Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4U9T1

Protein Details
Accession A0A4Q4U9T1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
318-342DNPPPSSPPPKQRQRQARGKQQAVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
226-237RAAGASRAGKRK
326-383PPKQRQRQARGKQQAVARGRSSRAATARAAAAAAPKGGGSGSRAAKKQGAASSRAKPA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.5, nucl 13, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010585  DNA_repair_prot_XRCC4  
IPR014751  XRCC4-like_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06632  XRCC4  
Amino Acid Sequences MADIPVLRFPISGKEDEFFLLEVTPYGSKPLDLKLRGSEGSAVFAAKLRHKRIGEHKTANGHCTDAEWEAILTATLVDQKPAHDIEIRAEMQEDGSVIELCVRKNFQGITQRLGAIKLSENPDEEISLFAWCVSAIAARARVEEELAAAVARAGALEASVAELKGQLRELIRAREDDEALLLEKFRDLLNEKKVKIRQQQRLLAAADVDPAKLARVPGADAAALKRAAGASRAGKRKAAGDGDDDDAIDDDVDASVKMEVDSVAGADGGPQLDPEEDEPETTDTEETASEAAAREAETETETDNDNDNDNDNDNDIDDNPPPSSPPPKQRQRQARGKQQAVARGRSSRAATARAAAAAAPKGGGSGSRAAKKQGAASSRAKPATPRQQRGDTTDGGDDEDEDEEEPPPRNMPFSKGKKPAAPSPANGDDSDETESDDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.27
4 0.27
5 0.19
6 0.15
7 0.13
8 0.11
9 0.1
10 0.12
11 0.12
12 0.11
13 0.14
14 0.13
15 0.14
16 0.16
17 0.23
18 0.29
19 0.3
20 0.33
21 0.35
22 0.4
23 0.39
24 0.39
25 0.36
26 0.28
27 0.29
28 0.26
29 0.21
30 0.17
31 0.19
32 0.21
33 0.24
34 0.32
35 0.34
36 0.42
37 0.43
38 0.51
39 0.59
40 0.66
41 0.68
42 0.67
43 0.67
44 0.69
45 0.7
46 0.64
47 0.55
48 0.45
49 0.35
50 0.29
51 0.26
52 0.18
53 0.15
54 0.13
55 0.11
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.06
60 0.05
61 0.05
62 0.09
63 0.1
64 0.11
65 0.12
66 0.13
67 0.16
68 0.17
69 0.18
70 0.17
71 0.18
72 0.19
73 0.26
74 0.25
75 0.22
76 0.22
77 0.2
78 0.17
79 0.16
80 0.13
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.11
86 0.12
87 0.12
88 0.16
89 0.17
90 0.16
91 0.19
92 0.2
93 0.22
94 0.3
95 0.32
96 0.32
97 0.33
98 0.34
99 0.32
100 0.32
101 0.26
102 0.18
103 0.18
104 0.19
105 0.2
106 0.2
107 0.21
108 0.21
109 0.21
110 0.2
111 0.18
112 0.14
113 0.11
114 0.1
115 0.09
116 0.07
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.07
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.1
131 0.09
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.02
141 0.02
142 0.02
143 0.02
144 0.02
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.09
154 0.09
155 0.14
156 0.17
157 0.19
158 0.2
159 0.21
160 0.22
161 0.22
162 0.22
163 0.17
164 0.15
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.08
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.08
174 0.1
175 0.16
176 0.25
177 0.31
178 0.32
179 0.38
180 0.42
181 0.48
182 0.54
183 0.58
184 0.58
185 0.61
186 0.66
187 0.62
188 0.62
189 0.55
190 0.46
191 0.36
192 0.27
193 0.2
194 0.14
195 0.11
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.1
217 0.13
218 0.2
219 0.26
220 0.26
221 0.27
222 0.28
223 0.29
224 0.3
225 0.27
226 0.21
227 0.19
228 0.2
229 0.2
230 0.2
231 0.17
232 0.13
233 0.11
234 0.1
235 0.07
236 0.04
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.11
269 0.1
270 0.07
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.13
295 0.13
296 0.14
297 0.13
298 0.12
299 0.11
300 0.1
301 0.11
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.13
309 0.15
310 0.22
311 0.27
312 0.35
313 0.44
314 0.54
315 0.62
316 0.71
317 0.79
318 0.81
319 0.86
320 0.86
321 0.87
322 0.87
323 0.82
324 0.78
325 0.71
326 0.69
327 0.64
328 0.59
329 0.52
330 0.46
331 0.44
332 0.43
333 0.41
334 0.38
335 0.36
336 0.34
337 0.31
338 0.29
339 0.28
340 0.24
341 0.22
342 0.16
343 0.16
344 0.13
345 0.12
346 0.1
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.14
353 0.2
354 0.25
355 0.27
356 0.3
357 0.33
358 0.35
359 0.38
360 0.38
361 0.36
362 0.37
363 0.42
364 0.46
365 0.5
366 0.5
367 0.45
368 0.44
369 0.5
370 0.55
371 0.6
372 0.61
373 0.61
374 0.68
375 0.71
376 0.72
377 0.68
378 0.59
379 0.51
380 0.46
381 0.39
382 0.31
383 0.27
384 0.21
385 0.17
386 0.15
387 0.12
388 0.1
389 0.11
390 0.1
391 0.13
392 0.15
393 0.14
394 0.16
395 0.16
396 0.21
397 0.22
398 0.27
399 0.36
400 0.43
401 0.52
402 0.59
403 0.64
404 0.66
405 0.71
406 0.73
407 0.72
408 0.69
409 0.62
410 0.61
411 0.62
412 0.58
413 0.51
414 0.47
415 0.39
416 0.35
417 0.35
418 0.27
419 0.21