Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4XND3

Protein Details
Accession A0A4Q4XND3    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-109VAMVNEPKKRKRHIPTDNLPNETKHydrophilic
172-199QGSEQDAKPKKEKRKPKKTKDNPYGLTPBasic
495-523LDRFDKRQSKAKLKVSKKKREADNAIKEGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-11RGRGRARK
179-191KPKKEKRKPKKTK
500-514KRQSKAKLKVSKKKR
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 14.333, cyto 5, cyto_nucl 3.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MPKRGRGRARKTAVPVRGGWDVLPHGLGAAPNAGTAPESLEQMPTLGTATESLTAEQITLATTSGTTPATASARASATTTATTSTVAMVNEPKKRKRHIPTDNLPNETKLETEINEEPEAEPEGGLRRSKRIRAIALNSTTPQETPAEPASQKRSSKAETSHTQQEDSHPGQGSEQDAKPKKEKRKPKKTKDNPYGLTPGETPFPYWMAPTPAQCEEVYKLLADMHDDVQPQAPEVIPAPSIEVAGCGEVPSVLDALLRTLLSGATTFDNADKMIKGLVEKFGILPEGIGKGSIDWNKVRLSPLEDVVDAICVGGLGNNKAKSIKAILDMVHQETIERRDAYLEERETGIAASVIGAAVKTKGQKDLEIEKVEKNILSLDHIRDLSVDEAMKEFTKYPGVGVKTSACVILFCLQRPCFAVDTHVDKFSRWLRWVPEKATVDDIFSHLEVRCPDHLKYGLHQLFIRHGKTCGKCRRGTVEGTEEWKTLVCPLEHLLDRFDKRQSKAKLKVSKKKREADNAIKEGAGAVKDEEADGLDGIEGGIATTGEGKMSDIDDDGDGGVAQDADMDPMAMEVDEGVVGHSADSPDSELSELDGAESGQEDVQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.64
3 0.58
4 0.54
5 0.47
6 0.38
7 0.32
8 0.27
9 0.23
10 0.21
11 0.16
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.1
16 0.1
17 0.09
18 0.09
19 0.09
20 0.09
21 0.08
22 0.08
23 0.11
24 0.1
25 0.13
26 0.13
27 0.14
28 0.14
29 0.14
30 0.14
31 0.1
32 0.1
33 0.08
34 0.07
35 0.07
36 0.08
37 0.11
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.12
43 0.11
44 0.1
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.07
51 0.09
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.12
56 0.13
57 0.14
58 0.14
59 0.15
60 0.16
61 0.16
62 0.17
63 0.15
64 0.15
65 0.15
66 0.15
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.12
71 0.12
72 0.13
73 0.12
74 0.13
75 0.19
76 0.25
77 0.32
78 0.4
79 0.46
80 0.52
81 0.59
82 0.67
83 0.7
84 0.75
85 0.78
86 0.81
87 0.83
88 0.87
89 0.86
90 0.8
91 0.71
92 0.62
93 0.53
94 0.43
95 0.33
96 0.25
97 0.2
98 0.16
99 0.2
100 0.22
101 0.23
102 0.23
103 0.23
104 0.21
105 0.2
106 0.22
107 0.17
108 0.13
109 0.11
110 0.14
111 0.17
112 0.2
113 0.2
114 0.26
115 0.32
116 0.38
117 0.45
118 0.47
119 0.51
120 0.56
121 0.6
122 0.61
123 0.58
124 0.56
125 0.49
126 0.44
127 0.38
128 0.29
129 0.25
130 0.18
131 0.15
132 0.16
133 0.18
134 0.2
135 0.21
136 0.25
137 0.31
138 0.36
139 0.37
140 0.37
141 0.4
142 0.39
143 0.44
144 0.44
145 0.45
146 0.43
147 0.48
148 0.53
149 0.49
150 0.47
151 0.42
152 0.41
153 0.4
154 0.37
155 0.35
156 0.27
157 0.25
158 0.24
159 0.25
160 0.24
161 0.22
162 0.22
163 0.27
164 0.32
165 0.36
166 0.44
167 0.51
168 0.58
169 0.63
170 0.72
171 0.74
172 0.8
173 0.88
174 0.91
175 0.94
176 0.94
177 0.96
178 0.95
179 0.94
180 0.85
181 0.79
182 0.72
183 0.61
184 0.52
185 0.41
186 0.32
187 0.24
188 0.21
189 0.17
190 0.13
191 0.14
192 0.12
193 0.11
194 0.12
195 0.15
196 0.17
197 0.17
198 0.2
199 0.2
200 0.22
201 0.21
202 0.22
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.13
