Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4YRF4

Protein Details
Accession A0A4Q4YRF4    Localization Confidence High Confidence Score 22.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
365-392QALRDKDAAKRKRERRRENEKKQKEIVRBasic
482-501RKAEKDTKYRAKKARKEYDDBasic
598-626AKNQPAVAKEPKKKRTKEKKKVVATEEWSHydrophilic
736-770ALNARPIKKVREAKARKKFKAAQRLEKLKKKSDLLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-12AKGRL
14-14K
17-17K
19-20AK
371-388DAAKRKRERRRENEKKQK
483-496KAEKDTKYRAKKAR
602-618PAVAKEPKKKRTKEKKK
717-766KPQKPISKAAAAAIKEKMRALNARPIKKVREAKARKKFKAAQRLEKLKKK
791-847KAARGANKARPQPKLVVARGLNRGIKGRPKGVKGRYKIVDARMKKELRAQKRIAKRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 3, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MALQKKHAKGRLDKWYKLAKEKGYRARAAFKLIQLNRKYGFLEKSKVLLDLCAAPGSWCQVAAETMPNGSLIVGVDLAPIKPIPRVITFQSDITTEKCRATIRSHLKTWKADTVLHDGAPNVGTAWVQDSFNQAELALQSLKLATEFLVEGGTFVTKVFRSTQYNQLLWVFNQLFTKVEATKPPSSRNVSAEIFVVARGFKAPKHLDPKFLDPKAVFADTKDAAPNNEAKVFNPEVKKRKRGGYEEGDYTQFKELPASEFIETTDPIAVLSTYNKLSFEQPRNGDVALAALDKMPETTDEIRNCCADLKVLGRKDFKMLLKWRLKAREAFGLPTKNTKKPESEAPEEVAEVESMDEELKIQEELQALRDKDAAKRKRERRRENEKKQKEIVRMQLHMVAPMDIGMEQDGPIGQDAMFSLKPVDKTGAVNKIAKGKMAMLSEAEKNRDSGIGSSPDSDSDISDDEEDALERELDGLYENYKERKAEKDTKYRAKKARKEYDDGEWEGVSADEQESSDGGDLEEDSSSESDEDDSELSKPLITDLDNETSEAGSLSKRAKNFFSQDIFQDIPGILDEPEPEVDGVDAEMVDAAEEEKPAAKNQPAVAKEPKKKRTKEKKKVVATEEWSSDSEVDDKGGFEIAKHSQGQMEEWEDEDQRRPDGKLDIDIITAEAMTLAHQLATGQKSSYDVIDEGFNKYAFKDRDGLPEWFLDDESKHDKPQKPISKAAAAAIKEKMRALNARPIKKVREAKARKKFKAAQRLEKLKKKSDLLASDENMTEKEKADSIQRLMAKAARGANKARPQPKLVVARGLNRGIKGRPKGVKGRYKIVDARMKKELRAQKRIAKRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.75
3 0.73
4 0.72
5 0.71
6 0.7
7 0.71
8 0.77
9 0.79
10 0.77
11 0.78
12 0.73
13 0.74
14 0.67
15 0.65
16 0.59
17 0.55
18 0.57
19 0.56
20 0.61
21 0.55
22 0.58
23 0.52
24 0.5
25 0.46
26 0.42
27 0.44
28 0.41
29 0.44
30 0.4
31 0.42
32 0.41
33 0.41
34 0.35
35 0.28
36 0.24
37 0.22
38 0.21
39 0.18
40 0.17
41 0.15
42 0.16
43 0.18
44 0.16
45 0.13
46 0.11
47 0.12
48 0.13
49 0.14
50 0.17
51 0.14
52 0.14
53 0.14
54 0.14
55 0.13
56 0.11
57 0.1
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.06
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.11
69 0.14
70 0.16
71 0.19
72 0.23
73 0.26
74 0.33
75 0.35
76 0.34
77 0.33
78 0.31
79 0.29
80 0.28
81 0.29
82 0.23
83 0.22
84 0.24
85 0.25
86 0.27
87 0.3
88 0.38
89 0.44
90 0.49
91 0.55
92 0.6
93 0.65
94 0.67
95 0.67
96 0.64
97 0.56
98 0.52
99 0.48
100 0.49
101 0.44
102 0.39
103 0.34
104 0.27
105 0.26
106 0.22
107 0.18
108 0.1
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.15
117 0.15
118 0.17
119 0.16
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.15
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.09
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.06
141 0.06
142 0.08
143 0.08
144 0.1
145 0.14
146 0.18
147 0.25
148 0.29
149 0.39
150 0.43
151 0.43
152 0.44
153 0.44
154 0.41
155 0.34
156 0.38
157 0.29
158 0.24
