157	0.09
158	0.1
159	0.13
160	0.15
161	0.18
162	0.2
163	0.25
164	0.3
165	0.28
166	0.28
167	0.27
168	0.26
169	0.23
170	0.21
171	0.18
172	0.15
173	0.13
174	0.13
175	0.14
176	0.16
177	0.22
178	0.23
179	0.23
180	0.22
181	0.24
182	0.31
183	0.35
184	0.33
185	0.32
186	0.36
187	0.36
188	0.38
189	0.37
190	0.33
191	0.27
192	0.3
193	0.28
194	0.26
195	0.25
196	0.23
197	0.24
198	0.21
199	0.22
200	0.2
201	0.23
202	0.22
203	0.24
204	0.24
205	0.25
206	0.27
207	0.31
208	0.34
209	0.3
210	0.27
211	0.26
212	0.26
213	0.24
214	0.22
215	0.2
216	0.18
217	0.19
218	0.23
219	0.22
220	0.21
221	0.29
222	0.35
223	0.42
224	0.48
225	0.5
226	0.53
227	0.6
228	0.63
229	0.62
230	0.61
231	0.53
232	0.51
233	0.49
234	0.41
235	0.35
236	0.29
237	0.24
238	0.18
239	0.16
240	0.11
241	0.07
242	0.07
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.07
253	0.08
254	0.08
255	0.1
256	0.11
257	0.09
258	0.11
259	0.15
260	0.17
261	0.17
262	0.17
263	0.18
264	0.2
265	0.2
266	0.22
267	0.23
268	0.22
269	0.29
270	0.3
271	0.35
272	0.42
273	0.51
274	0.56
275	0.6
276	0.63
277	0.62
278	0.7
279	0.7
280	0.66
281	0.65
282	0.63
283	0.57
284	0.58
285	0.52
286	0.44
287	0.39
288	0.36
289	0.28
290	0.25
291	0.24
292	0.18
293	0.19
294	0.19
295	0.17
296	0.14
297	0.13
298	0.1
299	0.1
300	0.1
301	0.09
302	0.08
303	0.08
304	0.08
305	0.07
306	0.07
307	0.06
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.14
313	0.16
314	0.19
315	0.28
316	0.33
317	0.39
318	0.47
319	0.52
320	0.47
321	0.53
322	0.54
323	0.48
324	0.5
325	0.46
326	0.4
327	0.34
328	0.31
329	0.23
330	0.19
331	0.17
332	0.1
333	0.07
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.04
339	0.03
340	0.03
341	0.02
342	0.02
343	0.02
344	0.02
345	0.02
346	0.02
347	0.02
348	0.02
349	0.03
350	0.06
351	0.07
352	0.13
353	0.2
354	0.24
355	0.35
356	0.45
357	0.54
358	0.63
359	0.72
360	0.7
361	0.69
362	0.73
363	0.65
364	0.63
365	0.55
366	0.46
367	0.4
368	0.37
369	0.31
370	0.24
371	0.21
372	0.13
373	0.11
374	0.08
375	0.04
376	0.04
377	0.03
378	0.03
379	0.03
380	0.03
381	0.03
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.05
386	0.06
387	0.07
388	0.08
389	0.09
390	0.08
391	0.11
392	0.12
393	0.12
394	0.12
395	0.14
396	0.16
397	0.2
398	0.25
399	0.26
400	0.28
401	0.29
402	0.28
403	0.28
404	0.31
405	0.34
406	0.36
407	0.4
408	0.45
409	0.5
410	0.56
411	0.58
412	0.54
413	0.49
414	0.47
415	0.42
416	0.36
417	0.37
418	0.32
419	0.29
420	0.27
421	0.25
422	0.2
423	0.18
424	0.15
425	0.09
426	0.1
427	0.08
428	0.09
429	0.1
430	0.11
431	0.12
432	0.16
433	0.16
434	0.14
435	0.14
436	0.18
437	0.22
438	0.26
439	0.3
440	0.33
441	0.34
442	0.35
443	0.37
444	0.37
445	0.39
446	0.4
447	0.42
448	0.43
449	0.49
450	0.5
451	0.5
452	0.46
453	0.45
454	0.44
455	0.41
456	0.38
457	0.31
458	0.29
459	0.29
460	0.3
461	0.27
462	0.24
463	0.23
464	0.19
465	0.2
466	0.24
467	0.24
468	0.25
469	0.22
470	0.21
471	0.21
472	0.21
473	0.24
474	0.22
475	0.22
476	0.22
477	0.26
478	0.27
479	0.33
480	0.36
481	0.37
482	0.4
483	0.42
484	0.44
485	0.46
486	0.47
487	0.43
488	0.46
489	0.44
490	0.42
491	0.37
492	0.35
493	0.29
494	0.27
495	0.23
496	0.15
497	0.14
498	0.11
499	0.1
500	0.08
501	0.08
502	0.07
503	0.06
504	0.05
505	0.04
506	0.04
507	0.06
508	0.11
509	0.19
510	0.29
511	0.37
512	0.43
513	0.51
514	0.59

A0A4Y7QLB2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer