Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4VAF1

Protein Details
Accession A0A4Q4VAF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
482-506ADVDAEERRKRRKDRDDVLRREDANBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-266KKGGKKR
286-286K
488-496ERRKRRKDR
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 11, nucl 9.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001623  DnaJ_domain  
IPR018253  DnaJ_domain_CS  
IPR036869  J_dom_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR018856  Stn1_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF00226  DnaJ  
PF10451  Stn1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00636  DNAJ_1  
PS50076  DNAJ_2  
CDD cd06257  DnaJ  
cd03524  RPA2_OBF_family  
Amino Acid Sequences MSASEDIFEGEPPVINPYEVLGVERTATPDKIKSAYRKAALKHHPDKVSEDQKEKAHETFQSIAFAYAVLSDPVRRKRYDDTGSTSESIVDSDGFSWSDFYREQFRDAVSQDAIKKFAKKYKGSDEEKDDLLVSYEQFKGNWDKIYETVMLSDPIHDHERFRSIIAEAIERRDVPPFKAFTLETRKARDARIRAAKKEAGEAEEYAKELGVHDTIFGDKKKKGNKESEQDLAALIRSNQRNRSSLLDDLAAKYGATGGSKKGGKKRAVEEEPSEEAFQAAAARLKKKGKNAEPLVFYPQYCFYLSPTFNKWCPLRATDIHDLASHPGFEGQDVFFSLNHPIIWVRVVGVVVAVDAFHGRRVYTVDDSTGQCIECSVEVPKSPKTGVRDEEPARNPAAADAAQGTVSDVPADIDVGMVVDVKGRVKLFRDRKQIKILKVQRVGSTEREVQFWNKIGDFRRDVLCRPWVLDRRDVRRAKKQHLADVDAEERRKRRKDRDDVLRREDANRRLNRVGRHPTVELMHREPSTKSMDGKAHGDGQSDALGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.13
4 0.13
5 0.15
6 0.14
7 0.16
8 0.13
9 0.13
10 0.14
11 0.15
12 0.18
13 0.18
14 0.2
15 0.22
16 0.24
17 0.27
18 0.3
19 0.37
20 0.42
21 0.48
22 0.55
23 0.58
24 0.61
25 0.62
26 0.68
27 0.7
28 0.72
29 0.71
30 0.72
31 0.7
32 0.66
33 0.68
34 0.68
35 0.68
36 0.64
37 0.6
38 0.57
39 0.56
40 0.59
41 0.56
42 0.48
43 0.42
44 0.38
45 0.39
46 0.38
47 0.35
48 0.32
49 0.29
50 0.27
51 0.23
52 0.2
53 0.14
54 0.11
55 0.1
56 0.08
57 0.08
58 0.12
59 0.19
60 0.28
61 0.33
62 0.34
63 0.37
64 0.44
65 0.53
66 0.57
67 0.56
68 0.55
69 0.55
70 0.58
71 0.55
72 0.47
73 0.38
74 0.3
75 0.24
76 0.17
77 0.12
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.1
84 0.09
85 0.12
86 0.12
87 0.14
88 0.21
89 0.22
90 0.25
91 0.25
92 0.26
93 0.28
94 0.29
95 0.3
96 0.23
97 0.25
98 0.28
99 0.28
100 0.3
101 0.27
102 0.31
103 0.33
104 0.39
105 0.44
106 0.44
107 0.5
108 0.57
109 0.65
110 0.66
111 0.67
112 0.68
113 0.63
114 0.57
115 0.51
116 0.4
117 0.3
118 0.26
119 0.2
120 0.13
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.13
125 0.16
126 0.2
127 0.22
128 0.25
129 0.23
130 0.23
131 0.23
132 0.26
133 0.25
134 0.19
135 0.18
136 0.15
137 0.16
138 0.14
139 0.14
140 0.11
141 0.14
142 0.17
143 0.16
144 0.17
145 0.18
146 0.21
147 0.21
148 0.21
149 0.19
150 0.15
151 0.19
152 0.18
153 0.21
154 0.18
155 0.2
156 0.21
157 0.2
158 0.2
159 0.22
160 0.23
161 0.21
162 0.25
163 0.24
164 0.24
165 0.26
166 0.26
167 0.27
168 0.35
169 0.39
170 0.38
171 0.41
172 0.45
173 0.44
174 0.48
175 0.49
176 0.44
177 0.46
178 0.53
179 0.53
180 0.51
181 0.55
182 0.53
183 0.46
184 0.46
185 0.38
186 0.3
187 0.26
188 0.24
189 0.21
190 0.18
191 0.18
192 0.13
193 0.12
