FuNGI

A0A4Q4VKM4

Protein Details

Accession

A0A4Q4VKM4

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
236-273	QMLINKKSKKKAKALEKARDKLKRQERRKNAPHPLNFS	Hydrophilic
475-495	LAKWKEEQKKRKRAENGLPEN	Hydrophilic
672-695	EAEGKSTTNREKARKKNFLMTLSK	Hydrophilic
711-730	LKNHIERSKSGGRRRNGKSR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
239-266	INKKSKKKAKALEKARDKLKRQERRKNA
483-486	KKRK
640-730	KSTKEERVALAREGKPDREEHKSTQAIRKAKKEAEGKSTTNREKARKKNFLMTLSKARSKNKRSLVVTRNILKNHIERSKSGGRRRNGKSR

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MRRDPEDYEKEFIEAWNQYEAAHDKFMASPVNADSNALIDFHDLIDLIAHVADLYPQHTQSFTPGLKAILVQHHAVLEPELREKLVSSLVLLRRKNILDSSELLTTLFPILISTGSKTLRMLLFQKILSDLRNSNTKTVNHRLNRTMQTVLFNLVTADRSDPKAIWATKIVRELWKRQIWTDARPVEIMKEASLADNEKVAVSGTRFFLGSDQDREEADDDSSEDEGVDVKKMKHQMLINKKSKKKAKALEKARDKLKRQERRKNAPHPLNFSALHLLHDPQGFAEALFEKHLLSSRAKLALESKTLTLQLVTRLVGLHKLTLVPLYSWFIKYLTPRQASVTSFLASLAQATHNLVPPDVLEPLIQKIANEFVSEAAASEVAAAGLNAIREIAARQPLAMTETLLQDLVQYRKSKDKGVMMAARGLLSLYREKAADMLAKKDRGKDASMGLRTGELKQQKFGEEEVGQIEGLELLAKWKEEQKKRKRAENGLPENVEDGEKDEGDEDGFNSSDWEVASSDSDSSGEWIRVSDSEDEPEPVPKKAKIDSKDPEEEEDDGDSGDDDHDEDKQNAVDEVKRLQNLATTQILTPADLAKLRELQMEAKLDKALGNRKRREALEARHMDEGLTAEQIEAPVKLRKSTKEERVALAREGKPDREEHKSTQAIRKAKKEAEGKSTTNREKARKKNFLMTLSKARSKNKRSLVVTRNILKNHIERSKSGGRRRNGKSR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.23
3	0.22
4	0.22
5	0.2
6	0.25
7	0.28
8	0.24
9	0.24
10	0.22
11	0.2
12	0.21
13	0.24
14	0.23
15	0.19
16	0.19
17	0.19
18	0.24
19	0.23
20	0.22
21	0.2
22	0.17
23	0.17
24	0.15
25	0.13
26	0.09
27	0.09
28	0.09
29	0.09
30	0.08
31	0.07
32	0.07
33	0.07
34	0.06
35	0.06
36	0.05
37	0.05
38	0.05
39	0.06
40	0.07
41	0.09
42	0.11
43	0.12
44	0.13
45	0.14
46	0.14
47	0.17
48	0.24
49	0.23
50	0.23
51	0.23
52	0.23
53	0.23
54	0.24
55	0.25
56	0.23
57	0.25
58	0.23
59	0.23
60	0.23
61	0.22
62	0.22
63	0.19
64	0.15
65	0.15
66	0.17
67	0.17
68	0.17
69	0.17
70	0.17
71	0.17
72	0.17
73	0.15
74	0.13
75	0.2
76	0.27
77	0.34
78	0.34
79	0.34
80	0.37
81	0.38
82	0.4
83	0.35
84	0.31
85	0.27
86	0.3
87	0.31
88	0.26
89	0.25
90	0.22
91	0.19
92	0.17
93	0.14
94	0.11
95	0.07
96	0.06
97	0.06
98	0.07
99	0.08
100	0.09
101	0.13
102	0.14
103	0.15
104	0.15
105	0.19
106	0.19
107	0.22
108	0.23
109	0.24
110	0.28
111	0.27
112	0.28
113	0.27
114	0.27
115	0.25
116	0.27
117	0.23
118	0.23
119	0.3
120	0.31
121	0.32
122	0.37
123	0.4
124	0.43
125	0.49
126	0.56
127	0.55
128	0.59
129	0.6
130	0.63
131	0.63
132	0.59
133	0.54
134	0.45
135	0.42
136	0.37
137	0.34
138	0.26
139	0.2
140	0.17
141	0.15
142	0.14
143	0.11
144	0.13
145	0.13
146	0.15
147	0.17
148	0.16
149	0.18
150	0.25
151	0.24
