FuNGI

A0A4Q4Y0A9

Protein Details

Accession

A0A4Q4Y0A9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
335-360	EDSALLTPSKRKRRRKARGGSGTNTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
343-353	SKRKRRRKARG

Subcellular Location(s)

plas 22, E.R. 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013057 AA_transpt_TM IPR037685 RBP11 IPR036603 RBP11-like IPR009025 RBP11-like_dimer IPR008193 RNA_pol_Rpb11_13-16kDa_CS
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0005665 C:RNA polymerase II, core complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0046983 F:protein dimerization activity GO:0001055 F:RNA polymerase II activity
Pfam	View protein in Pfam PF01490 Aa_trans PF13656 RNA_pol_L_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS01154 RNA_POL_L_13KD
CDD	cd06926 RNAP_II_RPB11

Amino Acid Sequences

MAGSDQETNSTPLAAAGQLSSSPSSLRSRAYGTSVPRAEFTARLASPVPANPVGTTPPLRSASPHPIEGSNSGRLSPLPGPGQSVPGPGRSALAAALSSSVGTSPPRHGTPARPASPATMTSQPQPSITPPTYGSFETKSRSAAYEDPEIVKRHLVRPVDAPDSNAGSNCDSAKGKQVGEVSGRRQDDDEFSSLRLQGGDITRQIYRWTEGADDRRRTQRSKSFSAPEGEPENEILDINSIKAPGGFRRNYLRRAAHDPSTNPHTLEAGGGVPRGRHEPQLFTSSFLEFLTLYGHFAGEELEEDDEALLPGEYFTSGSEDEEDMYDSDEDREPMEDSALLTPSKRKRRRKARGGSGTNTPFNTALLLLKSFVGTGVLFLPRAYLNGGMVFSNLVLLGVAALSYYCFVLLVTTRLKVVGSFGDMGGILYGKWLRSLILGSVVISQIGFVAAYIVFTAENLQAFILAVTNCEKYIQITWLILLQMVIFLPFSLFRDIGKLGFTALIADAFILIGLAYLFYYDVLTLSTKGFADIIQFNQKDWTLFIGTAIFTFEGIGLIIPIQESMKTPSKFPKVMFYVMIIITVLFVTMGAVSYAAYGSKTETVVLLNLPQDDKLVNGVQLLYSLAILLSTPLQIFPAIRIMENALFTKSGKYNPYIKWQKNGFRFLIVFLCALIAWGGADDLDKFVALVGNFACIPLVYIYPPMLHYRGVARTKFWKVSDILLCVFGIIAMAFELFLVDEAAGEKKITEKPFAGMSNTSDFILLKEDHTLGNLLSEHLKQAPHVLMAGYKVAHPNVPEVMIRVQTDGTITPREVMIDVCKQLVAAYGQLGREFTREYELRRMADTGHQENGTNGGV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.1
3	0.08
4	0.09
5	0.09
6	0.11
7	0.11
8	0.11
9	0.11
10	0.14
11	0.19
12	0.21
13	0.23
14	0.24
15	0.27
16	0.3
17	0.35
18	0.37
19	0.37
20	0.45
21	0.46
22	0.44
23	0.41
24	0.41
25	0.37
26	0.33
27	0.31
28	0.29
29	0.26
30	0.27
31	0.27
32	0.26
33	0.27
34	0.28
35	0.31
36	0.24
37	0.25
38	0.23
39	0.24
40	0.25
41	0.26
42	0.27
43	0.23
44	0.28
45	0.3
46	0.3
47	0.32
48	0.36
49	0.42
50	0.43
51	0.44
52	0.39
53	0.38
54	0.41
55	0.42
56	0.4
57	0.35
58	0.32
59	0.29
60	0.27
61	0.25
62	0.28
63	0.25
64	0.26
65	0.23
66	0.23
67	0.27
68	0.27
69	0.32
70	0.28
71	0.31
72	0.27
73	0.27
74	0.27
75	0.23
76	0.23
77	0.18
78	0.18
79	0.13
80	0.12
81	0.09
82	0.08
83	0.08
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.06
88	0.07
89	0.09
90	0.11
91	0.16
92	0.21
93	0.23
94	0.27
95	0.3
96	0.36
97	0.44
98	0.52
99	0.5
100	0.47
101	0.47
102	0.46
103	0.46
104	0.41
105	0.35
106	0.31
107	0.29
108	0.32
109	0.36
110	0.33
111	0.31
112	0.31
113	0.3
114	0.32
115	0.31
116	0.29
117	0.26
118	0.28
119	0.3
120	0.3
121	0.3
122	0.26
123	0.28
124	0.29
125	0.28
126	0.28
127	0.26
128	0.26
129	0.27
130	0.27
131	0.28
132	0.3
133	0.3
134	0.32
135	0.34
136	0.35
137	0.32
138	0.33
139	0.32
140	0.3
141	0.35
142	0.33
143	0.32
144	0.36
145	0.4
146	0.41
147	0.39
148	0.36
149	0.32
150	0.33
151	0.31
152	0.26
153	0.22
154	0.17
155	0.18
156	0.17
157	0.18
