FuNGI

A0A4Y7PHH0

Protein Details

Accession

A0A4Y7PHH0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-27	QGRSTAQRRVRLHREHQDGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 8.5, pero 5, cyto 4.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5 IPR022581 Spt5_N IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF11942 Spt5_N

Amino Acid Sequences

MTSEMDGQGRSTAQRRVRLHREHQDGSAGHELPWAQLADGTCIQGLFVNDLDQPTPQQEAKDKQEAFLDVSAQVFDGDEESEEEDRQDPDFIDNDTRDEDVHTRSTQIANAPIEPLSVVGHAEREEAEEIARRLVTRYGNGMQEGANESGMSQLRDEPTVENFNHIFRVQTRLGKEKDSIARIEENAKKEQLTVEAFALSFDANHVYIRANHINIARCICAGYSNIFLLRLHPVAQENIPAVLTAMKKARRLIPAITSAWVTVKDKKSIYNGDLTAVLSTSPESIEVACVPRIPHPWFAPKEDLQRRPPPQIVKIDDIPSLRRETLETDGDSVVTFKWEGRTYNDGLEVITLTPDKCTAVYHPPLDHFTIQFLESGIRQPMVRYVSNLTLRTGDRVELLGAGFLHQYGKITKTEQDTFSVDIFTYNDREGTYTTNVTVDWSELRRGFCTGDHVVVYAGQHKSRRGLVSEVAEDTVTLIAENKELVCSSCDSHVQD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.49
3	0.57
4	0.66
5	0.72
6	0.77
7	0.79
8	0.81
9	0.75
10	0.7
11	0.68
12	0.58
13	0.54
14	0.5
15	0.41
16	0.32
17	0.31
18	0.29
19	0.22
20	0.25
21	0.19
22	0.12
23	0.14
24	0.14
25	0.17
26	0.18
27	0.18
28	0.15
29	0.15
30	0.15
31	0.15
32	0.15
33	0.12
34	0.11
35	0.12
36	0.13
37	0.14
38	0.15
39	0.13
40	0.14
41	0.14
42	0.18
43	0.17
44	0.2
45	0.26
46	0.33
47	0.4
48	0.48
49	0.46
50	0.43
51	0.46
52	0.44
53	0.39
54	0.33
55	0.27
56	0.18
57	0.18
58	0.17
59	0.13
60	0.11
61	0.08
62	0.07
63	0.07
64	0.06
65	0.06
66	0.07
67	0.1
68	0.11
69	0.11
70	0.12
71	0.13
72	0.13
73	0.14
74	0.14
75	0.12
76	0.13
77	0.15
78	0.16
79	0.19
80	0.18
81	0.19
82	0.2
83	0.19
84	0.17
85	0.19
86	0.19
87	0.18
88	0.21
89	0.2
90	0.2
91	0.22
92	0.23
93	0.22
94	0.22
95	0.25
96	0.22
97	0.22
98	0.22
99	0.2
100	0.18
101	0.16
102	0.14
103	0.09
104	0.07
105	0.07
106	0.06
107	0.08
108	0.08
109	0.09
110	0.08
111	0.1
112	0.1
113	0.1
114	0.1
115	0.13
116	0.13
117	0.14
118	0.14
119	0.12
120	0.13
121	0.17
122	0.18
123	0.16
124	0.21
125	0.23
126	0.24
127	0.24
128	0.24
129	0.19
130	0.19
131	0.2
132	0.15
133	0.12
134	0.1
135	0.1
136	0.13
137	0.14
138	0.12
139	0.1
140	0.12
141	0.13
142	0.14
143	0.15
144	0.13
145	0.16
146	0.2
147	0.2
148	0.21
149	0.2
150	0.2
151	0.21
152	0.2
153	0.18
154	0.14
155	0.2
156	0.19
157	0.23
158	0.26
159	0.32
160	0.33
161	0.34
162	0.34
163	0.35
164	0.37
165	0.35
166	0.33
167	0.28
168	0.28
169	0.26
170	0.33
171	0.31
172	0.29
173	0.29
174	0.29
175	0.26
176	0.25
177	0.25
178	0.21
179	0.18
180	0.16
181	0.13
182	0.13
183	0.13
184	0.12
185	0.12
186	0.08
187	0.06
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.06
193	0.06
194	0.07
195	0.13
196	0.15
197	0.14
198	0.17