152	0.24
153	0.28
154	0.3
155	0.33
156	0.37
157	0.37
158	0.38
159	0.42
160	0.46
161	0.49
162	0.51
163	0.48
164	0.45
165	0.52
166	0.47
167	0.48
168	0.51
169	0.43
170	0.39
171	0.39
172	0.38
173	0.3
174	0.29
175	0.25
176	0.15
177	0.14
178	0.13
179	0.13
180	0.14
181	0.14
182	0.11
183	0.11
184	0.11
185	0.1
186	0.09
187	0.09
188	0.09
189	0.08
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.11
194	0.11
195	0.12
196	0.16
197	0.18
198	0.19
199	0.2
200	0.2
201	0.2
202	0.22
203	0.21
204	0.17
205	0.14
206	0.11
207	0.09
208	0.1
209	0.1
210	0.09
211	0.07
212	0.06
213	0.07
214	0.07
215	0.09
216	0.11
217	0.11
218	0.15
219	0.2
220	0.21
221	0.25
222	0.28
223	0.36
224	0.44
225	0.54
226	0.6
227	0.65
228	0.69
229	0.73
230	0.78
231	0.76
232	0.75
233	0.73
234	0.75
235	0.76
236	0.81
237	0.82
238	0.84
239	0.82
240	0.81
241	0.8
242	0.73
243	0.73
244	0.73
245	0.73
246	0.74
247	0.78
248	0.8
249	0.83
250	0.88
251	0.89
252	0.88
253	0.87
254	0.82
255	0.79
256	0.71
257	0.64
258	0.55
259	0.46
260	0.4
261	0.31
262	0.26
263	0.2
264	0.18
265	0.16
266	0.16
267	0.15
268	0.1
269	0.11
270	0.1
271	0.09
272	0.09
273	0.08
274	0.08
275	0.09
276	0.09
277	0.07
278	0.08
279	0.1
280	0.11
281	0.11
282	0.13
283	0.15
284	0.18
285	0.18
286	0.18
287	0.2
288	0.21
289	0.22
290	0.2
291	0.18
292	0.16
293	0.16
294	0.16
295	0.12
296	0.1
297	0.1
298	0.1
299	0.1
300	0.09
301	0.09
302	0.09
303	0.12
304	0.11
305	0.09
306	0.08
307	0.08
308	0.08
309	0.09
310	0.09
311	0.06
312	0.07
313	0.09
314	0.1
315	0.1
316	0.1
317	0.1
318	0.12
319	0.14
320	0.2
321	0.26
322	0.27
323	0.27
324	0.29
325	0.32
326	0.3
327	0.3
328	0.25
329	0.17
330	0.16
331	0.15
332	0.13
333	0.1
334	0.09
335	0.07
336	0.05
337	0.05
338	0.06
339	0.07
340	0.09
341	0.09
342	0.09
343	0.08
344	0.08
345	0.09
346	0.08
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.09
352	0.08
353	0.07
354	0.07
355	0.09
356	0.09
357	0.09
358	0.08
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.07
363	0.05
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.02
371	0.02
372	0.03
373	0.03
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.04
379	0.06
380	0.08
381	0.08
382	0.08
383	0.08
384	0.09
385	0.1
386	0.1
387	0.08
388	0.07
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.07
394	0.1
395	0.11
396	0.14
397	0.15
398	0.16
399	0.24
400	0.26
401	0.28
402	0.29
403	0.32
404	0.32
405	0.36
406	0.38
407	0.32
408	0.32
409	0.29
410	0.25
411	0.2
412	0.16
413	0.1
414	0.08
415	0.1
416	0.08
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.1
421	0.11
422	0.14
423	0.13
424	0.18
425	0.21
426	0.26
427	0.27
428	0.3
429	0.32