159 0.25
160 0.23
161 0.21
162 0.2
163 0.23
164 0.16
165 0.18
166 0.22
167 0.27
168 0.34
169 0.37
170 0.4
171 0.45
172 0.49
173 0.51
174 0.47
175 0.47
176 0.41
177 0.38
178 0.34
179 0.27
180 0.21
181 0.17
182 0.15
183 0.09
184 0.08
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.18
189 0.22
190 0.29
191 0.39
192 0.4
193 0.46
194 0.49
195 0.58
196 0.59
197 0.55
198 0.52
199 0.42
200 0.44
201 0.4
202 0.38
203 0.29
204 0.2
205 0.25
206 0.21
207 0.22
208 0.22
209 0.18
210 0.17
211 0.19
212 0.21
213 0.18
214 0.23
215 0.22
216 0.21
217 0.26
218 0.28
219 0.31
220 0.35
221 0.4
222 0.45
223 0.53
224 0.61
225 0.59
226 0.65
227 0.67
228 0.67
229 0.67
230 0.66
231 0.63
232 0.59
233 0.56
234 0.51
235 0.43
236 0.39
237 0.32
238 0.23
239 0.18
240 0.16
241 0.14
242 0.14
243 0.16
244 0.17
245 0.16
246 0.15
247 0.16
248 0.16
249 0.15
250 0.13
251 0.11
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.07
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.16
264 0.24
265 0.29
266 0.34
267 0.35
268 0.36
269 0.37
270 0.36
271 0.31
272 0.22
273 0.17
274 0.11
275 0.09
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.09
284 0.13
285 0.18
286 0.21
287 0.23
288 0.25
289 0.25
290 0.24
291 0.22
292 0.18
293 0.13
294 0.12
295 0.16
296 0.21
297 0.25
298 0.29
299 0.31
300 0.31
301 0.33
302 0.37
303 0.33
304 0.35
305 0.37
306 0.42
307 0.46
308 0.5
309 0.53
310 0.53
311 0.55
312 0.5
313 0.47
314 0.46
315 0.4
316 0.39
317 0.38
318 0.36
319 0.34
320 0.39
321 0.41
322 0.38
323 0.41
324 0.4
325 0.39
326 0.38
327 0.46
328 0.44
329 0.45
330 0.42
331 0.4
332 0.37
333 0.33
334 0.3
335 0.21
336 0.14
337 0.09
338 0.07
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.06
349 0.08
350 0.08
351 0.11
352 0.16
353 0.15
354 0.16
355 0.19
356 0.17
357 0.22
358 0.32
359 0.36
360 0.4
361 0.5
362 0.59
363 0.67
364 0.77
365 0.82
366 0.83
367 0.87
368 0.9
369 0.92
370 0.93
371 0.91
372 0.87
373 0.83
374 0.78
375 0.73
376 0.68
377 0.66
378 0.59
379 0.52
380 0.46
381 0.44
382 0.38
383 0.32
384 0.26
385 0.17
386 0.12
387 0.11
388 0.1
389 0.05
390 0.05
391 0.04
392 0.04
393 0.03
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.03
400 0.04
401 0.04
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.08
407 0.09
408 0.1
409 0.11
410 0.09
411 0.11
412 0.15
413 0.2
414 0.21
415 0.23
416 0.23
417 0.29
418 0.28
419 0.27
420 0.23
421 0.18
422 0.2
423 0.18
424 0.17
425 0.11
426 0.13
427 0.16
428 0.17
429 0.18
430 0.15
431 0.14
432 0.14
433 0.14
434 0.13
435 0.1
436 0.12
437 0.13
438 0.13
439 0.14
440 0.13
441 0.13
442 0.13
443 0.12
444 0.09
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.05
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.07
464 0.08
465 0.1
466 0.11
467 0.12
468 0.13
469 0.19
470 0.26
471 0.35
472 0.42
473 0.51
474 0.58
475 0.68
476 0.74
477 0.77
478 0.78
479 0.79
480 0.8
481 0.8
482 0.82
483 0.76
484 0.73
485 0.67
486 0.65
487 0.6
488 0.53
489 0.43
490 0.32
491 0.27
492 0.22
493 0.19
494 0.11
495 0.07
