Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4YXX3

Protein Details
Accession A0A4Q4YXX3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
280-305RSLHAPTTKRRRRTRASTKAARQQPVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
287-295TKRRRRTRA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MAAKRGPSPELVPSPFIKKRNLEWSIELPAPATRASSEATSSSSSDDQQGAADSRAEEEESPSAAAVEAGEGHVDDHLGYFSRILTKATLSSFPSDIPHLSVERYQKLYTANFGSPRGAHFVVHQHDHPVAGTHYDLRLQINETSSASWAIKEPLLTLALGCSVRAARRSEQSTVEQKCYRDKSALFMETASSPTGSLLIWDTGTYTVLPQQDKQAPAVDPDSQSSSSDPEERGPTEQEKLQRAFQARKIRIKLHGSRLPHTYVLNLRLTRDEDVAGRARSLHAPTTKRRRRTRASTKAARQQPVTSSSDSEAASGPRRDTNGDDDDDDAETVKAPAELVAGNQDDGAGISAMEREIRELEDEHVRRTNAYAGAANTIGSVHQRRWYLSLDREACGFAKRRRSGGRTVWEPSSPPAVPGGGSSSAAGDDGDGERGEEEDGGNRLRFPFYVRGVEVERSIVTGRLAADILRDGGVVGYVGRKGWRPVLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.49
3 0.5
4 0.5
5 0.47
6 0.52
7 0.59
8 0.61
9 0.57
10 0.56
11 0.57
12 0.55
13 0.51
14 0.43
15 0.34
16 0.3
17 0.27
18 0.21
19 0.17
20 0.12
21 0.12
22 0.14
23 0.14
24 0.15
25 0.15
26 0.17
27 0.18
28 0.18
29 0.2
30 0.2
31 0.2
32 0.21
33 0.2
34 0.18
35 0.16
36 0.19
37 0.17
38 0.16
39 0.17
40 0.14
41 0.15
42 0.15
43 0.16
44 0.14
45 0.15
46 0.15
47 0.15
48 0.15
49 0.13
50 0.12
51 0.11
52 0.1
53 0.07
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.13
70 0.13
71 0.14
72 0.15
73 0.15
74 0.18
75 0.2
76 0.23
77 0.2
78 0.23
79 0.22
80 0.22
81 0.22
82 0.21
83 0.19
84 0.18
85 0.18
86 0.16
87 0.17
88 0.21
89 0.25
90 0.27
91 0.3
92 0.28
93 0.28
94 0.31
95 0.31
96 0.31
97 0.3
98 0.29
99 0.28
100 0.29
101 0.29
102 0.25
103 0.26
104 0.27
105 0.23
106 0.19
107 0.19
108 0.25
109 0.27
110 0.29
111 0.28
112 0.25
113 0.25
114 0.25
115 0.23
116 0.17
117 0.14
118 0.12
119 0.12
120 0.11
121 0.12
122 0.13
123 0.14
124 0.13
125 0.14
126 0.15
127 0.16
128 0.16
129 0.17
130 0.16
131 0.16
132 0.15
133 0.16
134 0.14
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.1
152 0.14
153 0.17
154 0.18
155 0.24
156 0.28
157 0.3
158 0.32
159 0.37
160 0.42
161 0.42
162 0.45
163 0.41
164 0.39
165 0.44
166 0.45
167 0.41
168 0.37
169 0.34
170 0.33
171 0.36
172 0.36
173 0.28
174 0.24
175 0.24
176 0.2
177 0.2
178 0.16
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.06
193 0.05
194 0.08
195 0.11
196 0.12
197 0.12
198 0.18
199 0.21
200 0.22
201 0.23
202 0.23
203 0.2
204 0.21
205 0.22
206 0.19
207 0.16
208 0.16
209 0.17
210 0.15
211 0.15
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.14
216 0.13
217 0.13
218 0.14
219 0.15
220 0.16
221 0.17
222 0.17
223 0.17
224 0.19
225 0.21
226 0.24
227 0.25
228 0.25
229 0.27
230 0.29
231 0.31
232 0.35
233 0.41
234 0.41
235 0.46
236 0.48
237 0.47
238 0.5
239 0.54
240 0.53
241 0.52
242 0.52
243 0.48
244 0.47
245 0.47
246 0.42
247 0.36
248 0.3
249 0.24
250 0.22
251 0.23
252 0.24
253 0.22
254 0.2
255 0.21
256 0.22
257 0.21
258 0.19
259 0.16
260 0.12
261 0.15
262 0.17
263 0.16
264 0.14
265 0.13
266 0.13
267 0.15
268 0.16
269 0.17
270 0.2
271 0.25
272 0.33
273 0.44
274 0.5
275 0.58
276 0.65
277 0.7
278 0.73
279 0.79
280 0.82
281 0.82
282 0.85
283 0.85
284 0.83
285 0.84
286 0.81
287 0.74
288 0.64
289 0.56
290 0.49
291 0.44
292 0.4
293 0.31
294 0.26
295 0.24
296 0.25
297 0.22
298 0.2
299 0.15
300 0.14
301 0.18
302 0.18
303 0.18
304 0.17
305 0.18
306 0.19
307 0.2
308 0.24
309 0.24
310 0.24
311 0.23
312 0.22
313 0.22
314 0.21
315 0.18
316 0.13
317 0.09
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.1
347 0.13
348 0.22
349 0.23
350 0.25
351 0.28
352 0.28
353 0.26
354 0.27
355 0.29
356 0.21
357 0.22
358 0.21
359 0.18
360 0.19
361 0.19
362 0.18
363 0.13
364 0.11
365 0.1
366 0.12
367 0.13
368 0.14
369 0.19
370 0.2
371 0.22
372 0.25
373 0.3
374 0.32
375 0.35
376 0.43
377 0.4
378 0.39
379 0.39
380 0.37
381 0.33
382 0.32
383 0.34
384 0.3
385 0.38
386 0.4
387 0.47
388 0.54
389 0.58
390 0.61
391 0.63
392 0.67
393 0.62
394 0.63
395 0.59
396 0.52
397 0.49
398 0.43
399 0.4
400 0.31
401 0.25
402 0.23
403 0.2
404 0.18
405 0.17
406 0.19
407 0.13
408 0.14
409 0.13
410 0.12
411 0.12
412 0.12
413 0.11
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.09
418 0.08
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.1
423 0.08
424 0.08
425 0.1
426 0.13
427 0.15
428 0.16
429 0.16
430 0.18
431 0.19
432 0.19
433 0.21
434 0.26
435 0.28
436 0.33
437 0.33
438 0.36
439 0.38
440 0.4
441 0.35
442 0.3
443 0.25
444 0.21
445 0.21
446 0.18
447 0.14
448 0.14
449 0.14
450 0.14
451 0.14
452 0.12
453 0.13
454 0.13
455 0.14
456 0.12
457 0.11
458 0.09
459 0.09
460 0.09
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.09
465 0.1
466 0.13
467 0.16
468 0.2