Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1XNK6

Protein Details
Accession A0A4V1XNK6    Localization Confidence Low Confidence Score 6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
252-272ALELYRSPRRHHPPRACVTDLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11, extr 5, cysk 4, nucl 3, cyto 3, cyto_nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010499  AraC_E-bd  
IPR029442  GyrI-like  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR018060  HTH_AraC  
IPR018062  HTH_AraC-typ_CS  
IPR011256  Reg_factor_effector_dom_sf  
IPR020449  Tscrpt_reg_HTH_AraC-type  
Gene Ontology GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06445  GyrI-like  
PF12833  HTH_18  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00041  HTH_ARAC_FAMILY_1  
PS01124  HTH_ARAC_FAMILY_2  
Amino Acid Sequences MKPRTEHDYHRRIARVIQAILADPAAPHTVQSLAAVAHLSPFHFHRIYRALTGEGVFETVQRMRLAQAARRLSGAEDSVTDVALNVGYGSPQAFARAFREFTGVSPRAFQTRQQALNVRSADTEDLPPIELIEQPPLHALCLRHDGPVATIRQTFITLRQLLGIDMESADAPDRIGICHGDPETPGSFEYFAGVILDAPRAITGPLLPMRIEGGLYACHRLIGPYALIAPTMQALYGGCLPSYGFEPDDRPALELYRSPRRHHPPRACVTDLMIPIRKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.54
3 0.45
4 0.42
5 0.35
6 0.32
7 0.31
8 0.27
9 0.18
10 0.11
11 0.12
12 0.11
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.1
17 0.1
18 0.11
19 0.1
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.08
24 0.09
25 0.09
26 0.09
27 0.1
28 0.12
29 0.17
30 0.18
31 0.18
32 0.22
33 0.27
34 0.29
35 0.3
36 0.31
37 0.26
38 0.26
39 0.26
40 0.21
41 0.16
42 0.15
43 0.11
44 0.1
45 0.11
46 0.11
47 0.13
48 0.12
49 0.13
50 0.12
51 0.17
52 0.2
53 0.21
54 0.29
55 0.29
56 0.3
57 0.3
58 0.3
59 0.26
60 0.25
61 0.21
62 0.13
63 0.11
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.1
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.05
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.04
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.11
83 0.14
84 0.15
85 0.14
86 0.17
87 0.16
88 0.16
89 0.24
90 0.23
91 0.2
92 0.21
93 0.21
94 0.23
95 0.23
96 0.25
97 0.25
98 0.3
99 0.32
100 0.33
101 0.38
102 0.36
103 0.42
104 0.4
105 0.32
106 0.25
107 0.23
108 0.21
109 0.17
110 0.16
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.1
128 0.15
129 0.16
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.14
134 0.18
135 0.17
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.13
140 0.14
141 0.13
142 0.11
143 0.16
144 0.15
145 0.15
146 0.15
147 0.15
148 0.14
149 0.14
150 0.12
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.09
192 0.11
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.13
197 0.13
198 0.13
199 0.08
200 0.08
201 0.1
202 0.11
203 0.13
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.13
208 0.13
209 0.11
210 0.11
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.08
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.13
230 0.13
231 0.11
232 0.12
233 0.15
234 0.17
235 0.21
236 0.21
237 0.19
238 0.19
239 0.19
240 0.2
241 0.22
242 0.27
243 0.33
244 0.37
245 0.4
246 0.5
247 0.58
248 0.67
249 0.74
250 0.78
251 0.77
252 0.83
253 0.87
254 0.8
255 0.71
256 0.64
257 0.6
258 0.53
259 0.49