Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4X5H9

Protein Details
Accession A0A4Q4X5H9    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-126AKPSSRSKDKGKGKQKQSLDHydrophilic
280-300FKQFKKDQKVRSSEKKKKTALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-118KGK
292-297SEKKKK
322-327RRKKRK
452-456RLKGK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPKGKWIDKKTAQHFTLVHRPQNDPRIHDSDAPPMVLNPTTAPNSHKVKKLDDLASELGSDAAAVRANEGEAANYGVYFDDTEYDYMQHLRDLNSSSAGGEVVFVEAKPSSRSKDKGKGKQKQSLDDALRQLDIEDAERKKRELLDDDILPSKNLTRLTYQAQQDVPDAIGRFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDDDDEIFQELAKEGQELDDFEFEEQGDFFDDDDEDGWESDDTAKPKREYKTAARGADEEAPTLVPVPGSGSGEEVPAPNENWLDDFKQFKKDQKVRSSEKKKKTALPPPSNSDLQSSLFTTTTNGGLRRKKRKGALTSQSGYSMTSSSLVRTEQLGILDERFEKLEERHYNPAHEDGEDDFLYGDDDGTASALSGITGITGASTASSVTGPTRGDFDSILDDFLGGYSMHGKKQLKKGGWKNGAEQLDDIRRELGPPRLKGKYAGGGGKTKSPAAAAALTFGAPSASR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.62
3 0.63
4 0.6
5 0.57
6 0.51
7 0.56
8 0.58
9 0.64
10 0.62
11 0.56
12 0.57
13 0.57
14 0.56
15 0.57
16 0.52
17 0.51
18 0.48
19 0.44
20 0.36
21 0.31
22 0.3
23 0.24
24 0.22
25 0.15
26 0.17
27 0.18
28 0.2
29 0.23
30 0.28
31 0.36
32 0.41
33 0.47
34 0.46
35 0.49
36 0.55
37 0.59
38 0.57
39 0.51
40 0.5
41 0.45
42 0.42
43 0.37
44 0.29
45 0.21
46 0.15
47 0.13
48 0.07
49 0.06
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.08
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.09
63 0.07
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.14
77 0.15
78 0.17
79 0.2
80 0.2
81 0.2
82 0.2
83 0.17
84 0.16
85 0.14
86 0.11
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.11
96 0.14
97 0.18
98 0.24
99 0.3
100 0.37
101 0.47
102 0.57
103 0.64
104 0.72
105 0.78
106 0.79
107 0.83
108 0.8
109 0.77
110 0.72
111 0.7
112 0.64
113 0.59
114 0.54
115 0.46
116 0.41
117 0.33
118 0.28
119 0.2
120 0.16
121 0.13
122 0.17
123 0.18
124 0.24
125 0.25
126 0.26
127 0.27
128 0.29
129 0.31
130 0.3
131 0.33
132 0.32
133 0.32
134 0.34
135 0.35
136 0.33
137 0.28
138 0.24
139 0.19
140 0.17
141 0.17
142 0.17
143 0.16
144 0.19
145 0.24
146 0.3
147 0.31
148 0.31
149 0.3
150 0.3
151 0.28
152 0.25
153 0.21
154 0.16
155 0.15
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.11
161 0.13
162 0.13
163 0.17
164 0.18
165 0.19
166 0.19
167 0.22
168 0.22
169 0.19
170 0.17
171 0.15
172 0.14
173 0.12
174 0.12
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.06
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.04
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.08
222 0.1
223 0.13
224 0.17
225 0.18
226 0.24
227 0.27
228 0.29
229 0.33
230 0.38
231 0.45
232 0.48
233 0.48
234 0.44
235 0.42
236 0.4
237 0.39
238 0.32
239 0.22
240 0.15
241 0.13
242 0.12
243 0.11
244 0.09
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.08
263 0.1
264 0.1
265 0.12
266 0.16
267 0.17
268 0.25
269 0.27
270 0.32
271 0.41
272 0.47
273 0.53
274 0.58
275 0.65
276 0.66
277 0.75
278 0.8
279 0.79
280 0.81
281 0.82
282 0.77
283 0.77
284 0.78
285 0.77
286 0.77
287 0.77
288 0.72
289 0.69
290 0.69
291 0.62
292 0.53
293 0.46
294 0.37
295 0.28
296 0.24
297 0.19
298 0.16
299 0.15
300 0.14
301 0.13
302 0.12
303 0.13
304 0.14
305 0.16
306 0.21
307 0.29
308 0.38
309 0.48
310 0.54
311 0.58
312 0.64
313 0.7
314 0.72
315 0.75
316 0.75
317 0.73
318 0.68
319 0.62
320 0.56
321 0.47
322 0.38
323 0.28
324 0.2
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.09
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.11
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.13
337 0.13
338 0.13
339 0.14
340 0.13
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.22
347 0.27
348 0.31
349 0.39
350 0.4
351 0.42
352 0.42
353 0.45
354 0.36
355 0.3
356 0.26
357 0.19
358 0.22
359 0.19
360 0.17
361 0.13
362 0.11
363 0.12
364 0.1
365 0.09
366 0.04
367 0.05
368 0.04
369 0.05
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.03
378 0.04
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.06
389 0.07
390 0.1
391 0.1
392 0.11
393 0.14
394 0.14
395 0.15
396 0.15
397 0.15
398 0.17
399 0.17
400 0.17
401 0.14
402 0.13
403 0.12
404 0.11
405 0.11
406 0.06
407 0.06
408 0.13
409 0.15
410 0.16
411 0.24
412 0.29
413 0.35
414 0.45
415 0.54
416 0.54
417 0.63
418 0.72
419 0.75
420 0.8
421 0.75
422 0.71
423 0.7
424 0.65
425 0.56
426 0.48
427 0.43
428 0.42
429 0.39
430 0.35
431 0.29
432 0.26
433 0.27
434 0.3
435 0.33
436 0.33
437 0.38
438 0.44
439 0.47
440 0.49
441 0.5
442 0.52
443 0.5
444 0.48
445 0.49
446 0.46
447 0.48
448 0.49
449 0.51
450 0.48
451 0.4
452 0.35
453 0.29
454 0.26
455 0.23
456 0.25
457 0.18
458 0.18
459 0.18
460 0.17
461 0.16
462 0.14