199	0.2
200	0.23
201	0.23
202	0.24
203	0.19
204	0.17
205	0.17
206	0.14
207	0.12
208	0.1
209	0.1
210	0.09
211	0.09
212	0.09
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.11
217	0.1
218	0.09
219	0.1
220	0.11
221	0.12
222	0.12
223	0.12
224	0.1
225	0.1
226	0.09
227	0.08
228	0.07
229	0.08
230	0.08
231	0.09
232	0.13
233	0.15
234	0.17
235	0.2
236	0.25
237	0.25
238	0.27
239	0.27
240	0.26
241	0.28
242	0.27
243	0.25
244	0.21
245	0.18
246	0.16
247	0.15
248	0.14
249	0.16
250	0.18
251	0.21
252	0.22
253	0.24
254	0.28
255	0.3
256	0.3
257	0.28
258	0.26
259	0.23
260	0.23
261	0.21
262	0.16
263	0.12
264	0.11
265	0.06
266	0.06
267	0.05
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.05
273	0.06
274	0.07
275	0.07
276	0.09
277	0.09
278	0.12
279	0.17
280	0.19
281	0.22
282	0.24
283	0.32
284	0.33
285	0.36
286	0.38
287	0.37
288	0.45
289	0.49
290	0.53
291	0.51
292	0.58
293	0.58
294	0.58
295	0.6
296	0.54
297	0.52
298	0.53
299	0.5
300	0.46
301	0.45
302	0.42
303	0.39
304	0.36
305	0.32
306	0.26
307	0.25
308	0.21
309	0.18
310	0.17
311	0.17
312	0.2
313	0.21
314	0.2
315	0.19
316	0.19
317	0.18
318	0.17
319	0.15
320	0.1
321	0.08
322	0.08
323	0.06
324	0.1
325	0.12
326	0.14
327	0.18
328	0.23
329	0.24
330	0.25
331	0.26
332	0.22
333	0.2
334	0.19
335	0.14
336	0.1
337	0.09
338	0.08
339	0.07
340	0.07
341	0.08
342	0.08
343	0.08
344	0.09
345	0.12
346	0.19
347	0.24
348	0.27
349	0.28
350	0.3
351	0.32
352	0.34
353	0.32
354	0.24
355	0.21
356	0.19
357	0.18
358	0.16
359	0.14
360	0.12
361	0.11
362	0.13
363	0.13
364	0.12
365	0.12
366	0.12
367	0.17
368	0.2
369	0.2
370	0.2
371	0.22
372	0.28
373	0.34
374	0.34
375	0.3
376	0.3
377	0.3
378	0.3
379	0.28
380	0.21
381	0.17
382	0.17
383	0.16
384	0.13
385	0.12
386	0.1
387	0.09
388	0.09
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.07
393	0.09
394	0.1
395	0.13
396	0.14
397	0.16
398	0.21
399	0.27
400	0.32
401	0.32
402	0.34
403	0.34
404	0.34
405	0.32
406	0.28
407	0.22
408	0.18
409	0.17
410	0.15
411	0.16
412	0.14
413	0.14
414	0.14
415	0.15
416	0.15
417	0.18
418	0.2
419	0.19
420	0.19
421	0.18
422	0.18
423	0.18
424	0.18
425	0.15
426	0.16
427	0.17
428	0.22
429	0.24
430	0.26
431	0.26
432	0.27
433	0.27
434	0.24
435	0.28
436	0.25
437	0.25
438	0.23
439	0.22
440	0.21
441	0.21
442	0.2
443	0.2
444	0.21
445	0.23
446	0.26
447	0.28
448	0.32
449	0.37
450	0.4
451	0.37
452	0.38
453	0.4
454	0.42
455	0.42
456	0.39
457	0.34
458	0.3
459	0.26
460	0.22
461	0.17
462	0.11
463	0.08
464	0.09
465	0.08
466	0.09
467	0.1
468	0.1
469	0.11
470	0.11
471	0.13
472	0.13
473	0.15
474	0.17
475	0.19

A0A4Y7PHH0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer