Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4ZH93

Protein Details
Accession A0A4Q4ZH93    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-129YREIDEKMDRRRRARREAREKAEREEYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-124RRRRARREAREKA
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 8.5, cyto_mito 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MTGRRDFLNQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEDQIKEALAKRAAQLGFGDAAGAKKGDDDDDNDERYQDPDNEVGLFAGGIYDKDDDEADRIYREIDEKMDRRRRARREAREKAEREEYERQNPKISHQFADLKRGLESITEEEWASLPEVGDLTGKARRARQARHQRFYAVPDSVLAAASTTGELGATVNDDGVASTTSSSQDGTMTNFAKIGQARDKVLQVRLDQASQNGTSTSVAGSATSVDPKGYLTSLAKSSLTEGAPQVSDINRVRELLESVIKTNPTNGPGWIAAARIEELAGKIVAARGVIARGCQHCPKNEDVWLENIRLNEGRNAKIIAAQAIQKNNRSVRLWVEAMKLEEDIRSKKRVIRHALDHIPESEALWKEAVNLEEDPEDARLMLAKATELIPLSVDLWLALARLETPENAQKVLNKARKHIPTSHEIWIAAARLQEQLGSGEKVNVMKRAVQVLAKESAMPKREEWIAEAEKCEQEGAVITCGAIIRETLGWGLDEDDDRKDTWLDDARASINRGRYETARAIYAYALRVFPTSKTIWLAAADLERNHGSKEELWAVLEKAVNACPRSEILWMMLAKEKWQAGEIDNARRVLARAFQQNPNNEDIWLAAVKLEAENDQVDQARELLKTARQEAPTDRVWMKSVAFERQQNDLDTALDLVQQALNLFPASPKLWMMKGQIYEDLDKPLQAREAYSTGVKAVPSSVPLWLLYARLEEKLGQLPKARSVLDRARLAVPKSAELWCESVRVERRAQNTKQAETLMERALRDVPKPQQGTLWSEKIWHLTARPQRKPRALEAIKEVDNDPALLVAVARIFWGERRLDKAQAWFERALVRDADRGDSWAWYYRFLLEHGTPEKREEVVAKCVSVEPRHGEVWQAVAKDPRNARKGVEQILKLVAQELKSFSAAVLMDEDVATPDDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.29
3 0.24
4 0.22
5 0.18
6 0.16
7 0.13
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.28
37 0.3
38 0.3
39 0.37
40 0.36
41 0.31
42 0.28
43 0.24
44 0.21
45 0.19
46 0.19
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.11
51 0.09
52 0.09
53 0.1
54 0.12
55 0.13
56 0.17
57 0.23
58 0.28
59 0.31
60 0.3
61 0.3
62 0.28
63 0.28
64 0.28
65 0.23
66 0.21
67 0.19
68 0.2
69 0.2
70 0.2
71 0.18
72 0.14
73 0.11
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.05
78 0.07
79 0.08
80 0.07
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.14
86 0.13
87 0.13
88 0.14
89 0.14
90 0.15
91 0.16
92 0.16
93 0.18
94 0.26
95 0.31
96 0.42
97 0.5
98 0.56
99 0.63
100 0.71
101 0.75
102 0.78
103 0.83
104 0.84
105 0.85
106 0.89
107 0.9
108 0.9
109 0.85
110 0.8
111 0.79
112 0.7
113 0.66
114 0.65
115 0.61
116 0.61
117 0.66
118 0.61
119 0.59
120 0.58
121 0.58
122 0.58
123 0.55
124 0.47
125 0.46
126 0.53
127 0.47
128 0.56
129 0.51
130 0.42
131 0.39
132 0.37
133 0.3
134 0.23
135 0.23
136 0.18
137 0.17
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.16
142 0.15
143 0.13
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.08
151 0.1
152 0.12
153 0.16
154 0.18
155 0.23
156 0.3
157 0.37
158 0.44
159 0.53
160 0.61
161 0.69
162 0.73
163 0.71
164 0.68
165 0.63
166 0.62
167 0.57
168 0.47
169 0.36
170 0.29
171 0.28
172 0.23
173 0.2
174 0.14
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.06
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.1
202 0.12
203 0.17
204 0.17
205 0.17
206 0.17
207 0.17
208 0.19
209 0.2
210 0.22
211 0.23
212 0.25
213 0.27
214 0.29
215 0.33
216 0.33
217 0.35
218 0.35
219 0.29
220 0.33
221 0.32
222 0.32
223 0.28
224 0.26
225 0.25
