Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7QH01

Protein Details
Accession A0A4Y7QH01    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-102ETPAAPVLKRQNKKRKEPEDYTSAHydrophilic
109-128GPSIKRGKSDPKNENERKSKBasic
229-255GEGSKPRRTVDKKKATRRIGKMQKKLEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
232-252SKPRRTVDKKKATRRIGKMQK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12.833, cyto 9.5, mito_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034393  TatSF1-like  
IPR034392  TatSF1-like_RRM1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
CDD cd12281  RRM1_TatSF1_like  
cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MSSAPPSAAAGASAEDQAAAFSSDTRTYYSTVTKKWQYEDDEGNEFEYHADKGVWVPLVDEEAAREQQAAYSVQGVDEETPAAPVLKRQNKKRKEPEDYTSATAVSEAGPSIKRGKSDPKNENERKSKNTAVYVTGLPLDAEMEEIITRFGKCGVLEEDDEGEPKVKLYAKDDGSFSGEALVVYFKEESVSLAVAMLDDAELRLGDPSTRMAVKQAEFGHKNTTQGPSGEGSKPRRTVDKKKATRRIGKMQKKLEEWDSGDEFGPAADPLDKSTASNKNSRVVVLKHMFTQQELEEDASLLLDLKEDVREECSTLGEVTNVVLYDREAEGIMTVKFRDPLSAQACVIRMHGRFFAGRQVEASLYSGKNRFKRSGTGDEIEGDGDDAEKKRLDAFAQWLLTEGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.08
6 0.08
7 0.07
8 0.07
9 0.11
10 0.13
11 0.14
12 0.16
13 0.17
14 0.18
15 0.21
16 0.29
17 0.32
18 0.35
19 0.43
20 0.48
21 0.51
22 0.53
23 0.57
24 0.55
25 0.55
26 0.58
27 0.54
28 0.51
29 0.47
30 0.44
31 0.38
32 0.31
33 0.25
34 0.19
35 0.14
36 0.11
37 0.11
38 0.09
39 0.1
40 0.13
41 0.14
42 0.12
43 0.13
44 0.12
45 0.14
46 0.14
47 0.13
48 0.11
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.11
54 0.12
55 0.14
56 0.14
57 0.11
58 0.13
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.07
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.08
71 0.12
72 0.22
73 0.31
74 0.39
75 0.49
76 0.6
77 0.69
78 0.8
79 0.86
80 0.86
81 0.86
82 0.86
83 0.81
84 0.78
85 0.72
86 0.64
87 0.54
88 0.43
89 0.33
90 0.26
91 0.2
92 0.13
93 0.09
94 0.06
95 0.07
96 0.08
97 0.1
98 0.15
99 0.17
100 0.18
101 0.21
102 0.31
103 0.39
104 0.48
105 0.55
106 0.59
107 0.69
108 0.74
109 0.8
110 0.79
111 0.76
112 0.72
113 0.69
114 0.66
115 0.58
116 0.56
117 0.49
118 0.41
119 0.38
120 0.33
121 0.27
122 0.22
123 0.18
124 0.13
125 0.11
126 0.08
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.08
139 0.07
140 0.1
141 0.12
142 0.13
143 0.14
144 0.15
145 0.16
146 0.15
147 0.15
148 0.13
149 0.11
150 0.09
151 0.08
152 0.1
153 0.11
154 0.12
155 0.14
156 0.21
157 0.23
158 0.25
159 0.25
160 0.24
161 0.24
162 0.23
163 0.19
164 0.13
165 0.11
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.02
186 0.02
187 0.02
188 0.02
189 0.02
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.09
199 0.12
200 0.12
201 0.17
202 0.19
203 0.23
204 0.25
205 0.26
206 0.3
207 0.28
208 0.29
209 0.26
210 0.26
211 0.21
212 0.19
213 0.2
214 0.16
215 0.18
216 0.2
217 0.24
218 0.28
219 0.32
220 0.35
221 0.35
222 0.43
223 0.46
224 0.54
225 0.58
226 0.64
227 0.68
228 0.75
229 0.84
230 0.84
231 0.86
232 0.83
233 0.83
234 0.82
235 0.83
236 0.81
237 0.79
238 0.76
239 0.69
240 0.65
241 0.58
242 0.52
243 0.44
244 0.39
245 0.33
246 0.28
247 0.26
248 0.22
249 0.18
250 0.13
251 0.11
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.17
261 0.24
262 0.26
263 0.32
264 0.33
265 0.36
266 0.37
267 0.37
268 0.35
269 0.3
270 0.36
271 0.34
272 0.33
273 0.3
274 0.33
275 0.32
276 0.28
277 0.28
278 0.2
279 0.17
280 0.17
281 0.16
282 0.12
283 0.12
284 0.11
285 0.08
286 0.08
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.07
294 0.08
295 0.11
296 0.12
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.1
318 0.11
319 0.1
320 0.1
321 0.11
322 0.14
323 0.14
324 0.17
325 0.16
326 0.24
327 0.26
328 0.28
329 0.27
330 0.28
331 0.3
332 0.27
333 0.28
334 0.25
335 0.23
336 0.23
337 0.24
338 0.23
339 0.23
340 0.24
341 0.3
342 0.27
343 0.26
344 0.24
345 0.25
346 0.23
347 0.22
348 0.24
349 0.2
350 0.18
351 0.23
352 0.28
353 0.34
354 0.4
355 0.45
356 0.49
357 0.48
358 0.55
359 0.58
360 0.61
361 0.61
362 0.58
363 0.53
364 0.48
365 0.45
366 0.37
367 0.29
368 0.2
369 0.12
370 0.1
371 0.12
372 0.12
373 0.14
374 0.15
375 0.15
376 0.17
377 0.2
378 0.21
379 0.23
380 0.27
381 0.32
382 0.33
383 0.32