158	0.16
159	0.17
160	0.24
161	0.26
162	0.25
163	0.27
164	0.28
165	0.28
166	0.33
167	0.37
168	0.33
169	0.37
170	0.37
171	0.34
172	0.33
173	0.32
174	0.3
175	0.29
176	0.27
177	0.21
178	0.22
179	0.23
180	0.23
181	0.21
182	0.17
183	0.13
184	0.14
185	0.16
186	0.17
187	0.17
188	0.19
189	0.18
190	0.19
191	0.2
192	0.18
193	0.17
194	0.15
195	0.15
196	0.17
197	0.22
198	0.31
199	0.38
200	0.41
201	0.44
202	0.51
203	0.55
204	0.54
205	0.58
206	0.57
207	0.56
208	0.58
209	0.61
210	0.57
211	0.57
212	0.59
213	0.5
214	0.46
215	0.42
216	0.36
217	0.29
218	0.24
219	0.21
220	0.16
221	0.15
222	0.11
223	0.09
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.07
229	0.09
230	0.1
231	0.14
232	0.22
233	0.22
234	0.25
235	0.35
236	0.41
237	0.44
238	0.5
239	0.49
240	0.46
241	0.53
242	0.54
243	0.49
244	0.49
245	0.46
246	0.44
247	0.45
248	0.41
249	0.34
250	0.3
251	0.25
252	0.2
253	0.19
254	0.14
255	0.09
256	0.08
257	0.09
258	0.09
259	0.08
260	0.09
261	0.14
262	0.14
263	0.19
264	0.2
265	0.23
266	0.26
267	0.32
268	0.31
269	0.3
270	0.3
271	0.24
272	0.23
273	0.19
274	0.16
275	0.1
276	0.1
277	0.09
278	0.07
279	0.08
280	0.07
281	0.07
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.04
295	0.04
296	0.03
297	0.03
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.06
303	0.06
304	0.07
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.09
309	0.09
310	0.07
311	0.08
312	0.08
313	0.07
314	0.09
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.09
320	0.09
321	0.09
322	0.08
323	0.08
324	0.09
325	0.1
326	0.09
327	0.08
328	0.15
329	0.23
330	0.34
331	0.43
332	0.52
333	0.62
334	0.73
335	0.84
336	0.88
337	0.9
338	0.91
339	0.92
340	0.88
341	0.8
342	0.77
343	0.7
344	0.61
345	0.51
346	0.41
347	0.3
348	0.23
349	0.2
350	0.12
351	0.09
352	0.08
353	0.08
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.05
361	0.05
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.03
381	0.03
382	0.02
383	0.02
384	0.02
385	0.02
386	0.02
387	0.02
388	0.02
389	0.02
390	0.02
391	0.02
392	0.02
393	0.03
394	0.03
395	0.04
396	0.07
397	0.07
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.08
403	0.08
404	0.06
405	0.07
406	0.07
407	0.07
408	0.07
409	0.07
410	0.07
411	0.06
412	0.05
413	0.03
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.06
422	0.05
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.08
427	0.08
428	0.07
429	0.06
430	0.06
431	0.04
432	0.04
433	0.03
434	0.02
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.03
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.04
452	0.05
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.08
457	0.08
458	0.07
459	0.09
460	0.1
461	0.09
462	0.09
463	0.09
464	0.1
465	0.1
466	0.09
467	0.07
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.04
472	0.03
473	0.03
474	0.03
475	0.04
476	0.05
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.1
481	0.1
482	0.1
483	0.11
484	0.09
485	0.08
486	0.08
487	0.08
488	0.06
489	0.06
490	0.05
491	0.04
492	0.04
493	0.04
494	0.03
495	0.03
496	0.02
497	0.02
498	0.02
499	0.02
500	0.02
501	0.02
502	0.02
503	0.03
504	0.03
505	0.03
506	0.03
507	0.03
508	0.04