226 0.21
227 0.21
228 0.15
229 0.14
230 0.12
231 0.11
232 0.1
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.13
249 0.15
250 0.16
251 0.16
252 0.15
253 0.17
254 0.18
255 0.17
256 0.16
257 0.15
258 0.15
259 0.15
260 0.15
261 0.14
262 0.11
263 0.17
264 0.17
265 0.21
266 0.2
267 0.2
268 0.21
269 0.2
270 0.21
271 0.17
272 0.19
273 0.16
274 0.17
275 0.19
276 0.19
277 0.18
278 0.2
279 0.2
280 0.18
281 0.18
282 0.17
283 0.17
284 0.16
285 0.18
286 0.15
287 0.13
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.06
303 0.05
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.11
308 0.13
309 0.17
310 0.23
311 0.26
312 0.29
313 0.32
314 0.35
315 0.35
316 0.37
317 0.36
318 0.31
319 0.34
320 0.32
321 0.3
322 0.28
323 0.24
324 0.22
325 0.19
326 0.19
327 0.19
328 0.2
329 0.2
330 0.19
331 0.2
332 0.18
333 0.2
334 0.2
335 0.16
336 0.14
337 0.16
338 0.18
339 0.24
340 0.26
341 0.26
342 0.3
343 0.3
344 0.33
345 0.31
346 0.29
347 0.27
348 0.3
349 0.29
350 0.26
351 0.26
352 0.24
353 0.23
354 0.22
355 0.18
356 0.14
357 0.14
358 0.14
359 0.17
360 0.19
361 0.21
362 0.23
363 0.26
364 0.32
365 0.39
366 0.45
367 0.46
368 0.48
369 0.53
370 0.57
371 0.55
372 0.49
373 0.41
374 0.34
375 0.28
376 0.22
377 0.18
378 0.13
379 0.12
380 0.11
381 0.1
382 0.1
383 0.12
384 0.12
385 0.1
386 0.09
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.08
392 0.08
393 0.06
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.06
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.07
408 0.06
409 0.05
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.05
419 0.05
420 0.07
421 0.11
422 0.12
423 0.13
424 0.13
425 0.14
426 0.19
427 0.28
428 0.32
429 0.29
430 0.33
431 0.4
432 0.45
433 0.47
434 0.47
435 0.42
436 0.41
437 0.44
438 0.44
439 0.37
440 0.32
441 0.28
442 0.23
443 0.2
444 0.16
445 0.12
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.09
457 0.11
458 0.12
459 0.13
460 0.12
461 0.14
462 0.14
463 0.16
464 0.16
465 0.15
466 0.15
467 0.15
468 0.16
469 0.13
470 0.13
471 0.13
472 0.16
473 0.17
474 0.18
475 0.15
476 0.16
477 0.18
478 0.17
479 0.17
480 0.19
481 0.2
482 0.19
483 0.2
484 0.2
485 0.18
486 0.18
487 0.16
488 0.1
489 0.07
490 0.08
491 0.08
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.07
497 0.06
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.05
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.06
508 0.05
509 0.06
510 0.07
511 0.08
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.08
517 0.11
518 0.16
519 0.16
520 0.16
521 0.17
522 0.18
523 0.19
524 0.21
525 0.2
526 0.19
527 0.19
528 0.2
529 0.2
530 0.2
531 0.23
532 0.25
533 0.23
534 0.2
535 0.18
536 0.18
537 0.16
538 0.17
539 0.13
540 0.11
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.1
546 0.13
547 0.12
548 0.12
549 0.14
550 0.14
551 0.14
552 0.13
553 0.13
554 0.1
555 0.11
556 0.11
557 0.09
558 0.11
559 0.11
560 0.11
561 0.11
562 0.11
563 0.1
564 0.1
565 0.14
566 0.14
567 0.13
568 0.14
569 0.14
570 0.14
571 0.15
572 0.14
573 0.11
574 0.1
575 0.12
576 0.14
577 0.14
578 0.14
579 0.13
580 0.13
581 0.14
582 0.14
583 0.12
584 0.1
585 0.14
586 0.14