430	0.3
431	0.31
432	0.27
433	0.28
434	0.3
435	0.3
436	0.27
437	0.24
438	0.23
439	0.23
440	0.22
441	0.22
442	0.22
443	0.21
444	0.24
445	0.25
446	0.25
447	0.25
448	0.25
449	0.24
450	0.18
451	0.18
452	0.16
453	0.15
454	0.13
455	0.11
456	0.11
457	0.06
458	0.05
459	0.04
460	0.03
461	0.04
462	0.05
463	0.05
464	0.06
465	0.13
466	0.22
467	0.32
468	0.43
469	0.52
470	0.63
471	0.69
472	0.77
473	0.79
474	0.8
475	0.81
476	0.81
477	0.79
478	0.74
479	0.69
480	0.6
481	0.52
482	0.43
483	0.33
484	0.22
485	0.15
486	0.1
487	0.09
488	0.09
489	0.08
490	0.08
491	0.08
492	0.08
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.07
501	0.08
502	0.07
503	0.07
504	0.09
505	0.08
506	0.09
507	0.08
508	0.08
509	0.07
510	0.09
511	0.09
512	0.09
513	0.08
514	0.08
515	0.09
516	0.1
517	0.12
518	0.14
519	0.13
520	0.15
521	0.16
522	0.18
523	0.17
524	0.23
525	0.22
526	0.21
527	0.24
528	0.23
529	0.26
530	0.31
531	0.38
532	0.36
533	0.44
534	0.48
535	0.52
536	0.57
537	0.55
538	0.52
539	0.46
540	0.43
541	0.35
542	0.29
543	0.22
544	0.14
545	0.13
546	0.1
547	0.08
548	0.07
549	0.06
550	0.05
551	0.06
552	0.08
553	0.1
554	0.11
555	0.12
556	0.12
557	0.13
558	0.13
559	0.15
560	0.15
561	0.15
562	0.19
563	0.22
564	0.22
565	0.22
566	0.21
567	0.23
568	0.22
569	0.24
570	0.22
571	0.19
572	0.19
573	0.23
574	0.23
575	0.19
576	0.18
577	0.15
578	0.14
579	0.15
580	0.16
581	0.14
582	0.18
583	0.18
584	0.2
585	0.2
586	0.21
587	0.24
588	0.29
589	0.26
590	0.25
591	0.24
592	0.22
593	0.23
594	0.26
595	0.31
596	0.34
597	0.44
598	0.48
599	0.54
600	0.6
601	0.59
602	0.63
603	0.62
604	0.61
605	0.62
606	0.62
607	0.58
608	0.54
609	0.52
610	0.43
611	0.35
612	0.29
613	0.19
614	0.14
615	0.11
616	0.09
617	0.1
618	0.1
619	0.1
620	0.09
621	0.11
622	0.16
623	0.17
624	0.22
625	0.27
626	0.32
627	0.4
628	0.5
629	0.57
630	0.61
631	0.64
632	0.64
633	0.67
634	0.64
635	0.6
636	0.6
637	0.52
638	0.5
639	0.5
640	0.47
641	0.43
642	0.45
643	0.45
644	0.45
645	0.48
646	0.45
647	0.51
648	0.55
649	0.59
650	0.62
651	0.65
652	0.66
653	0.67
654	0.7
655	0.69
656	0.66
657	0.69
658	0.68
659	0.66
660	0.66
661	0.66
662	0.62
663	0.63
664	0.69
665	0.66
666	0.66
667	0.67
668	0.68
669	0.72
670	0.78
671	0.8
672	0.8
673	0.8
674	0.82
675	0.81
676	0.8
677	0.77
678	0.74
679	0.73
680	0.71
681	0.73
682	0.69
683	0.7
684	0.72
685	0.72
686	0.75
687	0.73
688	0.76
689	0.75
690	0.79
691	0.79
692	0.78
693	0.79
694	0.77
695	0.75
696	0.67
697	0.63
698	0.59
699	0.56
700	0.56
701	0.55
702	0.5
703	0.45
704	0.51
705	0.58
706	0.61
707	0.66
708	0.65
709	0.66
710	0.73

A0A4Q4VKM4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer