Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4R5XFU0

Protein Details
Accession A0A4R5XFU0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-130AEARDASNKSRKRRKMAKAPEEERERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-124KSRKRRKMAKAP
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.333, cyto 5, cyto_mito 4.333, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022042  snRNA-activating_su3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12251  SNAPC3  
Amino Acid Sequences MKHYANESLFGPPSELIHIATFIQDASSRKNIGSKDASVGPSLTPEQLPTTLNEVEGYAQNDDIAAECSVDDLRDLLNNVFRDPMLFCHVARSHEENLGSIQATAEARDASNKSRKRRKMAKAPEEERERADVMALRKTLADVSLQSWQYVIASCENNLMRSTNWCCRYTVDTAAFMRAPKNSDFNTLSKPRTTTISEHTIPSPDQPFDAFIVVSIHNRLSWGNQYSRSSQHAVLGSNTLGDLFDNIICPSNEIPAQKCGDDVSQGYVEGIPQRLGGIICIEGEAFTDGRSKEDYASKLRTHIEGLPKAKRPVIQNITNMHERTFASLSTRVNQPYWLLHQGSCEHFVVIDEIRLLCDTDLQEGYPLTLQITPPLLDMCQACSKVPAVWSVVGDVRLGQSPCLLCARCWQAMGQSGCEGVLVVPLPRHEVGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.16
4 0.15
5 0.16
6 0.14
7 0.14
8 0.13
9 0.1
10 0.1
11 0.12
12 0.14
13 0.19
14 0.24
15 0.24
16 0.25
17 0.3
18 0.3
19 0.35
20 0.38
21 0.35
22 0.34
23 0.38
24 0.39
25 0.35
26 0.35
27 0.27
28 0.25
29 0.24
30 0.21
31 0.16
32 0.16
33 0.17
34 0.19
35 0.19
36 0.18
37 0.21
38 0.2
39 0.2
40 0.19
41 0.16
42 0.16
43 0.18
44 0.19
45 0.14
46 0.14
47 0.13
48 0.13
49 0.12
50 0.11
51 0.1
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.06
60 0.07
61 0.08
62 0.1
63 0.11
64 0.16
65 0.17
66 0.18
67 0.18
68 0.17
69 0.17
70 0.16
71 0.17
72 0.18
73 0.19
74 0.18
75 0.25
76 0.27
77 0.28
78 0.32
79 0.34
80 0.31
81 0.33
82 0.33
83 0.26
84 0.25
85 0.24
86 0.2
87 0.15
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.13
96 0.15
97 0.19
98 0.28
99 0.35
100 0.44
101 0.54
102 0.62
103 0.68
104 0.77
105 0.8
106 0.82
107 0.87
108 0.88
109 0.88
110 0.85
111 0.83
112 0.79
113 0.71
114 0.61
115 0.53
116 0.43
117 0.32
118 0.29
119 0.24
120 0.19
121 0.22
122 0.2
123 0.18
124 0.17
125 0.17
126 0.16
127 0.13
128 0.12
129 0.08
130 0.1
131 0.16
132 0.16
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.13
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.16
143 0.16
144 0.17
145 0.16
146 0.16
147 0.13
148 0.18
149 0.23
150 0.26
151 0.3
152 0.3
153 0.3
154 0.32
155 0.35
156 0.33
157 0.34
158 0.28
159 0.27
160 0.26
161 0.27
162 0.26
163 0.22
164 0.2
165 0.16
166 0.17
167 0.14
168 0.18
169 0.17
170 0.22
171 0.25
172 0.25
173 0.31
174 0.33
175 0.34
176 0.31
177 0.32
178 0.27
179 0.28
180 0.28
181 0.24
182 0.24
183 0.29
184 0.29
185 0.29
186 0.28
187 0.26
188 0.24
189 0.23
190 0.21
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.11
196 0.12
197 0.09
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.11
209 0.14
210 0.16
211 0.19
212 0.22
213 0.24
214 0.26
215 0.28
216 0.26
217 0.24
218 0.25
219 0.23
220 0.22
221 0.2
222 0.19
223 0.15
224 0.12
225 0.11
226 0.08
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.08
235 0.07
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.12
240 0.13
241 0.14
242 0.16
243 0.18
244 0.16
245 0.16
246 0.16
247 0.14
248 0.14
249 0.13
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.09
275 0.09
276 0.11
277 0.13
278 0.13
279 0.15
280 0.2
281 0.23
282 0.25
283 0.31
284 0.3
285 0.33
286 0.34
287 0.32
288 0.3
289 0.31
290 0.34
291 0.35
292 0.4
293 0.43
294 0.47
295 0.48
296 0.48
297 0.47
298 0.42
299 0.46
300 0.48
301 0.47
302 0.48
303 0.5
304 0.52
305 0.53
306 0.49
307 0.39
308 0.35
309 0.29
310 0.27
311 0.24
312 0.2
313 0.19
314 0.22
315 0.23
316 0.24
317 0.28
318 0.26
319 0.25
320 0.26
321 0.24
322 0.24
323 0.27
324 0.29
325 0.27
326 0.25
327 0.28
328 0.3
329 0.31
330 0.31
331 0.26
332 0.21
333 0.19
334 0.18
335 0.18
336 0.15
337 0.13
338 0.11
339 0.1
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.09
344 0.11
345 0.11
346 0.13
347 0.14
348 0.13
349 0.14
350 0.14
351 0.15
352 0.12
353 0.12
354 0.1
355 0.11
356 0.11
357 0.13
358 0.15
359 0.14
360 0.14
361 0.15
362 0.14
363 0.14
364 0.15
365 0.17
366 0.21
367 0.21
368 0.21
369 0.22
370 0.23
371 0.23
372 0.23
373 0.22
374 0.19
375 0.2
376 0.2
377 0.21
378 0.22
379 0.2
380 0.19
381 0.17
382 0.15
383 0.19
384 0.19
385 0.16
386 0.18
387 0.18
388 0.21
389 0.27
390 0.26
391 0.21
392 0.29
393 0.36
394 0.33
395 0.34
396 0.32
397 0.31
398 0.38
399 0.4
400 0.34
401 0.29
402 0.27
403 0.25
404 0.24
405 0.19
406 0.11
407 0.11
408 0.1
409 0.1
410 0.12
411 0.13
412 0.18