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.14
217 0.14
218 0.13
219 0.11
220 0.1
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.03
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.06
273 0.05
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.09
280 0.11
281 0.13
282 0.12
283 0.14
284 0.15
285 0.17
286 0.17
287 0.14
288 0.17
289 0.16
290 0.17
291 0.16
292 0.15
293 0.14
294 0.13
295 0.12
296 0.08
297 0.06
298 0.04
299 0.03
300 0.03
301 0.04
302 0.05
303 0.06
304 0.1
305 0.1
306 0.11
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.12
313 0.14
314 0.14
315 0.16
316 0.18
317 0.18
318 0.16
319 0.14
320 0.12
321 0.12
322 0.14
323 0.14
324 0.13
325 0.12
326 0.12
327 0.13
328 0.16
329 0.2
330 0.18
331 0.16
332 0.16
333 0.16
334 0.15
335 0.14
336 0.11
337 0.06
338 0.05
339 0.04
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.04
346 0.05
347 0.08
348 0.09
349 0.14
350 0.15
351 0.17
352 0.21
353 0.27
354 0.31
355 0.33
356 0.34
357 0.3
358 0.31
359 0.3
360 0.25
361 0.19
362 0.14
363 0.11
364 0.12
365 0.14
366 0.14
367 0.17
368 0.17
369 0.16
370 0.15
371 0.16
372 0.13
373 0.12
374 0.1
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.11
383 0.11
384 0.12
385 0.16
386 0.18
387 0.17
388 0.19
389 0.19
390 0.17
391 0.18
392 0.17
393 0.12
394 0.1
395 0.11
396 0.15
397 0.15
398 0.16
399 0.22
400 0.22
401 0.23
402 0.25
403 0.26
404 0.21
405 0.2
406 0.22
407 0.19
408 0.25
409 0.26
410 0.28
411 0.26
412 0.24
413 0.29
414 0.31
415 0.32
416 0.28
417 0.31
418 0.33
419 0.43
420 0.48
421 0.46
422 0.5
423 0.47
424 0.46
425 0.47
426 0.41
427 0.33
428 0.28
429 0.26
430 0.19
431 0.17
432 0.17
433 0.12
434 0.15
435 0.14
436 0.17
437 0.21
438 0.23
439 0.23
440 0.26
441 0.3
442 0.29
443 0.3
444 0.37
445 0.35
446 0.34
447 0.35
448 0.3
449 0.35
450 0.38
451 0.38
452 0.29
453 0.3
454 0.36
455 0.41
456 0.5
457 0.52
458 0.54
459 0.56
460 0.59
461 0.64
462 0.6
463 0.58
464 0.54
465 0.5
466 0.47
467 0.47
468 0.44
469 0.36
470 0.32
471 0.28
472 0.22
473 0.18
474 0.18
475 0.14
476 0.14
477 0.16
478 0.21
479 0.23
480 0.23
481 0.24
482 0.28
483 0.31
484 0.32
485 0.38
486 0.39
487 0.41
488 0.5
489 0.55
490 0.58
491 0.65
492 0.72
493 0.74
494 0.78
495 0.85
496 0.86
497 0.88
498 0.87
499 0.87
500 0.86
501 0.86
502 0.86
503 0.87
504 0.86
505 0.79
506 0.71
507 0.62
508 0.52
509 0.42
510 0.34
511 0.24
512 0.14
513 0.1
514 0.1
515 0.1
516 0.1
517 0.1
518 0.08
519 0.09
520 0.08
521 0.07
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.05
526 0.04
527 0.03
528 0.04
529 0.03
530 0.04
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.06
535 0.07
536 0.08
537 0.09
538 0.09
539 0.08
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.09
545 0.08
546 0.07
547 0.07
548 0.05
549 0.05
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.07
558 0.05
559 0.05
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.06
568 0.08
569 0.08
570 0.08
571 0.09
572 0.11
573 0.11
574 0.12
575 0.12
576 0.1
577 0.11
578 0.12
579 0.11
580 0.1
581 0.1
582 0.09
583 0.08
584 0.09