FuNGI

A0A4V1XQ35

Protein Details

Accession

A0A4V1XQ35

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
214-233	QYIRNCYDYRRNKTPRNKTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
454-455	KR

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto 5, mito 3, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005739 C:mitochondrion GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09274 RNase_HI_RT_Ty3

Amino Acid Sequences

METDASPERAYPIQDRKLLAMVQTLKHYCPKLWGQKFFVVTDHQALLYFASKRVLSTRQIRWADFLSNFDITFQYRPGKENVAADALSRKTVDLPTVKARKKEEKTQALIPPEQLNFPIAATNETPTGVRIEDIPQGADLVDLIRRKNEVQNLGKRDNKLMVPEKTTNGRIFLRTALIREAHAPKIFAHPGQNKVIKMLIREYTWPRLKQDVRQYIRNCYDYRRNKTPRNKTPGLLHPLPIPNDIWDHVAVDGKNMPKDRYGYNYVWAFIDKLSRIMATLPGKKTDTAETLASRYYRYLYRFLKIPAIWISDNAGQFISQFLAKLNELTGTKHRHGNALHPQTQKAVEFTNQKLDQRLRFYIDKYQNDWNVHIPALDFAHNSSWHSSINMAPLKVMLGKDIRNPLSLDLDTAKAETEPAQRALAIVKQIKDVQTLTRKAALETQKRQEAQANKKRRPADFRVGDKVFLRKKGFAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.47
3	0.46
4	0.47
5	0.45
6	0.38
7	0.36
8	0.34
9	0.32
10	0.38
11	0.37
12	0.36
13	0.41
14	0.42
15	0.35
16	0.37
17	0.45
18	0.48
19	0.55
20	0.6
21	0.59
22	0.64
23	0.65
24	0.59
25	0.52
26	0.46
27	0.39
28	0.36
29	0.31
30	0.25
31	0.22
32	0.21
33	0.2
34	0.2
35	0.18
36	0.15
37	0.17
38	0.17
39	0.18
40	0.23
41	0.26
42	0.29
43	0.37
44	0.43
45	0.5
46	0.54
47	0.53
48	0.52
49	0.5
50	0.48
51	0.4
52	0.36
53	0.3
54	0.27
55	0.26
56	0.23
57	0.22
58	0.18
59	0.19
60	0.19
61	0.22
62	0.22
63	0.25
64	0.27
65	0.31
66	0.32
67	0.33
68	0.32
69	0.29
70	0.27
71	0.25
72	0.27
73	0.23
74	0.21
75	0.19
76	0.16
77	0.16
78	0.17
79	0.22
80	0.2
81	0.24
82	0.32
83	0.42
84	0.46
85	0.49
86	0.55
87	0.6
88	0.63
89	0.69
90	0.69
91	0.69
92	0.7
93	0.72
94	0.71
95	0.65
96	0.61
97	0.53
98	0.47
99	0.38
100	0.34
101	0.27
102	0.22
103	0.17
104	0.15
105	0.15
106	0.1
107	0.12
108	0.12
109	0.13
110	0.12
111	0.12
112	0.12
113	0.11
114	0.12
115	0.09
116	0.09
117	0.09
118	0.11
119	0.14
120	0.14
121	0.14
122	0.13
123	0.13
124	0.12
125	0.11
126	0.08
127	0.05
128	0.08
129	0.1
130	0.1
131	0.11
132	0.13
133	0.15
134	0.2
135	0.26
136	0.31
137	0.38
138	0.47
139	0.53
140	0.58
141	0.6
142	0.56
143	0.53
144	0.48
145	0.4
146	0.39
147	0.39
148	0.36
149	0.37
150	0.39
151	0.39
152	0.39
153	0.41
154	0.35
155	0.31
156	0.29
157	0.25
158	0.24
159	0.22
160	0.22
161	0.19
162	0.19
163	0.18
164	0.17
165	0.16
166	0.2
167	0.22
168	0.21
169	0.21
170	0.21
171	0.19
172	0.24
173	0.25
174	0.22
175	0.26
176	0.27
177	0.31
178	0.36
179	0.39
180	0.33
181	0.33
182	0.35
183	0.28
184	0.25