587 0.14
588 0.17
589 0.16
590 0.16
591 0.18
592 0.18
593 0.13
594 0.15
595 0.14
596 0.12
597 0.2
598 0.23
599 0.26
600 0.28
601 0.28
602 0.27
603 0.26
604 0.26
605 0.18
606 0.19
607 0.18
608 0.23
609 0.27
610 0.34
611 0.39
612 0.43
613 0.44
614 0.44
615 0.39
616 0.31
617 0.27
618 0.21
619 0.17
620 0.13
621 0.1
622 0.07
623 0.06
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.05
628 0.07
629 0.07
630 0.07
631 0.09
632 0.1
633 0.1
634 0.09
635 0.1
636 0.11
637 0.1
638 0.11
639 0.12
640 0.14
641 0.16
642 0.2
643 0.25
644 0.24
645 0.27
646 0.29
647 0.32
648 0.31
649 0.33
650 0.3
651 0.26
652 0.26
653 0.25
654 0.22
655 0.23
656 0.23
657 0.24
658 0.27
659 0.31
660 0.31
661 0.34
662 0.36
663 0.32
664 0.3
665 0.25
666 0.21
667 0.17
668 0.16
669 0.11
670 0.09
671 0.08
672 0.07
673 0.07
674 0.07
675 0.06
676 0.06
677 0.06
678 0.05
679 0.06
680 0.05
681 0.08
682 0.09
683 0.09
684 0.11
685 0.12
686 0.14
687 0.18
688 0.21
689 0.23
690 0.25
691 0.26
692 0.28
693 0.28
694 0.29
695 0.27
696 0.27
697 0.23
698 0.21
699 0.2
700 0.18
701 0.19
702 0.17
703 0.17
704 0.16
705 0.17
706 0.18
707 0.18
708 0.17
709 0.15
710 0.16
711 0.15
712 0.11
713 0.12
714 0.11
715 0.12
716 0.12
717 0.12
718 0.11
719 0.11
720 0.13
721 0.12
722 0.12
723 0.1
724 0.13
725 0.13
726 0.13
727 0.14
728 0.13
729 0.15
730 0.21
731 0.23
732 0.23
733 0.27
734 0.28
735 0.32
736 0.35
737 0.34
738 0.28
739 0.33
740 0.38
741 0.4
742 0.4
743 0.38
744 0.4
745 0.43
746 0.43
747 0.41
748 0.34
749 0.29
750 0.29
751 0.28
752 0.24
753 0.22
754 0.24
755 0.2
756 0.2
757 0.19
758 0.23
759 0.28
760 0.31
761 0.34
762 0.36
763 0.43
764 0.51
765 0.53
766 0.56
767 0.56
768 0.54
769 0.52
770 0.47
771 0.42
772 0.36
773 0.37
774 0.32
775 0.28
776 0.26
777 0.25
778 0.29
779 0.29
780 0.27
781 0.3
782 0.32
783 0.38
784 0.4
785 0.39
786 0.38
787 0.4
788 0.46
789 0.45
790 0.43
791 0.34
792 0.34
793 0.35
794 0.34
795 0.33
796 0.28
797 0.23
798 0.28
799 0.37
800 0.45
801 0.54
802 0.59
803 0.66
804 0.72
805 0.75
806 0.73
807 0.75
808 0.68
809 0.64
810 0.63
811 0.6
812 0.54
813 0.5
814 0.44
815 0.35
816 0.31
817 0.26
818 0.18
819 0.12
820 0.1
821 0.08
822 0.07
823 0.06
824 0.06
825 0.05
826 0.05
827 0.06
828 0.06
829 0.08
830 0.13
831 0.16
832 0.19
833 0.26
834 0.3
835 0.34
836 0.37
837 0.43
838 0.47
839 0.48
840 0.5
841 0.44
842 0.42
843 0.42
844 0.41
845 0.36
846 0.29
847 0.26
848 0.25
849 0.25
850 0.28
851 0.23
852 0.24
853 0.22
854 0.21
855 0.21
856 0.26
857 0.25
858 0.23
859 0.24
860 0.24
861 0.25
862 0.25
863 0.28
864 0.22
865 0.29
866 0.33
867 0.37
868 0.36
869 0.37
870 0.39
871 0.33
872 0.34
873 0.32
874 0.3
875 0.33
876 0.34
877 0.32
878 0.31
879 0.34
880 0.37
881 0.34
882 0.35
883 0.32
884 0.34
885 0.35
886 0.34
887 0.33
888 0.29
889 0.32
890 0.3
891 0.25
892 0.24
893 0.29
894 0.32
895 0.37
896 0.44
897 0.47
898 0.49
899 0.49
900 0.5
901 0.52
902 0.57
903 0.58
904 0.58
905 0.51
906 0.49
907 0.51
908 0.48
909 0.39
910 0.36
911 0.3
912 0.23
913 0.24
914 0.24
915 0.22
916 0.22
917 0.22
918 0.18
919 0.19
920 0.17
921 0.15
922 0.15
923 0.13
924 0.13
925 0.12
926 0.13
927 0.1