Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4YMM3

Protein Details
Accession A0A4Q4YMM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
500-525RETCEQYERRVRKQKKGDRASAKWIKHydrophilic
612-642MPFPRARGPPPPQIPRHRHPPPPPPPPPPATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
509-519RVRKQKKGDRA
618-636RGPPPPQIPRHRHPPPPPP
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 8.5, mito 8, nucl 4.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
cd20336  Rcat_RBR  
Amino Acid Sequences MGEAYDSIAGASLSHLDTAHPLCRASNPVKFIGLPAEHSSRCELRIEKLVSRLRRDKAPCSSDGPGMLAQAATQAATQAISPDHHKFIAKLHDLDRETAVLEITGSSIKPTSELSRVAAFLRRRYADGRQQIHHDARIEFYKGGKPIVTNELPKESTALSYRAVPIGDDGALRVDWTGSDLGLDRAQQENIELAARAGSTVGDIRRTIVRFLRDSNPDLAHLVKDPHQIEICAVGGLRPGALQGSNWEARRVGTWLCRYLRIRIRSHGDFFVFRGFNEEYIWHHPELGRHGYGHIRPLRQWLRDRVFALISGGVSPVKVEDDDIRLLSHGKVLRGRVRVRLGKTIEFAVPRKIEDSFVQAEAWLLPATETCTVCGDEKRVSEMPRRIAESCTHPATMCKECVGHWISSSLDTLAWDRLRCPECPQLLSFEDVRHLAPPDAFERYDALATRAAVGTVEEFKWCLNPRCGAGQIYPRGCSKAQCYECKRHLCLRHDVPWHSRETCEQYERRVRKQKKGDRASAKWIKEATKPCPGCERAIHKYTGCDHVTCKSLPAGPSRPRLTTSLGICGHEWCWVCLSPYYQDGRGLLHCKHKEDCPYFDNPPDYEGGRVFMPFPRARGPPPPQIPRHRHPPPPPPPPPPATFPAAHPNIHLRQPRAARDAGPPPFVFLNQYVGHGAVNHHRNLAYN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.09
4 0.14
5 0.17
6 0.2
7 0.19
8 0.2
9 0.2
10 0.24
11 0.31
12 0.33
13 0.36
14 0.37
15 0.38
16 0.39
17 0.38
18 0.36
19 0.36
20 0.31
21 0.29
22 0.3
23 0.34
24 0.32
25 0.34
26 0.38
27 0.32
28 0.32
29 0.34
30 0.31
31 0.29
32 0.38
33 0.41
34 0.4
35 0.46
36 0.53
37 0.54
38 0.61
39 0.65
40 0.6
41 0.64
42 0.66
43 0.66
44 0.68
45 0.67
46 0.61
47 0.59
48 0.58
49 0.51
50 0.47
51 0.4
52 0.31
53 0.26
54 0.22
55 0.16
56 0.12
57 0.11
58 0.1
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.09
67 0.1
68 0.15
69 0.19
70 0.21
71 0.23
72 0.24
73 0.23
74 0.28
75 0.36
76 0.37
77 0.37
78 0.37
79 0.44
80 0.44
81 0.45
82 0.4
83 0.31
84 0.26
85 0.23
86 0.19
87 0.11
88 0.1
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.12
98 0.15
99 0.18
100 0.2
101 0.21
102 0.23
103 0.24
104 0.25
105 0.29
106 0.28
107 0.3
108 0.35
109 0.34
110 0.35
111 0.38
112 0.44
113 0.47
114 0.53
115 0.54
116 0.5
117 0.53
118 0.58
119 0.58
120 0.53
121 0.47
122 0.38
123 0.36
124 0.36
125 0.33
126 0.26
127 0.25
128 0.26
129 0.24
130 0.25
131 0.23
132 0.2
133 0.22
134 0.29
135 0.3
136 0.29
137 0.3
138 0.34
139 0.34
140 0.33
141 0.31
142 0.23
143 0.22
144 0.21
145 0.2
146 0.16
147 0.17
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.15
152 0.13
153 0.13
154 0.12
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.07
164 0.07
165 0.05
166 0.06
167 0.07
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.12
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.1
178 0.11
179 0.09
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.08
188 0.09
189 0.1
190 0.1
191 0.12
192 0.17
193 0.18
194 0.2
195 0.22
196 0.25
197 0.26
198 0.3
199 0.35
200 0.34
201 0.36
202 0.38
203 0.34
204 0.3
205 0.29
206 0.26
207 0.2
208 0.17
209 0.17
210 0.16
211 0.21
212 0.21
213 0.22
214 0.22
215 0.21
216 0.2
217 0.2
218 0.17
219 0.1
220 0.1
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.05
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.11
232 0.15
233 0.15
234 0.16
235 0.16
236 0.16
237 0.17
238 0.18
239 0.15
240 0.18
241 0.21
242 0.27
243 0.28
244 0.33
245 0.34
246 0.4
247 0.45
248 0.46
249 0.46
250 0.46
251 0.51
252 0.49
253 0.51
254 0.45
255 0.39
256 0.33
257 0.3
258 0.31
259 0.24
260 0.2
261 0.22
262 0.19
263 0.17
264 0.17
265 0.17
266 0.14
267 0.19
268 0.22
269 0.17
270 0.18
271 0.19
272 0.2
273 0.24
