FuNGI

A0A4Q4VIM9

Protein Details

Accession

A0A4Q4VIM9

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
40-63	KEVMDEQARKKRKRDQMQDGDEDD	Acidic
99-129	QEISEKERRKEEKKQARKERKAERQMLREEE	Basic
422-496	DDEKLLKKAVKRKEQLKKKSTKEWKERSDGVAKAMKEKQKKREENIKKRREEKLTNKAGKKKGGAKKTKGRAGFE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
49-51	KKR
104-122	KERRKEEKKQARKERKAER
272-313	RDARKADRDGKPIRTRQELIEARRQKEAERKAHKKEVRRQQK
370-373	KKKG
412-506	RKRAEGEKIKDDEKLLKKAVKRKEQLKKKSTKEWKERSDGVAKAMKEKQKKREENIKKRREEKLTNKAGKKKGGAKKTKGRAGFEGSFKVGGKKR

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR029190 Rrp14/SURF6_C IPR029188 Rrp14_N IPR007019 SURF6
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF15459 RRP14 PF04935 SURF6

Amino Acid Sequences

MYYGEDNSDQWQRKKQTKAEAAAARRNKLDPDSELNRSVKEVMDEQARKKRKRDQMQDGDEDDWSDVEGVEAEKPRQGMKSRAQKDTTKKQKTVDTEAQEISEKERRKEEKKQARKERKAERQMLREEEAAFERQTIKGVNKIKLGTREARTKSESAVSGPASNSSAKPNQSIEKNEPEPVQNSDMRDVDVSGITTAESDEKAVDASASPSEPQSPVFDPNGTPADSTGQAPSTTTSVSSTVPPSEKPKHIKIPQDTEALRARLAAKIQALRDARKADRDGKPIRTRQELIEARRQKEAERKAHKKEVRRQQKAEADRLREEALASARNSPGGILSPAIDADTNFAFGRVGFGDGAQLSHDLTHVLNKGKKKGPSDPKTALQKLENQKKRLQEMDEEKRKDVEDKEVWLTARKRAEGEKIKDDEKLLKKAVKRKEQLKKKSTKEWKERSDGVAKAMKEKQKKREENIKKRREEKLTNKAGKKKGGAKKTKGRAGFEGSFKVGGKKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.67
2	0.7
3	0.72
4	0.74
5	0.76
6	0.76
7	0.76
8	0.75
9	0.75
10	0.74
11	0.67
12	0.6
13	0.56
14	0.5
15	0.45
16	0.43
17	0.38
18	0.4
19	0.43
20	0.45
21	0.49
22	0.47
23	0.44
24	0.41
25	0.37
26	0.3
27	0.27
28	0.24
29	0.22
30	0.31
31	0.35
32	0.4
33	0.49
34	0.57
35	0.6
36	0.65
37	0.71
38	0.72
39	0.78
40	0.82
41	0.83
42	0.84
43	0.87
44	0.86
45	0.78
46	0.69
47	0.58
48	0.48
49	0.37
50	0.26
51	0.18
52	0.11
53	0.08
54	0.06
55	0.07
56	0.07
57	0.1
58	0.13
59	0.13
60	0.15
61	0.16
62	0.18
63	0.23
64	0.27
65	0.31
66	0.38
67	0.48
68	0.53
69	0.6
70	0.64
71	0.66
72	0.71
73	0.74
74	0.76
75	0.74
76	0.72
77	0.69
78	0.71
79	0.7
80	0.7
81	0.67
82	0.61
83	0.56
84	0.53
85	0.49
86	0.43
87	0.37
88	0.33
89	0.31
90	0.3
91	0.28
92	0.36
93	0.43
94	0.48
95	0.58
96	0.64
97	0.69
98	0.76
99	0.84
100	0.86
101	0.9
102	0.93
103	0.92
104	0.92
105	0.91
106	0.91
107	0.9
108	0.87
109	0.84
110	0.8
111	0.76
112	0.68
113	0.59
114	0.49
115	0.41
116	0.35
117	0.29
118	0.22
119	0.18
120	0.17
121	0.15
122	0.16
123	0.16
124	0.15
125	0.21
126	0.27
127	0.29
128	0.32
129	0.34
130	0.36
131	0.4
132	0.43
133	0.43
134	0.42
135	0.48
136	0.47
137	0.5
138	0.49
139	0.44
140	0.41
141	0.38
142	0.33
143	0.26
144	0.26
145	0.22
146	0.2
147	0.19
148	0.18
149	0.16
150	0.16
151	0.15
152	0.17
153	0.2
154	0.19
155	0.22
156	0.24
157	0.27
158	0.31
159	0.36
160	0.36
161	0.4
162	0.41
163	0.41
164	0.39
165	0.36
166	0.33
167	0.31
168	0.29
169	0.24
170	0.23
171	0.24
172	0.23
173	0.21
174	0.19
175	0.16
176	0.13
177	0.11
178	0.1
179	0.07
180	0.06
181	0.06
