FuNGI

A0A4Y7PED5

Protein Details

Accession

A0A4Y7PED5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
417-436	NTPPHPHNLLRRRNTPQPHL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cysk 14, cyto 6, nucl 4, cyto_mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000684 RNA_pol_II_repeat_euk IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0046872 F:metal ion binding GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF04998 RNA_pol_Rpb1_5 PF05001 RNA_pol_Rpb1_R
PROSITE	View protein in PROSITE PS00115 RNA_POL_II_REPEAT

Amino Acid Sequences

MLNSVDLRGVKGIDRVFLVNFDKAIITDSGSIAPKQVKEWVLETDGVNLKTVMCINGVDWRRTYSNSCVEIFNVLGIEAARGAIMKELRRVIEFDGSKVNYRHLALLCDLMTHRGTLTAITRHGINRADTGALMRCSFEETVEILMEAAAVGEKDDCHGIAENVMFGQMAPMGTGSFDVALDMDILKDVIVDHRLPVQNMLAAHADGGLTPGQVAMTPYDSNSPMWSSDVANFKGEQAAFSPLAVNGGEDPSNFSYSMFGQSPRHMGAMSPGGGYSPSSPNAYSPTSPYVQSPFGGATSPFGTSPYATSPFYDRTRSATSPTYSPTSPALNLTSPGYSPTSPRYSPTSPSFSPTSPRYSPQSPSFSPTSPRYSPTSPSFSPASPRYSPTCESCSPKHPGYDLFLPQRLYNTLRPLQNTPPHPHNLLRRRNTPQPHLPIPLHPQHIVRLCQFY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.22
3	0.21
4	0.24
5	0.26
6	0.22
7	0.21
8	0.2
9	0.18
10	0.17
11	0.19
12	0.15
13	0.13
14	0.13
15	0.14
16	0.17
17	0.19
18	0.19
19	0.19
20	0.23
21	0.22
22	0.23
23	0.28
24	0.27
25	0.28
26	0.3
27	0.3
28	0.29
29	0.31
30	0.29
31	0.29
32	0.32
33	0.3
34	0.28
35	0.24
36	0.21
37	0.2
38	0.21
39	0.15
40	0.11
41	0.11
42	0.11
43	0.19
44	0.22
45	0.23
46	0.23
47	0.27
48	0.28
49	0.31
50	0.34
51	0.33
52	0.39
53	0.4
54	0.4
55	0.37
56	0.35
57	0.34
58	0.3
59	0.23
60	0.14
61	0.1
62	0.09
63	0.08
64	0.08
65	0.06
66	0.05
67	0.05
68	0.05
69	0.05
70	0.08
71	0.12
72	0.13
73	0.18
74	0.21
75	0.22
76	0.24
77	0.25
78	0.24
79	0.29
80	0.28
81	0.25
82	0.3
83	0.3
84	0.33
85	0.33
86	0.32
87	0.27
88	0.27
89	0.31
90	0.24
91	0.25
92	0.22
93	0.23
94	0.21
95	0.19
96	0.18
97	0.16
98	0.15
99	0.13
100	0.12
101	0.1
102	0.1
103	0.1
104	0.14
105	0.14
106	0.15
107	0.15
108	0.17
109	0.17
110	0.21
111	0.22
112	0.19
113	0.18
114	0.18
115	0.18
116	0.16
117	0.17
118	0.17
119	0.15
120	0.14
121	0.13
122	0.12
123	0.14
124	0.14
125	0.13
126	0.1
127	0.1
128	0.11
129	0.1
130	0.1
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.05
135	0.04
136	0.03
137	0.03
138	0.03
139	0.03
140	0.03
141	0.04
142	0.05
143	0.05
144	0.06
145	0.07
146	0.07
147	0.08
148	0.08
149	0.08
150	0.07
151	0.07
152	0.06
153	0.05
154	0.05
155	0.04
156	0.04
157	0.04
158	0.04
159	0.04
160	0.04
161	0.04
162	0.04
163	0.04
164	0.04
165	0.04
166	0.03
