Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4YYT8

Protein Details
Accession A0A4Q4YYT8    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-109DRDSYREDRNRDRDRRHRSRSRSPRSDRRDRHQSPSRDRRDRDRDRDHDRQRTRRDDRDRYRERERDBasic
266-285GAVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-112ARDRRDDRDRRDDRDSYREDRNRDRDRRHRSRSRSPRSDRRDRHQSPSRDRRDRDRDRDHDRQRTRRDDRDRYRERERDRRR
122-171LRRQTARDPGRDREPRISASPPARGPPAKPDRSPLDSPLPTRPKDDRPRS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MVDQPRRGRNRPDSRQMWDESDRRNRHGPDARDRRDDRDRRDDRDSYREDRNRDRDRRHRSRSRSPRSDRRDRHQSPSRDRRDRDRDRDHDRQRTRRDDRDRYRERERDRRRDDTLEDFSKLRRQTARDPGRDREPRISASPPARGPPAKPDRSPLDSPLPTRPKDDRPRSRGTGTPLSFKVGKHEDGESRRRDDRSKSYDAKDSPRPEERNGASTAEGNAMDVDDAEDDEDVEVIDDGLAAMQAMMGFGGFGTTKGTHVPGNNAGAVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.79
3 0.72
4 0.68
5 0.65
6 0.61
7 0.6
8 0.64
9 0.61
10 0.6
11 0.64
12 0.6
13 0.62
14 0.65
15 0.64
16 0.64
17 0.71
18 0.72
19 0.74
20 0.74
21 0.72
22 0.73
23 0.74
24 0.72
25 0.72
26 0.72
27 0.68
28 0.73
29 0.72
30 0.67
31 0.68
32 0.66
33 0.59
34 0.63
35 0.63
36 0.62
37 0.65
38 0.69
39 0.7
40 0.73
41 0.79
42 0.78
43 0.83
44 0.88
45 0.88
46 0.88
47 0.87
48 0.89
49 0.9
50 0.91
51 0.9
52 0.89
53 0.89
54 0.89
55 0.91
56 0.87
57 0.86
58 0.86
59 0.8
60 0.8
61 0.79
62 0.79
63 0.79
64 0.82
65 0.83
66 0.81
67 0.79
68 0.8
69 0.81
70 0.82
71 0.81
72 0.81
73 0.79
74 0.78
75 0.85
76 0.84
77 0.83
78 0.82
79 0.81
80 0.8
81 0.82
82 0.81
83 0.8
84 0.81
85 0.81
86 0.82
87 0.83
88 0.83
89 0.79
90 0.82
91 0.8
92 0.78
93 0.78
94 0.78
95 0.78
96 0.77
97 0.77
98 0.72
99 0.68
100 0.64
101 0.6
102 0.56
103 0.48
104 0.42
105 0.36
106 0.32
107 0.33
108 0.31
109 0.27
110 0.24
111 0.26
112 0.32
113 0.43
114 0.51
115 0.53
116 0.57
117 0.57
118 0.63
119 0.64
120 0.59
121 0.54
122 0.47
123 0.41
124 0.4
125 0.38
126 0.33
127 0.31
128 0.32
129 0.27
130 0.26
131 0.26
132 0.24
133 0.22
134 0.28
135 0.34
136 0.34
137 0.34
138 0.37
139 0.39
140 0.44
141 0.45
142 0.38
143 0.37
144 0.35
145 0.36
146 0.41
147 0.41
148 0.36
149 0.39
150 0.39
151 0.41
152 0.5
153 0.59
154 0.6
155 0.62
156 0.68
157 0.68
158 0.67
159 0.61
160 0.57
161 0.55
162 0.47
163 0.45
164 0.38
165 0.37
166 0.36
167 0.32
168 0.32
169 0.26
170 0.26
171 0.23
172 0.25
173 0.28
174 0.33
175 0.4
176 0.38
177 0.39
178 0.42
179 0.43
180 0.44
181 0.45
182 0.48
183 0.48
184 0.53
185 0.54
186 0.53
187 0.58
188 0.58
189 0.57
190 0.55
191 0.53
192 0.51
193 0.53
194 0.53
195 0.49
196 0.53
197 0.49
198 0.45
199 0.42
200 0.37
201 0.29
202 0.27
203 0.25
204 0.18
205 0.16
206 0.12
207 0.1
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.04
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.02
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.02
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.07
241 0.08
242 0.09
243 0.11
244 0.13
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247 0.22
248 0.24
249 0.26
250 0.28
251 0.28
252 0.27
253 0.29
254 0.35
255 0.35
256 0.35
257 0.37
258 0.42
259 0.5
260 0.6
261 0.66
262 0.68
263 0.72
264 0.76
265 0.8
266 0.82
267 0.78
268 0.72
269 0.65
270 0.57
271 0.54
272 0.51
273 0.45
274 0.4