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.08
202 0.1
203 0.11
204 0.14
205 0.17
206 0.23
207 0.3
208 0.37
209 0.43
210 0.51
211 0.58
212 0.61
213 0.63
214 0.6
215 0.54
216 0.46
217 0.39
218 0.29
219 0.21
220 0.14
221 0.1
222 0.13
223 0.16
224 0.19
225 0.25
226 0.28
227 0.3
228 0.31
229 0.35
230 0.32
231 0.29
232 0.27
233 0.23
234 0.2
235 0.19
236 0.18
237 0.13
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.06
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.12
246 0.15
247 0.18
248 0.24
249 0.32
250 0.35
251 0.39
252 0.44
253 0.48
254 0.49
255 0.49
256 0.45
257 0.42
258 0.39
259 0.36
260 0.3
261 0.21
262 0.17
263 0.14
264 0.11
265 0.07
266 0.05
267 0.08
268 0.09
269 0.11
270 0.15
271 0.22
272 0.25
273 0.31
274 0.4
275 0.43
276 0.52
277 0.56
278 0.57
279 0.54
280 0.53
281 0.52
282 0.44
283 0.37
284 0.29
285 0.24
286 0.2
287 0.18
288 0.16
289 0.13
290 0.18
291 0.19
292 0.21
293 0.25
294 0.26
295 0.26
296 0.31
297 0.3
298 0.27
299 0.29
300 0.27
301 0.28
302 0.28
303 0.34
304 0.34
305 0.35
306 0.31
307 0.29
308 0.28
309 0.24
310 0.21
311 0.14
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.09
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.08
321 0.07
322 0.08
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.06
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.03
341 0.03
342 0.04
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.09
348 0.12
349 0.15
350 0.15
351 0.16
352 0.19
353 0.2
354 0.21
355 0.2
356 0.16
357 0.13
358 0.12
359 0.11
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.12
365 0.15
366 0.18
367 0.19
368 0.2
369 0.23
370 0.26
371 0.31
372 0.32
373 0.33
374 0.39
375 0.4
376 0.48
377 0.47
378 0.44
379 0.38
380 0.35
381 0.31
382 0.23
383 0.22
384 0.13
385 0.11
386 0.1
387 0.1
388 0.09
389 0.09
390 0.1
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.06
398 0.05
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.05
406 0.06
407 0.07
408 0.1
409 0.1
410 0.13
411 0.16
412 0.27
413 0.35
414 0.44
415 0.55
416 0.58
417 0.63
418 0.72
419 0.75
420 0.71
421 0.72
422 0.72
423 0.71
424 0.72
425 0.69
426 0.62
427 0.59
428 0.57
429 0.5
430 0.47
431 0.44
432 0.38
433 0.37
434 0.35
435 0.33
436 0.34
437 0.34
438 0.31
439 0.26
440 0.29
441 0.31
442 0.37
443 0.38
444 0.36
445 0.4
446 0.39
447 0.4
448 0.41
449 0.43
450 0.37
451 0.36
452 0.43
453 0.44
454 0.45
455 0.52
456 0.54
457 0.56
458 0.65
459 0.7
460 0.68
461 0.71
462 0.76
463 0.75
464 0.76
465 0.74
466 0.72
467 0.71
468 0.68
469 0.61
470 0.58
471 0.56
472 0.52
473 0.5
474 0.47
475 0.47
476 0.51
477 0.57
478 0.61
479 0.66
480 0.71
481 0.79
482 0.83
483 0.88
484 0.9
485 0.9
486 0.88
487 0.85
488 0.76
489 0.72
490 0.69
491 0.67
492 0.66
493 0.63
494 0.62
495 0.62
496 0.66
497 0.66
498 0.68
499 0.69
500 0.65
501 0.65
502 0.59
503 0.56
504 0.55
505 0.55
506 0.51
507 0.45
508 0.45
509 0.4
510 0.41
511 0.38
512 0.38
513 0.37
514 0.35
515 0.34
516 0.35
517 0.39
518 0.4
519 0.42
520 0.41
521 0.42
522 0.4
523 0.38
524 0.32
525 0.29