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.03
172	0.03
173	0.03
174	0.03
175	0.03
176	0.04
177	0.06
178	0.07
179	0.07
180	0.13
181	0.14
182	0.14
183	0.15
184	0.14
185	0.14
186	0.14
187	0.15
188	0.1
189	0.09
190	0.09
191	0.08
192	0.07
193	0.05
194	0.06
195	0.05
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.05
202	0.04
203	0.06
204	0.06
205	0.07
206	0.08
207	0.09
208	0.09
209	0.1
210	0.1
211	0.08
212	0.09
213	0.1
214	0.09
215	0.12
216	0.16
217	0.17
218	0.17
219	0.16
220	0.16
221	0.17
222	0.16
223	0.13
224	0.1
225	0.12
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.08
230	0.09
231	0.09
232	0.08
233	0.05
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.09
238	0.09
239	0.1
240	0.1
241	0.1
242	0.1
243	0.11
244	0.14
245	0.12
246	0.13
247	0.14
248	0.15
249	0.17
250	0.17
251	0.17
252	0.13
253	0.12
254	0.13
255	0.14
256	0.14
257	0.11
258	0.1
259	0.1
260	0.1
261	0.11
262	0.1
263	0.09
264	0.1
265	0.11
266	0.12
267	0.13
268	0.16
269	0.18
270	0.16
271	0.17
272	0.19
273	0.19
274	0.2
275	0.2
276	0.2
277	0.19
278	0.18
279	0.16
280	0.13
281	0.12
282	0.12
283	0.11
284	0.1
285	0.1
286	0.1
287	0.09
288	0.1
289	0.1
290	0.09
291	0.11
292	0.12
293	0.14
294	0.14
295	0.15
296	0.18
297	0.23
298	0.25
299	0.27
300	0.24
301	0.27
302	0.33
303	0.33
304	0.34
305	0.34
306	0.34
307	0.33
308	0.35
309	0.33
310	0.27
311	0.28
312	0.26
313	0.22
314	0.21
315	0.21
316	0.2
317	0.17
318	0.18
319	0.18
320	0.16
321	0.14
322	0.15
323	0.16
324	0.14
325	0.15
326	0.2
327	0.25
328	0.25
329	0.27
330	0.32
331	0.33
332	0.38
333	0.42
334	0.43
335	0.38
336	0.41
337	0.42
338	0.36
339	0.4
340	0.37
341	0.39
342	0.34
343	0.37
344	0.39
345	0.4
346	0.45
347	0.46
348	0.51
349	0.45
350	0.47
351	0.47
352	0.43
353	0.45
354	0.44
355	0.44
356	0.38
357	0.4
358	0.41
359	0.4
360	0.44
361	0.44
362	0.46
363	0.39
364	0.41
365	0.4
366	0.36
367	0.4
368	0.38
369	0.39
370	0.34
371	0.38
372	0.39
373	0.41
374	0.44
375	0.41
376	0.44
377	0.43
378	0.47
379	0.47
380	0.49
381	0.51
382	0.51
383	0.49
384	0.46
385	0.43
386	0.43
387	0.46
388	0.46
389	0.45
390	0.46
391	0.44
392	0.42
393	0.41
394	0.39
395	0.36
396	0.34
397	0.36
398	0.39
399	0.42
400	0.45
401	0.47
402	0.53
403	0.56
404	0.58
405	0.57
406	0.57
407	0.58
408	0.58
409	0.6
410	0.62
411	0.64
412	0.67
413	0.68
414	0.7
415	0.73
416	0.78
417	0.8
418	0.79
419	0.79
420	0.77
421	0.75
422	0.74
423	0.68
424	0.65
425	0.65
426	0.63
427	0.58
428	0.52
429	0.48
430	0.48
431	0.53
432	0.51

A0A4Y7PED5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer