Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7Q1S2

Protein Details
Accession A0A4Y7Q1S2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
136-163DSTRVRYPNSPPHKRKRRSPHGEHVEGVBasic
354-379GITHRWGTKKLPKKTHKGFRKVACIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
147-157PHKRKRRSPHG
362-371KKLPKKTHKG
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 9.5, nucl 8, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045077  L3_arc_euk  
IPR000597  Ribosomal_L3  
IPR044892  Ribosomal_L3_dom_3_arc_sf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006396  P:RNA processing  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00297  Ribosomal_L3  
PF13428  TPR_14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MTQTTFRTRSFSNAVRHPTFNDFTCGFPAATSPEHLNYFQFVRPAKRILPGPSNFSTTTSTSAKDGIIVRRLNLPAARKMLGTAIGMCPKEKLFKGYIELSEFDRARQLYEKYIELDPTNPSAWIQYAQLEENLGDSTRVRYPNSPPHKRKRRSPHGEHVEGVHRLRGREGVDEGLRLRRYRLRGISREEEEEEDGGKGGGTWGWQACHRVGRSAIVGYFGHSMHMREVVEAVTVIETSPMIVVARLSDEVEHRFYMNEYRSMKKYFTLYAKKHNEDGGKSISREIERIRKYCTVIRTRKKARLIEIRVNSGSVVDKVEYAQGLFGKPIEVRSVFKQDEVIEVIAITKGNGSEGITHRWGTKKLPKKTHKGFRKVACIGAWHPSKVMFSVARAGQNSYHHRTELNKKIYRIGKGDDESNNLVIMKQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.59
3 0.6
4 0.57
5 0.56
6 0.53
7 0.46
8 0.44
9 0.36
10 0.34
11 0.35
12 0.33
13 0.25
14 0.21
15 0.21
16 0.19
17 0.19
18 0.2
19 0.2
20 0.21
21 0.24
22 0.25
23 0.24
24 0.24
25 0.25
26 0.25
27 0.27
28 0.27
29 0.31
30 0.34
31 0.38
32 0.38
33 0.4
34 0.44
35 0.46
36 0.52
37 0.48
38 0.51
39 0.49
40 0.51
41 0.45
42 0.42
43 0.39
44 0.31
45 0.33
46 0.28
47 0.26
48 0.23
49 0.24
50 0.21
51 0.22
52 0.25
53 0.25
54 0.3
55 0.3
56 0.3
57 0.35
58 0.35
59 0.35
60 0.34
61 0.33
62 0.32
63 0.36
64 0.35
65 0.29
66 0.29
67 0.27
68 0.25
69 0.22
70 0.18
71 0.17
72 0.21
73 0.22
74 0.21
75 0.21
76 0.2
77 0.25
78 0.24
79 0.25
80 0.22
81 0.25
82 0.29
83 0.32
84 0.33
85 0.3
86 0.31
87 0.28
88 0.32
89 0.29
90 0.25
91 0.25
92 0.23
93 0.22
94 0.26
95 0.25
96 0.24
97 0.27
98 0.28
99 0.26
100 0.28
101 0.27
102 0.23
103 0.24
104 0.2
105 0.2
106 0.19
107 0.16
108 0.14
109 0.13
110 0.14
111 0.13
112 0.11
113 0.11
114 0.12
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.09
125 0.14
126 0.16
127 0.17
128 0.2
129 0.27
130 0.37
131 0.47
132 0.55
133 0.6
134 0.69
135 0.78
136 0.82
137 0.85
138 0.86
139 0.87
140 0.87
141 0.86
142 0.86
143 0.84
144 0.81
145 0.71
146 0.63
147 0.56
148 0.48
149 0.39
150 0.32
151 0.24
152 0.21
153 0.21
154 0.21
155 0.17
156 0.17
157 0.17
158 0.17
159 0.16
160 0.17
161 0.17
162 0.19
163 0.2
164 0.18
165 0.2
166 0.21
167 0.25
168 0.3
169 0.37
170 0.41
171 0.45
172 0.51
173 0.55
174 0.52
175 0.51
176 0.45
177 0.38
178 0.31
179 0.25
180 0.19
181 0.13
182 0.11
183 0.08
184 0.06
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.09
194 0.11
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.16
200 0.16
201 0.15
202 0.14
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.09
212 0.11
213 0.1
214 0.08
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.07
237 0.1
238 0.12
239 0.12
240 0.11
241 0.11
242 0.12
243 0.16
244 0.17
245 0.21
246 0.22
247 0.25
248 0.29
249 0.31
250 0.31
251 0.28
252 0.28
253 0.27
254 0.33
255 0.39
256 0.39
257 0.48
258 0.55
259 0.55
260 0.55
261 0.54
262 0.49
263 0.41
264 0.41
265 0.37
266 0.32
267 0.31
268 0.3
269 0.29
270 0.26
271 0.27
272 0.27
273 0.3
274 0.33
275 0.35
276 0.38
277 0.38
278 0.41
279 0.43
280 0.48
281 0.49
282 0.53
283 0.61
284 0.66
285 0.71
286 0.75
287 0.79
288 0.75
289 0.74
290 0.74
291 0.72
292 0.71
293 0.67
294 0.65
295 0.57
296 0.52
297 0.43
298 0.33
299 0.26
300 0.18
301 0.15
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.1
307 0.09
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.11
316 0.14
317 0.14
318 0.17
319 0.21
320 0.29
321 0.28
322 0.28
323 0.3
324 0.26
325 0.27
326 0.27
327 0.23
328 0.14
329 0.14
330 0.14
331 0.12
332 0.11
333 0.08
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.13
340 0.16
341 0.21
342 0.23
343 0.24
344 0.27
345 0.31
346 0.33
347 0.35
348 0.42
349 0.47
350 0.55
351 0.65
352 0.71
353 0.77
354 0.86
355 0.88
356 0.89
357 0.89
358 0.88
359 0.85
360 0.86
361 0.78
362 0.71
363 0.62
364 0.56
365 0.48
366 0.48
367 0.43
368 0.34
369 0.32
370 0.29
371 0.28
372 0.25
373 0.28
374 0.2
375 0.18
376 0.24
377 0.27
378 0.3
379 0.3
380 0.32
381 0.3
382 0.37
383 0.44
384 0.43
385 0.43
386 0.39
387 0.4
388 0.46
389 0.52
390 0.55
391 0.57
392 0.57
393 0.56
394 0.64
395 0.68
396 0.67
397 0.62
398 0.57
399 0.55
400 0.52
401 0.57
402 0.52
403 0.51
404 0.47
405 0.43
406 0.39
407 0.3