Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y7QBI1

Protein Details
Accession A0A4Y7QBI1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
254-275DDESRKNKKLKKTPATDNQYVCHydrophilic
297-318CNACGLRWSKKSRKVDDPPVINHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 10.333, cyto 7.5, cyto_pero 6.666, pero 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS50112  PAS  
CDD cd00130  PAS  
cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MALQPPQQTAGPSGQHRQPQVFEFTKRKRWADILISELPETINLVLSTNCKVLYCGTAVTELLGWGVEDLVDGDLTEFINDDDLPTFTEQFQGALQARQEFFTYLRLKCKGEFVASPTHSSSSKELLFEIVGHPYYIPDDHECKCIFAMAKLYPSRNNAVLNTFLELKMENERLAQRLVDLRAQIVPAPGSMPPPLALPSMCVPSQMYNPSSYSLSSSRMDDIAPSPTRSAFDVLGMGGYGSAGAASTADDHADDESRKNKKLKKTPATDNQYVCVTCGRTDSPEWRKGPLGPKTLCNACGLRWSKKSRKVDDPPVINTVPPPLPPHQPHVQIQMQQHTMPNQWPMRPGGHMFGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.45
3 0.48
4 0.49
5 0.46
6 0.44
7 0.48
8 0.47
9 0.49
10 0.53
11 0.58
12 0.64
13 0.68
14 0.67
15 0.64
16 0.62
17 0.63
18 0.61
19 0.57
20 0.53
21 0.5
22 0.49
23 0.43
24 0.39
25 0.31
26 0.22
27 0.19
28 0.12
29 0.1
30 0.08
31 0.09
32 0.1
33 0.12
34 0.15
35 0.15
36 0.15
37 0.13
38 0.14
39 0.14
40 0.16
41 0.15
42 0.14
43 0.13
44 0.14
45 0.14
46 0.14
47 0.12
48 0.09
49 0.08
50 0.07
51 0.06
52 0.04
53 0.04
54 0.04
55 0.03
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.07
70 0.07
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.1
75 0.13
76 0.12
77 0.11
78 0.11
79 0.15
80 0.15
81 0.15
82 0.17
83 0.18
84 0.19
85 0.19
86 0.2
87 0.16
88 0.15
89 0.21
90 0.25
91 0.23
92 0.29
93 0.32
94 0.33
95 0.32
96 0.37
97 0.31
98 0.29
99 0.28
100 0.25
101 0.31
102 0.31
103 0.32
104 0.28
105 0.28
106 0.25
107 0.26
108 0.24
109 0.2
110 0.2
111 0.18
112 0.17
113 0.16
114 0.16
115 0.14
116 0.13
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.09
123 0.08
124 0.09
125 0.1
126 0.14
127 0.15
128 0.19
129 0.19
130 0.19
131 0.19
132 0.19
133 0.17
134 0.14
135 0.17
136 0.14
137 0.19
138 0.21
139 0.22
140 0.23
141 0.25
142 0.27
143 0.24
144 0.25
145 0.2
146 0.2
147 0.2
148 0.17
149 0.16
150 0.15
151 0.12
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.12
157 0.1
158 0.11
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.12
163 0.1
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.09
173 0.08
174 0.06
175 0.07
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.1
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.12
192 0.15
193 0.16
194 0.16
195 0.15
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.15
200 0.16
201 0.14
202 0.17
203 0.16
204 0.16
205 0.16
206 0.16
207 0.15
208 0.14
209 0.14
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.17
214 0.17
215 0.18
216 0.18
217 0.18
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.04
226 0.04
227 0.03
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.09
241 0.09
242 0.12
243 0.2
244 0.24
245 0.3
246 0.37
247 0.42
248 0.51
249 0.6
250 0.68
251 0.71
252 0.75
253 0.79
254 0.83
255 0.85
256 0.82
257 0.73
258 0.64
259 0.57
260 0.48
261 0.39
262 0.32
263 0.24
264 0.18
265 0.19
266 0.18
267 0.18
268 0.22
269 0.31
270 0.36
271 0.43
272 0.44
273 0.44
274 0.45
275 0.47
276 0.53
277 0.51
278 0.52
279 0.46
280 0.49
281 0.52
282 0.53
283 0.48
284 0.43
285 0.36
286 0.28
287 0.35
288 0.37
289 0.38
290 0.43
291 0.52
292 0.58
293 0.66
294 0.75
295 0.73
296 0.79
297 0.81
298 0.83
299 0.83
300 0.8
301 0.74
302 0.7
303 0.63
304 0.52
305 0.43
306 0.38
307 0.3
308 0.26
309 0.27
310 0.25
311 0.34
312 0.37
313 0.43
314 0.45
315 0.5
316 0.51
317 0.54
318 0.57
319 0.53
320 0.55
321 0.56
322 0.51
323 0.47
324 0.47
325 0.42
326 0.4
327 0.37
328 0.41
329 0.38
330 0.37
331 0.39
332 0.4
333 0.39
334 0.4
335 0.4