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.04
193	0.05
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.07
198	0.08
199	0.08
200	0.09
201	0.11
202	0.12
203	0.14
204	0.15
205	0.16
206	0.15
207	0.17
208	0.19
209	0.16
210	0.14
211	0.11
212	0.12
213	0.12
214	0.13
215	0.1
216	0.09
217	0.09
218	0.09
219	0.1
220	0.08
221	0.08
222	0.07
223	0.07
224	0.08
225	0.09
226	0.1
227	0.1
228	0.11
229	0.12
230	0.13
231	0.19
232	0.23
233	0.28
234	0.32
235	0.37
236	0.44
237	0.49
238	0.55
239	0.54
240	0.56
241	0.54
242	0.54
243	0.48
244	0.43
245	0.41
246	0.34
247	0.28
248	0.22
249	0.19
250	0.15
251	0.16
252	0.14
253	0.12
254	0.14
255	0.15
256	0.2
257	0.21
258	0.21
259	0.25
260	0.27
261	0.26
262	0.27
263	0.31
264	0.32
265	0.36
266	0.43
267	0.44
268	0.49
269	0.56
270	0.56
271	0.57
272	0.54
273	0.5
274	0.43
275	0.48
276	0.45
277	0.42
278	0.47
279	0.49
280	0.46
281	0.48
282	0.47
283	0.4
284	0.43
285	0.47
286	0.48
287	0.52
288	0.58
289	0.61
290	0.7
291	0.72
292	0.73
293	0.74
294	0.75
295	0.76
296	0.77
297	0.73
298	0.72
299	0.76
300	0.72
301	0.72
302	0.67
303	0.6
304	0.53
305	0.52
306	0.44
307	0.35
308	0.3
309	0.23
310	0.18
311	0.17
312	0.16
313	0.16
314	0.15
315	0.15
316	0.15
317	0.12
318	0.11
319	0.09
320	0.09
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.08
326	0.07
327	0.06
328	0.07
329	0.07
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.07
335	0.09
336	0.08
337	0.09
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.09
343	0.07
344	0.07
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.1
351	0.13
352	0.18
353	0.23
354	0.27
355	0.35
356	0.4
357	0.45
358	0.47
359	0.54
360	0.59
361	0.62
362	0.67
363	0.65
364	0.66
365	0.71
366	0.68
367	0.61
368	0.53
369	0.54
370	0.56
371	0.62
372	0.62
373	0.57
374	0.59
375	0.62
376	0.64
377	0.6
378	0.53
379	0.52
380	0.54
381	0.61
382	0.66
383	0.62
384	0.58
385	0.55
386	0.53
387	0.48
388	0.4
389	0.38
390	0.32
391	0.34
392	0.35
393	0.36
394	0.36
395	0.39
396	0.38
397	0.36
398	0.37
399	0.34
400	0.34
401	0.35
402	0.45
403	0.47
404	0.52
405	0.54
406	0.53
407	0.53
408	0.52
409	0.51
410	0.5
411	0.47
412	0.47
413	0.43
414	0.44
415	0.49
416	0.56
417	0.63
418	0.64
419	0.66
420	0.7
421	0.76
422	0.81
423	0.86
424	0.88
425	0.88
426	0.85
427	0.88
428	0.88
429	0.88
430	0.88
431	0.88
432	0.86
433	0.84
434	0.81
435	0.76
436	0.73
437	0.64
438	0.59
439	0.54
440	0.46
441	0.45
442	0.48
443	0.5
444	0.53
445	0.6
446	0.64
447	0.7
448	0.78
449	0.8
450	0.84
451	0.87
452	0.89
453	0.91
454	0.91
455	0.89
456	0.88
457	0.88
458	0.87
459	0.86
460	0.85
461	0.85
462	0.86
463	0.86
464	0.87
465	0.87
466	0.84
467	0.81
468	0.79
469	0.78
470	0.77
471	0.78
472	0.79
473	0.8
474	0.83
475	0.86
476	0.86
477	0.82
478	0.78
479	0.74
480	0.72
481	0.68
482	0.63
483	0.57
484	0.51
485	0.47
486	0.42

A0A4Q4VIM9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer