Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4ZPF3

Protein Details
Accession A0A4Q4ZPF3    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
150-170IPPHLRRRQEQPPRDKNQQDAHydrophilic
172-191AGVKKRYQPYYRKAIPKKTVHydrophilic
913-935YYVDYNKRKRKISQPLPGKESNFHydrophilic
957-981RDLDKLYTRYSKKNKKDLGYRPGYEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
266-269AKKK
676-705RRIGKKAPHVREADVSKPAKGKEKVKDKSR
791-808KPANRSPHQKTSSRHGRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, pero 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036412  HAD-like_sf  
IPR023214  HAD_sf  
IPR040450  TFIIF_beta_HTH  
IPR040504  TFIIF_beta_N  
IPR011039  TFIIF_interaction  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF12710  HAD  
PF02270  TFIIF_beta  
PF17683  TFIIF_beta_N  
CDD cd07980  TFIIF_beta  
Amino Acid Sequences MASSSQVKPEPGIKNDPDDGKPSPAALSDDDIYEDAGDLEFYTDNPAPDNYAGNVYLTHVPKYLYDAWAHLDDDAEIRIGTIRQWNETGPDGQPRQRIAMLLDHRQPEHQNVPKEYNLDVKDMQLINTFMFTEQDLPGYKNKSQGANRNIPPHLRRRQEQPPRDKNQQDANAGVKKRYQPYYRKAIPKKTVLAGKFAHELNCQPVMNAETRHILTTRASDAMKPKATTKMMAAARGMPSGIIQAGSFAPDKFSTLVRPLADVKKAAKKKQEERAARLSQSELRDRIFQCYDRFNYWSMKAFKQTLNQPEAWLRENLEELAVLHKTGRFANHWELKPEYKRGNLQGVESAAPDLAPEGDESDFDADDDNVEMEDLLNKYDVGGSVLHLLKHQHDLALSIITLRSPPSQSNPPPFSQLSLIATLHNHSSPLPAMSIFLDFDGTITTQDTIGELAGFALRVQRSDAGRDLSREWDAVVRAYVDDYRAGADEHHTPAAGRLEPAQEVEFLRALKHVETRSLDRVRRCGLFRGIGGGAFREAGRALVADGTIDLRPGFHEFVEARASEGWRVWVVSVNWSASFIGGACGHPGITVVANDVREDGSVVGPAILNRGGGEPRALTNSHDKLDVMEAVLREESLADKSSVYMGDSNTDLECLLAAHRGIVIADSPDTTLLKTLRRIGKKAPHVREADVSKPAKGKEKVKDKSRGAYIEDPAPLDPTSKPSDNPAYYGIRTSRYANQGAVHESEYYGILSSPPTPPSEFVPPPAHRHQSRSSQRHNVPQDARRADKSSSKPANRSPHQKTSSRHGRKASAPPEVPGPSATAPTVPPAAPDPPLAPRYAPSATPDTSLAIRCGPPAASYISPEVPVIPPAVPDPPPPLRSAWQAHQLPHTTFWEEIKEKYQFESQYEPEQVDYYVDYNKRKRKISQPLPGKESNFIAYFLQLYLPITHQRHLNIILRDLDKLYTRYSKKNKKDLGYRPGYEIRLMDPENPEGGVLETMWDPPTSVWDLNDEKHRVDRMTGQYDHATEDPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.53
3 0.56
4 0.5
5 0.48
6 0.45
7 0.42
8 0.39
9 0.34
10 0.29
11 0.26
12 0.26
13 0.23
14 0.24
15 0.2
16 0.2
17 0.2
18 0.19
19 0.17
20 0.14
21 0.13
22 0.09
23 0.08
24 0.07
25 0.06
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.13
30 0.14
31 0.15
32 0.17
33 0.17
34 0.19
35 0.2
36 0.22
37 0.18
38 0.19
39 0.19
40 0.17
41 0.17
42 0.17
43 0.23
44 0.22
45 0.23
46 0.21
47 0.21
48 0.21
49 0.28
50 0.29
51 0.24
52 0.24
53 0.24
54 0.27
55 0.28
56 0.28
57 0.22
58 0.18
59 0.16
60 0.15
61 0.14
62 0.11
63 0.08
64 0.08
65 0.1
66 0.09
67 0.12
68 0.18
69 0.19
70 0.21
71 0.23
72 0.24
73 0.26
74 0.29
75 0.29
76 0.25
77 0.32
78 0.34
79 0.38
80 0.42
81 0.41
82 0.41
83 0.39
84 0.38
85 0.31
86 0.36
87 0.36
88 0.39
89 0.43
90 0.42
91 0.42
92 0.44
93 0.45
