Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4R5XFR1

Protein Details
Accession A0A4R5XFR1    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-47VFDGEKKRPKKLPTGPRQPRESKRVSSBasic
268-287MFPSKPKKIKKDSAQRRRTMHydrophilic
297-319VSATIPKSRKRSNRKPGNSKVLQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-44KKRPKKLPTGPRQPRESKR
272-332KPKKIKKDSAQRRRTMPVKSVSATKVSATIPKSRKRSNRKPGNSKVLQVVKKSKSKSKSVP
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR008918  HhH2  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
Amino Acid Sequences MIGWSRLATELRQNDTGLICVFDGEKKRPKKLPTGPRQPRESKRVSSVRGMLEPNKIQKLSRPRNATCTYQSTNPDSGKRARQARKITIAEAKTVERGVQGAEVVPPEGLSHLEHDEEVAVEHAARRSNVHDGDGCEEAGEGCKDLKFVKSHGVLKVPENPSQFDIIFPAPQSEKTVEQMSSPEDPSEGSVVATGRATDDSGDGGESNTHSGKELAPNATQVMDASTHGMSFLLDLRPVLISKPKDSTNTGGDHRGHPYGSLPTSADMFPSKPKKIKKDSAQRRRTMPVKSVSATKVSATIPKSRKRSNRKPGNSKVLQVVKKSKSKSKSVPAKVLIGMKDRSTYIPESFGRRGKAPKSSAYKESKMLLEAMGVPWIQVEDGQKANAVASSLVLNGHADFVASDDMDVLIHGAPLLRNLVSDEKPLITISSIHLREALHLDRDSFVDFALLLGTDFSERIKDFGPARVLNLIQKHGSIERVLVTEKRVSSKVYVGKYLEQTKRARQVFRNLTPVPDSKFLRPREIDEEALARIVKKFKMGDALKDSASVSADK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.34
4 0.26
5 0.2
6 0.15
7 0.13
8 0.14
9 0.17
10 0.22
11 0.28
12 0.37
13 0.43
14 0.52
15 0.59
16 0.64
17 0.69
18 0.74
19 0.78
20 0.79
21 0.83
22 0.86
23 0.87
24 0.9
25 0.89
26 0.87
27 0.85
28 0.82
29 0.77
30 0.76
31 0.76
32 0.71
33 0.69
34 0.66
35 0.62
36 0.59
37 0.57
38 0.51
39 0.5
40 0.52
41 0.51
42 0.5
43 0.47
44 0.42
45 0.46
46 0.53
47 0.56
48 0.59
49 0.61
50 0.58
51 0.67
52 0.7
53 0.68
54 0.63
55 0.61
56 0.56
57 0.53
58 0.54
59 0.51
60 0.53
61 0.51
62 0.48
63 0.45
64 0.48
65 0.5
66 0.54
67 0.58
68 0.61
69 0.66
70 0.71
71 0.74
72 0.77
73 0.71
74 0.68
75 0.66
76 0.59
77 0.53
78 0.47
79 0.39
80 0.32
81 0.29
82 0.25
83 0.17
84 0.16
85 0.13
86 0.11
87 0.1
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.09
99 0.1
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.1
105 0.09
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.08
110 0.1
111 0.12
112 0.12
113 0.13
114 0.15
115 0.22
116 0.23
117 0.23
118 0.24
119 0.24
120 0.26
121 0.26
122 0.23
123 0.16
124 0.15
125 0.13
126 0.12
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.1
133 0.14
134 0.14
135 0.16
136 0.23
137 0.28
138 0.32
139 0.34
140 0.39
141 0.36
142 0.37
143 0.45
144 0.4
145 0.39
146 0.36
147 0.35
148 0.31
149 0.32
150 0.29
151 0.2
152 0.2
153 0.16
154 0.16
155 0.14
156 0.15
157 0.13
158 0.14
159 0.17
160 0.16
161 0.16
162 0.18
163 0.2
164 0.18
165 0.18
166 0.18
167 0.19
168 0.19
169 0.18
170 0.16
171 0.13
172 0.13
173 0.13
174 0.13
175 0.1
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.13
201 0.16
202 0.17
203 0.17
204 0.17
205 0.17
206 0.17
207 0.16
208 0.11
209 0.09
