Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4XTV3

Protein Details
Accession A0A4Q4XTV3    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
403-430SPELKPQASMPPRKRKPVDIFMKPKPKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-145RRKLPRPPRDGRGGGGPRKPGMGRRGG
413-433PPRKRKPVDIFMKPKPKVQKR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPLTPDVSDIGNMAYPTVRTILLQINSAKQLRHLEINSPQLEGDDAECWIRLINRDFPVLAKRHNFEPKNPTSWHKIYARYERLEAEQKREAEEKLKAAFAGIKKEKQENVSTIVDFDRRKLPRPPRDGRGGGGPRKPGMGRRGGGPDEGDLRFTGGTRTKVTSAQSILKKARREAREISARNRLATPTGLLPVNRSQIVSAPKGMVEAARIKAQPATRIHAPGVPSKDEQKHSRELEEREARLRKMKNMGANKGATVVSDSDLEDEDGYDDEDGYDDGDMSGPGGLDADDLEDIFDEKPKPSPTRATKPTTASTSSGGFSASTSRSHITKRSGLLSNAPGSSKNNLIVSTRPAPKPTTSTPASASASKPVSASTNSKSFSPPLENSSPPKYSPPAGTASSMSPELKPQASMPPRKRKPVDIFMKPKPKVQKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.12
4 0.13
5 0.12
6 0.1
7 0.14
8 0.21
9 0.21
10 0.25
11 0.26
12 0.29
13 0.35
14 0.37
15 0.34
16 0.31
17 0.37
18 0.35
19 0.41
20 0.38
21 0.38
22 0.43
23 0.51
24 0.47
25 0.41
26 0.38
27 0.3
28 0.29
29 0.23
30 0.18
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.12
38 0.16
39 0.2
40 0.26
41 0.28
42 0.3
43 0.3
44 0.32
45 0.37
46 0.36
47 0.38
48 0.37
49 0.37
50 0.43
51 0.53
52 0.54
53 0.54
54 0.6
55 0.6
56 0.6
57 0.6
58 0.57
59 0.56
60 0.56
61 0.55
62 0.5
63 0.52
64 0.54
65 0.61
66 0.64
67 0.58
68 0.58
69 0.52
70 0.53
71 0.54
72 0.49
73 0.45
74 0.44
75 0.41
76 0.42
77 0.43
78 0.39
79 0.35
80 0.36
81 0.33
82 0.29
83 0.29
84 0.25
85 0.23
86 0.26
87 0.23
88 0.3
89 0.3
90 0.33
91 0.36
92 0.41
93 0.43
94 0.43
95 0.45
96 0.38
97 0.39
98 0.37
99 0.34
100 0.3
101 0.28
102 0.29
103 0.24
104 0.24
105 0.27
106 0.26
107 0.31
108 0.39
109 0.48
110 0.53
111 0.62
112 0.67
113 0.65
114 0.72
115 0.69
116 0.61
117 0.61
118 0.59
119 0.55
120 0.52
121 0.48
122 0.4
123 0.41
124 0.4
125 0.36
126 0.33
127 0.34
128 0.31
129 0.32
130 0.37
131 0.35
132 0.35
133 0.29
134 0.25
135 0.22
136 0.21
137 0.18
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.11
142 0.13
143 0.13
144 0.16
145 0.17
146 0.19
147 0.2
148 0.23
149 0.24
150 0.24
151 0.23
152 0.28
153 0.29
154 0.33
155 0.38
156 0.4
157 0.41
158 0.43
159 0.48
160 0.44
161 0.46
162 0.45
163 0.47
164 0.52
165 0.53
166 0.52
167 0.53
168 0.51
169 0.46
170 0.43
171 0.35
172 0.26
173 0.23
174 0.2
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.14
180 0.15
181 0.17
182 0.16
183 0.15
184 0.13
185 0.16
186 0.2
187 0.18
188 0.16
189 0.14
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.1
194 0.08
195 0.1
196 0.1
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.16
201 0.17
202 0.21
203 0.2
204 0.23
205 0.22
206 0.24
207 0.24
208 0.23
209 0.24
210 0.22
211 0.23
212 0.21
213 0.2
214 0.24
215 0.28
216 0.31
217 0.33
218 0.33
219 0.38
220 0.36
221 0.4
222 0.4
223 0.38
224 0.43
225 0.45
226 0.42
227 0.41
228 0.43
229 0.4
230 0.41
231 0.41
232 0.36
233 0.37
234 0.39
235 0.4
236 0.44
237 0.47
238 0.45
239 0.43
240 0.39
241 0.34
242 0.3
243 0.22
244 0.16
245 0.13
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.03
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.08
284 0.09
285 0.1
286 0.15
287 0.2
288 0.23
289 0.26
290 0.35
291 0.41
292 0.51
293 0.57
294 0.59
295 0.6
296 0.62
297 0.63
298 0.57
299 0.51
300 0.43
301 0.37
302 0.32
303 0.27
304 0.22
305 0.18
306 0.14
307 0.11
308 0.13
309 0.13
310 0.12
311 0.14
312 0.16
313 0.18
314 0.21
315 0.26
316 0.28
317 0.32
318 0.34
319 0.38
320 0.4
321 0.39
322 0.41
323 0.4
324 0.38
325 0.34
326 0.31
327 0.27
328 0.25
329 0.27
330 0.24
331 0.22
332 0.2
333 0.2
334 0.21
335 0.22
336 0.26
337 0.31
338 0.36
339 0.35
340 0.37
341 0.39
342 0.4
343 0.44
344 0.42
345 0.42
346 0.38
347 0.38
348 0.39
349 0.41
350 0.41
351 0.37
352 0.33
353 0.32
354 0.32
355 0.29
356 0.27
357 0.22
358 0.22
359 0.24
360 0.28
361 0.26
362 0.31
363 0.32
364 0.33
365 0.34
366 0.33
367 0.34
368 0.36
369 0.34
370 0.34
371 0.39
372 0.42
373 0.45
374 0.49
375 0.47
376 0.41
377 0.44
378 0.4
379 0.39
380 0.39
381 0.37
382 0.35
383 0.35
384 0.35
385 0.32
386 0.3
387 0.29
388 0.28
389 0.25
390 0.21
391 0.23
392 0.25
393 0.24
394 0.23
395 0.22
396 0.3
397 0.38
398 0.48
399 0.55
400 0.62
401 0.68
402 0.78
403 0.81
404 0.81
405 0.81
406 0.81
407 0.81
408 0.81
409 0.82
410 0.82
411 0.88
412 0.79
413 0.77