496 0.05
497 0.04
498 0.04
499 0.05
500 0.04
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.05
508 0.05
509 0.04
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.07
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.08
527 0.08
528 0.1
529 0.12
530 0.15
531 0.15
532 0.16
533 0.15
534 0.14
535 0.13
536 0.11
537 0.08
538 0.05
539 0.08
540 0.13
541 0.15
542 0.17
543 0.2
544 0.22
545 0.28
546 0.32
547 0.35
548 0.34
549 0.33
550 0.32
551 0.34
552 0.32
553 0.26
554 0.23
555 0.17
556 0.13
557 0.12
558 0.11
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.08
565 0.07
566 0.07
567 0.06
568 0.06
569 0.05
570 0.04
571 0.04
572 0.03
573 0.03
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.04
578 0.04
579 0.04
580 0.05
581 0.07
582 0.08
583 0.09
584 0.13
585 0.14
586 0.17
587 0.2
588 0.28
589 0.27
590 0.32
591 0.4
592 0.46
593 0.54
594 0.6
595 0.67
596 0.69
597 0.76
598 0.82
599 0.84
600 0.86
601 0.88
602 0.89
603 0.9
604 0.9
605 0.91
606 0.85
607 0.81
608 0.75
609 0.69
610 0.6
611 0.52
612 0.42
613 0.35
614 0.29
615 0.21
616 0.17
617 0.13
618 0.12
619 0.09
620 0.09
621 0.08
622 0.1
623 0.09
624 0.08
625 0.12
626 0.13
627 0.16
628 0.17
629 0.17
630 0.17
631 0.18
632 0.19
633 0.18
634 0.19
635 0.16
636 0.17
637 0.19
638 0.18
639 0.19
640 0.23
641 0.21
642 0.22
643 0.23
644 0.23
645 0.24
646 0.27
647 0.27
648 0.26
649 0.27
650 0.24
651 0.22
652 0.22
653 0.19
654 0.14
655 0.12
656 0.08
657 0.05
658 0.04
659 0.04
660 0.05
661 0.05
662 0.05
663 0.05
664 0.06
665 0.1
666 0.12
667 0.12
668 0.12
669 0.12
670 0.14
671 0.15
672 0.15
673 0.13
674 0.11
675 0.11
676 0.16
677 0.16
678 0.17
679 0.19
680 0.18
681 0.16
682 0.17
683 0.25
684 0.22
685 0.23
686 0.26
687 0.26
688 0.34
689 0.39
690 0.4
691 0.34
692 0.33
693 0.32
694 0.27
695 0.25
696 0.18
697 0.14
698 0.17
699 0.22
700 0.23
701 0.27
702 0.36
703 0.41
704 0.48
705 0.58
706 0.63
707 0.62
708 0.67
709 0.68
710 0.65
711 0.6
712 0.56
713 0.51
714 0.42
715 0.4
716 0.38
717 0.34
718 0.3
719 0.3
720 0.28
721 0.27
722 0.31
723 0.32
724 0.37
725 0.44
726 0.49
727 0.55
728 0.59
729 0.6
730 0.64
731 0.69
732 0.67
733 0.7
734 0.73
735 0.77
736 0.82
737 0.88
738 0.83
739 0.84
740 0.84
741 0.82
742 0.83
743 0.82
744 0.82
745 0.82
746 0.88
747 0.88
748 0.88
749 0.85
750 0.83
751 0.81
752 0.74
753 0.7
754 0.68
755 0.64
756 0.62
757 0.62
758 0.55
759 0.51
760 0.47
761 0.41
762 0.33
763 0.3
764 0.24
765 0.17
766 0.18
767 0.16
768 0.17
769 0.23
770 0.28
771 0.28
772 0.34
773 0.35
774 0.34
775 0.35
776 0.37
777 0.32
778 0.31
779 0.35
780 0.35
781 0.37
782 0.41
783 0.47
784 0.53
785 0.6
786 0.63
787 0.61
788 0.6
789 0.62
790 0.66
791 0.66
792 0.6
793 0.6
794 0.57
795 0.59
796 0.6
797 0.61
798 0.55
799 0.48
800 0.49
801 0.46
802 0.51
803 0.51
804 0.54
805 0.55
806 0.6
807 0.67
808 0.73
809 0.76
810 0.73
811 0.77
812 0.72
813 0.72
814 0.71
815 0.7
816 0.7
817 0.66
818 0.65
819 0.65
820 0.63
821 0.58
822 0.61
823 0.62
824 0.62
825 0.66
826 0.69
827 0.69