Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4ZUM0

Protein Details
Accession A0A4Q4ZUM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
450-474RNSEEGRLKKRLKRQEKNDEKKDGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
456-467RLKKRLKRQEKN
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.833, cyto_mito 3.666, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MATATQHAAQQRPFSPLQASPSSNNPTGMVTQPAPKKLKISPSPPSQPASPYVHPGYAGSPSATTPGSAAPNLPSPAPQNYPNPQSAPSQINTPYQQNGRPPNSLPMPSPATPAPSLATPQPQPSTPAPYVHTTFVPTNVGHSNMGPPSIAPSSFSAANDAQKQASKAGPSKGSDYDMNDMLAGTGINLDEEAEKLNDFEIREGFPYHPPGGRDNFYGAGPANQPSQHAEAPTQEELAAEVADEAWNEAARRLTIFRTNELLNHFLEPGIVHQRLFQRASKHGLSLNTELKPDGKSHYMGRVLSPADFPKPEVKVSFRNAPDGTLVQTHGSFIPHEAYLADQIALLSIATKEHMRSLIGEANRVATTRQRTAHGAVPLEWADAAAPQQPNPNGIPAGSPRTGAESAVSPRTNPLKRPADEISNGLPTPVSEVSSPNFLVEALEDVGKEVRNSEEGRLKKRLKRQEKNDEKKDGEDGGSRAGSVAPGTPGSMAPEADAKPMTKKESKKAAKLAEISSTTVNQTLSMFAGGKKKKKYSWMTGGGGPGSGANTPRPQGLSQPGTPGGTVSASSRAPRGPLTRDSAHRLGAFREDSEKGKNIQLRDWVAVLEDRDIDPVVLQTAYDRLDKSDFGDKVARVDVAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.37
3 0.35
4 0.39
5 0.39
6 0.4
7 0.36
8 0.43
9 0.47
10 0.45
11 0.42
12 0.37
13 0.32
14 0.31
15 0.31
16 0.28
17 0.24
18 0.3
19 0.34
20 0.42
21 0.43
22 0.42
23 0.45
24 0.46
25 0.54
26 0.55
27 0.58
28 0.59
29 0.64
30 0.71
31 0.7
32 0.68
33 0.6
34 0.54
35 0.53
36 0.51
37 0.44
38 0.42
39 0.41
40 0.38
41 0.36
42 0.34
43 0.29
44 0.25
45 0.24
46 0.18
47 0.16
48 0.15
49 0.17
50 0.16
51 0.14
52 0.11
53 0.14
54 0.16
55 0.15
56 0.16
57 0.16
58 0.21
59 0.22
60 0.22
61 0.2
62 0.21
63 0.26
64 0.29
65 0.31
66 0.34
67 0.39
68 0.44
69 0.46
70 0.44
71 0.41
72 0.41
73 0.41
74 0.39
75 0.33
76 0.33
77 0.32
78 0.36
79 0.37
80 0.37
81 0.38
82 0.37
83 0.4
84 0.43
85 0.5
86 0.48
87 0.49
88 0.48
89 0.5
90 0.51
91 0.49
92 0.43
93 0.39
94 0.4
95 0.37
96 0.38
97 0.32
98 0.3
99 0.28
100 0.28
101 0.23
102 0.18
103 0.19
104 0.19
105 0.23
106 0.21
107 0.26
108 0.27
109 0.26
110 0.3
111 0.31
112 0.36
113 0.32
114 0.34
115 0.32
116 0.34
117 0.36
118 0.33
119 0.31
120 0.26
121 0.25
122 0.24
123 0.24
124 0.19
125 0.2
126 0.2
127 0.21
128 0.18
129 0.18
130 0.2
131 0.17
132 0.18
133 0.14
134 0.13
135 0.14
136 0.15
137 0.15
138 0.13
139 0.14
140 0.16
141 0.18
142 0.18
143 0.18
144 0.18
145 0.22
146 0.23
147 0.23
148 0.22
149 0.22
150 0.23
151 0.21
152 0.22
153 0.23
154 0.24
155 0.28
156 0.31
157 0.31
158 0.34
159 0.33
160 0.34
161 0.32
162 0.3
163 0.28
164 0.24
165 0.22
166 0.18
167 0.16
168 0.13
169 0.11
170 0.08
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.14
191 0.15
192 0.16
193 0.2
194 0.2
195 0.21
196 0.22
197 0.25
198 0.27
199 0.27
200 0.26
201 0.24
202 0.23
203 0.2
204 0.2
205 0.16
206 0.14
207 0.13
208 0.13
209 0.13
210 0.12
211 0.13
212 0.15
213 0.18
214 0.17
215 0.17
216 0.16
217 0.17
218 0.21
219 0.2
220 0.18
221 0.14
222 0.13
223 0.12
224 0.12
225 0.09
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.09
240 0.11
241 0.17
242 0.18
243 0.19
244 0.21
245 0.22
246 0.23
247 0.24
248 0.24
249 0.18
250 0.17
251 0.15
252 0.12
253 0.12
254 0.1
255 0.1
256 0.14
257 0.13
258 0.12
259 0.16