94 0.42
95 0.46
96 0.46
97 0.48
98 0.5
99 0.54
100 0.54
101 0.53
102 0.47
103 0.46
104 0.4
105 0.37
106 0.32
107 0.28
108 0.32
109 0.3
110 0.3
111 0.24
112 0.23
113 0.19
114 0.19
115 0.19
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.11
121 0.14
122 0.14
123 0.16
124 0.21
125 0.26
126 0.27
127 0.31
128 0.34
129 0.4
130 0.46
131 0.53
132 0.57
133 0.62
134 0.65
135 0.66
136 0.65
137 0.64
138 0.63
139 0.64
140 0.64
141 0.62
142 0.61
143 0.62
144 0.7
145 0.73
146 0.77
147 0.78
148 0.79
149 0.8
150 0.86
151 0.81
152 0.77
153 0.75
154 0.73
155 0.64
156 0.57
157 0.56
158 0.54
159 0.51
160 0.47
161 0.42
162 0.41
163 0.45
164 0.5
165 0.52
166 0.54
167 0.6
168 0.69
169 0.72
170 0.77
171 0.78
172 0.8
173 0.79
174 0.77
175 0.74
176 0.7
177 0.69
178 0.59
179 0.57
180 0.48
181 0.44
182 0.4
183 0.36
184 0.32
185 0.26
186 0.27
187 0.25
188 0.28
189 0.25
190 0.21
191 0.21
192 0.21
193 0.23
194 0.22
195 0.2
196 0.19
197 0.2
198 0.22
199 0.2
200 0.19
201 0.17
202 0.19
203 0.2
204 0.19
205 0.19
206 0.21
207 0.26
208 0.32
209 0.35
210 0.33
211 0.33
212 0.37
213 0.38
214 0.37
215 0.33
216 0.34
217 0.32
218 0.33
219 0.31
220 0.27
221 0.27
222 0.25
223 0.23
224 0.14
225 0.13
226 0.11
227 0.1
228 0.07
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.09
233 0.1
234 0.09
235 0.11
236 0.1
237 0.12
238 0.12
239 0.13
240 0.14
241 0.16
242 0.2
243 0.19
244 0.21
245 0.25
246 0.28
247 0.29
248 0.29
249 0.31
250 0.37
251 0.43
252 0.47
253 0.51
254 0.56
255 0.62
256 0.69
257 0.74
258 0.72
259 0.72
260 0.76
261 0.72
262 0.64
263 0.57
264 0.5
265 0.45
266 0.42
267 0.41
268 0.33
269 0.3
270 0.35
271 0.35
272 0.37
273 0.36
274 0.35
275 0.32
276 0.37
277 0.38
278 0.35
279 0.36
280 0.33
281 0.33
282 0.32
283 0.37
284 0.35
285 0.34
286 0.36
287 0.38
288 0.38
289 0.4
290 0.45
291 0.44
292 0.44
293 0.42
294 0.39
295 0.39
296 0.39
297 0.35
298 0.29
299 0.23
300 0.19
301 0.19
302 0.17
303 0.14
304 0.11
305 0.09
306 0.11
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.1
312 0.12
313 0.14
314 0.13
315 0.18
316 0.27
317 0.35
318 0.35
319 0.37
320 0.39
321 0.43
322 0.45
323 0.46
324 0.41
325 0.37
326 0.4
327 0.41
328 0.45
329 0.4
330 0.37
331 0.33
332 0.31
333 0.28
334 0.23
335 0.19
336 0.11
337 0.1
338 0.09
339 0.06
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.06
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.11
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.13
375 0.14
376 0.17
377 0.16
378 0.12
379 0.11
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.1
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.09
391 0.11
392 0.15
393 0.24
394 0.28
395 0.37
396 0.39
397 0.38
398 0.41
399 0.4
400 0.37
401 0.3