274 0.24
275 0.19
276 0.17
277 0.18
278 0.21
279 0.21
280 0.27
281 0.26
282 0.24
283 0.24
284 0.33
285 0.37
286 0.38
287 0.43
288 0.44
289 0.45
290 0.47
291 0.47
292 0.4
293 0.35
294 0.3
295 0.25
296 0.17
297 0.12
298 0.08
299 0.08
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.06
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.09
313 0.1
314 0.1
315 0.12
316 0.11
317 0.12
318 0.14
319 0.18
320 0.23
321 0.28
322 0.3
323 0.32
324 0.37
325 0.4
326 0.4
327 0.44
328 0.41
329 0.37
330 0.36
331 0.32
332 0.27
333 0.25
334 0.23
335 0.2
336 0.18
337 0.17
338 0.17
339 0.16
340 0.15
341 0.14
342 0.17
343 0.14
344 0.14
345 0.14
346 0.13
347 0.12
348 0.11
349 0.11
350 0.06
351 0.05
352 0.04
353 0.04
354 0.06
355 0.08
356 0.09
357 0.08
358 0.1
359 0.11
360 0.12
361 0.13
362 0.14
363 0.13
364 0.14
365 0.18
366 0.2
367 0.21
368 0.27
369 0.31
370 0.34
371 0.34
372 0.37
373 0.33
374 0.32
375 0.32
376 0.31
377 0.31
378 0.28
379 0.26
380 0.23
381 0.23
382 0.26
383 0.26
384 0.21
385 0.17
386 0.15
387 0.15
388 0.21
389 0.22
390 0.18
391 0.15
392 0.16
393 0.15
394 0.16
395 0.16
396 0.1
397 0.08
398 0.08
399 0.09
400 0.11
401 0.13
402 0.12
403 0.12
404 0.19
405 0.21
406 0.21
407 0.25
408 0.29
409 0.3
410 0.32
411 0.32
412 0.29
413 0.28
414 0.29
415 0.25
416 0.18
417 0.17
418 0.16
419 0.16
420 0.13
421 0.13
422 0.11
423 0.11
424 0.12
425 0.13
426 0.15
427 0.15
428 0.14
429 0.14
430 0.14
431 0.15
432 0.14
433 0.13
434 0.12
435 0.12
436 0.13
437 0.11
438 0.1
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.09
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.13
448 0.17
449 0.21
450 0.22
451 0.24
452 0.26
453 0.29
454 0.31
455 0.28
456 0.28
457 0.3
458 0.34
459 0.33
460 0.34
461 0.31
462 0.32
463 0.31
464 0.3
465 0.28
466 0.31
467 0.35
468 0.43
469 0.48
470 0.54
471 0.62
472 0.66
473 0.66
474 0.64
475 0.66
476 0.62
477 0.65
478 0.63
479 0.63
480 0.62
481 0.62
482 0.6
483 0.55
484 0.54
485 0.46
486 0.4
487 0.37
488 0.38
489 0.39
490 0.41
491 0.39
492 0.43
493 0.52
494 0.56
495 0.62
496 0.65
497 0.67
498 0.7
499 0.79
500 0.8
501 0.81
502 0.84
503 0.84
504 0.83
505 0.81
506 0.82
507 0.79
508 0.71
509 0.64
510 0.58
511 0.52
512 0.49
513 0.51
514 0.46
515 0.48
516 0.47
517 0.45
518 0.5
519 0.49
520 0.46
521 0.47
522 0.49
523 0.46
524 0.5
525 0.51
526 0.43
527 0.45
528 0.44
529 0.44
530 0.38
531 0.32
532 0.29
533 0.3
534 0.33
535 0.28
536 0.26
537 0.21
538 0.23
539 0.24
540 0.3
541 0.35
542 0.39
543 0.47
544 0.49
545 0.48
546 0.47
547 0.47
548 0.45
549 0.43
550 0.38
551 0.38
552 0.36
553 0.35
554 0.33
555 0.32
556 0.27
557 0.26
558 0.25
559 0.17
560 0.18
561 0.18
562 0.19
563 0.2
564 0.22
565 0.2
566 0.25
567 0.28
568 0.26
569 0.27
570 0.26
571 0.27
572 0.3
573 0.31
574 0.3
575 0.36
576 0.38
577 0.4
578 0.43
579 0.46
580 0.51
581 0.51
582 0.53
583 0.48
584 0.51
585 0.5
586 0.53
587 0.52
588 0.42
589 0.38
590 0.35
591 0.31
592 0.27
593 0.24
594 0.2
595 0.16
596 0.16
597 0.16
598 0.16
599 0.24
600 0.23
601 0.25
602 0.29
603 0.32
604 0.36
605 0.44
606 0.48
607 0.5
608 0.58
609 0.65
610 0.68
611 0.75
612 0.8
613 0.77
614 0.81
615 0.79
616 0.8
617 0.8
618 0.82
619 0.81
620 0.83
621 0.85
622 0.81
623 0.8
624 0.77
625 0.72
626 0.66
627 0.61
628 0.55
629 0.48
630 0.45
631 0.47
632 0.45
633 0.41
634 0.38
635 0.41
636 0.4
637 0.47
638 0.49
639 0.42
640 0.47
641 0.54
642 0.59
643 0.56
644 0.54
645 0.49
646 0.5
647 0.56
648 0.52
649 0.51
650 0.44
651 0.42
652 0.41
653 0.38
654 0.34
655 0.26
656 0.28
657 0.23
658 0.25
659 0.22
660 0.21
661 0.21
662 0.19
663 0.2
664 0.23
665 0.28
666 0.27
667 0.29