Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4R5XH00

Protein Details
Accession A0A4R5XH00    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
291-310LNLRPETKTKLRKTREEMDDHydrophilic
344-371SASEQKKVLERDRKRAIRKSQGKMTVKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
332-371KRKAEEERISKLSASEQKKVLERDRKRAIRKSQGKMTVKK
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 10, nucl 6.5, E.R. 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
CDD cd22265  UDM1_RNF168  
Amino Acid Sequences MAAQNFVLNLLKFLTPPPVFTGPDYDGLEYRWKVVVFRPALFKVEAFLILGVIFYIAAFFVGKSANAKRANAWLNSHFTLLSQQFSSPTFAGLVPDGYSDFFNFSTGRRGVASLHTVFALMPRHDLLQMLFMFGRSLIELNYNPTDEVELDFKLSSTNTPGFVWAVVAKDELSKVKDGRWDLTFTKTTENPQLGSSFSVMSEFADVTENILKISGGTSLQQVLGDPAFKPYFRSLSVTDQPRERPALPIPSEFRERHVILSLRAPPSSKAGVTVPLVKAVFSLIDVLDTKLNLRPETKTKLRKTREEMDDELRKEADAEKKEEAELQKQNEKRKAEEERISKLSASEQKKVLERDRKRAIRKSQGKMTVKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.2
3 0.22
4 0.28
5 0.3
6 0.31
7 0.32
8 0.37
9 0.3
10 0.35
11 0.35
12 0.3
13 0.26
14 0.27
15 0.33
16 0.27
17 0.27
18 0.24
19 0.23
20 0.23
21 0.27
22 0.34
23 0.31
24 0.34
25 0.38
26 0.37
27 0.4
28 0.39
29 0.34
30 0.26
31 0.24
32 0.21
33 0.15
34 0.13
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.07
39 0.05
40 0.04
41 0.03
42 0.03
43 0.03
44 0.03
45 0.04
46 0.04
47 0.05
48 0.06
49 0.07
50 0.11
51 0.14
52 0.22
53 0.25
54 0.27
55 0.28
56 0.35
57 0.4
58 0.39
59 0.41
60 0.37
61 0.4
62 0.4
63 0.39
64 0.3
65 0.25
66 0.28
67 0.25
68 0.22
69 0.17
70 0.17
71 0.17
72 0.19
73 0.22
74 0.15
75 0.15
76 0.14
77 0.13
78 0.14
79 0.13
80 0.12
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.16
93 0.16
94 0.17
95 0.16
96 0.16
97 0.17
98 0.19
99 0.24
100 0.18
101 0.18
102 0.17
103 0.16
104 0.15
105 0.16
106 0.17
107 0.12
108 0.13
109 0.13
110 0.14
111 0.14
112 0.14
113 0.12
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.1
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.08
126 0.08
127 0.11
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.1
134 0.11
135 0.09
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.1
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.11
161 0.11
162 0.13
163 0.17
164 0.18
165 0.19
166 0.19
167 0.22
168 0.21
169 0.25
170 0.25
171 0.22
172 0.24
173 0.23
174 0.23
175 0.24
176 0.24
177 0.2
178 0.19
179 0.18
180 0.16
181 0.15
182 0.14
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.1
214 0.11
215 0.11
216 0.13
217 0.15
218 0.17
219 0.17
220 0.21
221 0.2
222 0.26
223 0.33
224 0.37
225 0.37
226 0.38
227 0.38
228 0.38
229 0.39
230 0.32
231 0.29
232 0.27
233 0.34
234 0.32
235 0.35
236 0.35
237 0.35
238 0.41
239 0.37
240 0.37
241 0.35
242 0.33
243 0.3
244 0.32
245 0.3
246 0.25
247 0.31
248 0.34
249 0.29
250 0.29
251 0.29
252 0.24
253 0.27
254 0.28
255 0.22
256 0.18
257 0.17
258 0.2
259 0.2
260 0.25
261 0.21
262 0.22
263 0.22
264 0.2
265 0.19
266 0.16
267 0.14
268 0.09
269 0.1
270 0.06
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.14
278 0.17
279 0.17
280 0.18
281 0.22
282 0.28
283 0.37
284 0.45
285 0.52
286 0.59
287 0.68
288 0.73
289 0.78
290 0.79
291 0.81
292 0.79
293 0.75
294 0.7
295 0.69
296 0.69
297 0.61
298 0.55
299 0.45
300 0.37
301 0.31
302 0.32
303 0.31
304 0.28
305 0.31
306 0.32
307 0.33
308 0.34
309 0.38
310 0.36
311 0.36
312 0.39
313 0.4
314 0.46
315 0.49
316 0.58
317 0.6
318 0.6
319 0.56
320 0.59
321 0.62
322 0.63
323 0.67
324 0.64
325 0.64
326 0.65
327 0.62
328 0.53
329 0.45
330 0.44
331 0.44
332 0.43
333 0.42
334 0.42
335 0.45
336 0.51
337 0.57
338 0.59
339 0.61
340 0.63
341 0.67
342 0.74
343 0.78
344 0.81
345 0.84
346 0.85
347 0.85
348 0.87
349 0.86
350 0.85
351 0.86