509	0.05
510	0.06
511	0.06
512	0.07
513	0.07
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.1
518	0.1
519	0.13
520	0.2
521	0.2
522	0.2
523	0.22
524	0.22
525	0.19
526	0.18
527	0.18
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.1
532	0.1
533	0.09
534	0.1
535	0.07
536	0.05
537	0.06
538	0.05
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.03
543	0.03
544	0.03
545	0.03
546	0.04
547	0.04
548	0.04
549	0.05
550	0.11
551	0.19
552	0.2
553	0.22
554	0.3
555	0.36
556	0.39
557	0.39
558	0.42
559	0.38
560	0.39
561	0.38
562	0.31
563	0.27
564	0.24
565	0.23
566	0.15
567	0.1
568	0.08
569	0.07
570	0.06
571	0.03
572	0.03
573	0.03
574	0.03
575	0.03
576	0.03
577	0.03
578	0.03
579	0.03
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.06
585	0.07
586	0.08
587	0.08
588	0.08
589	0.09
590	0.09
591	0.09
592	0.1
593	0.1
594	0.1
595	0.11
596	0.1
597	0.1
598	0.1
599	0.09
600	0.1
601	0.1
602	0.09
603	0.09
604	0.1
605	0.09
606	0.09
607	0.09
608	0.06
609	0.05
610	0.05
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.05
617	0.05
618	0.05
619	0.06
620	0.06
621	0.07
622	0.07
623	0.13
624	0.13
625	0.13
626	0.13
627	0.15
628	0.16
629	0.18
630	0.18
631	0.13
632	0.13
633	0.14
634	0.17
635	0.17
636	0.2
637	0.21
638	0.24
639	0.31
640	0.34
641	0.45
642	0.51
643	0.51
644	0.56
645	0.61
646	0.66
647	0.65
648	0.69
649	0.59
650	0.53
651	0.51
652	0.44
653	0.39
654	0.31
655	0.23
656	0.16
657	0.15
658	0.1
659	0.1
660	0.08
661	0.05
662	0.04
663	0.04
664	0.04
665	0.03
666	0.04
667	0.04
668	0.05
669	0.05
670	0.05
671	0.05
672	0.05
673	0.08
674	0.07
675	0.09
676	0.08
677	0.1
678	0.1
679	0.1
680	0.09
681	0.07
682	0.08
683	0.07
684	0.08
685	0.07
686	0.09
687	0.1
688	0.11
689	0.12
690	0.15
691	0.15
692	0.15
693	0.15
694	0.19
695	0.27
696	0.33
697	0.32
698	0.33
699	0.4
700	0.46
701	0.51
702	0.47
703	0.43
704	0.38
705	0.45
706	0.45
707	0.41
708	0.35
709	0.3
710	0.29
711	0.24
712	0.22
713	0.14
714	0.09
715	0.05
716	0.04
717	0.03
718	0.04
719	0.03
720	0.03
721	0.04
722	0.03
723	0.04
724	0.04
725	0.04
726	0.04
727	0.05
728	0.07
729	0.07
730	0.07
731	0.07
732	0.11
733	0.18
734	0.2
735	0.24
736	0.24
737	0.25
738	0.31
739	0.33
740	0.32
741	0.28
742	0.29
743	0.29
744	0.29
745	0.27
746	0.22
747	0.2
748	0.17
749	0.2
750	0.17
751	0.13
752	0.15
753	0.16
754	0.15
755	0.16
756	0.17
757	0.12
758	0.14
759	0.14
760	0.12
761	0.14
762	0.15
763	0.16
764	0.17
765	0.18
766	0.15
767	0.2
768	0.21
769	0.19
770	0.19
771	0.17
772	0.16
773	0.17
774	0.19
775	0.14
776	0.14
777	0.17
778	0.17
779	0.19
780	0.18
781	0.2
782	0.2
783	0.21
784	0.2
785	0.2
786	0.22
787	0.23
788	0.23
789	0.21
790	0.2
791	0.18
792	0.19
793	0.18
794	0.18
795	0.18
796	0.18
797	0.18
798	0.18
799	0.19
800	0.17
801	0.17
802	0.19
803	0.22
804	0.23
805	0.22
806	0.22
807	0.2
808	0.2
809	0.21
810	0.17
811	0.12
812	0.15
813	0.17
814	0.18
815	0.19
816	0.2
817	0.18
818	0.18
819	0.19
820	0.17
821	0.22
822	0.24
823	0.29
824	0.37
825	0.42
826	0.41
827	0.42
828	0.41
829	0.35
830	0.4
831	0.43
832	0.37
833	0.37
834	0.36
835	0.35
836	0.34

A0A4Q4Y0A9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer