Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4U6T1

Protein Details
Accession A0A4Q4U6T1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-184YDPEERRRRNETRRYRDRAGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
170-190RRRNETRRYRDRAGSGYGRRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDSMDLDIDMDLDVDLVPDEPIAPELAAEELPGDRSDGEVAEEPDVLAPTKVHMRGLDVLKPDDVKAYIAEHFPESPFEKIEWIDDSSANLIFPSEPVAARALEALAVEPIQDVALLPARQLLPAKQYSQMPDIALQVRLAVLSDKKQAGAAQRSRFYLLNPEYDPEERRRRNETRRYRDRAGSGYGRRRGRDFRDEEPTEPFDVNLYDDDEASLANRATRPRPVRRRSYTPESDRSEPGRTSYRNENRGKELFPEGSGNRRSSRRDRSASPTRDRDGDRSMDDMPSDRQAARNRDRARAIKSDMSRSNRSRELFPQKLKSGNGRLGDAVEDAADLMAKGITLPLMDGSSDVKTSTRSRRLEDRITVPGKGKLADRISSPGEAAADGSAFSIRGSASQKSADQGFVIKGVAGKSVKELFPAKFGSNSGKELFADRLEGRTRQRQRAGDLFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.05
4 0.05
5 0.05
6 0.06
7 0.06
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.06
12 0.07
13 0.09
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.07
18 0.09
19 0.09
20 0.1
21 0.08
22 0.09
23 0.1
24 0.1
25 0.12
26 0.14
27 0.16
28 0.16
29 0.16
30 0.15
31 0.15
32 0.16
33 0.13
34 0.11
35 0.09
36 0.11
37 0.17
38 0.18
39 0.19
40 0.19
41 0.22
42 0.29
43 0.33
44 0.35
45 0.32
46 0.33
47 0.33
48 0.33
49 0.29
50 0.25
51 0.22
52 0.17
53 0.15
54 0.16
55 0.17
56 0.17
57 0.18
58 0.17
59 0.18
60 0.17
61 0.2
62 0.2
63 0.19
64 0.2
65 0.19
66 0.19
67 0.18
68 0.2
69 0.18
70 0.18
71 0.18
72 0.17
73 0.18
74 0.17
75 0.17
76 0.14
77 0.11
78 0.1
79 0.08
80 0.08
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.13
106 0.13
107 0.14
108 0.16
109 0.16
110 0.18
111 0.21
112 0.23
113 0.23
114 0.26
115 0.28
116 0.29
117 0.29
118 0.24
119 0.22
120 0.23
121 0.22
122 0.2
123 0.16
124 0.14
125 0.12
126 0.11
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.1
131 0.15
132 0.15
133 0.16
134 0.17
135 0.19
136 0.23
137 0.31
138 0.35
139 0.37
140 0.39
141 0.4
142 0.42
143 0.4
144 0.34
145 0.34
146 0.29
147 0.28
148 0.26
149 0.26
150 0.26
151 0.28
152 0.3
153 0.28
154 0.36
155 0.35
156 0.39
157 0.46
158 0.53
159 0.61
160 0.69
161 0.73
162 0.74
163 0.8
164 0.84
165 0.8
166 0.76
167 0.69
168 0.62
169 0.56
170 0.53
171 0.5
172 0.5
173 0.52
174 0.51
175 0.49
176 0.49
177 0.5
178 0.49
179 0.51
180 0.47
181 0.45
182 0.51
183 0.52
184 0.49
185 0.47
186 0.42
187 0.34
188 0.29
189 0.24
190 0.15
191 0.14
192 0.13
193 0.09
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.06
202 0.05
203 0.06
204 0.08
205 0.1
206 0.11
207 0.19
208 0.26
209 0.35
210 0.46
211 0.52
212 0.6
213 0.65
214 0.72
215 0.72
216 0.74
217 0.73
218 0.69
219 0.7
220 0.64
221 0.61
222 0.55
223 0.5
224 0.44
225 0.36
226 0.32
227 0.3
228 0.27
229 0.28
230 0.35
231 0.4
232 0.46
233 0.51
234 0.51
235 0.5
236 0.52
237 0.49
238 0.41
239 0.37
240 0.28
241 0.24
242 0.25
243 0.2
244 0.24
245 0.26
246 0.25
247 0.26
248 0.29
249 0.34
250 0.38
251 0.48
252 0.5
253 0.52
254 0.54
255 0.59
256 0.66
257 0.68
258 0.68
259 0.63
260 0.57
261 0.57
262 0.54
263 0.49
264 0.43
265 0.38
266 0.31
267 0.28
268 0.27
269 0.22
270 0.2
271 0.18
272 0.16
273 0.15
274 0.15
275 0.13
276 0.18
277 0.24
278 0.33
279 0.38
280 0.45
281 0.46
282 0.51
283 0.57
284 0.56
285 0.55
286 0.52
287 0.5
288 0.48
289 0.48
290 0.5
291 0.51
292 0.52
293 0.55
294 0.52
295 0.53
296 0.52
297 0.52
298 0.48
299 0.5
300 0.53
301 0.54
302 0.57
303 0.58
304 0.56
305 0.58
306 0.57
307 0.55
308 0.51
309 0.48
310 0.44
311 0.38
312 0.35
313 0.31
314 0.29
315 0.22
316 0.15
317 0.09
318 0.07
319 0.06
320 0.05
321 0.04
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.07
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.12
341 0.19
342 0.28
343 0.36
344 0.38
345 0.43
346 0.53
347 0.6
348 0.64
349 0.64
350 0.59
351 0.59
352 0.58
353 0.56
354 0.49
355 0.45
356 0.39
357 0.34
358 0.31
359 0.29
360 0.31
361 0.3
362 0.3
363 0.31
364 0.32
365 0.3
366 0.29
367 0.22
368 0.18
369 0.16
370 0.15
371 0.1
372 0.08
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.1
381 0.13
382 0.15
383 0.18
384 0.21
385 0.22
386 0.24
387 0.26
388 0.23
389 0.2
390 0.21
391 0.19
392 0.17
393 0.16
394 0.13
395 0.14
396 0.13
397 0.18
398 0.16
399 0.16
400 0.2
401 0.25
402 0.24
403 0.27
404 0.31
405 0.27
406 0.32
407 0.35
408 0.32
409 0.29
410 0.31
411 0.35
412 0.34
413 0.37
414 0.33
415 0.32
416 0.31
417 0.31
418 0.32
419 0.24
420 0.26
421 0.23
422 0.27
423 0.29
424 0.34
425 0.38
426 0.46
427 0.54
428 0.58
429 0.66
430 0.66
431 0.69