402 0.27
403 0.2
404 0.18
405 0.17
406 0.13
407 0.14
408 0.13
409 0.12
410 0.11
411 0.09
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.09
416 0.08
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.05
425 0.06
426 0.06
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.03
442 0.06
443 0.06
444 0.07
445 0.08
446 0.11
447 0.12
448 0.14
449 0.16
450 0.16
451 0.17
452 0.19
453 0.19
454 0.18
455 0.18
456 0.15
457 0.14
458 0.12
459 0.12
460 0.11
461 0.1
462 0.08
463 0.07
464 0.08
465 0.08
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.06
473 0.08
474 0.1
475 0.11
476 0.11
477 0.1
478 0.1
479 0.11
480 0.13
481 0.12
482 0.09
483 0.09
484 0.1
485 0.1
486 0.11
487 0.1
488 0.09
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.08
493 0.09
494 0.09
495 0.09
496 0.09
497 0.12
498 0.12
499 0.14
500 0.16
501 0.19
502 0.26
503 0.31
504 0.34
505 0.32
506 0.35
507 0.34
508 0.35
509 0.34
510 0.3
511 0.27
512 0.25
513 0.24
514 0.23
515 0.2
516 0.18
517 0.16
518 0.12
519 0.1
520 0.08
521 0.08
522 0.05
523 0.05
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.04
537 0.05
538 0.07
539 0.08
540 0.07
541 0.09
542 0.09
543 0.11
544 0.13
545 0.12
546 0.11
547 0.11
548 0.12
549 0.1
550 0.1
551 0.09
552 0.07
553 0.08
554 0.07
555 0.1
556 0.1
557 0.13
558 0.14
559 0.13
560 0.13
561 0.14
562 0.13
563 0.09
564 0.09
565 0.06
566 0.06
567 0.06
568 0.06
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.05
575 0.05
576 0.05
577 0.06
578 0.07
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.06
593 0.06
594 0.05
595 0.05
596 0.07
597 0.07
598 0.07
599 0.08
600 0.07
601 0.08
602 0.1
603 0.1
604 0.11
605 0.18
606 0.2
607 0.21
608 0.2
609 0.2
610 0.18
611 0.19
612 0.18
613 0.11
614 0.1
615 0.09
616 0.09
617 0.09
618 0.08
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.06
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.08
627 0.09
628 0.09
629 0.09
630 0.09
631 0.08
632 0.09
633 0.09
634 0.1
635 0.09
636 0.09
637 0.08
638 0.06
639 0.06
640 0.05
641 0.05
642 0.05
643 0.05
644 0.05
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.05
649 0.05
650 0.05
651 0.05
652 0.05
653 0.05
654 0.06
655 0.07
656 0.06
657 0.09
658 0.1
659 0.13
660 0.15
661 0.22
662 0.29
663 0.33
664 0.36
665 0.41
666 0.48
667 0.56
668 0.64
669 0.62
670 0.62
671 0.6
672 0.6
673 0.58
674 0.53
675 0.46
676 0.44
677 0.39
678 0.34
679 0.34
680 0.34
681 0.37
682 0.39
683 0.43
684 0.44
685 0.54
686 0.6
687 0.66
688 0.74
689 0.68
690 0.69
691 0.67
692 0.61
693 0.55
694 0.53
695 0.46
696 0.4
697 0.37
698 0.31
699 0.26
700 0.25
701 0.19
702 0.16
703 0.14
704 0.14
705 0.19
706 0.19
707 0.2
708 0.23
709 0.31
710 0.3
711 0.31
712 0.31
713 0.3