185	0.24
186	0.2
187	0.18
188	0.22
189	0.24
190	0.3
191	0.34
192	0.34
193	0.33
194	0.39
195	0.4
196	0.43
197	0.5
198	0.51
199	0.5
200	0.56
201	0.56
202	0.55
203	0.58
204	0.54
205	0.45
206	0.4
207	0.46
208	0.48
209	0.53
210	0.56
211	0.59
212	0.65
213	0.75
214	0.8
215	0.8
216	0.8
217	0.75
218	0.67
219	0.66
220	0.64
221	0.62
222	0.51
223	0.42
224	0.37
225	0.37
226	0.35
227	0.3
228	0.22
229	0.15
230	0.15
231	0.15
232	0.12
233	0.1
234	0.09
235	0.09
236	0.11
237	0.1
238	0.1
239	0.12
240	0.12
241	0.15
242	0.16
243	0.16
244	0.16
245	0.18
246	0.19
247	0.21
248	0.26
249	0.24
250	0.28
251	0.28
252	0.27
253	0.25
254	0.24
255	0.19
256	0.13
257	0.15
258	0.1
259	0.1
260	0.1
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.14
265	0.17
266	0.23
267	0.23
268	0.25
269	0.27
270	0.27
271	0.28
272	0.25
273	0.22
274	0.19
275	0.2
276	0.18
277	0.18
278	0.19
279	0.18
280	0.16
281	0.14
282	0.14
283	0.16
284	0.17
285	0.24
286	0.25
287	0.27
288	0.3
289	0.31
290	0.35
291	0.31
292	0.32
293	0.27
294	0.28
295	0.26
296	0.23
297	0.25
298	0.22
299	0.22
300	0.19
301	0.16
302	0.12
303	0.12
304	0.12
305	0.1
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.09
313	0.11
314	0.12
315	0.15
316	0.2
317	0.24
318	0.27
319	0.31
320	0.32
321	0.34
322	0.34
323	0.4
324	0.44
325	0.46
326	0.52
327	0.49
328	0.49
329	0.46
330	0.47
331	0.4
332	0.31
333	0.24
334	0.22
335	0.25
336	0.26
337	0.33
338	0.34
339	0.35
340	0.39
341	0.42
342	0.43
343	0.43
344	0.44
345	0.4
346	0.4
347	0.41
348	0.45
349	0.49
350	0.48
351	0.46
352	0.51
353	0.52
354	0.51
355	0.51
356	0.44
357	0.37
358	0.32
359	0.29
360	0.21
361	0.17
362	0.17
363	0.16
364	0.13
365	0.12
366	0.15
367	0.15
368	0.17
369	0.17
370	0.17
371	0.16
372	0.16
373	0.17
374	0.15
375	0.22
376	0.24
377	0.22
378	0.2
379	0.2
380	0.21
381	0.22
382	0.2
383	0.16
384	0.16
385	0.18
386	0.24
387	0.32
388	0.32
389	0.32
390	0.33
391	0.31
392	0.32
393	0.3
394	0.27
395	0.21
396	0.21
397	0.19
398	0.19
399	0.17
400	0.12
401	0.13
402	0.15
403	0.19
404	0.21
405	0.22
406	0.23
407	0.22
408	0.23
409	0.24
410	0.23
411	0.25
412	0.25
413	0.25
414	0.28
415	0.32
416	0.33
417	0.34
418	0.32
419	0.33
420	0.38
421	0.4
422	0.4
423	0.43
424	0.42
425	0.4
426	0.47
427	0.48
428	0.49
429	0.54
430	0.59
431	0.61
432	0.61
433	0.62
434	0.62
435	0.62
436	0.63
437	0.65
438	0.67
439	0.66
440	0.73
441	0.78
442	0.78
443	0.77
444	0.75
445	0.76
446	0.75
447	0.75
448	0.77
449	0.72
450	0.67
451	0.62
452	0.62
453	0.58
454	0.56
455	0.54

A0A4V1XQ35

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer