Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4XSH6

Protein Details
Accession A0A4Q4XSH6    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-61ITAHGAGKRNRKRRSTGRAVYENEHydrophilic
239-259QAALLKRKRQHRDNLFKQQAQHydrophilic
383-403KEDMLRRRRAPVAPNKKRGFFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-52AGKRNRKRRS
245-248RKRQ
260-263KRKP
388-401RRRRAPVAPNKKRG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013268  U3_snoRNA_assoc  
Gene Ontology GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08297  U3_snoRNA_assoc  
Amino Acid Sequences MAPALTTRSKTLHGVAEEEDAQAKSTTNVDPSPREGPITAHGAGKRNRKRRSTGRAVYENEDDATHDSSLSTPARKKLFVRAREEADDGDGHDPATTAGVRIVQVQTEVRDQRPKRSRSNSVADSQDDDAVPESQRASRQLQEEAIQRLASQCVEPGFRSAALKAKEEEKVTGKAKHVVFGDDDDVEKYVAAAVGEKPAVVEKEKEEDLDEAPEAVSTKAAARETLESAKALAEATEKQAALLKRKRQHRDNLFKQQAQKRKPAPKPDLASSESDTQDPEATREAEDAPATTGRQRVEKLNLPGILPAEYLTESSSEGDDEAALERAVKKPKKISFEDALQSIGKESRVPRDQVVGSTVYRVVAGQTDKNLAPKLHKNTRYVKEDMLRRRRAPVAPNKKRGFFVAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.32
4 0.3
5 0.28
6 0.26
7 0.19
8 0.19
9 0.17
10 0.16
11 0.13
12 0.15
13 0.17
14 0.18
15 0.22
16 0.25
17 0.28
18 0.32
19 0.35
20 0.33
21 0.33
22 0.3
23 0.29
24 0.28
25 0.3
26 0.27
27 0.27
28 0.3
29 0.35
30 0.41
31 0.5
32 0.55
33 0.6
34 0.67
35 0.7
36 0.77
37 0.8
38 0.84
39 0.84
40 0.83
41 0.83
42 0.82
43 0.79
44 0.74
45 0.66
46 0.57
47 0.46
48 0.37
49 0.29
50 0.23
51 0.21
52 0.16
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.17
57 0.18
58 0.21
59 0.23
60 0.3
61 0.33
62 0.37
63 0.38
64 0.44
65 0.51
66 0.53
67 0.58
68 0.58
69 0.59
70 0.59
71 0.58
72 0.48
73 0.4
74 0.32
75 0.26
76 0.21
77 0.15
78 0.12
79 0.11
80 0.1
81 0.08
82 0.09
83 0.07
84 0.06
85 0.07
86 0.08
87 0.09
88 0.11
89 0.12
90 0.1
91 0.12
92 0.13
93 0.14
94 0.2
95 0.22
96 0.23
97 0.33
98 0.34
99 0.43
100 0.51
101 0.56
102 0.59
103 0.64
104 0.7
105 0.68
106 0.76
107 0.69
108 0.65
109 0.62
110 0.53
111 0.47
112 0.39
113 0.33
114 0.24
115 0.2
116 0.16
117 0.14
118 0.13
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.13
123 0.17
124 0.19
125 0.21
126 0.23
127 0.25
128 0.25
129 0.27
130 0.29
131 0.29
132 0.26
133 0.22
134 0.2
135 0.19
136 0.18
137 0.15
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.17
149 0.18
150 0.19
151 0.18
152 0.21
153 0.23
154 0.23
155 0.25
156 0.22
157 0.26
158 0.28
159 0.31
160 0.29
161 0.33
162 0.32
163 0.33
164 0.3
165 0.26
166 0.23
167 0.2
168 0.2
169 0.14
170 0.14
171 0.1
172 0.1
173 0.08
174 0.08
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.08
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.11
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.05
204 0.04
205 0.06
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.11
211 0.13
212 0.14
213 0.14
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.1
218 0.09
219 0.07
220 0.06
221 0.07
222 0.09
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.15
227 0.17
228 0.24
229 0.3
230 0.36
231 0.41
232 0.5
233 0.58
234 0.62
235 0.7
236 0.73
237 0.77
238 0.79
239 0.83
240 0.81
241 0.76
242 0.78
243 0.75
244 0.73
245 0.67
246 0.66
247 0.64
248 0.68
249 0.71
250 0.73
251 0.72
252 0.72
253 0.72
254 0.68
255 0.64
256 0.56
257 0.52
258 0.44
259 0.42
260 0.34
261 0.29
262 0.24
263 0.2
264 0.2
265 0.17
266 0.16
267 0.13
268 0.13
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.13
273 0.13
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.12
278 0.12
279 0.15
280 0.15
281 0.19
282 0.2
283 0.23
284 0.29
285 0.35
286 0.38
287 0.4
288 0.4
289 0.37
290 0.37
291 0.32
292 0.27
293 0.2
294 0.15
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.1
313 0.15
314 0.25
315 0.28
316 0.33
317 0.41
318 0.48
319 0.55
320 0.59
321 0.61
322 0.58
323 0.61
324 0.6
325 0.52
326 0.48
327 0.4
328 0.34
329 0.28
330 0.23
331 0.17
332 0.17
333 0.19
334 0.26
335 0.31
336 0.34
337 0.34
338 0.39
339 0.4
340 0.37
341 0.38
342 0.32
343 0.26
344 0.26
345 0.24
346 0.18
347 0.16
348 0.14
349 0.12
350 0.14
351 0.17
352 0.17
353 0.19
354 0.24
355 0.25
356 0.29
357 0.32
358 0.29
359 0.33
360 0.4
361 0.47
362 0.53
363 0.59
364 0.62
365 0.69
366 0.76
367 0.74
368 0.69
369 0.67
370 0.65
371 0.68
372 0.71
373 0.72
374 0.72
375 0.68
376 0.71
377 0.7
378 0.69
379 0.7
380 0.7
381 0.71
382 0.73
383 0.81
384 0.81
385 0.78
386 0.73