260 0.19
261 0.23
262 0.25
263 0.26
264 0.24
265 0.27
266 0.33
267 0.3
268 0.28
269 0.27
270 0.27
271 0.27
272 0.28
273 0.29
274 0.24
275 0.24
276 0.23
277 0.21
278 0.2
279 0.17
280 0.15
281 0.13
282 0.14
283 0.15
284 0.2
285 0.21
286 0.21
287 0.2
288 0.21
289 0.19
290 0.18
291 0.18
292 0.14
293 0.13
294 0.13
295 0.14
296 0.16
297 0.16
298 0.17
299 0.17
300 0.19
301 0.23
302 0.27
303 0.32
304 0.28
305 0.32
306 0.3
307 0.29
308 0.27
309 0.22
310 0.19
311 0.13
312 0.13
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.04
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.11
344 0.15
345 0.15
346 0.16
347 0.15
348 0.16
349 0.16
350 0.15
351 0.13
352 0.13
353 0.17
354 0.2
355 0.22
356 0.22
357 0.24
358 0.27
359 0.31
360 0.3
361 0.26
362 0.22
363 0.23
364 0.21
365 0.18
366 0.15
367 0.1
368 0.07
369 0.07
370 0.06
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.13
375 0.14
376 0.16
377 0.16
378 0.17
379 0.13
380 0.13
381 0.14
382 0.13
383 0.18
384 0.16
385 0.16
386 0.14
387 0.19
388 0.19
389 0.17
390 0.15
391 0.13
392 0.15
393 0.2
394 0.2
395 0.16
396 0.19
397 0.28
398 0.29
399 0.29
400 0.36
401 0.4
402 0.41
403 0.46
404 0.45
405 0.42
406 0.41
407 0.42
408 0.35
409 0.29
410 0.28
411 0.22
412 0.19
413 0.14
414 0.16
415 0.13
416 0.12
417 0.09
418 0.11
419 0.12
420 0.15
421 0.15
422 0.11
423 0.11
424 0.1
425 0.09
426 0.08
427 0.09
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.08
436 0.08
437 0.12
438 0.13
439 0.17
440 0.23
441 0.27
442 0.34
443 0.42
444 0.49
445 0.52
446 0.6
447 0.67
448 0.71
449 0.77
450 0.81
451 0.84
452 0.88
453 0.91
454 0.91
455 0.88
456 0.79
457 0.7
458 0.63
459 0.53
460 0.44
461 0.37
462 0.29
463 0.24
464 0.22
465 0.19
466 0.16
467 0.14
468 0.12
469 0.09
470 0.09
471 0.07
472 0.07
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.11
477 0.11
478 0.1
479 0.1
480 0.14
481 0.14
482 0.15
483 0.16
484 0.15
485 0.18
486 0.22
487 0.28
488 0.31
489 0.36
490 0.43
491 0.53
492 0.59
493 0.63
494 0.68
495 0.67
496 0.67
497 0.65
498 0.59
499 0.54
500 0.48
501 0.42
502 0.35
503 0.3
504 0.24
505 0.21
506 0.19
507 0.14
508 0.13
509 0.12
510 0.11
511 0.11
512 0.11
513 0.13
514 0.22
515 0.28
516 0.35
517 0.41
518 0.47
519 0.51
520 0.6
521 0.66
522 0.66
523 0.7
524 0.72
525 0.67
526 0.64
527 0.62
528 0.52
529 0.43
530 0.33
531 0.23
532 0.15
533 0.13
534 0.11
535 0.12
536 0.15
537 0.16
538 0.19
539 0.21
540 0.21
541 0.25
542 0.32
543 0.35
544 0.33
545 0.37
546 0.37
547 0.35
548 0.34
549 0.29
550 0.21
551 0.16
552 0.15
553 0.12
554 0.14
555 0.15
556 0.16
557 0.19
558 0.19
559 0.2
560 0.25
561 0.29
562 0.31
563 0.35
564 0.41
565 0.45
566 0.48
567 0.54
568 0.52
569 0.51
570 0.48
571 0.44
572 0.39
573 0.39
574 0.35
575 0.29
576 0.31
577 0.3
578 0.3
579 0.34
580 0.35
581 0.32
582 0.37
583 0.39
584 0.37
585 0.39
586 0.44
587 0.43
588 0.41
589 0.39
590 0.32
591 0.3
592 0.3
593 0.26
594 0.2
595 0.18
596 0.16
597 0.17
598 0.17
599 0.15
600 0.13
601 0.12
602 0.12
603 0.1
604 0.09
605 0.09
606 0.12
607 0.14
608 0.16
609 0.16
610 0.18
611 0.2
612 0.21
613 0.24
614 0.3
615 0.28
616 0.3
617 0.36
618 0.33
619 0.34
620 0.36