Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4XHR0

Protein Details
Accession A0A4Q4XHR0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
414-442LVVTRGKGFTKEKNKKKRGSYKGGALDVHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
421-432GFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAKKSKKTEKSKATPAAPAADNQAPPTQLMDLVESFLCDQGFNNAHREFQKHRAKNGWKSDGSSRGDNNGHTSLVSVFQAWETFSSKDSATAPKQQAIDRVTKVSSSSSSSSSSSDSDSSSDDSSDSDSDGDDVSMADAPATKAESSDSSDSSSCSSSSSDSDSDSDSESDDETATSKAKAPAAKARNTTNPLKRKAKSDSEVSSSESDSDEDMSDSSSEDERPRAKKTKTADSSDESSSESSDSDSSSDDSSSDDEAAKPKASSKTQAADSSSPSSSFESDSSSSDSNSDSDSESDTAAVASKVPLPESDSSSSSSDSESDDEDAKPASKDVTVNGTGSDTSATLDKTSPQFQEAPLPPDPVETNNRVKNGAKTAKTQNQPFSRIRQDVAIDPRLSSNAYVSHSWGDKAHEDLVVTRGKGFTKEKNKKKRGSYKGGALDVHQVRSIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.7
3 0.66
4 0.56
5 0.48
6 0.43
7 0.39
8 0.35
9 0.32
10 0.32
11 0.25
12 0.25
13 0.25
14 0.2
15 0.16
16 0.17
17 0.17
18 0.14
19 0.16
20 0.15
21 0.14
22 0.14
23 0.14
24 0.13
25 0.1
26 0.1
27 0.15
28 0.2
29 0.21
30 0.27
31 0.26
32 0.3
33 0.33
34 0.38
35 0.37
36 0.43
37 0.53
38 0.52
39 0.58
40 0.64
41 0.71
42 0.75
43 0.8
44 0.79
45 0.7
46 0.68
47 0.69
48 0.67
49 0.62
50 0.57
51 0.49
52 0.46
53 0.46
54 0.43
55 0.41
56 0.34
57 0.3
58 0.24
59 0.23
60 0.17
61 0.17
62 0.16
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.1
68 0.11
69 0.12
70 0.13
71 0.13
72 0.15
73 0.14
74 0.16
75 0.18
76 0.23
77 0.25
78 0.33
79 0.35
80 0.38
81 0.4
82 0.4
83 0.44
84 0.4
85 0.43
86 0.36
87 0.36
88 0.32
89 0.3
90 0.29
91 0.25
92 0.23
93 0.2
94 0.2
95 0.2
96 0.21
97 0.22
98 0.22
99 0.22
100 0.21
101 0.19
102 0.17
103 0.16
104 0.15
105 0.15
106 0.16
107 0.15
108 0.14
109 0.12
110 0.11
111 0.12
112 0.12
113 0.11
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.06
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.08
132 0.09
133 0.13
134 0.15
135 0.15
136 0.16
137 0.16
138 0.16
139 0.17
140 0.16
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.11
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.14
151 0.15
152 0.14
153 0.13
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.1
165 0.12
166 0.15
167 0.17
168 0.19
169 0.27
170 0.32
171 0.37
172 0.37
173 0.39
174 0.42
175 0.46
176 0.51
177 0.51
178 0.53
179 0.56
180 0.61
181 0.59
182 0.59
183 0.61
184 0.61
185 0.56
186 0.54
187 0.49
188 0.45
189 0.44
190 0.4
191 0.34
192 0.26
193 0.23
194 0.17
195 0.14
196 0.1
197 0.1
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.06
206 0.07
207 0.08
208 0.11
209 0.16
210 0.19
211 0.24
212 0.31
213 0.31
214 0.35
215 0.39
216 0.47
217 0.47
218 0.5
219 0.48
220 0.44
221 0.46
222 0.41
223 0.37
224 0.27
225 0.22
226 0.17
227 0.14
228 0.1
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.1
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.14
249 0.19
250 0.2
251 0.24
252 0.25
253 0.28
254 0.31
255 0.33
256 0.32
257 0.29
258 0.3
259 0.29
260 0.25
261 0.21
262 0.2
263 0.18
264 0.16
265 0.15
266 0.13
267 0.13
268 0.14
269 0.15
270 0.17
271 0.16
272 0.15
273 0.15
274 0.15
275 0.12
276 0.12
277 0.11
278 0.09
279 0.09
280 0.11
281 0.11
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.05
289 0.06
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.12
295 0.14
296 0.18
297 0.2
298 0.19
299 0.21
300 0.22
301 0.23
302 0.2
303 0.18
304 0.15
305 0.13
306 0.13
307 0.11
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.13
314 0.12
315 0.11
316 0.1
317 0.1
318 0.11
319 0.12
320 0.17
321 0.17
322 0.17
323 0.17
324 0.17
325 0.15
326 0.15
327 0.14
328 0.08
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.09
334 0.13
335 0.16
336 0.2
337 0.21
338 0.22
339 0.23
340 0.23
341 0.32
342 0.32
343 0.34
344 0.32
345 0.33
346 0.3
347 0.31
348 0.31
349 0.26
350 0.28
351 0.29
352 0.35
353 0.37
354 0.39
355 0.4
356 0.41
357 0.42
358 0.46
359 0.49
360 0.44
361 0.46
362 0.54
363 0.6
364 0.65
365 0.66
366 0.66
367 0.64
368 0.68
369 0.65
370 0.63
371 0.63
372 0.59
373 0.53
374 0.48
375 0.44
376 0.44
377 0.47
378 0.46
379 0.38
380 0.36
381 0.36
382 0.33
383 0.31
384 0.24
385 0.19
386 0.16
387 0.19
388 0.19
389 0.2
390 0.23
391 0.24
392 0.25
393 0.24
394 0.24
395 0.23
396 0.25
397 0.25
398 0.21
399 0.21
400 0.21
401 0.24
402 0.24
403 0.22
404 0.21
405 0.21
406 0.21
407 0.27
408 0.31
409 0.37
410 0.44
411 0.55
412 0.64
413 0.73
414 0.82
415 0.85
416 0.9
417 0.91
418 0.9
419 0.9
420 0.88
421 0.87
422 0.85
423 0.81
424 0.7
425 0.61
426 0.6
427 0.53
428 0.47
429 0.4
430 0.33
431 0.28