Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7QCH1

Protein Details
Accession A0A4Y7QCH1    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-261SRYVSRSPSHSRSRSRSRSRSPYRSRSRSVSPDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 10, cyto_nucl 9.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANTTVRGAQAIHGQNPQFLVEYVIRSRIYESQYWKEKCFALTAETLIDHAIQLNTIGGVYGNQNPTPFLCLLLKLLQIQPEKEILVEYLQVDEFKYLRALAAMYIRMTFRPAEVYELLEPLLKDYRKLRLRSMAGYTLTYMDEFVDSLLNEERVCDLILPRMTKRDVLEENSEIGPRKSLLLDAMEGKSEHGSERGRSRSRSASRSASGTPSGTGRVNGSTTPSETGSRYVSRSPSHSRSRSRSRSRSPYRSRSRSVSPDRMDADTEPPSSM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.32
4 0.31
5 0.24
6 0.19
7 0.2
8 0.16
9 0.2
10 0.2
11 0.24
12 0.23
13 0.22
14 0.25
15 0.27
16 0.29
17 0.31
18 0.36
19 0.41
20 0.5
21 0.53
22 0.52
23 0.5
24 0.48
25 0.44
26 0.4
27 0.32
28 0.26
29 0.24
30 0.23
31 0.2
32 0.18
33 0.17
34 0.14
35 0.13
36 0.09
37 0.09
38 0.08
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.05
44 0.05
45 0.04
46 0.05
47 0.07
48 0.11
49 0.13
50 0.14
51 0.15
52 0.15
53 0.16
54 0.19
55 0.17
56 0.14
57 0.13
58 0.13
59 0.15
60 0.17
61 0.17
62 0.16
63 0.17
64 0.21
65 0.22
66 0.22
67 0.21
68 0.2
69 0.19
70 0.17
71 0.16
72 0.11
73 0.09
74 0.1
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.08
84 0.07
85 0.06
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.1
97 0.08
98 0.1
99 0.1
100 0.13
101 0.13
102 0.15
103 0.14
104 0.14
105 0.14
106 0.12
107 0.11
108 0.09
109 0.14
110 0.12
111 0.13
112 0.15
113 0.24
114 0.29
115 0.32
116 0.33
117 0.36
118 0.39
119 0.4
120 0.41
121 0.35
122 0.29
123 0.27
124 0.25
125 0.18
126 0.16
127 0.13
128 0.1
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.1
146 0.13
147 0.15
148 0.15
149 0.18
150 0.19
151 0.21
152 0.21
153 0.23
154 0.23
155 0.25
156 0.29
157 0.26
158 0.28
159 0.26
160 0.26
161 0.21
162 0.18
163 0.15
164 0.11
165 0.11
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.13
172 0.13
173 0.13
174 0.13
175 0.13
176 0.12
177 0.11
178 0.1
179 0.11
180 0.13
181 0.16
182 0.23
183 0.31
184 0.35
185 0.37
186 0.41
187 0.47
188 0.52
189 0.53
190 0.52
191 0.5
192 0.48
193 0.49
194 0.46
195 0.4
196 0.35
197 0.31
198 0.26
199 0.21
200 0.21
201 0.18
202 0.17
203 0.15
204 0.15
205 0.16
206 0.15
207 0.18
208 0.17
209 0.18
210 0.19
211 0.19
212 0.19
213 0.19
214 0.22
215 0.22
216 0.23
217 0.24
218 0.26
219 0.29
220 0.3
221 0.35
222 0.41
223 0.45
224 0.53
225 0.59
226 0.64
227 0.69
228 0.77
229 0.81
230 0.83
231 0.85
232 0.85
233 0.88
234 0.9
235 0.92
236 0.91
237 0.91
238 0.92
239 0.9
240 0.86
241 0.82
242 0.8
243 0.8
244 0.79
245 0.78
246 0.71
247 0.7
248 0.66
249 0.62
250 0.55
251 0.47
252 0.42
253 0.36