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.08
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.12
228 0.13
229 0.15
230 0.18
231 0.2
232 0.22
233 0.24
234 0.27
235 0.24
236 0.27
237 0.26
238 0.28
239 0.28
240 0.27
241 0.27
242 0.25
243 0.21
244 0.17
245 0.17
246 0.15
247 0.14
248 0.13
249 0.11
250 0.1
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.09
255 0.09
256 0.15
257 0.2
258 0.23
259 0.27
260 0.33
261 0.41
262 0.49
263 0.57
264 0.6
265 0.66
266 0.74
267 0.79
268 0.83
269 0.78
270 0.74
271 0.71
272 0.67
273 0.59
274 0.53
275 0.48
276 0.42
277 0.39
278 0.39
279 0.34
280 0.31
281 0.28
282 0.22
283 0.19
284 0.16
285 0.2
286 0.18
287 0.25
288 0.3
289 0.37
290 0.42
291 0.48
292 0.57
293 0.63
294 0.72
295 0.74
296 0.79
297 0.82
298 0.86
299 0.87
300 0.88
301 0.79
302 0.7
303 0.67
304 0.64
305 0.56
306 0.51
307 0.51
308 0.47
309 0.51
310 0.52
311 0.52
312 0.5
313 0.54
314 0.57
315 0.59
316 0.63
317 0.63
318 0.67
319 0.62
320 0.59
321 0.54
322 0.5
323 0.41
324 0.35
325 0.3
326 0.23
327 0.22
328 0.2
329 0.19
330 0.18
331 0.19
332 0.15
333 0.2
334 0.21
335 0.25
336 0.29
337 0.32
338 0.3
339 0.31
340 0.36
341 0.35
342 0.41
343 0.39
344 0.42
345 0.47
346 0.49
347 0.54
348 0.56
349 0.54
350 0.49
351 0.48
352 0.41
353 0.34
354 0.3
355 0.22
356 0.16
357 0.14
358 0.11
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.07
363 0.07
364 0.06
365 0.07
366 0.08
367 0.1
368 0.11
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.12
373 0.1
374 0.09
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.08
403 0.07
404 0.07
405 0.1
406 0.15
407 0.15
408 0.17
409 0.18
410 0.17
411 0.18
412 0.18
413 0.16
414 0.11
415 0.11
416 0.12
417 0.2
418 0.19
419 0.19
420 0.21
421 0.21
422 0.22
423 0.26
424 0.25
425 0.21
426 0.21
427 0.22
428 0.2
429 0.21
430 0.21
431 0.16
432 0.13
433 0.09
434 0.09
435 0.08
436 0.07
437 0.06
438 0.04
439 0.04
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.06
444 0.09
445 0.09
446 0.11
447 0.12
448 0.16
449 0.17
450 0.23
451 0.3
452 0.27
453 0.29
454 0.31
455 0.31
456 0.32
457 0.33
458 0.31
459 0.25
460 0.25
461 0.25
462 0.23
463 0.24
464 0.2
465 0.18
466 0.17
467 0.18
468 0.2
469 0.19
470 0.21
471 0.24
472 0.25
473 0.28
474 0.28
475 0.29
476 0.29
477 0.35
478 0.39
479 0.38
480 0.41
481 0.39
482 0.44
483 0.48
484 0.55
485 0.53
486 0.53
487 0.55
488 0.58
489 0.65
490 0.65
491 0.66
492 0.63
493 0.68
494 0.71
495 0.72
496 0.73
497 0.64
498 0.61
499 0.59
500 0.57
501 0.51
502 0.48
503 0.45
504 0.45
505 0.52
506 0.52
507 0.56
508 0.54
509 0.55
510 0.55
511 0.56
512 0.49
513 0.44
514 0.43
515 0.34
516 0.34
517 0.28
518 0.22
519 0.22
520 0.24
521 0.23
522 0.26
523 0.27
524 0.27
525 0.37
526 0.39
527 0.44
528 0.46
529 0.48
530 0.43
531 0.43
532 0.4
533 0.32