714 0.29
715 0.33
716 0.29
717 0.24
718 0.25
719 0.27
720 0.29
721 0.3
722 0.31
723 0.29
724 0.3
725 0.29
726 0.29
727 0.27
728 0.22
729 0.18
730 0.16
731 0.15
732 0.13
733 0.11
734 0.08
735 0.07
736 0.06
737 0.07
738 0.09
739 0.1
740 0.11
741 0.13
742 0.14
743 0.15
744 0.19
745 0.26
746 0.25
747 0.28
748 0.35
749 0.36
750 0.42
751 0.48
752 0.52
753 0.46
754 0.52
755 0.53
756 0.55
757 0.63
758 0.66
759 0.67
760 0.69
761 0.72
762 0.75
763 0.74
764 0.72
765 0.69
766 0.66
767 0.67
768 0.62
769 0.61
770 0.55
771 0.53
772 0.47
773 0.49
774 0.49
775 0.5
776 0.54
777 0.56
778 0.58
779 0.63
780 0.71
781 0.7
782 0.74
783 0.72
784 0.72
785 0.72
786 0.74
787 0.69
788 0.69
789 0.73
790 0.72
791 0.7
792 0.65
793 0.65
794 0.65
795 0.72
796 0.67
797 0.65
798 0.57
799 0.52
800 0.52
801 0.48
802 0.41
803 0.31
804 0.28
805 0.19
806 0.2
807 0.19
808 0.14
809 0.13
810 0.14
811 0.16
812 0.13
813 0.13
814 0.15
815 0.16
816 0.16
817 0.17
818 0.17
819 0.21
820 0.22
821 0.22
822 0.2
823 0.19
824 0.23
825 0.23
826 0.22
827 0.21
828 0.25
829 0.24
830 0.26
831 0.25
832 0.22
833 0.23
834 0.23
835 0.2
836 0.18
837 0.17
838 0.16
839 0.17
840 0.15
841 0.13
842 0.14
843 0.17
844 0.15
845 0.17
846 0.2
847 0.19
848 0.2
849 0.19
850 0.19
851 0.15
852 0.15
853 0.15
854 0.12
855 0.11
856 0.12
857 0.16
858 0.15
859 0.16
860 0.23
861 0.27
862 0.29
863 0.3
864 0.32
865 0.32
866 0.37
867 0.41
868 0.39
869 0.43
870 0.45
871 0.46
872 0.49
873 0.5
874 0.45
875 0.43
876 0.41
877 0.33
878 0.31
879 0.3
880 0.32
881 0.29
882 0.3
883 0.33
884 0.34
885 0.32
886 0.34
887 0.39
888 0.33
889 0.35
890 0.39
891 0.35
892 0.39
893 0.39
894 0.37
895 0.31
896 0.3
897 0.26
898 0.21
899 0.19
900 0.13
901 0.18
902 0.23
903 0.3
904 0.38
905 0.46
906 0.53
907 0.58
908 0.64
909 0.68
910 0.75
911 0.77
912 0.79
913 0.81
914 0.82
915 0.83
916 0.81
917 0.73
918 0.64
919 0.56
920 0.5
921 0.4
922 0.33
923 0.26
924 0.21
925 0.2
926 0.17
927 0.15
928 0.11
929 0.12
930 0.12
931 0.14
932 0.22
933 0.23
934 0.26
935 0.29
936 0.3
937 0.32
938 0.37
939 0.41
940 0.35
941 0.37
942 0.41
943 0.39
944 0.39
945 0.36
946 0.32
947 0.29
948 0.28
949 0.29
950 0.32
951 0.36
952 0.45
953 0.55
954 0.63
955 0.7
956 0.78
957 0.82
958 0.81
959 0.87
960 0.87
961 0.87
962 0.85
963 0.77
964 0.74
965 0.72
966 0.64
967 0.56
968 0.47
969 0.39
970 0.37
971 0.36
972 0.33
973 0.3
974 0.31
975 0.29
976 0.28
977 0.25
978 0.18
979 0.18
980 0.14
981 0.1
982 0.1
983 0.09
984 0.11
985 0.12
986 0.11
987 0.11
988 0.1
989 0.15
990 0.18
991 0.18
992 0.18
993 0.23
994 0.27
995 0.31
996 0.4
997 0.38
998 0.36
999 0.41
1000 0.44
1001 0.39
1002 0.39
1003 0.43
1004 0.43
1005 0.49
1006 0.48
1007 0.46
1008 0.46
1009 0.45
1010 0.46